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异质信息网络中最大路径连通Steiner分量查询算法
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作者 李源 范晓林 +3 位作者 孙晶 赵会群 杨森 王国仁 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2023年第2期655-675,共21页
异质信息网络(HINs)是包含多种类型对象(顶点)和链接(边)的有向图,能够表达丰富复杂的语义和结构信息.HINs中的稠密子图查询问题,即给定一个查询点q,在HINs中查询包含q的稠密子图,已成为该领域的热点和重点研究问题,并在活动策划、生物... 异质信息网络(HINs)是包含多种类型对象(顶点)和链接(边)的有向图,能够表达丰富复杂的语义和结构信息.HINs中的稠密子图查询问题,即给定一个查询点q,在HINs中查询包含q的稠密子图,已成为该领域的热点和重点研究问题,并在活动策划、生物分析和商品推荐等领域具有广泛应用.但现有方法主要存在以下两个问题:(1)基于模体团和关系约束查询的稠密子图具有多种类型顶点,导致其不能解决仅关注某种特定类型顶点的场景;(2)基于元路径的方法虽然可查询到某种特定类型顶点的稠密子图,但其忽略了子图中顶点之间基于元路径的连通度.为此,首先在HINs中提出了基于元路径的边不相交路径的连通度,即路径连通度;然后,基于路径连通度提出了k-路径连通分量(k-PCC)模型,该模型要求子图的路径连通度至少为k;其次,基于k-PCC模型提出了最大路径连通Steiner分量(SMPCC)概念,其为包含q的具有最大路径连通度的k-PCC;最后,提出一种高效的基于图分解的k-PCC发现算法,并在此基础上提出了优化查询SMPCC算法.大量基于真实和合成HINs数据的实验结果验证了所提出模型和算法的有效性和高效性. 展开更多
关键词 异质信息网络 稠密子图查询 k-路径连通分量 最大路径连通steiner分量 元路径
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基于图压缩的最大Steiner连通k核查询处理 被引量:2
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作者 李鸣鹏 高宏 邹兆年 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2016年第9期2265-2277,共13页
研究了基于图压缩的最大Steiner连通k核查询处理,提出了一种支持最大Steiner连通k核查询的图压缩算法SC,证明了基于SC压缩算法的查询正确性.由于最大Steiner连通k核查询仅需要找到符合要求的连通区域,提出了图压缩算法TC,进一步将压缩... 研究了基于图压缩的最大Steiner连通k核查询处理,提出了一种支持最大Steiner连通k核查询的图压缩算法SC,证明了基于SC压缩算法的查询正确性.由于最大Steiner连通k核查询仅需要找到符合要求的连通区域,提出了图压缩算法TC,进一步将压缩图压缩为树.证明了基于压缩树的查询正确性,并提出了线性时间的无需解压缩的查询处理算法.真实和虚拟数据上的实验结果表明:压缩算法平均可将原始图压缩掉88%,且对于稠密的原始图,压缩算法的压缩效果更好,可将原始图压缩掉90%,与在原始图上直接进行查询处理相比,基于压缩图的查询处理算法效率更好,平均提升了1~2个数量级. 展开更多
关键词 最大steiner连通k核 图压缩 等价类 查询处理 压缩比
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基于KST索引的最大连通Steiner分量查询算法 被引量:1
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作者 陈子阳 陈伟 +1 位作者 贾勇 周军锋 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 2020年第7期1215-1229,共15页
查找图的连通分量在生物信息学领域有着重要应用价值,其中的关键问题之一是查询最大连通Steiner分量(SMCC).针对已有最大连通Steiner分量查询方法中存在的查询效率低的问题,本文首先提出利用k-edge连通分量与(k+1)-edge连通分量之间的... 查找图的连通分量在生物信息学领域有着重要应用价值,其中的关键问题之一是查询最大连通Steiner分量(SMCC).针对已有最大连通Steiner分量查询方法中存在的查询效率低的问题,本文首先提出利用k-edge连通分量与(k+1)-edge连通分量之间的包含关系建立顶点集合的分层索引KST.和现有的专用索引相比,KST索引规模得到了缩减;然后本文提出了基于KST索引的SMCC查询算法以及具有顶点数量限制的SMCC L查询算法.和已有方法中索引的是图中顶点不同,KST索引中维护的是顶点集合的包含关系.其优点在于将已有方法在遍历过程中的一次一顶点的查询方式转换为更高效的一次一集合的查询方式,显著减少了需要访问的索引点数量,极大提升了查询处理的效率;最后,基于15个真实数据集进行实验测试,从不同角度验证了本文所提方法的高效性. 展开更多
关键词 无向图 k-edge连通分量 最大连通steiner分量 索引 最大生成树
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TRANSFORMATIONS FOR THE PRIZE-COLLECTING STEINER TREE PROBLEM AND THE MAXIMUM-WEIGHT CONNECTED SUBGRAPH PROBLEM TO SAP
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作者 Daniel Rehfeldt Thorsten Koch 《Journal of Computational Mathematics》 SCIE CSCD 2018年第3期459-468,共10页
Transformations of Steiner tree problem variants have been frequently discussed in the literature. Besides allowing to easily transfer complexity results, they constitute a central pillar of exact state-of-the-art sol... Transformations of Steiner tree problem variants have been frequently discussed in the literature. Besides allowing to easily transfer complexity results, they constitute a central pillar of exact state-of-the-art solvers for well-known variants such as the Steiner tree problem in graphs. In this article transformations for both the prize-collecting Steiner tree problem and the maximum-weight connected subgraph problem to the Steiner arborescence problem are introduced for the first time. Furthermore, the considerable implications for practical solving approaches will be demonstrated, including the computation of strong upper and lower bounds. 展开更多
关键词 Prize-collecting steiner tree problem maximum-weight connected subgraphproblem Graph transformations Dual-ascent heuristics.
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Exploring the Constrained Maximum Edge-weight Connected Graph Problem
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作者 Zhen-ping Li Shi-hua Zhang +1 位作者 Xiang-Sun Zhang Luo-nan Chen 《Acta Mathematicae Applicatae Sinica》 SCIE CSCD 2009年第4期697-708,共12页
Given an edge weighted graph, the maximum edge-weight connected graph (MECG) is a connected subgraph with a given number of edges and the maximal weight sum. Here we study a special case, i.e. the Constrained Maximu... Given an edge weighted graph, the maximum edge-weight connected graph (MECG) is a connected subgraph with a given number of edges and the maximal weight sum. Here we study a special case, i.e. the Constrained Maximum Edge-Weight Connected Graph problem (CMECG), which is an MECG whose candidate subgraphs must include a given set of k edges, then also called the k-CMECG. We formulate the k-CMECG into an integer linear programming model based on the network flow problem. The k-CMECG is proved to be NP-hard. For the special case 1-CMECG, we propose an exact algorithm and a heuristic algorithm respectively. We also propose a heuristic algorithm for the k-CMECG problem. Some simulations have been done to analyze the quality of these algorithms. Moreover, we show that the algorithm for 1-CMECG problem can lead to the solution of the general MECG problem. 展开更多
关键词 connected subgraph integer linear programming model network flow constraint steiner network maximum edge weight heuristic algorithm
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