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miR171家族保守性分析及其在香蕉叶片不同温度处理下的表达分析
被引量：
1
1
作者
周丽丽
屈蒙蒙
+4 位作者
蔡晓桐
徐小萍
张舒婷
赖钟雄
林玉玲
《园艺与种苗》
CAS
2018年第2期21-25,共5页
[目的]研究三明野生蕉和天宝栽培蕉在不同温度处理后mi R171家族成员在叶片中的表达情况,初步探索香蕉mi R171家族成员的抗寒机制。[方法]采用生物信息学分析和实时荧光定量PCR(q PCR)的方法,对香蕉中mi R171家族成员进行研究。[结果]...
[目的]研究三明野生蕉和天宝栽培蕉在不同温度处理后mi R171家族成员在叶片中的表达情况,初步探索香蕉mi R171家族成员的抗寒机制。[方法]采用生物信息学分析和实时荧光定量PCR(q PCR)的方法,对香蕉中mi R171家族成员进行研究。[结果]序列比对结果表明,mi R171前体与成熟体序列间有2个保守性较高的重叠区,推测mi R171成熟体可能来自这2个区域。实时荧光定量PCR结果表明,三明野生蕉的mi R171b的相对表达量在0℃时达到最高,而天宝栽培蕉mi R171b则在4℃处理时表达量达到最高;mi R171c和mi R171c*在野生蕉和天宝蕉中具有相似的表达模式,其表达量都在4℃达到最高。[结论]mi R171家族成员可能具有多重调节功能,其家族成员mi R171b,mi R172c和mi R171c*可能在香蕉冷胁迫中发挥重要作用。
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关键词
香蕉
mir171家族
温度处理
实时荧光定量PCR
下载PDF
职称材料
文心兰miR171家族成员鉴定、进化特性及在软腐病侵染过程中的表达
被引量：
1
2
作者
吴秋桢
林争春
+4 位作者
倪珊珊
张舒婷
张梓浩
林玉玲
赖钟雄
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期498-507,共10页
为了解植物miR171家族成员的进化特性及在文心兰侵染软腐病过程中的表达模式,运用生物信息学的方法,从miRbase数据库、文心兰转录组数据库中获取miR171家族48个物种268个前体序列和326个成熟体序列,进行植物学分类、构建进化树、预测二...
为了解植物miR171家族成员的进化特性及在文心兰侵染软腐病过程中的表达模式,运用生物信息学的方法,从miRbase数据库、文心兰转录组数据库中获取miR171家族48个物种268个前体序列和326个成熟体序列,进行植物学分类、构建进化树、预测二级结构、靶基因预测及实时荧光定量等手段,对文心兰miR171基因家族进行研究.生信分析结果显示:(1)植物miR171家族分布十分广泛,在不同物种间数量分布差异显著,苔藓植物可能是miR171家族进化的祖先,在禾本科植物中进化较完全;(2)系统进化树显示,物种的进化与植物miR171家族成员进化有一定的关系;(3)二级结构预测表明植物miR171家族成员均能形成典型的茎环结构,整体保守性较高,其最小折叠自由能在不同植物中差异显著.为验证以上推论,在文心兰侵染软腐病过程中分析miR171和其靶基因的表达量,结果表明pre-miR171在假鳞茎的相对表达量最高,是根相对表达量的12倍,在叶和根中表达量逐渐减少,且在假鳞茎中随着处理时间的延长,premiR171表达量先上升后下降,而靶基因的表达呈现出与之相反的趋势.本研究表明植物miR171家族成员表达具有时空特异性,且主要靶向GRAS基因家族发挥功能.(图8表3参40)
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关键词
mir171家族
进化规律
分子特性
文心兰
软腐病
原文传递
杨树MIR171基因家族进化与功能分化研究
被引量：
8
3
作者
刘志祥
曾超珍
+2 位作者
曾渭贤
徐刚标
谭晓风
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期313-319,共7页
MicroRN（miRNA）是一类重要的非编码小分子RNA，广泛参与植物生长发育和胁迫响应的调控。杨树MIR171基因家族是一个古老的miRNA基因家族，具有14个成员。本文对杨树MIR171基因家族的基因倍增模式、表达方式、启动子结构及靶基因进行了...
MicroRN（miRNA）是一类重要的非编码小分子RNA，广泛参与植物生长发育和胁迫响应的调控。杨树MIR171基因家族是一个古老的miRNA基因家族，具有14个成员。本文对杨树MIR171基因家族的基因倍增模式、表达方式、启动子结构及靶基因进行了分析。结果表明：杨树MIR171基因家族主要通过48-54百万年前的染色体大片段重复进行扩张，其表达方式和功能已经出现分化。MIR171基因家族可能主要通过调控GRAS转录因子和信号转导蛋白参与杨树生长发育、光信号转导和光形态建成的调控。
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关键词
杨树
MICRORNA
mir
171
基因
家族
进化
功能分化
原文传递
题名
miR171家族保守性分析及其在香蕉叶片不同温度处理下的表达分析
被引量：
1
1
作者
周丽丽
屈蒙蒙
蔡晓桐
徐小萍
张舒婷
赖钟雄
林玉玲
机构
福建农林大学园艺植物生物工程研究所
出处
《园艺与种苗》
CAS
2018年第2期21-25,共5页
基金
福建省大学生创新创业训练计划项目(201710389077)
文摘
[目的]研究三明野生蕉和天宝栽培蕉在不同温度处理后mi R171家族成员在叶片中的表达情况,初步探索香蕉mi R171家族成员的抗寒机制。[方法]采用生物信息学分析和实时荧光定量PCR(q PCR)的方法,对香蕉中mi R171家族成员进行研究。[结果]序列比对结果表明,mi R171前体与成熟体序列间有2个保守性较高的重叠区,推测mi R171成熟体可能来自这2个区域。实时荧光定量PCR结果表明,三明野生蕉的mi R171b的相对表达量在0℃时达到最高,而天宝栽培蕉mi R171b则在4℃处理时表达量达到最高;mi R171c和mi R171c*在野生蕉和天宝蕉中具有相似的表达模式,其表达量都在4℃达到最高。[结论]mi R171家族成员可能具有多重调节功能,其家族成员mi R171b,mi R172c和mi R171c*可能在香蕉冷胁迫中发挥重要作用。
关键词
香蕉
mir171家族
温度处理
实时荧光定量PCR
Keywords
Banana
mill
171
family
Temperature stress treatment
ileal-time quantitative PCR
分类号
Q812 [生物学—生物工程]
S667 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
文心兰miR171家族成员鉴定、进化特性及在软腐病侵染过程中的表达
被引量：
1
2
作者
吴秋桢
林争春
倪珊珊
张舒婷
张梓浩
林玉玲
赖钟雄
机构
福建农林大学园艺植物生物工程研究所
出处
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期498-507,共10页
基金
福建省重大农业科技专项(2015NZ0002-1)
福建农林大学科技创新基金项目(KF2015108,CXZX2018076)资助。
文摘
为了解植物miR171家族成员的进化特性及在文心兰侵染软腐病过程中的表达模式,运用生物信息学的方法,从miRbase数据库、文心兰转录组数据库中获取miR171家族48个物种268个前体序列和326个成熟体序列,进行植物学分类、构建进化树、预测二级结构、靶基因预测及实时荧光定量等手段,对文心兰miR171基因家族进行研究.生信分析结果显示:(1)植物miR171家族分布十分广泛,在不同物种间数量分布差异显著,苔藓植物可能是miR171家族进化的祖先,在禾本科植物中进化较完全;(2)系统进化树显示,物种的进化与植物miR171家族成员进化有一定的关系;(3)二级结构预测表明植物miR171家族成员均能形成典型的茎环结构,整体保守性较高,其最小折叠自由能在不同植物中差异显著.为验证以上推论,在文心兰侵染软腐病过程中分析miR171和其靶基因的表达量,结果表明pre-miR171在假鳞茎的相对表达量最高,是根相对表达量的12倍,在叶和根中表达量逐渐减少,且在假鳞茎中随着处理时间的延长,premiR171表达量先上升后下降,而靶基因的表达呈现出与之相反的趋势.本研究表明植物miR171家族成员表达具有时空特异性,且主要靶向GRAS基因家族发挥功能.(图8表3参40)
关键词
mir171家族
进化规律
分子特性
文心兰
软腐病
Keywords
mir
171
family
evolutionary regularity
molecular characteristics
Oncidium
soft rot
分类号
S436.8 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
杨树MIR171基因家族进化与功能分化研究
被引量：
8
3
作者
刘志祥
曾超珍
曾渭贤
徐刚标
谭晓风
机构
中南林业科技大学生命科学与技术学院
经济林育种与栽培国家林业局重点实验室
中南林业科技大学林学院
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期313-319,共7页
基金
湖南省自然科学基金项目(13JJ3095)
中南林业科技大学青年基金项目(QJ2011042B)
文摘
MicroRN（miRNA）是一类重要的非编码小分子RNA，广泛参与植物生长发育和胁迫响应的调控。杨树MIR171基因家族是一个古老的miRNA基因家族，具有14个成员。本文对杨树MIR171基因家族的基因倍增模式、表达方式、启动子结构及靶基因进行了分析。结果表明：杨树MIR171基因家族主要通过48-54百万年前的染色体大片段重复进行扩张，其表达方式和功能已经出现分化。MIR171基因家族可能主要通过调控GRAS转录因子和信号转导蛋白参与杨树生长发育、光信号转导和光形态建成的调控。
关键词
杨树
MICRORNA
mir
171
基因
家族
进化
功能分化
Keywords
Populus trichocarpa
microRNA
mir
171
gene family
evolution
function diversification
分类号
S792.11 [农业科学—林木遗传育种]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
miR171家族保守性分析及其在香蕉叶片不同温度处理下的表达分析
周丽丽
屈蒙蒙
蔡晓桐
徐小萍
张舒婷
赖钟雄
林玉玲
《园艺与种苗》
CAS
2018
1
下载PDF
职称材料
2
文心兰miR171家族成员鉴定、进化特性及在软腐病侵染过程中的表达
吴秋桢
林争春
倪珊珊
张舒婷
张梓浩
林玉玲
赖钟雄
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
原文传递
3
杨树MIR171基因家族进化与功能分化研究
刘志祥
曾超珍
曾渭贤
徐刚标
谭晓风
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
8
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