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基于SCAR标记和DNA条形码技术的苍术基原鉴别研究
1
作者
陈研
冯露露
+1 位作者
黄荣
齐伟辰
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2024年第2期490-501,共12页
目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR...
目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR、DAMD分子标记方法,优化PCR反应体系,筛选并转换成特异性标记,同时,采用条形码方法分析种间序列差异。结果通过SRAP、ISSR、DAMD三种分子标记方法的PCR扩增,共筛选出198对能稳定扩增且重现性好的引物,转换出7对能稳定、快速鉴别北苍术和关苍术的SCAR引物。条形码方法检测出北苍术ITS2序列长度为454 bp,关苍术ITS2序列长度为453 bp,与其他苍术属植物之间遗传距离较远。NJ树结果显示,北苍术、关苍术及其他苍术属植物均各自聚为一支,表现出良好的单系性。依据ITS2二级结构,4种苍术属植物在螺旋区的茎环数目、大小、位置均有明显差异,可以直观地进行区分。结论所开发的特异性SCAR标记为苍术属植物优良品种的筛选提供了新方法,DNA条形码能稳定、准确鉴别北苍术。
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关键词
北苍术
关苍术
Internal
transcribed
spacer
2(ITS2)
Sequence-related
amplified
polymorphism(SRAP)
Inter-simple
sequence
repeat(ISSR)
Direct
amplification
of
minisatellite
region
dna
(DAMD)
Sequence
characterized
amplified
regions(SCAR)
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职称材料
题名
基于SCAR标记和DNA条形码技术的苍术基原鉴别研究
1
作者
陈研
冯露露
黄荣
齐伟辰
机构
长春中医药大学药学院
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2024年第2期490-501,共12页
基金
2022年吉林省教育厅科学技术研究项目一般课题(JJKH20220874KJ):吉林省药材苍术分子鉴定研究,负责人:齐伟辰
2020年吉林省科技发展计划项目一般课题(20200708041YY):北苍术药材生产技术集成及规范化生产基地建设,负责人:齐伟辰。
文摘
目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR、DAMD分子标记方法,优化PCR反应体系,筛选并转换成特异性标记,同时,采用条形码方法分析种间序列差异。结果通过SRAP、ISSR、DAMD三种分子标记方法的PCR扩增,共筛选出198对能稳定扩增且重现性好的引物,转换出7对能稳定、快速鉴别北苍术和关苍术的SCAR引物。条形码方法检测出北苍术ITS2序列长度为454 bp,关苍术ITS2序列长度为453 bp,与其他苍术属植物之间遗传距离较远。NJ树结果显示,北苍术、关苍术及其他苍术属植物均各自聚为一支,表现出良好的单系性。依据ITS2二级结构,4种苍术属植物在螺旋区的茎环数目、大小、位置均有明显差异,可以直观地进行区分。结论所开发的特异性SCAR标记为苍术属植物优良品种的筛选提供了新方法,DNA条形码能稳定、准确鉴别北苍术。
关键词
北苍术
关苍术
Internal
transcribed
spacer
2(ITS2)
Sequence-related
amplified
polymorphism(SRAP)
Inter-simple
sequence
repeat(ISSR)
Direct
amplification
of
minisatellite
region
dna
(DAMD)
Sequence
characterized
amplified
regions(SCAR)
Keywords
Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz
Atractylodes japonica Koidz.ex Kitam
Internal transcribed spacer 2(ITS2)
Sequence-related amplified polymorphism(SRAP)
Inter-simple sequence repeat(ISSR)
Direct amplification
分类号
R-058 [医药卫生]
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题名
作者
出处
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1
基于SCAR标记和DNA条形码技术的苍术基原鉴别研究
陈研
冯露露
黄荣
齐伟辰
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2024
0
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