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Loss of chromosome 9p21 and decreased p16 expression correlate with malignant gastrointestinal stromal tumor 被引量:2
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作者 Yun Zhang Hui Cao +7 位作者 Ming Wang Wen-Yi Zhao Zhi-Yong Shen Dan-Ping Shen Xing-Zhi Ni Zhi-Yong Wu Yan-Ying Shen Yan-Yan Song 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2010年第37期4716-4724,共9页
AIM: To investigate loss of heterozygosity (LOH) of chromosome 9p21 and the prognostic relevance of p16 expression in gastrointestinal stromal tumor (GIST). METHODS: Fifty-one GIST patients (30 men and 21 women; media... AIM: To investigate loss of heterozygosity (LOH) of chromosome 9p21 and the prognostic relevance of p16 expression in gastrointestinal stromal tumor (GIST). METHODS: Fifty-one GIST patients (30 men and 21 women; median age 59 years; range 29-80 years) treated surgically within a 10-year period were grouped by aggressive behavior risk (17 with very low and low, 14 intermediate, and 20 high risk). GISTs were characterized immunohistochemically and evaluated for LOH of 9p21 by microsatellite analysis at D9S1751, D9S1846, D9S942, and D9S1748. LOH of 9p21 and immunohistochemicalexpression of p16 protein encoded at 9p21 were correlated with clinicopathological parameters, and the prognostic significance of p16 alterations was evaluated. RESULTS: Thirty-one (63.3%) cases showed LOH with at least one microsatellite marker. LOH frequency was 37.0% at D9S1751, 37.5% at D9S1846, 42.1% at D9S942, and 24.2% at D9S1748. There was a higher LOH frequency of D9S942 in high-risk than in non-highrisk tumors (P < 0.05, χ 2 = 4.47). Gender, age, tumor size and site were not correlated with allelic loss. Ninety percent (18/20) of the GIST patients in the high risk group showed LOH with at least one of the 9p21 markers, while 57.1% (8/14) in the intermediate risk group and 33.3% (5/15) in the very low and low risk groups, respectively (P < 0.05, χ 2 = 12.16). Eight (28.5%) of 31 patients with LOH and 1 (5.6%) of 18 patients without LOH died of the disease during the follow-up period. Loss of p16 protein expression occurred in 41.2%, but in 60% of the high risk group and 23.5% of the very low and low risk groups (P < 0.05, χ 2 = 4.98). p16 loss was associated with poor prognosis (P < 0.05, χ 2 = 4.18): the 3and 5-year overall survival rates were 84.8% and 70.8% for p16-negative and 100% and 92.0% for p16-positive patients, respectively. CONCLUSION: LOH at 9p21 appears to play an important role in GIST progression; decreased p16 expression in GIST is highly predictive of poor outcome. 展开更多
关键词 Gastrointestinal stromal tumor loss of heterozygosity p16 pROGNOSIS tumor suppressor gene
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Are there tumor suppressor genes on chromosome 4p in sporadic colorectal carcinoma?
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作者 Hai-Tao Zheng Li-Xin Jiang +5 位作者 Zhong-Chuan Lv Da-Peng Li Chong-Zhi Zhou Jian-Jun Gao Lin He Zhi-Hai Peng 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2008年第1期90-94,共5页
AIM: To study the candidate tumor suppressor genes (TSG) on chromosome 4p by detecting the high frequency of loss of heterozygosity (LOH) in sporadic colorectal carcinoma in Chinese patients.METHODS: Seven fluorescent... AIM: To study the candidate tumor suppressor genes (TSG) on chromosome 4p by detecting the high frequency of loss of heterozygosity (LOH) in sporadic colorectal carcinoma in Chinese patients.METHODS: Seven fluorescent labeled polymorphic microsatellite markers were analyzed in 83 cases of colorectal carcinoma and matched normal tissue DNA by PCR. PCR products were eletrophoresed on an ABI 377 DNA sequencer. Genescan 3.7 and Genotype 3.7 software were used for LOH scanning and analysis. The same procedure was performed by the other six microsatellite markers spanning D4S3013 locus to make further detailed deletion mapping. Comparison between LOH frequency and clinicopathological factors was performed by χ2 test.RESULTS: Data were collected from all informative loci. The average LOH frequency on 4p was 24.25%, and 42.3% and 35.62% on D4S405 and D4S3013 locus, respectively. Adjacent markers of D4S3013 displayed a low LOH frequency (< 30%) by detailed deletion mapping. Significant opposite difference was observed between LOH frequency and tumor diameter on D4S412 and D4S1546 locus (0% vs 16.67%, P = 0.041; 54.55% vs 11.11%, P = 0.034, respectively). On D4S403 locus, LOH was significantly associated with tumor gross pattern (11.11%, 0, 33.33%, P = 0.030). No relationship was detected on other loci compared with clinicopathologial features.CONCLUSION: By deletion mapping, two obvious high frequency LOH regions spanning D4S3013 (4p15.2) and D4S405 (4p14) locus are detected. Candidate TSG, which is involved in carcinogenesis and progression of sporadic colorectal carcinoma on chromosome 4p, may be located between D4S3017 and D4S2933 (about 1.7 cm). 展开更多
关键词 loss of heterozygosity Colorectal carcinoma Chromosome 4p tumor suppressor gene
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A preliminary study on the loss of heterozygosity at 17p13 in gastric and colorectal cancers 被引量:4
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作者 WU Guo Jun 1, SHAN Xiang Nian 2, LI Ming Fa 2, SHI Shao Lin 1, ZHENG Qi Ping 1, YU Long 1 and ZHAO Shou Yuan 1 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1997年第3期32-34,共3页
Apreliminarystudyonthelossofheterozygosityat17p13ingastricandcolorectalcancersWUGuoJun1,SHANXiangNian2,LIM... Apreliminarystudyonthelossofheterozygosityat17p13ingastricandcolorectalcancersWUGuoJun1,SHANXiangNian2,LIMingFa2,SHIShaoL... 展开更多
关键词 stomach NEOpLASMS COLORECTAL NEOpLASMS p53 gene heterozygosity loss genes suppressor tumor
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Detailed Deletion Mapping of Chromosome 9p21-22 in Nasopharyngeal Carcinoma
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作者 阳剑波 张晓梅 +6 位作者 邓龙文 谭国林 周鸣 曾朝阳 曹莉 沈守荣 李桂源 《Chinese Journal of Cancer Research》 SCIE CAS CSCD 2000年第3期8-11,共4页
Objective: To further refine the extent of deletion on chromosome 9p21-22 in nasopharyngeal carcinoma (NPC) and provide evidence for discovering new tumor suppressor gene. Methods: Loss of heterozygosity (LOH) on chro... Objective: To further refine the extent of deletion on chromosome 9p21-22 in nasopharyngeal carcinoma (NPC) and provide evidence for discovering new tumor suppressor gene. Methods: Loss of heterozygosity (LOH) on chromosome 9p21-22 was analyzed in 25 paired blood and tumor samples by using 11 high-density microsatellite polymorphic markers. Results: 17 of 25 cases (68.0%) showed LOH at one or more loci. Higher frequencies of LOH were found at four loci: D9S161 (35.0%), D9S1678 (31.5%), D9S263 (33.3%) and D9S1853 (33.3%), where 6 cases had a contiguous stretch of allelic loss. Conclusion: The minimal common region of deletion might be defined between D9S161 and D9S1853 (estimated about 2.7 cM in extent) at 9p21.1, suggesting that inactivation of one or more tumor suppressor genes located in this region may be an important step in NPC. 展开更多
关键词 Nasopharyngeal carcinoma Chromosome 9p21-22 loss of heterozygosity tumor suppressor gene
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瘤细胞纯度梯度体系及APC-LOH模型的建立和意义
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作者 吕良敬 陈志哲 +1 位作者 黄明清 张学敏 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 1997年第1期94-98,共5页
建立了一个瘤细胞标本纯度参照体系,以降低标本不纯对抑癌基因杂合性缺失(LOH)研究的影响。根据代表不同纯度的标本中两个等位基因的配比推算纯合子/杂合子DNA的构成比及掺入量,进而构建了瘤细胞模拟纯度梯度体系,并以APC基因的LOH分析... 建立了一个瘤细胞标本纯度参照体系,以降低标本不纯对抑癌基因杂合性缺失(LOH)研究的影响。根据代表不同纯度的标本中两个等位基因的配比推算纯合子/杂合子DNA的构成比及掺入量,进而构建了瘤细胞模拟纯度梯度体系,并以APC基因的LOH分析为例,在优化实验条件基础上建立了不同纯度瘤细胞的APC-LOH模型。结果表明,该APC-LOH检测系统至少能分析纯度低至60%的标本,优于其它文献提出的纯度要求(>70%)。结论是构建纯度梯度体系及抑癌基因LOH模型有利于提高及确定LOH检测系统的分辨能力。 展开更多
关键词 瘤细胞纯度梯度体系 杂合性缺失 肿瘤抑制基因 ApC基因 ApC-loh模型
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前列腺肿瘤高密度allelotype初步分析
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作者 王照明 黎永祥 +1 位作者 张建民 姚青 《实用癌症杂志》 2002年第2期148-150,共3页
目的 探讨原发性前列腺癌及高级别前列腺上皮内肿瘤 (PIN ) 2 2条常染色体等位基因杂合性缺失及其意义。方法采用显微切割技术提取前列腺癌及高级别前列腺上皮内肿瘤各 10例的DNA ,然后采用PCR及微卫星多态性技术 ,对 2 2条常染色体上... 目的 探讨原发性前列腺癌及高级别前列腺上皮内肿瘤 (PIN ) 2 2条常染色体等位基因杂合性缺失及其意义。方法采用显微切割技术提取前列腺癌及高级别前列腺上皮内肿瘤各 10例的DNA ,然后采用PCR及微卫星多态性技术 ,对 2 2条常染色体上的 382个微卫星标志位点进行高密度allelotype分析。 结果  10例原发性前列腺癌在染色体 1p、1q、2 p、2 q、6q、8p、8q、10q、11q、13q、16p、17p等部位存在高频杂合性缺失 (LOH ) ,前列腺上皮内肿瘤则在染色体 2 p、2q、6q、8p、10q、1q等区易检测到LOH。结论前列腺癌患者 2 q14、8p12~ 2 1、10 q2 3~ 2 4、13q14等区域存在高频的LOH ,位于这些区域的抑癌基因在前列腺癌发生。 展开更多
关键词 前列腺肿瘤 杂合性缺失 抑癌基因 aaelotype分
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人膀胱移行细胞癌染色体9p21.3-9p23杂合性缺失作图
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作者 张睿 张建军 +3 位作者 张自强 何祖根 程书钧 高燕宁 《实用癌症杂志》 2003年第1期1-5,共5页
目的 研究并确定人膀胱移行细胞癌染色体 9p2 1.3 -9p2 3区域杂合性缺失发生率和最小缺失区域 ,为寻找与克隆膀胱移行细胞癌相关的抑癌基因提供线索。方法 选取 7个微卫星多态性标记 (其中 6个位于 9p2 1.3 -9p2 3 ,另 1个位于 9q3 4... 目的 研究并确定人膀胱移行细胞癌染色体 9p2 1.3 -9p2 3区域杂合性缺失发生率和最小缺失区域 ,为寻找与克隆膀胱移行细胞癌相关的抑癌基因提供线索。方法 选取 7个微卫星多态性标记 (其中 6个位于 9p2 1.3 -9p2 3 ,另 1个位于 9q3 4作为对照 ) ,对 2 4例膀胱移行细胞癌组织及其对应的外周血淋巴细胞进行核素标记的聚合酶链反应和聚丙烯酰胺变性凝胶电泳。分析 9p2 1.3 -9p2 3区各微卫星位点杂合性缺失的发生情况及其与病理分期分级的关系。 结果  2 4例膀胱癌中的 2 0例 (83 .3 % )存在至少 1个微卫星位点的杂合性缺失。在 9p2 1.3 -9p2 3区域的 6个位点中 ,杂合性缺失率最高的为 9p2 3的D9S2 85 ,达66.7%(8/12 ) ;其次为 9p2 1的D9S1846,达 5 4.5 % (6/11)。位于 9q3 4.12的D9S182 1的杂合性缺失率为 5 4.5 % (6/11) ,而且在发生杂合性缺失的 6个病例中 ,有 5个被证明为部分染色体片段的缺失。结论 在 9p2 1.3 -9p2 3区域 ,可能至少存在 2个与膀胱移行细胞癌相关的候选抑癌基因 ,分别位于D 9S2 展开更多
关键词 胱移行细胞癌 杂合性缺失 抑癌基因
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肺癌癌前病变中的分子生物学异常事件 被引量:7
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作者 邵淑娟 汪洋 杨佩满 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第1期99-103,共5页
近二十年来,我国肺癌的发病率迅速上升,到目前为止,肺癌的发病率和死亡率已居肿瘤之首。早期诊断是提高肺癌5年生存率的关键。本文拟对肺癌发生中的早期遗传学事件加以概述,其中主要有p53的突变,p16启动子区的异常甲基化,3p、8p、9p、5... 近二十年来,我国肺癌的发病率迅速上升,到目前为止,肺癌的发病率和死亡率已居肿瘤之首。早期诊断是提高肺癌5年生存率的关键。本文拟对肺癌发生中的早期遗传学事件加以概述,其中主要有p53的突变,p16启动子区的异常甲基化,3p、8p、9p、5q的杂合性缺失等,以期寻找肺癌发生中的生物标记,为肺癌的诊断和治疗提供理论参考。 展开更多
关键词 肺癌 癌前病变 分子生物学异常事件 抑癌基因 杂合性缺失
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第17号染色体短臂杂合性缺失与肿瘤的研究进展
9
作者 傅晓艳 谭海栋 +1 位作者 李旭升 郑闪 《金华职业技术学院学报》 2002年第4期61-64,25,共5页
抑癌基因是人类正常细胞中所具有的一类基因,对细胞的增殖分化有调节作用。染色体体臂上某一区域非随机杂合性缺失导致抑癌基因的丧失,从而促使肿瘤发生。本文总结了第17号染色体短臂(17p)杂合性缺失与肿瘤发生关系的研究进展,该研究不... 抑癌基因是人类正常细胞中所具有的一类基因,对细胞的增殖分化有调节作用。染色体体臂上某一区域非随机杂合性缺失导致抑癌基因的丧失,从而促使肿瘤发生。本文总结了第17号染色体短臂(17p)杂合性缺失与肿瘤发生关系的研究进展,该研究不仅为我们定位新的抑癌基因提供了基础,为肿瘤的预防、早期发现和诊断提供了依据,同时也使我们能更好理解肿瘤的分子进展。 展开更多
关键词 染色体 短臂杂合性缺失 肿瘤 抑癌基因 细胞 非随机杂合性缺失 loh
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胶质母细胞瘤11号染色体杂合性丢失的研究
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作者 胡杰 江澄川 +2 位作者 吴浩强 彭颂先 唐婉君 《中国临床神经科学》 2002年第1期25-27,共3页
目的 :寻找胶质母细胞瘤 (GBM) 11号染色体上可能存在肿瘤抑制基因的杂合性丢失 (LOH)区域。方法 :应用聚合酶链反应方法 ,采用荧光标记的引物和ABIPRISMTM3 77型DNA序列自动分析仪 ,分析GBM 11号染色体上 18个微卫星多态性标记的LOH。... 目的 :寻找胶质母细胞瘤 (GBM) 11号染色体上可能存在肿瘤抑制基因的杂合性丢失 (LOH)区域。方法 :应用聚合酶链反应方法 ,采用荧光标记的引物和ABIPRISMTM3 77型DNA序列自动分析仪 ,分析GBM 11号染色体上 18个微卫星多态性标记的LOH。结果 :在 47 6%GBM 11号染色体上观察到LOH ,11p和 11q的LOH率分别为 42 9%和 2 3 8%。 11q上所有位点的LOH率都较低 (<3 0 % ) ,在 11p上的下列区域检测到较高的LOH率 :11p 15 5上的D11S40 46(3 3 3 % )位点、11p12 p13上的D11S90 5 (4 1 2 % ) D11S93 5(3 7 5 % )区域。结论 :在 11p 15 5上的D11S40 46位点、11p12 p13上的D11S90 5 D11S93 展开更多
关键词 杂合性丢失 胶质母细胞瘤 肿瘤抑制基因 11号染色体
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胶质母细胞瘤染色体10q杂合性缺失的初步研究
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作者 胡杰 江澄川 《中国临床神经科学》 2000年第2期86-88,共3页
目的:寻找胶质母细胞瘤10号染色体长臂(10q)上可能存在肿瘤抑制基因的杂合性缺失(LOH)区域,为发现和定位肿瘤抑制基因提供线索和依据。方法:应用聚合酶链反应(PCR)方法分析10例胶质母细胞瘤(GBM)染色体10... 目的:寻找胶质母细胞瘤10号染色体长臂(10q)上可能存在肿瘤抑制基因的杂合性缺失(LOH)区域,为发现和定位肿瘤抑制基因提供线索和依据。方法:应用聚合酶链反应(PCR)方法分析10例胶质母细胞瘤(GBM)染色体10q上9个微卫星多态性标记的LOH。结果:在90%(9/10例)肿瘤组织染色体10q上检出LOH。以在10q~(23)上的D10s2492-D10s541位点间和10q(25-26)上的D10s1723-D10s216位点间区域的LOH频率最高。结论:染色体10q~(23)上的D10s2492-D10s541位点间和10~q(25-26)上的D10sl723-D10s216位点间区域可能存在与GBM有关的多个肿瘤抑制基因。 展开更多
关键词 杂合性缺失 胶质母细胞瘤 10q染色体 GBM
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