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细菌sRNA来源、作用机制及调控网络研究进展
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作者 赵子墨 乔建军 +3 位作者 袁琳 龙映鹏 任书江 吴昊 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期290-297,共8页
通过发酵生产工业产品一直是细菌等微生物的研究热点,但是发酵过程中存在的代谢副产物和环境胁迫等问题,限制了工业菌株的发展。sRNA是细菌中普遍存在的一类调控性非编码RNA,它们与核糖开关、双组分系统、转录因子等其他调控元件共同构... 通过发酵生产工业产品一直是细菌等微生物的研究热点,但是发酵过程中存在的代谢副产物和环境胁迫等问题,限制了工业菌株的发展。sRNA是细菌中普遍存在的一类调控性非编码RNA,它们与核糖开关、双组分系统、转录因子等其他调控元件共同构成了细菌中的复杂调控网络,在代谢调控和抗胁迫中都发挥着异常重要的作用。文章对细菌中sRNA的来源、作用机制以及在调控网络中的角色进行了详细总结,有助于更好地解析细菌的代谢途径及发酵过程中受到的环境限制,对构建低毒力、高鲁棒性菌株,助力工业产品的发酵生产有重要参考意义。 展开更多
关键词 srna 非编码小RNA 机制 代谢 调控网络
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溶藻弧菌细胞密度相关sRNA的鉴定及其对毒力的调控作用
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作者 李莹 李印可 +5 位作者 周欣 李莹玉 杨文娟 王浩 何佩云 刘欢 《陕西科技大学学报》 北大核心 2023年第1期52-58,共7页
溶藻弧菌作为四大致病弧菌之一,可引起鱼虾的系统性疾病以及人类肠道和创伤性伤口感染,其毒力因子的表达及致病性与细胞密度紧密相关.sRNA是存在于细菌中的非编码小RNA,作为转录后调控因子广泛参与细菌的毒力、环境应激、生长代谢等过程... 溶藻弧菌作为四大致病弧菌之一,可引起鱼虾的系统性疾病以及人类肠道和创伤性伤口感染,其毒力因子的表达及致病性与细胞密度紧密相关.sRNA是存在于细菌中的非编码小RNA,作为转录后调控因子广泛参与细菌的毒力、环境应激、生长代谢等过程.利用转录组测序等手段,在溶藻弧菌中筛选出了显著差异表达的细胞密度相关非编码RNA分子,sRNA0087,并对其二级结构以及靶标mRNA进行预测.通过构建其突变株及回补株,探究了sRNA0087对溶藻弧菌毒力因子的调控作用.实验结果表明,溶藻弧菌在高细胞密度(9 h)相较于低细胞密度共有82个差异表达sRNA,其中47个表达上调,35个表达下调.sRNA0087下调水平最为显著,具有典型RNA二级结构,包含4个茎环结构以及3’端poly(U)结构,其在溶藻弧菌基因组中存在多个潜在靶标mRNA分子.成功构建Δ0087缺失株和0087^(+)回补株,sRNA0087对溶藻弧菌的运动性、生物被膜形成以及胞外蛋白酶的分泌具有显著的促进作用. 展开更多
关键词 溶藻弧菌 srna 毒力调控
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水生动物致病菌sRNA研究进展
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作者 王荃生 刘苏 +1 位作者 王朵 胡永华 《水产学杂志》 CAS 北大核心 2023年第5期125-130,共6页
细菌sRNA是一种长度为40~500个核苷酸的非编码的调控小RNA,是细菌重要的转录后调控因子,能迅速响应外界环境,帮助病原菌适应逆境条件和侵染宿主。目前哺乳动物病原菌s RNA已研究的较为深入,但水生动物致病菌s RNA的研究刚起步,亟待加强... 细菌sRNA是一种长度为40~500个核苷酸的非编码的调控小RNA,是细菌重要的转录后调控因子,能迅速响应外界环境,帮助病原菌适应逆境条件和侵染宿主。目前哺乳动物病原菌s RNA已研究的较为深入,但水生动物致病菌s RNA的研究刚起步,亟待加强。本文综述了s RNA调控基因表达的机制及其在水生动物重要致病菌如溶藻弧菌和杀鱼爱德华氏菌等的研究进展,以期为s RNA参与水产致病菌毒力的研究提供思路。 展开更多
关键词 srna 调控 致病性 水生动物致病菌 弧菌 爱德华氏菌
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沙门氏菌sRNA RybB及伴侣蛋白Hfq对孔蛋白OmpW表达的调控作用
4
作者 令狐远凤 潘永 +3 位作者 杨阳 段世宇 张家莉 杨琦 《中国家禽》 北大核心 2023年第6期30-35,共6页
为探究sRNA RybB和伴侣蛋白Hfq对沙门氏菌孔蛋白OmpW表达的调控作用,研究利用λred同源重组系统构建ompW基因lacZ融合菌株,再通过P22噬菌体转导技术构建颜色指示菌株中rybB和hfq相关基因的单缺失株、双缺失株,通过β-半乳糖苷酶活性试验... 为探究sRNA RybB和伴侣蛋白Hfq对沙门氏菌孔蛋白OmpW表达的调控作用,研究利用λred同源重组系统构建ompW基因lacZ融合菌株,再通过P22噬菌体转导技术构建颜色指示菌株中rybB和hfq相关基因的单缺失株、双缺失株,通过β-半乳糖苷酶活性试验和qPCR分析,确定sRNA RybB及伴侣蛋白Hfq对孔蛋白OmpW表达的调控作用。结果显示:成功构建了颜色指示菌株ΔompW∶∶LacZ和相对应的基因缺失菌株;与标准株LT2相比,ΔhfqY25A、ΔhfqK56A、Δhfq65、Δhfq87基因使ompW蛋白表达水平极显著下调(P<0.01),具有正调控作用,而Δhfq72、Δhfq∶∶tet、ΔrybB、ΔrybBΔhfq∶∶tet基因使ompW蛋白表达水平极显著上调(P<0.01),具有负调控作用;与标准株LT2相比,缺失hfq定点突变和rybB对ompW基因具有负调控作用。研究表明,沙门氏菌伴侣蛋白Hfq及RybB对孔蛋白ompW基因的蛋白表达水平和转录水平产生不同程度的影响,初步阐明了伴侣蛋白Hfq、sRNA RybB和靶基因三者的内在关系,为沙门氏菌减毒活疫苗与新型抗菌药物研制的研究奠定基础。 展开更多
关键词 沙门氏菌 λ-Red同源重组系统 srna RybB 伴侣蛋白Hfq OmpW
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类鼻疽伯克霍尔德sRNA敲除株的构建及生物学功能初步评价
5
作者 宋心怡 厉安洋 +2 位作者 李艳梅 徐淑慧 夏乾峰 《海南医学院学报》 CAS 2023年第9期641-646,共6页
目的:构建类鼻疽伯克霍尔德菌(burkholderia pseudomallei,B. pseudomallei)sRNA基因敲除菌株,并对其生物学功能进行初步评价。方法:设计合成引物9sF/9sR、9xF/9xR、R1/F1,扩增sRNA基因上下游同源臂片段,通过酶切、连接和转化,将目的片... 目的:构建类鼻疽伯克霍尔德菌(burkholderia pseudomallei,B. pseudomallei)sRNA基因敲除菌株,并对其生物学功能进行初步评价。方法:设计合成引物9sF/9sR、9xF/9xR、R1/F1,扩增sRNA基因上下游同源臂片段,通过酶切、连接和转化,将目的片段克隆至质粒TPR-pK18mobSacB上,运用同源重组的方法获得类鼻疽伯克霍尔德菌sRNA敲除菌株。结果:类鼻疽伯克霍尔德菌敲除株△sRNA构建成功。与野生株HNBP001比较,△sRNA生长速度、泳动能力、生物被膜形成能力均下降,药敏结果无差异。结论:成功构建类鼻疽伯克霍尔德菌sRNA基因敲除株,为进一步研究sRNA在类鼻疽伯克霍尔德菌中的调控机制提供了基础。 展开更多
关键词 类鼻疽伯克霍尔德菌 srna 基因敲除
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Construction and biological characterization of Burkholderia pseudomallei sRNA gene deletion strain
6
作者 SONG Xin-yi LI An-yang +2 位作者 LI Yan-mei XU Shu-hui XIA Qian-feng 《Journal of Hainan Medical University》 CAS 2023年第9期1-6,共6页
Objective:Construction of Burkholderia pseudomallei(B.pseudomallei)sRNA knockout strains and observation of their biological function.Methods:Design 9sF/9sR,9xF/9xR and R1/F1 primers,which were used to amplify the hom... Objective:Construction of Burkholderia pseudomallei(B.pseudomallei)sRNA knockout strains and observation of their biological function.Methods:Design 9sF/9sR,9xF/9xR and R1/F1 primers,which were used to amplify the homologous arm fragment upstream and downstream of the sRNA gene,through enzyme cutting,ligation,and transformation,the sRNA gene was knocked out from the B.pseudomallei by homologous recombination method.Results:The sRNA mutant was successfully constructed.In comparison with wild strain HNBP001,the growth rate,motility and biofilm formation ofΔsRNA decreased,but the antibiotic sensitivity has no differences.Conclusion:The sRNA knockout strain of B.pseudomallei was successfully constructed,laying a foundation for further research on its mechanism of regulating B.pseudomallei. 展开更多
关键词 Burkholderia pseudomallei srna Gene knockout
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肠炎沙门氏菌sRNA伴侣蛋白Hfq表达与纯化 被引量:8
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作者 孟宪臣 孟霞 +3 位作者 聂佳佳 厚华艳 王勇祥 朱国强 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期1-4,19,共5页
利用pET原核表达系统和亲和层析表达纯化肠炎沙门氏菌sRNA伴侣蛋白Hfq。首先构建含靶基因hfq的重组表达质粒pET28a(+)-hfq,经PCR及双酶切鉴定构建正确,再将重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3),IPTG诱导目的基因高效表达。SDS-PAGE及Western ... 利用pET原核表达系统和亲和层析表达纯化肠炎沙门氏菌sRNA伴侣蛋白Hfq。首先构建含靶基因hfq的重组表达质粒pET28a(+)-hfq,经PCR及双酶切鉴定构建正确,再将重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3),IPTG诱导目的基因高效表达。SDS-PAGE及Western blot结果表明:Hfq在大肠杆菌中成功表达,蛋白分子质量约为16.6ku,且主要存在于上清中,以可溶形式表达。进一步对表达产物进行Ni 2+亲和层析纯化,获得纯度较高的融合蛋白,为研究Hfq蛋白与sRNA的相互作用以及sRNA的调控机制提供基础。 展开更多
关键词 肠炎沙门氏菌 Hfq蛋白 srna 表达 纯化
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细菌sRNA基因及其靶标预测研究进展 被引量:7
8
作者 王立贵 赵雅琳 李伍举 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期1-5,共5页
细菌sRNA是一类长度在40-500 nt之间的非编码RNA,主要以不完全碱基配对方式与靶标mRNA5′端相互作用进而发挥其生物学功能。鉴于预测方法可以为细菌sRNA及其靶标的实验发现提供指导,因此,细菌sRNA与靶标预测研究受到了广泛重视。文... 细菌sRNA是一类长度在40-500 nt之间的非编码RNA,主要以不完全碱基配对方式与靶标mRNA5′端相互作用进而发挥其生物学功能。鉴于预测方法可以为细菌sRNA及其靶标的实验发现提供指导,因此,细菌sRNA与靶标预测研究受到了广泛重视。文章首先将sRNA预测方法分为3类,分别是基于比较基因组学的预测方法、基于转录单元的预测方法和基于机器学习的预测方法;其次,将sRNA靶标预测方法分为2类,分别是序列比较方法与基于RNA二级结构的预测方法;最后对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析,并探讨了进一步的发展方向。 展开更多
关键词 srna 预测 靶标 细菌
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西方蜜蜂(Apis mellifera L.)sRNA的富集与文库检测 被引量:2
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作者 陈璇 俞晓敏 +2 位作者 郑火青 蔡亦梅 胡福良 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期2943-2948,共6页
【目的】提取及扩增蜜蜂(Apis mellifera L)sRNA,并构建文库检测富集结果是否满足高通量测序研究要求。【方法】取蜜蜂3个级型不同发育阶段个体作为材料,分别提取总RNA后混合,从中分离出15~40nt的sRNA,反转成cDNA后构建文库,进行蓝白... 【目的】提取及扩增蜜蜂(Apis mellifera L)sRNA,并构建文库检测富集结果是否满足高通量测序研究要求。【方法】取蜜蜂3个级型不同发育阶段个体作为材料,分别提取总RNA后混合,从中分离出15~40nt的sRNA,反转成cDNA后构建文库,进行蓝白斑筛选。挑选288个单克隆进行测序,对测序结果进行分析。【结果】有效序列为214条,插入的cDNA片段大小范围为15~39bp。其中,sme-miR-71c miRNA65条,ncRNA(包括tm-RNA、intron_ghI、5.8s rRNA)5条,tRNA28条,siRNA及其他sRNA33条,CDS1条,未知序列82条。【结论】本实验采用的方法能有效富集蜜蜂sRNA,能够满足高通量测序从中识别出蜜蜂miRNA的研究。 展开更多
关键词 西方蜜蜂(Apis MELLIFERA L.) srna富集 miRNA文库 直接克隆法 高通量测序
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伤寒沙门菌sRNA S2959增强细菌动力和生物膜形成能力 被引量:4
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作者 陆仁飞 孙嘉瑶 黄新祥 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2018年第10期774-778,共5页
目的研究伤寒沙门菌小RNA(sRNA) S2959对细菌动力以及生物膜形成能力的影响。方法利用Red重组系统制备伤寒沙门菌sRNA S2959缺陷株(△S2959),同时制备sRNA S2959缺陷株的空载体株(△S2959-pBAD)和回补株(△S2959-p S2959)等相关菌株。通... 目的研究伤寒沙门菌小RNA(sRNA) S2959对细菌动力以及生物膜形成能力的影响。方法利用Red重组系统制备伤寒沙门菌sRNA S2959缺陷株(△S2959),同时制备sRNA S2959缺陷株的空载体株(△S2959-pBAD)和回补株(△S2959-p S2959)等相关菌株。通过sRNA S2959缺陷株和野生株的生长曲线实验观察sRNA S2959缺失后对细菌生长的影响;通过细菌sRNA S2959缺陷株、空载体株、回补株的泳动能力实验和生物膜实验观察sRNA S2959对细菌动力以及生物膜形成能力的影响;再用定量PCR(q PCR)方法检测细菌鞭毛相关基因在sRNA S2959相关菌株中的表达水平。结果成功制备sRNA S2959缺陷株和回补株; sRNA S2959缺陷株和野生株在LB和TSB液体培养基中的生长曲线无明显差异;与野生株相比,sRNA S2959缺陷株的泳动能力和生物膜形成能力下调(P<0.05),而回补株的泳动能力和生物膜形成能力较缺陷株显著增加(P<0.05); q PCR结果显示,高表达sRNA S2959后,细菌鞭毛相关基因(flh D、fli A和flj B)的mRNA水平分别上调大约4、3和6倍。结论伤寒沙门菌sRNA S2959促进鞭毛的表达,进一步上调伤寒沙门菌动力以及生物膜的形成能力。 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 srna 动力 生物膜
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木薯sRNA测序分析及其开花相关microRNA的挖掘 被引量:2
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作者 丛汉卿 龙娅丽 +2 位作者 王荣香 孙化鹏 乔飞 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2018年第12期2427-2435,共9页
为研究木薯花序与叶片中sRNA表达特性,探索microRNA对其开花过程的调控。本研究以木薯品种"华南八号"花序和幼叶为材料,利用RNA-seq技术进行sRNA测序分析;并筛选开花相关microRNAs进行表达特性分析。从花序和幼叶测序结果中... 为研究木薯花序与叶片中sRNA表达特性,探索microRNA对其开花过程的调控。本研究以木薯品种"华南八号"花序和幼叶为材料,利用RNA-seq技术进行sRNA测序分析;并筛选开花相关microRNAs进行表达特性分析。从花序和幼叶测序结果中分别获得12 092 109条和11 499 655条sRNA序列。花序中筛选出139条已知microRNAs和253条新预测microRNA,分别预测得到992和3736条靶基因;幼叶中筛选出134条已知microRNA和191条新预测microRNAs,分别预测得到979和2 603条靶基因。最终筛选出8种与开花调控相关和3种花色调控相关的microRNAs。表达分析显示,miRNAs在两样品间呈现出较大的整体性差异,并且在功能与代谢通路上也不尽相同;开花相关microRNAs中表达差异较大的为miR156、miR172和miR169,其中miR156表达量在花序中高于幼叶,而miR172表达量在花序中低于幼叶,推测其功能为抑制后续的开花过程,避免过度开花。本研究分析了木薯花序与幼叶中sRNA的整体特性,通过表达差异分析初步明确了microRNAs对木薯开花的调控,为进一步深入探索奠定了基础。 展开更多
关键词 木薯 srna MICRORNA 开花 表达特性
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空气-SRNA-4催化剂磁流化床动力学研究 被引量:3
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作者 赵亚南 何晨晨 +2 位作者 张恺 范秀凯 曹长青 《青岛科技大学学报(自然科学版)》 CAS 2010年第5期480-484,共5页
在内径和高分别为140mm和1600 mm气固磁流化床反应器内,分别以空气和SRNA-4催化剂(平均粒径50μm)为气相和固相,采用不同外加磁场强度对磁流化床动力学进行了研究。应用计算流体力学软件FLUENT 6.2对磁流化床内局部固含率和床层压降进... 在内径和高分别为140mm和1600 mm气固磁流化床反应器内,分别以空气和SRNA-4催化剂(平均粒径50μm)为气相和固相,采用不同外加磁场强度对磁流化床动力学进行了研究。应用计算流体力学软件FLUENT 6.2对磁流化床内局部固含率和床层压降进行了模拟计算。模拟结果显示:无磁场作用时,随表观气速增加,床层界面变化剧烈,床内局部固含率的分布极不均匀,床层压降升高。随着磁场强度增加,气泡的数目和尺寸减小,床中局部固含率增大,且分布变得较均匀,床层压降呈现下降趋势。模拟结果与实验数据吻合良好。 展开更多
关键词 srna-4 磁流化床 磁场强度 模拟
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常规培养与缺氧条件下BCG菌体内外sRNA的表达检测 被引量:1
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作者 韩雪 顾伟 +4 位作者 李婷 范云帆 张文莉 赵吉子 付英梅 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2021年第2期60-66,共7页
近期发现细菌的sRNA在菌体内和菌体外均具有一定的生物学功能。为研究结核分枝杆菌菌体内外sRNA的表达情况,通过分析卡介苗(Bacillus Calmette-Guerin Vaccine,BCG)菌体和外泌体RNA测序结果,采用RT-qPCR法检测常规培养与缺氧条件下BCG... 近期发现细菌的sRNA在菌体内和菌体外均具有一定的生物学功能。为研究结核分枝杆菌菌体内外sRNA的表达情况,通过分析卡介苗(Bacillus Calmette-Guerin Vaccine,BCG)菌体和外泌体RNA测序结果,采用RT-qPCR法检测常规培养与缺氧条件下BCG菌体内外sRNA相对表达量,分析菌体内外sRNA谱的差异。结果显示,常规培养时,菌体内丰度较高的sRNA为MTS2823、MTS1338与ASdes,菌体外丰度较高的为Mcr3、MTS2823和AS1890。菌体内受缺氧诱导表达增加的是MTS2823、MTS1338、MTS0997和G2。其中MTS1338与G2的启动子区发现了DosR的结合基序。无论是否缺氧,MTS0997、G2、Mcr7和AS1890在菌体外的相对表达量均高于菌体内,而C8只在缺氧时菌体外表达增高。研究揭示了BCG菌体内外sRNA表达谱不同,且一部分sRNA在常规培养和缺氧应激时向菌体外释放,同时发现了细菌受缺氧诱导的sRNA种类。 展开更多
关键词 卡介苗(BCG) 细胞外RNA 细菌srna 缺氧 RT-QPCR
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布鲁菌sRNA研究进展 被引量:1
14
作者 董浩 彭小薇 +6 位作者 赵柏林 孙雨 曲萍 王晓英 胡冬梅 石慧 宋晓晖 《动物医学进展》 北大核心 2016年第8期91-94,共4页
布鲁菌病是一种危害严重的人兽共患病,威胁着畜牧业的发展和人类的公共卫生安全。作为布鲁菌病的病原,布鲁菌能够耐受宿主体内的各种杀菌机制并持续的生存。细菌的sRNA在基因组中被转录,但绝大多数sRNA并不编码蛋白质。sRNA通过碱基配对... 布鲁菌病是一种危害严重的人兽共患病,威胁着畜牧业的发展和人类的公共卫生安全。作为布鲁菌病的病原,布鲁菌能够耐受宿主体内的各种杀菌机制并持续的生存。细菌的sRNA在基因组中被转录,但绝大多数sRNA并不编码蛋白质。sRNA通过碱基配对与mRNA结合,影响mRNA的稳定性或翻译,从而调控细菌代谢、群体感应、环境应激及细菌毒力基因表达等生物过程。通过sRNA调控毒力相关基因表达,使布鲁菌可以耐受多种胞内应激环境。目前为止,仅有少数布鲁菌sRNA的功能得到了较全面的研究,论文对这些sRNA的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 布鲁菌 srna 基因表达 毒力基因
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NRSE/RE-1 dsRNA诱导小鼠胚胎干细胞分化为NSE阳性的神经元样细胞 被引量:1
15
作者 李宏图 顾文佳 +2 位作者 孟凡彪 马兰兰 庞希宁 《生命科学研究》 CAS CSCD 2009年第6期477-481,共5页
应用电打孔的方法将化学合成的NRSE/RE-1d sRNA转染小鼠胚胎干细胞,在去除LIF的条件下,直接接种培养,观察其分化情况,并对分化结果进行相关检测.结果显示分化细胞呈明显的神经样改变,免疫荧光显示NSE阳性率为(82.3±8.1)%.说明通过... 应用电打孔的方法将化学合成的NRSE/RE-1d sRNA转染小鼠胚胎干细胞,在去除LIF的条件下,直接接种培养,观察其分化情况,并对分化结果进行相关检测.结果显示分化细胞呈明显的神经样改变,免疫荧光显示NSE阳性率为(82.3±8.1)%.说明通过转染NRSE/RE-1d sRNA能有效地诱导小鼠胚胎干细胞向神经元细胞分化. 展开更多
关键词 胚胎干细胞 NRSE/RE-1d srna 诱导分化 神经元样细胞
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大鼠45SRNAs的cDNA克隆与序列分析 被引量:2
16
作者 徐来祥 马建章 汪永庆 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期24-28,共5页
利用RT PCR方法 ,首次从大鼠肝脏细胞总RNA中扩增出 4 .5SRNAs的cDNA。该cDNA被克隆到pGEM3Zf( +)质粒上 ,经酶切电泳鉴定 ,然后测序。与报道的小鼠和仓鼠 4 .5SRNAs序列进行了比较研究 。
关键词 大鼠 4.5srnas RT-PCR
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sRNA STnc1220基因缺失株对鼠伤寒沙门菌生物学特性和致病力的影响
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作者 李娜 宁程程 +6 位作者 郭蕴 季春辉 王立霞 张亚萍 孟庆玲 乔军 才学鹏 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期188-194,共7页
为探究鼠伤寒沙门菌sRNA STnc1220的分子特征、生物学功能及对细菌毒力的影响,通过PCR扩增了鼠伤寒沙门菌sRNA STnc1220基因,分析了其分子特征,利用TargetRNA2网站预测STnc1220基因可能调控的靶基因;利用λ-Red同源重组技术构建沙门菌(S... 为探究鼠伤寒沙门菌sRNA STnc1220的分子特征、生物学功能及对细菌毒力的影响,通过PCR扩增了鼠伤寒沙门菌sRNA STnc1220基因,分析了其分子特征,利用TargetRNA2网站预测STnc1220基因可能调控的靶基因;利用λ-Red同源重组技术构建沙门菌(STM)-基因缺失突变株,并与亲本SL1344比较,对其生长特性、生化特性、遗传稳定性、生物被膜(BF)形成能力、在不同应激环境中(pH值、H_(2)O_(2)、高盐和乙醇胁迫环境)的适应性、通过黏附侵染巨噬细胞和小鼠感染试验对致病力进行研究。结果显示,STnc1220基因全长73 bp、其上游5′-UTR存在-10和-35启动子结合位点,预测其潜在的靶基因为barA基因;试验成功构建缺失株STM-ΔSTnc1220,且具有良好的遗传稳定性;与SL1344亲本株相比,缺失株的生长速度、生化特性及生物被膜形成能力没有发生改变;在pH=4.8,pH=9和H_(2)O_(2)条件下生长速率差异不显著,但在4%NaCl环境下,缺失株在7 h后生长速率明显高于亲本株,在3.8%乙醇环境中缺失株在对数期的生长速率显著升高(P<0.05);其对巨噬细胞中黏附和侵袭能力极显著降低(P<0.01),小鼠LD_(50)显著升高,对小鼠的肝脏和脾脏的病理损伤致病力减弱。表明STnc1220基因在环境适应性和毒力调控中发挥了重要的作用。为阐明鼠伤寒沙门菌的致病机制提供理论依据。 展开更多
关键词 鼠伤寒沙门菌 srna STnc1220 生物学特性 毒力
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单核细胞增生李斯特菌sRNA伴侣分子hfq的基因克隆、表达及纯化
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作者 彭叶龙 乔军 +6 位作者 孟庆玲 谢堃 陈诚 刘田莉 马玉 才学鹏 陈创夫 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期80-84,共5页
为克隆、表达单核细胞增生李斯特菌sRNA分子伴侣蛋白hfq基因,并纯化重组蛋白,通过PCR的方法从单核细胞增生李斯特菌基因组DNA中扩增出hfq基因,将扩增产物克隆于pMD18-T载体中,测序验证后,再将hfq基因亚克隆至表达载体pET-32a(+)中,成功... 为克隆、表达单核细胞增生李斯特菌sRNA分子伴侣蛋白hfq基因,并纯化重组蛋白,通过PCR的方法从单核细胞增生李斯特菌基因组DNA中扩增出hfq基因,将扩增产物克隆于pMD18-T载体中,测序验证后,再将hfq基因亚克隆至表达载体pET-32a(+)中,成功构建pET-32a(+)-hfq原核表达载体。然后,转化至大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞中,通过IPTG进行诱导表达,对表达蛋白进行可溶性分析,并采用Ni-NTA纯化目的蛋白。结果显示:克隆的hfq基因全长234 bp,编码77个氨基酸,通过SDS-PAGE可以检测到27 kDa的蛋白特异性条带;并从上清中纯化得到了Hfq融合蛋白。为进一步研究该蛋白的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌 hfq基因 srna伴侣分子 克隆 表达 纯化
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犬贾第虫核糖体16sRNA部分序列克隆及测定
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作者 秦睿玲 张西臣 +1 位作者 田宗成 李建华 《热带医学杂志》 CAS 2002年第4期324-326,共3页
目的 获取犬贾第虫核糖体 16sRNA基因序列。方法 从犬贾第虫包囊中 ,快速提取DNA ,并以DNA为模板 ,利用热启动PCR技术扩增出一 6 11bp的预计大小的基因片段 ,纯化回收后 ,与PMD18 T载体连接转化到DH5a大肠杆菌中 ,筛选到阳性克隆经PCR... 目的 获取犬贾第虫核糖体 16sRNA基因序列。方法 从犬贾第虫包囊中 ,快速提取DNA ,并以DNA为模板 ,利用热启动PCR技术扩增出一 6 11bp的预计大小的基因片段 ,纯化回收后 ,与PMD18 T载体连接转化到DH5a大肠杆菌中 ,筛选到阳性克隆经PCR、EcoRⅠ和HindⅢ双酶切鉴定 ,并用双脱氧链末端终止法测定DNA序列 ,登陆BLAST进行同源性比较和分析。结果 获得了长度为 6 11bp的基因序列 ,并发现与犬贾第虫核糖体的同源性最高达 99%。结论 获得了犬贾第虫核糖体 16sRNA的部分基因序列 ,为研究其在核酸进化领域中的地位和PCR法快速诊断贾第虫病提供了理想的基因材料。 展开更多
关键词 核糖体 测定 犬贾第虫 16srna 克隆
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超分辨显微技术结合smFISH方法在E.coli sRNA SgrS定位中的应用
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作者 王净 阮崇美 +2 位作者 白园园 韩延平 杨瑞馥 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2019年第4期415-422,共8页
细菌调节小RNA通常与靶mRNA结合,影响翻译和mRNA降解过程.了解细菌小RNA的定量和定位信息,将有助于揭示细菌转录后水平的调控机制.小RNA SgrS通过抑制ptsG mRNA翻译起始,参与细菌磷酸葡萄糖代谢的应激过程.本研究应用单分子荧光原位杂交... 细菌调节小RNA通常与靶mRNA结合,影响翻译和mRNA降解过程.了解细菌小RNA的定量和定位信息,将有助于揭示细菌转录后水平的调控机制.小RNA SgrS通过抑制ptsG mRNA翻译起始,参与细菌磷酸葡萄糖代谢的应激过程.本研究应用单分子荧光原位杂交(smFISH)方法和超分辨显微技术可视化定位大肠杆菌细胞内小RNA SgrS,并初步验证伴侣分子Hfq蛋白和RNaseE降解酶对小RNA SgrS定位的影响.选取大肠杆菌模式菌MG1655 (野生株)、sgrS敲除株(△sgrS)和过表达株(△sgrS-pBAD-SgrS),使用RNA印迹和smFISH方法验证SgrS的过表达.应用smFISH方法分别在野生菌株、hfq敲除株(△hfq)和rne敲除株(△rne-710)中定位小RNA SgrS和ptsG mRNA,超分辨成像观察.与野生株相比,△hfq和△rne-710中SgrS主要定位于近膜区域,ptsG mRNA定位于细菌胞浆中,并且这两种RNA拷贝数均极显著增加.以上结果表明,分别敲除大肠杆菌hfq和rne-710基因导致SgrS和ptsG mRNA的表达量增加. smFISH方法和超分辨技术的结合应用为细菌RNA的直观定量和定位提供了高敏感性的检测方法,可用于基因调控的功能研究. 展开更多
关键词 大肠杆菌 Northern BLOT smFISH 超分辨显微技术 srna SgrS HFQ RNASE E ptsG mRNA
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