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基于ATD-GC-MS技术检测铁观音做青过程环境挥发性成分的动态变化 被引量：4
1
作者 毕婉君 魏子淳 +5 位作者 郑玉成 邓慧莉 倪子鑫 林宏政 郝志龙 孙云 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第8期201-211,共11页
采用全自动热脱-气相色谱-质谱法捕集和检测铁观音做青关键工艺节点的环境挥发性成分,应用短时间序列表达挖掘器(short time-series expression miner,STEM)和偏最小二乘法判别分析(partial least squaresdiscriminant analysis,PLS-DA... 采用全自动热脱-气相色谱-质谱法捕集和检测铁观音做青关键工艺节点的环境挥发性成分,应用短时间序列表达挖掘器(short time-series expression miner,STEM)和偏最小二乘法判别分析(partial least squaresdiscriminant analysis,PLS-DA)对铁观音做青过程中挥发性成分进行分析。结果显示,铁观音做青环境中共鉴定出122种挥发性成分,包括醇类、酯类、烯烃类、烷烃类、醛类、芳香烃类、酮类和其他化合物8大类,其中酯类是做青环境中的主要挥发物;STEM结果表明,检测出的挥发性成分可划分成19种变化趋势,且在2种趋势模型中有显著性富集,其中仲丁醇、乙酸乙酯、异戊醛、异戊醇、正己醇、2-庚醇、己酸甲酯、甲基庚烯酮、异丁酸辛酯等挥发性成分带有特殊香气并随着做青次数的增加而显著增加;PLS-DA结果表明,摇青和晾青两部分可有效区分开,并鉴定出7种共同特征挥发性成分(变异权重参数值>1):(Z)-乙酸-4-己烯-1-酯、反-3-己烯基丁酯、叶醇、3-己烯醛、异戊腈、(3E)-4,8-二甲基壬-1,3,7-三烯、罗勒烯异构体混合物。由此可见,铁观音做青过程中环境挥发性成分类别的比例和所含物质都会随做青过程的推进有所变化,大部分挥发性成分呈现较为明显的规律性变化,其中筛选得到的7种特征挥发性成分呈现有规律的倍数变化,可作为判断智能化做青的香气指标。 展开更多
关键词 铁观音 做青 环境挥发性成分 全自动热脱-气相色谱-质谱法 短时间序列表达挖掘器 偏最小二乘法判别分析
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基于GSEA和STEM分析方法挖掘左归降糖解郁方治疗糖尿病并发抑郁症的作用机制
2
作者 雷诗卉 李薇 +4 位作者 王瑾茜 刘检 孟盼 王宇红 杨蕙 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第18期98-106,共9页
目的:结合基因集富集分析(GSEA)和趋势分析(STEM)方法研究左归降糖解郁方治疗糖尿病并发抑郁症的关键途径并进行验证。方法:将SD大鼠随机分为正常组、模型组、左归降糖解郁方高、中、低剂量组、西药组。采用高脂饲养、链脲佐菌素(STZ)... 目的:结合基因集富集分析(GSEA)和趋势分析(STEM)方法研究左归降糖解郁方治疗糖尿病并发抑郁症的关键途径并进行验证。方法:将SD大鼠随机分为正常组、模型组、左归降糖解郁方高、中、低剂量组、西药组。采用高脂饲养、链脲佐菌素(STZ)注射、慢性温和不可预知应激结合法建立糖尿病并发抑郁症模型。左归降糖解郁方高、中、低剂量组分别灌胃20.52、10.26、5.13 g·kg^(-1)左归降糖解郁方,西药组灌胃给药二甲双胍0.18 g·kg^(-1)和氟西汀1.8 g·kg^(-1)。正常组和模型组灌胃等体积蒸馏水。给药28 d后,采用强迫游泳实验和Morris水迷宫检测动物的抑郁样行为和认知功能,血糖试纸检测动物空腹血糖,酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测胆固醇和甘油三酯含量。随机选取正常组、模型组和左归降糖解郁方高剂量组中每组3个海马样本进行高通量转录组测序,采用差异基因分析、GSEA分析、STEM分析筛选左归降糖解郁方治疗糖尿病并发抑郁症的关键通路和基因。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)进行验证筛选靶基因,采用蛋白免疫印迹法(Western blot)检测靶基因介导的信号蛋白表达。结果:与正常组比较,模型组大鼠空腹血糖、胆固醇、甘油三酯含量显著升高(P<0.01),其在强迫游泳实验中的不动时间显著增加,在Morris水迷宫实验中登上平台的时间显著延长而在目标象限的搜寻路程比明显下降(P<0.05,P<0.01);与模型组比较,左归降糖解郁方高剂量显著降低了糖尿病并发抑郁症大鼠血糖、胆固醇、甘油三酯含量,减少了动物在强迫游泳实验中的不动时间,缩短了动物在Morris水迷宫实验中的登台时间并增加了在目标区域的搜寻路程比(P<0.05,P<0.01)。转录组测序差异分析显示,正常组较模型组有差异基因1 366个,模型组较左归降糖解郁方高剂量组有差异基因1 149个,交集基因581个。GSEA结果显示,正常组与模型组有差异基因集9个,模型组与左归降糖解郁方高剂量组有差异基因集43个,交集基因集7个。STEM分析显示,按照正常组、模型组、左归降糖解郁方高剂量组的分析顺序,得到显著差异趋势聚类群2个。3种分析方法获得关键基因集轴突导向及关键靶点信号素3c(Sema3c)、信号素7a(Sema7a)、轴突导向受体蛋白3(Robo3)、酪氨酸蛋白激酶受体A8(Epha8)、酪氨酸蛋白激酶受体A7(Epha7)。Real-time PCR验证发现,与正常组比较,模型组大鼠海马Robo3、Sema7a、Epha7 mRNA表达明显降低(P<0.05,P<0.01);与模型组比较,左归降糖解郁方高剂量可明显增加Robo3、Sema7a、Epha7 mRNA表达(P<0.05,P<0.01)。Western blot结果表明,与正常组比较,模型组大鼠海马Sema7a、整合素β_(1)(ITGB1)、黏着斑激酶(FAK)蛋白显著降低(P<0.01);与模型组比较,左归降糖解郁方显著增加糖尿病并发抑郁症大鼠海马Sema7a、ITGB1、FAK蛋白表达(P<0.05,P<0.01)。结论:左归降糖解郁方可能通过调控Sema7a/ITGB1信号经轴突导向途径治疗糖尿病并发抑郁症。 展开更多
关键词 左归降糖解郁方 糖尿病并发抑郁症 转录组测序 基因集富集分析 趋势分析
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奶牛与肉牛不同生长发育阶段肝脏转录组比较分析 被引量：1
3
作者 周乐 石彩霞 +4 位作者 常晨城 王宇 满达 高静 张文广 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期158-169,共12页
为探究奶牛与肉牛肝脏组织在不同生长发育阶段中的差异,利用RNA-seq技术和生物信息学的研究方法,分别对海福特肉牛与荷斯坦奶牛6、9和12月龄3个不同生长发育阶段的肝脏组织进行基因差异表达及表达趋势分析。结果表明:1)海福特肉牛与荷... 为探究奶牛与肉牛肝脏组织在不同生长发育阶段中的差异,利用RNA-seq技术和生物信息学的研究方法,分别对海福特肉牛与荷斯坦奶牛6、9和12月龄3个不同生长发育阶段的肝脏组织进行基因差异表达及表达趋势分析。结果表明:1)海福特肉牛与荷斯坦奶牛之间在6、9和12月龄分别获得的差异表达基因为699、486和769个;2)对海福特肉牛与荷斯坦奶牛之间的差异表达基因进行功能注释,发现细胞色素P450信号通路和PPAR信号通路中差异表达基因的表达量在肉牛与奶牛之间存在差异,并且在不同生长阶段表达也不同。其中与脂肪细胞增殖和脂质代谢有关的功能基因:ACOX1、APOA1和ACADM,与天然免疫相关的通路中BoLA-DQB、BLA-DQB和BoLA-DQA这3个基因在海福特肉牛中的表达均高于荷斯坦奶牛;3)STEM分析结果显示荷斯坦奶牛与海福特肉牛肝脏组织在生长发育阶段中具有相同表达趋势中,奶牛与肉牛的时序性表达基因与代谢途径相关信号通路上存在差异。综上,本研究表明与脂质代谢和脂肪生成等代谢过程有关的途径可能在协同调控奶牛与肉牛生长发育阶段中发挥的作用及表达模式存在差异,这为深入研究奶牛与肉牛在生长发育阶段中的比较提供了一定的基础数据。 展开更多
关键词 肝脏 奶牛 肉牛 短时序表达分析 生长发育
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