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新月弯孢霉转录组分析及甾体C_(11)β-羟化酶基因鉴定
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作者 明卓 宋士奎 苏正定 《生物技术》 CAS 2023年第5期537-543,共7页
[目的]分析新月弯孢霉转录组,对甾体C_(11)β-羟基化酶基因进行鉴定。[方法]结合生物信息学和蛋白结构学对转录组分析,利用AlphaFold2进行蛋白结构模拟,与已知人源醛固酮合酶hCYP11B 2进行结构比对。[结果]在转录组中,共获得24943条Unig... [目的]分析新月弯孢霉转录组,对甾体C_(11)β-羟基化酶基因进行鉴定。[方法]结合生物信息学和蛋白结构学对转录组分析,利用AlphaFold2进行蛋白结构模拟,与已知人源醛固酮合酶hCYP11B 2进行结构比对。[结果]在转录组中,共获得24943条Unigenes,平均长度1915 bp。18792条(75.34%)可以匹配到蛋白数据库获得注释信息。Unigenes在各数据库中注释的基因数分别为:在COG数据库中有5615条(22.51%),在GO数据库中有4424条(17.74%),在KEGG数据库中有6322条(25.35%),在Swiss-Prot数据库中有11348条(45.50%)。通过初筛获得39个基因。经过AlphaFold2的结构模拟,与人的甾体醛固酮合酶(hCYP11B2)结构比对进行复筛,共26条甾体C_(11)β-羟基化酶相关基因被鉴定出来。[结论]该新月弯孢霉菌株具有甾体C_(11)β-羟基化的能力,通过对其转录组进行分析,共鉴定出26条甾体C_(11)β-羟基化酶相关基因。 展开更多
关键词 新月弯孢霉 甾体c_(11)β-羟基化酶 转录组 结构比对 生物信息学分析
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