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模拟干旱对甘薯近缘野生种[Ipomoea trifida(Kunth) G. Don]生理特性和基因表达谱的影响
被引量:
2
1
作者
王娇
李雪华
+7 位作者
戴习彬
成小威
孙健英
唐君
周志林
赵冬兰
张安
曹清河
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期881-888,共8页
本文研究分析30%浓度的PEG-6000模拟干旱胁迫对甘薯二倍体近缘野生种(Ipomoea trifida)幼苗生理指标的影响,并在此基础上利用高通量测序技术,进行转录组测序和基因表达谱分析。结果表明:随着干旱胁迫时间的延长,叶片超氧化物歧化酶(...
本文研究分析30%浓度的PEG-6000模拟干旱胁迫对甘薯二倍体近缘野生种(Ipomoea trifida)幼苗生理指标的影响,并在此基础上利用高通量测序技术,进行转录组测序和基因表达谱分析。结果表明:随着干旱胁迫时间的延长,叶片超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)活性增强、丙二醛(MDA)含量增加。其中,SOD、POD活性和MDA含量在胁迫6 h变化显著;转录组测序共得到40 385 764条净数据和7 600 078 117 bp数据量,de novo组装产生了65 174条转录本,N50为1 638 bp。通过干旱处理(干旱胁迫6 h)和对照组(对照0和6 h)之间基因差异表达分析,共有1 763个基因差异表达,其中557个基因上调表达,1 206个基因下调表达,下调表达基因的数量明显高于上调基因。
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关键词
甘薯近缘种[Ipomoea
trifida
(
kunth
)
g
.don
]
干旱胁迫
转录组
生理特征
原文传递
题名
模拟干旱对甘薯近缘野生种[Ipomoea trifida(Kunth) G. Don]生理特性和基因表达谱的影响
被引量:
2
1
作者
王娇
李雪华
戴习彬
成小威
孙健英
唐君
周志林
赵冬兰
张安
曹清河
机构
江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室
江苏师范大学生命科学学院
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期881-888,共8页
基金
国家自然科学基金(31461143017和31371681)
国家甘薯产业技术体系资源评价岗(CARS 2017-11-B-02)
+1 种基金
江苏省自然科学基金(BK20141144)
国家农作物种质资源平台徐州甘薯子平台(NICGR-062)
文摘
本文研究分析30%浓度的PEG-6000模拟干旱胁迫对甘薯二倍体近缘野生种(Ipomoea trifida)幼苗生理指标的影响,并在此基础上利用高通量测序技术,进行转录组测序和基因表达谱分析。结果表明:随着干旱胁迫时间的延长,叶片超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)活性增强、丙二醛(MDA)含量增加。其中,SOD、POD活性和MDA含量在胁迫6 h变化显著;转录组测序共得到40 385 764条净数据和7 600 078 117 bp数据量,de novo组装产生了65 174条转录本,N50为1 638 bp。通过干旱处理(干旱胁迫6 h)和对照组(对照0和6 h)之间基因差异表达分析,共有1 763个基因差异表达,其中557个基因上调表达,1 206个基因下调表达,下调表达基因的数量明显高于上调基因。
关键词
甘薯近缘种[Ipomoea
trifida
(
kunth
)
g
.don
]
干旱胁迫
转录组
生理特征
Keywords
Ipomoea
trifida
(
kunth
)
g.
don
drou
g
ht stress
transcriptome
physiolo
g
ical characteristics
分类号
S531 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
模拟干旱对甘薯近缘野生种[Ipomoea trifida(Kunth) G. Don]生理特性和基因表达谱的影响
王娇
李雪华
戴习彬
成小威
孙健英
唐君
周志林
赵冬兰
张安
曹清河
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
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参考文献
引证文献
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