目的:基于网络药理学方法筛选固本平喘剂(补骨脂、地龙、防风)中的主要活性成分,探讨其治疗支气管哮喘的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库TCMSP数据库、中药与化学成分数据库,筛选固本平喘剂的活性成分及靶标。利用Genecards、O...目的:基于网络药理学方法筛选固本平喘剂(补骨脂、地龙、防风)中的主要活性成分,探讨其治疗支气管哮喘的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库TCMSP数据库、中药与化学成分数据库,筛选固本平喘剂的活性成分及靶标。利用Genecards、OMIM数据库获得支气管哮喘的潜在靶标基因。将两者靶基因进行映射后通过Cytoscape3.6.1软件构建“成分-靶标”网络、结合String数据库构建蛋白质相互作用网络扩充核心靶点。依托功能注释生物信息学分析平台DAVID数据库对固本平喘剂的作用靶点进行基因本体(gene ontology,GO)生物学过程和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集注释分析,通过Autodock vina软件进行分子对接以验证结果。结果:符合筛选条件的共有53个活性成分,补骨脂18个,地龙17个,防风18个,筛选得到固本平喘剂关键成分,包括补骨脂黄酮类、补骨脂查耳酮类、汉黄芩素、补骨脂酚、β-谷甾醇等;通过GenCards、OMIM数据库剔除重复后,共收集支气管哮喘潜在靶点2358个。将固本平喘剂和支气管哮喘靶点进行映射取交集共得到237个交叉靶点,即固本平喘剂治疗支气管哮喘潜在作用靶点。以degree值大于二倍均值的靶点为PTGS2、ESR1、ACHE、ESR2、PTGS1、DPP4、ADORA3,degree值排名前5的靶蛋白为PIK3CA、MAPK3、MAPK1、TP53、AKT1。主要涉及PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、趋化因子信号通路、FoxO信号通路、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路、T细胞受体信号通路等。结论:固本平喘剂治疗支气管哮喘潜在作用靶点有PTGS2、ESR1、ACHE、ESR2、PTGS1、DPP4、ADORA3、PIK3CA、MAPK3、MAPK1、TP53、AKT1,可能通过抗感染、调节免疫、抑制气道重塑等发挥作用。展开更多
文摘目的:基于网络药理学方法筛选固本平喘剂(补骨脂、地龙、防风)中的主要活性成分,探讨其治疗支气管哮喘的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库TCMSP数据库、中药与化学成分数据库,筛选固本平喘剂的活性成分及靶标。利用Genecards、OMIM数据库获得支气管哮喘的潜在靶标基因。将两者靶基因进行映射后通过Cytoscape3.6.1软件构建“成分-靶标”网络、结合String数据库构建蛋白质相互作用网络扩充核心靶点。依托功能注释生物信息学分析平台DAVID数据库对固本平喘剂的作用靶点进行基因本体(gene ontology,GO)生物学过程和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集注释分析,通过Autodock vina软件进行分子对接以验证结果。结果:符合筛选条件的共有53个活性成分,补骨脂18个,地龙17个,防风18个,筛选得到固本平喘剂关键成分,包括补骨脂黄酮类、补骨脂查耳酮类、汉黄芩素、补骨脂酚、β-谷甾醇等;通过GenCards、OMIM数据库剔除重复后,共收集支气管哮喘潜在靶点2358个。将固本平喘剂和支气管哮喘靶点进行映射取交集共得到237个交叉靶点,即固本平喘剂治疗支气管哮喘潜在作用靶点。以degree值大于二倍均值的靶点为PTGS2、ESR1、ACHE、ESR2、PTGS1、DPP4、ADORA3,degree值排名前5的靶蛋白为PIK3CA、MAPK3、MAPK1、TP53、AKT1。主要涉及PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、趋化因子信号通路、FoxO信号通路、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路、T细胞受体信号通路等。结论:固本平喘剂治疗支气管哮喘潜在作用靶点有PTGS2、ESR1、ACHE、ESR2、PTGS1、DPP4、ADORA3、PIK3CA、MAPK3、MAPK1、TP53、AKT1,可能通过抗感染、调节免疫、抑制气道重塑等发挥作用。
