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染色质免疫沉淀-测序:全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术
被引量:
5
1
作者
梁芳
徐柯
+5 位作者
龚朝建
李俏
马健
熊炜
曾朝阳
李桂源
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期216-227,共12页
染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结合,在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术.在新一代测序(NGS)技术的大力推动下,ChIP-seq...
染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结合,在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术.在新一代测序(NGS)技术的大力推动下,ChIP-seq提供了一种相对于ChIP-chip高分辨率、低噪音、高覆盖率的研究方法.随着测序成本的降低,ChIP-seq逐步成为研究基因调控和表观遗传机制的一种常用手段.本文就该技术的最近研究进展进行综述,并着重介绍ChIP-seq数据分析过程及该技术的实际应用情况.
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关键词
ChIP—seq
新一代测序技术
基因调控
表观遗传学
数据分析
原文传递
题名
染色质免疫沉淀-测序:全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术
被引量:
5
1
作者
梁芳
徐柯
龚朝建
李俏
马健
熊炜
曾朝阳
李桂源
机构
中南大学
肿瘤
研究
所
中南大学疾病基因组研究中心湖南省非可控性炎症与肿瘤重点实验室
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期216-227,共12页
基金
国家自然科学基金资助项目(81272298
30871282
+7 种基金
30871365
81172189
81171930)
湖南省自然科学基金(10JJ7003)
霍英东高校青年教师基金(121036)
中央高校基本科研业务费专项资金(2011JQ020)
中南大学米塔尔创新创业项目(11MX27)
中南大学贵重仪器设备开放共享基金资助项目~~
文摘
染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结合,在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术.在新一代测序(NGS)技术的大力推动下,ChIP-seq提供了一种相对于ChIP-chip高分辨率、低噪音、高覆盖率的研究方法.随着测序成本的降低,ChIP-seq逐步成为研究基因调控和表观遗传机制的一种常用手段.本文就该技术的最近研究进展进行综述,并着重介绍ChIP-seq数据分析过程及该技术的实际应用情况.
关键词
ChIP—seq
新一代测序技术
基因调控
表观遗传学
数据分析
Keywords
ChlP-seq
next generation sequencing
gene regulation
epigenetics
data analysis
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
Q81 [生物学—生物工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
染色质免疫沉淀-测序:全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术
梁芳
徐柯
龚朝建
李俏
马健
熊炜
曾朝阳
李桂源
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2013
5
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已选择
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