MicroRNA及其研究现状 被引量：1

1

作者 呼高伟 陈兆国 +1 位作者 程天印 许娟 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期167-171,共5页

MicroRNA（miRNA）是一类非编码的内源性小RNA分子，长度约20-25个核苷酸（nucleo-tides，nt），参与调控诸多基因的表达。miRNA的作用方式有2种：一种是通过与靶标基因mRNA的完全匹配结合，促使mRNA发生降解；另一种是通过不完全地与靶... MicroRNA（miRNA）是一类非编码的内源性小RNA分子，长度约20-25个核苷酸（nucleo-tides，nt），参与调控诸多基因的表达。miRNA的作用方式有2种：一种是通过与靶标基因mRNA的完全匹配结合，促使mRNA发生降解；另一种是通过不完全地与靶mRNA的3’非编码区（3’untrans- 展开更多

关键词 MICRORNA 基因MRNA 非编码区 RNA分子 miRNA 内源性 核苷酸 多基因

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微小隐孢子虫三个基因主要抗原表位区的串联表达及其抗原性分析 被引量：4

2

作者 秦培兰 李艳 +7 位作者 米荣升 呼高伟 黄燕 周鹏 张国恩 苏庆美 曹薇 陈兆国 《中国动物传染病学报》 CAS 2012年第3期36-43,共8页

应用多个抗原表位预测软件对微小隐孢子虫CP15、P23和CP15/60三个子孢子表面抗原的氨基酸序列进行T细胞表位预测及分析,从中选取了三个抗原表位富集的基因片段,利用重叠延伸PCR(gene splicing by overlapping extension PCR,SOE PCR)将... 应用多个抗原表位预测软件对微小隐孢子虫CP15、P23和CP15/60三个子孢子表面抗原的氨基酸序列进行T细胞表位预测及分析,从中选取了三个抗原表位富集的基因片段,利用重叠延伸PCR(gene splicing by overlapping extension PCR,SOE PCR)将该三个基因片段串联在一起,各基因片段之间以柔性氨基酸(GGGGS)碱基序列链接,得到的拼接片段命名为CpTm。将目的基因克隆到原核表达载体pET-28a(+)上,构建重组表达质粒pET-CpTm,并转化到大肠杆菌BL21(DE3)中进行诱导表达,将纯化的重组蛋白免疫BALB/c小鼠制备多克隆抗体。结果成功地构建了CpTm串联基因并在大肠杆菌中以可溶形式高效表达,质谱分析表明重组表达蛋白包含了上述三个抗原的氨基酸序列。Western blot分析显示该重组蛋白能被牛抗微小隐孢子虫阳性血清及隐孢子虫鼠基因型CP15、P23、CP15/60基因重组表达蛋白免疫兔血清识别,制备的抗血清能被重组蛋白特异性识别,表明表达的重组蛋白具有较好的反应原性和免疫原性,为多表位疫苗的研制奠定了基础。 展开更多

关键词 微小隐孢子虫 抗原表位 重叠延伸PCR 原核表达 抗原性

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猪源附红细胞体rnpB基因的克隆与序列比较 被引量：2

3

作者 王向佩 周鹏 +9 位作者 米荣升 沈莉萍 黄燕 王晓娟 杨晓娇 石凯 刘宇轩 雷晓思 陈兆国 赵权 《中国动物传染病学报》 CAS 2014年第3期26-33,共8页

为了解猪源附红细胞体（Mycoplasma spp.）RNA酶P RNA（RNase P RNA,rnpB）基因序列变异状况,将实验室保存的经16S rRNA基因序列分析鉴定的53份猪源附红细胞体阳性DNA样品用于rnpB基因的扩增,扩增产物克隆至pMD18-T载体并进行序列测定... 为了解猪源附红细胞体（Mycoplasma spp.）RNA酶P RNA（RNase P RNA,rnpB）基因序列变异状况,将实验室保存的经16S rRNA基因序列分析鉴定的53份猪源附红细胞体阳性DNA样品用于rnpB基因的扩增,扩增产物克隆至pMD18-T载体并进行序列测定。将获得的序列与GenBank登录的猪附红细胞体（Mycoplasma suis）德国分离株rnpB基因序列（登录号：EF523602）进行分析和比对,利用MEGA5.0软件构建系统发育树,并与16S rRNA判定结果进行比较。结果共得到42条猪附红细胞体rnpB基因和11条小附红细胞体（M.parvum）rnpB基因序列。猪附红细胞体上海分离株rnpB基因与GenBank登录的猪附红细胞体德国分离株rnpB基因之间的核苷酸序列相似性为98.1%～100.0%;小附红细胞体上海分离株rnpB基因与猪附红细胞体德国分离株rnpB基因序列的相似性为91.0%,与猪附红细胞体上海分离株rnpB基因序列相似性为90.0%～91.0%。系统进化分析显示猪附红细胞体rnpB基因与小附红细胞体rnpB基因分布在不同聚簇上,与16S rRNA基因序列鉴定结果一致。 展开更多

关键词 猪附红细胞体 小附红细胞体 rnpB 克隆 序列比较

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不同DNA提取方法对隐孢子虫卵囊PCR检测的影响 被引量：5

4

作者 陈兆国 米荣升 +6 位作者 周鹏 黄燕 张国恩 苏庆美 秦培兰 呼高伟 林矫矫 《中国动物传染病学报》 CAS 2011年第1期57-61,共5页

为了提高隐孢子虫PCR检测的敏感性和效率,采用10种基因组DNA提取方法,对隐孢子虫卵囊DNA进行提取,对提取的DNA进行nested PCR扩增。经过3次重复试验,结果显示,Chelex 100法、FTA试纸法和Wizard DNAClean-Up System试剂盒法敏感性最高,... 为了提高隐孢子虫PCR检测的敏感性和效率,采用10种基因组DNA提取方法,对隐孢子虫卵囊DNA进行提取,对提取的DNA进行nested PCR扩增。经过3次重复试验,结果显示,Chelex 100法、FTA试纸法和Wizard DNAClean-Up System试剂盒法敏感性最高,能够稳定地扩增出1×102个卵囊提取的DNA,适合隐孢子虫病分子流行病学调查时大量样品DNA的提取。 展开更多

关键词 隐孢子虫 DNA 提取

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隐孢子虫不同基因型P23基因的克隆及序列比较 被引量：4

5

作者 胡义彬 米荣升 陈兆国 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第12期14-18,共5页

为克隆隐孢子虫不同基因型子孢子表面抗原P23基因,比较其序列差异,提取上海地区分离的隐孢子虫鼠基因型(Cryptosporidiummouse genotype)、隐孢子虫兔基因型(Cryptosporidiumrabbit geno-type)、隐孢子虫猪基因型Ⅱ(Cryptosporidiumpig ... 为克隆隐孢子虫不同基因型子孢子表面抗原P23基因,比较其序列差异,提取上海地区分离的隐孢子虫鼠基因型(Cryptosporidiummouse genotype)、隐孢子虫兔基因型(Cryptosporidiumrabbit geno-type)、隐孢子虫猪基因型Ⅱ(Cryptosporidiumpig genotypeⅡ)总RNA,经RT-PCR扩增P23基因,克隆到pMD18-T载体中,进行序列测定,并与GenBank上下载的微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum)序列进行同源性比对。结果显示,从隐孢子虫3个基因型中均扩增出了P23基因。与微小隐孢子虫P23基因核苷酸序列比较,隐孢子虫鼠基因型、兔基因型、猪基因型ⅡP23基因同源性分别为97.6%、97.3%、97.3%,氨基酸序列同源性分别为97.3%、97.3%和96.4%。获得了隐孢子虫鼠基因型、兔基因型、猪基因型Ⅱ子孢子表面抗原P23基因。 展开更多

关键词 隐孢子虫 基因型 P23基因 克隆 序列比较

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猪附红细胞体MSG1基因的克隆及序列分析 被引量：2

6

作者 曹薇 周鹏 +7 位作者 米荣升 黄燕 秦培兰 杨晓娇 王向佩 王晓娟 石凯 陈兆国 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2013年第7期44-48,共5页

为研究猪附红细胞体MSG1基因的遗传变异特点,从上海地区3个屠宰场采集自然感染附红细胞体的猪血液,提取基因组DNA,根据GenBank已经发表的猪附红细胞体MSG1基因序列(登录号AM407404.1),设计引物进行PCR扩增,将扩增产物连接到pMD18-T载体... 为研究猪附红细胞体MSG1基因的遗传变异特点,从上海地区3个屠宰场采集自然感染附红细胞体的猪血液,提取基因组DNA,根据GenBank已经发表的猪附红细胞体MSG1基因序列(登录号AM407404.1),设计引物进行PCR扩增,将扩增产物连接到pMD18-T载体上,进行序列测定和分析。结果共获得了82条猪附红细胞体MSG1基因序列,序列长度为1 011bp,共编码336个氨基酸。同源性分析显示与GenBank中已经发表的猪附红细胞体MSG1基因核苷酸序列相似性为96.5%～98.3%,氨基酸的相似性为97.9%～99.1%。MSG1基因核苷酸序列的系统进化分析表明,上海地区猪附红细胞体分离株与GenBank登录的德国54/96分离株序列的亲缘关系较远。 展开更多

关键词 猪附红细胞体 MSG1基因 克隆 序列分析

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隐孢子虫P23基因的原核表达及间接ELISA检测方法的建立 被引量：1

7

作者 张国恩 米荣升 +6 位作者 苏庆美 黄燕 周鹏 胡义彬 秦培兰 呼高伟 陈兆国 《中国动物传染病学报》 CAS 2011年第2期43-50,共8页

将隐孢子虫鼠基因型(Cryptosporidium mouse genotype)P23基因亚克隆到pGEX-4T-1载体中,并用大肠杆菌BL21(DE3)为宿主菌诱导表达。以纯化的rP23为诊断抗原,建立隐孢子虫间接ELISA检测方法,观察其敏感性、特异性和重复性,并对临床血清样... 将隐孢子虫鼠基因型(Cryptosporidium mouse genotype)P23基因亚克隆到pGEX-4T-1载体中,并用大肠杆菌BL21(DE3)为宿主菌诱导表达。以纯化的rP23为诊断抗原,建立隐孢子虫间接ELISA检测方法,观察其敏感性、特异性和重复性,并对临床血清样品进行检测。结果隐孢子虫鼠基因型P23基因在大肠杆菌中获得了高效表达,Western blot检测显示rP23能被隐孢子虫感染兔血清识别。以纯化rP23为诊断抗原,成功地建立了检测兔隐孢子虫病的间接ELISA技术。对23份临床血清检测结果显示,该方法检出率高于Sheather's蔗糖漂浮法、套式PCR法。本研究结果为研制兔隐孢子虫病诊断试剂盒打下了基础。 展开更多

关键词 隐孢子虫鼠基因型 P23基因 原核表达 间接ELISA

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四种隐孢子虫半胱氨酸蛋白酶Cryptopain-1基因的克隆和序列分析 被引量：1

8

作者 王晓娟 米荣升 +8 位作者 周鹏 黄燕 王向佩 杨晓娇 石凯 刘宇轩 雷晓思 陈兆国 赵权 《中国动物传染病学报》 CAS 2014年第5期41-48,共8页

为克隆不同种隐孢子虫(Cryptosporidium spp.)的半胱氨酸蛋白酶Cryptopain-1基因,分析其核苷酸与编码氨基酸序列的变异情况,根据GenBank上公布的微小隐孢子虫(C.parvum)Cryptopain-1基因序列设计合成引物,用PCR技术从不同种隐孢子虫基因... 为克隆不同种隐孢子虫(Cryptosporidium spp.)的半胱氨酸蛋白酶Cryptopain-1基因,分析其核苷酸与编码氨基酸序列的变异情况,根据GenBank上公布的微小隐孢子虫(C.parvum)Cryptopain-1基因序列设计合成引物,用PCR技术从不同种隐孢子虫基因组DNA中扩增Cryptopain-1基因,并将其克隆至pZeroBack/blunt载体,阳性克隆经PCR鉴定正确后测序,与微小隐孢子虫Cryptopain-1基因进行序列同源性比对,并进行系统进化分析。结果显示,本研究成功从泰泽隐孢子虫(C.tyzzeri)、火鸡隐孢子虫(C.meleagridis)、兔隐孢子虫(C.cuniculus)基因组DNA中扩增出Cryptopain-1基因。与微小隐孢子虫Cryptopain-1基因比较,泰泽隐孢子虫、火鸡隐孢子虫、兔隐孢子虫Cryptopain-1基因核苷酸序列相似性分别为98.67%、94.53%、98.34%,演绎的氨基酸序列相似性分别为99.00%、96.51%、99.00%。研究结果为利用Cryptopain-1基因进行隐孢子虫的代谢、致病机理等研究奠定了基础。 展开更多

关键词 隐孢子虫 Cryptopain-1基因 克隆 序列分析

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微小隐孢子虫CP15-P23-CP15/60基因的融合表达及抗血清的制备

9

作者 秦培兰 米荣升 +6 位作者 黄燕 周鹏 张国恩 苏庆美 呼高伟 曹薇 陈兆国 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2012年第7期54-59,共6页

以微小隐孢子虫基因组DNA为模板,PCR扩增获得子孢子表面抗原CP15、P23和CP15/60基因。利用重叠延伸PCR(SOE PCR)将该3段基因片段串联在一起,各基因片段之间引入柔性氨基酸接头(GGGGS)编码基因。将串联基因克隆到原核表达载体pET-28a(+)... 以微小隐孢子虫基因组DNA为模板,PCR扩增获得子孢子表面抗原CP15、P23和CP15/60基因。利用重叠延伸PCR(SOE PCR)将该3段基因片段串联在一起,各基因片段之间引入柔性氨基酸接头(GGGGS)编码基因。将串联基因克隆到原核表达载体pET-28a(+)上,构建重组表达载体,转化到大肠埃希菌BL21(DE3)中进行诱导表达,将纯化的重组蛋白免疫Balb/c小鼠制备多克隆抗体。结果表明,获得了CP15-P23-CP15/60融合基因,并在大肠埃希菌中高效表达,Western blot显示重组蛋白能被牛抗微小隐孢子虫阳性血清识别,制备的多克隆抗体能被重组蛋白特异性识别,表明获得的重组蛋白具有较好的抗原性。 展开更多

关键词 微小隐孢子虫 CP15-P23-CP15/60融合基因 原核表达 重叠延伸PCR

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微小隐孢子虫P23基因在毕赤酵母中的表达及初步应用

10

作者 黄燕 米荣升 +6 位作者 周鹏 曹薇 杨晓娇 王向佩 王晓娟 石凯 陈兆国 《中国动物传染病学报》 CAS 2012年第6期56-62,共7页

为将微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum)P23基因在巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)系统中进行表达,利用表达蛋白初步建立隐孢子虫病间接ELISA诊断技术,设计引物从微小隐孢子虫基因组DNA中扩增P23基因序列,构建pPIC9K-P23重组质粒,... 为将微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum)P23基因在巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)系统中进行表达,利用表达蛋白初步建立隐孢子虫病间接ELISA诊断技术,设计引物从微小隐孢子虫基因组DNA中扩增P23基因序列,构建pPIC9K-P23重组质粒,在毕赤酵母中进行表达,用阴离子交换层析柱进行纯化。以重组P23纯化蛋白为抗原建立间接ELISA检测方法,对现场采集的猪血清样品进行检测。SDS-PAGE显示所表达的蛋白大小约为23 kDa。Western blot检测表明该蛋白能与兔抗P23蛋白血清特异性结合。用建立的间接ELISA技术对186份猪血清样品进行检测,阳性率为83.3%。本研究获得了真核表达的P23重组蛋白,初步建立了微小隐孢子虫病间接ELISA诊断技术,为隐孢子虫病的诊断和流行病学调查打下了基础。 展开更多

关键词 微小隐孢子虫 P23基因 巴斯德毕赤酵母 真核表达

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隐孢子虫鼠基因型CP15基因真核表达质粒的构建及在Hela细胞中的表达 被引量：2

11

作者 苏庆美 何生虎 +6 位作者 米荣升 张国恩 黄燕 周鹏 秦培兰 呼高伟 陈兆国 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期519-525,共7页

为了构建隐孢子虫鼠基因型CP15基因的重组真核表达质粒,检测其重组质粒在Hela细胞中的表达。采用PCR方法,从pMD18-T-CP15菌液中扩增了CP15及含寡聚脱氧核苷酸(CpG-ODN)的CP15基因,酶切测序鉴定;将该基因亚克隆至pVAX1载体中,用脂质体介... 为了构建隐孢子虫鼠基因型CP15基因的重组真核表达质粒,检测其重组质粒在Hela细胞中的表达。采用PCR方法,从pMD18-T-CP15菌液中扩增了CP15及含寡聚脱氧核苷酸(CpG-ODN)的CP15基因,酶切测序鉴定;将该基因亚克隆至pVAX1载体中,用脂质体介导的方法转染Hela细胞,RT-PCR法、间接免疫荧光法和Western-blot法检测表达蛋白的生物学活性。结果显示,扩增了约360 bp和380 bp的隐孢子虫鼠基因型CP15和含CpG-ODN的CP15基因,酶切测序鉴定成功构建了pVAX1-CP15和含有CpG-ODN的重组真核表达质粒pVAX1-C-CP15。转染Hela细胞后,用RT-PCR法检测到外源基因有效的转录,用间接免疫荧光、SDS-PAGE和Western-blot法检测到外源基因的有效表达。结果表明,构建的重组真核表达质粒能够在Hela细胞中成功转录和表达,并且表达产物具有良好的免疫活性。这为下一步深入研制具有高保护性的隐孢子虫核酸疫苗奠定了基础。 展开更多

关键词 隐孢子虫鼠基因型 CP15 真核表达质粒 HELA细胞 表达

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