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题名水稻干旱胁迫诱导DNA甲基化时空变化特征分析
被引量：80
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作者
潘雅姣
傅彬英
王迪
朱苓华
黎志康
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机构
中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源和遗传改良重大科学工程
International Rice Research Institute
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出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第9期3009-3018,共10页
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基金
中国农业科学院作物科学研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(082060302-11)
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文摘
【目的】研究水稻抗旱导入系DK106和旱敏感轮回亲本IR64苗期和分蘖期干旱胁迫前后DNA甲基化的变化情况,并比较分析叶片和根部DNA甲基化变化特征,探讨DNA甲基化在水稻干旱胁迫反应中的作用。【方法】用甲基化敏感扩增多态性技术(methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)和高效液相层析(high performance liquid chromatography,HPLC)方法分析DNA甲基化变化情况;从聚丙烯酰胺凝胶回收甲基化多态性片段并克隆测序及序列比对。【结果】MSAP分析结果显示,水稻基因组中约有20%的CCGG位点发生了胞嘧啶甲基化;水分胁迫导致DNA甲基化平均水平明显增加,其中根部增加幅度尤为明显;DNA甲基化水平及状态变化在品种间存在差异,同时具有时期及组织特异性。对干旱胁迫特异诱导DNA甲基化片段序列分析结果表明,基因编码区和非编码区发生DNA甲基化的频率基本相同。【结论】干旱胁迫反应过程中DNA甲基化表现出一定时空特异性和品种特异性,且与品种抗旱性差异相关。
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关键词
DNA甲基化
干旱胁迫
甲基化敏感扩增多态性
高效液相层析
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Keywords
DNA methylation
drought stress
methylation sensitive amplified polymorphism
high performance liquid chromatography
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分类号
S511
[农业科学—作物学]
Q75
[生物学—分子生物学]
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