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长江上游特有鱼类红唇薄鳅线粒体控制区遗传多样性研究
被引量：
7
1
作者
申绍祎
田辉伍
+2 位作者
汪登强
陈大庆
刘绍平
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2017年第4期83-90,共8页
红唇薄鳅(Leptobotia rubrilabris)是长江上游特有鱼类,近年来资源量不断下降。本研究利用线粒体控制区序列片段(896 bp)分析了长江上游红唇薄鳅的遗传多样性及遗传结构,为其资源保护提供科学依据。共采集了119尾样本,来自长江上游江津...
红唇薄鳅(Leptobotia rubrilabris)是长江上游特有鱼类,近年来资源量不断下降。本研究利用线粒体控制区序列片段(896 bp)分析了长江上游红唇薄鳅的遗传多样性及遗传结构,为其资源保护提供科学依据。共采集了119尾样本,来自长江上游江津、四川南溪、岷江下游蕨溪等。结果显示,共检测到58个单倍型,平均单倍型多样性为0.967,平均核苷酸多样性0.006 7,表明红唇薄鳅种群具有较高的遗传多样性。单倍型NETWORK网络关系图和分析系统树结果显示红唇薄鳅单倍型不按地理分布聚类,但是明显分成了2个谱系,表明红唇薄鳅群体发生了同域遗传分化。AMOVA分析结果显示,采样点和采样时间的群体间没有发生遗传分化。中性检验、错配分析及BSP(Bayesian skyline plot)分析表明红唇薄鳅Lineage 1种群在距今0.007 5~0.055 Ma(百万年)期间发生过种群选择或扩张事件。
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关键词
红唇薄鳅(Leptobotia
rubrilabris)
长江上游
线粒体控制区
遗传多样性
下载PDF
职称材料
长江上游珍稀特有鱼类国家级自然保护区干流段鱼类组成及其多样性
被引量：
44
2
作者
高天珩
田辉伍
+1 位作者
叶超
段辛斌
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2013年第2期36-42,共7页
2010年9-11月、2011年5-7月和9-11月、2012年5-7月在长江上游珍稀特有鱼类国家级自然保护区干流宜宾、合江及江津江段进行了4次鱼类资源调查,共采集鱼类样本27 836尾,隶属于7目17科111种(亚种),其中长江上游特有鱼类27种,产漂流性卵鱼...
2010年9-11月、2011年5-7月和9-11月、2012年5-7月在长江上游珍稀特有鱼类国家级自然保护区干流宜宾、合江及江津江段进行了4次鱼类资源调查,共采集鱼类样本27 836尾,隶属于7目17科111种(亚种),其中长江上游特有鱼类27种,产漂流性卵鱼类45种,外来鱼类6种。宜宾、合江及江津江段鱼类物种数分别为85、91及91种,宜宾与合江江段鱼类相似度指数为69.23%,合江与江津江段为71.70%,宜宾与江津江段为77.78%。铜鱼(Coreius heterodon)、南方鲇(Silurus meridionalis)、长鳍吻(Rhinogobio ventralis)及圆口铜鱼(C.guichenoti)为保护区干流主要经济鱼类,产漂流性卵鱼类占渔获物总重量的66.35%。鱼类Shannon-Wiener多样性指数在4次调查中江津江段均最高,宜宾次之,合江最低,但三江段之间多样性指数均无显著性差异(P>0.05)。与历史资料相比,该江段鱼类资源明显减少,急需加强保护措施。
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关键词
鱼类组成
多样性
保护区
长江上游干流
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职称材料
长江上游小眼薄鳅线粒体DNA遗传多样性
被引量：
2
3
作者
申绍祎
田辉伍
+3 位作者
刘绍平
陈大庆
吕浩
汪登强
《生态学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期2824-2830,共7页
小眼薄鳅是长江上游特有的小型鱼类,自然分布狭窄。本研究采用线粒体细胞色素b(cytochrome b,cyt b)和控制区序列,对长江上游江津段和岷江下游宜宾段两个群体共108尾小眼薄鳅(Leptobotia microphthalma)样本的遗传多样性和遗传结构进行...
小眼薄鳅是长江上游特有的小型鱼类,自然分布狭窄。本研究采用线粒体细胞色素b(cytochrome b,cyt b)和控制区序列,对长江上游江津段和岷江下游宜宾段两个群体共108尾小眼薄鳅(Leptobotia microphthalma)样本的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果表明:小眼薄鳅群体cyt b序列共检出28个多态位点,34种单倍型,平均单倍型多样性指数(Hd)和核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.889和0.00382;控制区序列共检出变异位点49个,单倍型65种,Hd指数和Pi指数分别为0.958和0.00420。分子方差分析(AMOVA)显示:小眼薄鳅采样点群体内的变异大于群体间的变异,遗传变异绝大部分来自群体内部,群体间无显著遗传分化(F_(ST)<0.05),平均基因流(Nm)表明小眼薄鳅各采样点群体间基因交流十分频繁。基于Network网络结构可将小眼薄鳅样本划分成3个谱系,谱系间显示了显著的遗传分化(FST>0.25),提示小眼薄鳅种群内部可能有隔离的产生。核苷酸错配分布及Tajima's D中性检验结果显示小眼薄鳅可能未发生种群扩张事件。
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关键词
小眼薄鳅
长江
线粒体DNA
遗传多样性
原文传递
题名
长江上游特有鱼类红唇薄鳅线粒体控制区遗传多样性研究
被引量：
7
1
作者
申绍祎
田辉伍
汪登强
陈大庆
刘绍平
机构
西南大学生命
科学
学院
淡水鱼类
资源
与生殖发育教育部重点
实验
室
水产
科学
重庆市市级重点
实验
室
中国水产科学院长江水产研究所农业部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站
出处
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2017年第4期83-90,共8页
基金
中国长江三峡集团公司资助项目(No.0799570
No.0799574)
文摘
红唇薄鳅(Leptobotia rubrilabris)是长江上游特有鱼类,近年来资源量不断下降。本研究利用线粒体控制区序列片段(896 bp)分析了长江上游红唇薄鳅的遗传多样性及遗传结构,为其资源保护提供科学依据。共采集了119尾样本,来自长江上游江津、四川南溪、岷江下游蕨溪等。结果显示,共检测到58个单倍型,平均单倍型多样性为0.967,平均核苷酸多样性0.006 7,表明红唇薄鳅种群具有较高的遗传多样性。单倍型NETWORK网络关系图和分析系统树结果显示红唇薄鳅单倍型不按地理分布聚类,但是明显分成了2个谱系,表明红唇薄鳅群体发生了同域遗传分化。AMOVA分析结果显示,采样点和采样时间的群体间没有发生遗传分化。中性检验、错配分析及BSP(Bayesian skyline plot)分析表明红唇薄鳅Lineage 1种群在距今0.007 5~0.055 Ma(百万年)期间发生过种群选择或扩张事件。
关键词
红唇薄鳅(Leptobotia
rubrilabris)
长江上游
线粒体控制区
遗传多样性
Keywords
Leptobotia rubrilabris
the upper reaches of the Yangtze River
mitochondrial control region
genetic diversity
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
Q953 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
长江上游珍稀特有鱼类国家级自然保护区干流段鱼类组成及其多样性
被引量：
44
2
作者
高天珩
田辉伍
叶超
段辛斌
机构
西南大学生命
科学
学院
中国
水产
科学院
长江水产研究所
出处
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2013年第2期36-42,共7页
基金
公益性行业(农业)科研专项经费(No.200903048)
中国长江三峡集团公司资助项目(No.0799527)
文摘
2010年9-11月、2011年5-7月和9-11月、2012年5-7月在长江上游珍稀特有鱼类国家级自然保护区干流宜宾、合江及江津江段进行了4次鱼类资源调查,共采集鱼类样本27 836尾,隶属于7目17科111种(亚种),其中长江上游特有鱼类27种,产漂流性卵鱼类45种,外来鱼类6种。宜宾、合江及江津江段鱼类物种数分别为85、91及91种,宜宾与合江江段鱼类相似度指数为69.23%,合江与江津江段为71.70%,宜宾与江津江段为77.78%。铜鱼(Coreius heterodon)、南方鲇(Silurus meridionalis)、长鳍吻(Rhinogobio ventralis)及圆口铜鱼(C.guichenoti)为保护区干流主要经济鱼类,产漂流性卵鱼类占渔获物总重量的66.35%。鱼类Shannon-Wiener多样性指数在4次调查中江津江段均最高,宜宾次之,合江最低,但三江段之间多样性指数均无显著性差异(P>0.05)。与历史资料相比,该江段鱼类资源明显减少,急需加强保护措施。
关键词
鱼类组成
多样性
保护区
长江上游干流
Keywords
fish composition
diversity, nature reserve
mainstream in the upper Yangtze River
分类号
S932.4 [农业科学—渔业资源]
下载PDF
职称材料
题名
长江上游小眼薄鳅线粒体DNA遗传多样性
被引量：
2
3
作者
申绍祎
田辉伍
刘绍平
陈大庆
吕浩
汪登强
机构
西南大学生命
科学
学院
中国水产科学院长江水产研究所农业部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站
西南大学动物科技
学院
出处
《生态学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期2824-2830,共7页
基金
中国三峡集团公司项目(0799570
0799574和0799553)
农业部项目"长江中上游重要渔业水域主要经济物种产卵场及洄游通道调查"资助
文摘
小眼薄鳅是长江上游特有的小型鱼类,自然分布狭窄。本研究采用线粒体细胞色素b(cytochrome b,cyt b)和控制区序列,对长江上游江津段和岷江下游宜宾段两个群体共108尾小眼薄鳅(Leptobotia microphthalma)样本的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果表明:小眼薄鳅群体cyt b序列共检出28个多态位点,34种单倍型,平均单倍型多样性指数(Hd)和核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.889和0.00382;控制区序列共检出变异位点49个,单倍型65种,Hd指数和Pi指数分别为0.958和0.00420。分子方差分析(AMOVA)显示:小眼薄鳅采样点群体内的变异大于群体间的变异,遗传变异绝大部分来自群体内部,群体间无显著遗传分化(F_(ST)<0.05),平均基因流(Nm)表明小眼薄鳅各采样点群体间基因交流十分频繁。基于Network网络结构可将小眼薄鳅样本划分成3个谱系,谱系间显示了显著的遗传分化(FST>0.25),提示小眼薄鳅种群内部可能有隔离的产生。核苷酸错配分布及Tajima's D中性检验结果显示小眼薄鳅可能未发生种群扩张事件。
关键词
小眼薄鳅
长江
线粒体DNA
遗传多样性
Keywords
Leptobotia microphthalm
the Yangtze River
mitochondrial DNA
genetic diversity.
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长江上游特有鱼类红唇薄鳅线粒体控制区遗传多样性研究
申绍祎
田辉伍
汪登强
陈大庆
刘绍平
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2017
7
下载PDF
职称材料
2
长江上游珍稀特有鱼类国家级自然保护区干流段鱼类组成及其多样性
高天珩
田辉伍
叶超
段辛斌
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2013
44
下载PDF
职称材料
3
长江上游小眼薄鳅线粒体DNA遗传多样性
申绍祎
田辉伍
刘绍平
陈大庆
吕浩
汪登强
《生态学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
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