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基于SSR标记的澳洲坚果种质资源遗传多样性分析
被引量:
14
1
作者
井敏敏
黄炳钰
+2 位作者
戴小红
李栋梁
陈晶晶
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2022年第2期262-270,共9页
澳洲坚果原产于澳大利亚亚热带雨林,是我国新兴的重要经济作物,其种质资源丰富,但遗传背景复杂,亲缘关系混乱。开展澳洲坚果种质资源遗传多样性分析,可拓展澳洲坚果种质资源创新利用途径,有效加快澳洲坚果育种进程。形态表型分析是最早...
澳洲坚果原产于澳大利亚亚热带雨林,是我国新兴的重要经济作物,其种质资源丰富,但遗传背景复杂,亲缘关系混乱。开展澳洲坚果种质资源遗传多样性分析,可拓展澳洲坚果种质资源创新利用途径,有效加快澳洲坚果育种进程。形态表型分析是最早用于种质鉴定和管理的标记之一,但易受环境因素影响。DNA分子标记技术在种质资源鉴定、遗传多样性分析中克服了传统表型分析易受环境影响的缺点。本研究采用9对高多态性SSR引物对91份国外引进以及自主选育品种(品系)澳洲坚果种质进行遗传多样性分析。结果表明,共扩增出73个等位基因位点,平均等位基因8个,平均基因多样性为0.689,平均杂合度为0.578,多态性信息含量PIC为0.453~0.792,平均值为0.659,表明91份澳洲坚果具有较高的多态性。UPGMA聚类分析表明,在遗传距离为0.33处,将91份澳洲坚果分为2大类,且其亲缘关系与地理来源无显著相关性,与主成分分析、Structure分析结果一致。本研究供试澳洲坚果材料群体内遗传变异显著高于群体间变异,且遗传成分来源单一,遗传结构较为简单。本研究为澳洲坚果种质的有效利用以及核心种质构建提供理论基础,为进一步加速澳洲坚果种质遗传改良以及分子辅助育种奠定基础。
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关键词
澳洲坚果
种质资源
SSR标记
遗传多样性
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职称材料
芒果果实bHLH家族转录因子的生物信息学分析
被引量:
6
2
作者
郑斌
文定青
+4 位作者
武红霞
邹明宏
刘恒
王松标
赵巧丽
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2019年第2期289-299,共11页
bHLH家族作为植物中较大的转录因子家族之一,在真核生物生长发育调控中具有重要作用。本研究基于芒果果实转录组数据,利用生物信息学方法鉴定出87个bHLH家族蛋白,其中酸性蛋白所占比例较大,大部分为不稳定蛋白,且均为不含信号肽的亲水...
bHLH家族作为植物中较大的转录因子家族之一,在真核生物生长发育调控中具有重要作用。本研究基于芒果果实转录组数据,利用生物信息学方法鉴定出87个bHLH家族蛋白,其中酸性蛋白所占比例较大,大部分为不稳定蛋白,且均为不含信号肽的亲水性蛋白,除CL10714.Contig1为膜结合转录因子外,其余均不含跨膜结构。芒果bHLH蛋白结构域有多个氨基酸位点保守性较高,87个芒果bHLH蛋白中73个(83.91%)具有E-box结合功能。GO分析发现芒果bHLH蛋白共注释到生物学过程、细胞组分和分子功能3大类功能的17个亚类。进化树分析发现芒果bHLH蛋白与拟南芥有较高的保守性,并基于进化树对部分bHLH蛋白的功能进行了预测。本研究结果将为下一步芒果bHLH蛋白的功能研究奠定基础。
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关键词
芒果
bHLH家族
转录因子
生物信息学
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职称材料
油梨种苗繁育研究进展
被引量:
4
3
作者
郑斌
邹明宏
+2 位作者
文定青
王松标
欧雄常
《中国南方果树》
北大核心
2020年第6期168-173,共6页
油梨具有较高的营养价值,市场前景广阔,种苗需求量大。本综述从种子繁育、压条繁育、扦插繁育、嫁接繁育和组培繁育5个方面介绍了当前油梨种苗繁育技术的研究进展,以期为油梨大规模育苗提供参考。
关键词
油梨
种苗繁育
研究进展
原文传递
基于枝条、叶和花的油梨种质表型多样性分析
被引量:
4
4
作者
郑斌
施晓龙
邹明宏
《广东农业科学》
CAS
2020年第9期37-46,共10页
【目的】明确当前粤西已收集油梨种质资源的表型多样性,加强油梨种质资源的利用。【方法】以保存于国家热带果树种质资源圃的53份油梨种质资源为试验材料,采用偏相关分析、主成分分析和聚类分析等方法,对油梨的7个质量性状(叶形、叶缘...
【目的】明确当前粤西已收集油梨种质资源的表型多样性,加强油梨种质资源的利用。【方法】以保存于国家热带果树种质资源圃的53份油梨种质资源为试验材料,采用偏相关分析、主成分分析和聚类分析等方法,对油梨的7个质量性状(叶形、叶缘、叶尖形状、叶片颜色、叶面状态、花型、叶柄凹槽)和12个数量性状(枝条粗度、节间长度、叶长、叶宽、叶形指数、叶柄长度、花序侧轴长度、花序宽度、花序主轴长度、花梗长度、花瓣长度、萼片长度)进行调查分析。【结果】已收集油梨种质资源表型性状多样性丰富,质量性状与数量性状的多样性指数范围分别在0.094~1.228和1.373~1.921之间,表明油梨数量性状相对质量性状多样性更丰富。19个油梨表型性状间呈极显著相关的有29对,呈显著相关的21对。主成分分析表明,6个主成分因子的累计贡献率达72.396%,其中叶柄长度、枝条粗度、花瓣长度、花序侧轴长度、叶缘和叶面状态为主要性状。聚类分析显示,当欧氏距离为15时,可将53份油梨种质资源分为4大组群,组群Ⅰ花序较小,组群Ⅱ枝条粗度最粗,组群Ⅲ叶宽最窄,组群Ⅳ花序侧轴长度最长。【结论】粤西已收集保存的53份油梨资源的表型多样性丰富,调查的19个表型性状间有一定的相关性,其中叶柄长度、枝条粗度、花瓣长度、花序侧轴长度、叶缘和叶面状态可作为油梨资源评价及育种的主要指标。
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关键词
油梨
种质资源
表型多样性
偏相关分析
聚类分析
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职称材料
3个美国油梨品种在广东湛江引种表现评价
5
作者
朱利飞
刘丽琴
+2 位作者
郑雪文
胡小文
杨转英
《中国南方果树》
北大核心
2024年第1期83-90,共8页
为了解引入国家热带果树种质资源圃(广东省湛江市)的Hass、Tonnage和Wilson 3个美国油梨品种的生育期、果实品质性状和适应性等情况,对3个品种花形态、开花特性、开花授粉受精生理特征和主要果实性状等进行观测和比较分析。结果表明,3...
为了解引入国家热带果树种质资源圃(广东省湛江市)的Hass、Tonnage和Wilson 3个美国油梨品种的生育期、果实品质性状和适应性等情况,对3个品种花形态、开花特性、开花授粉受精生理特征和主要果实性状等进行观测和比较分析。结果表明,3个油梨品种在广东省湛江市均能正常开花结果,花期均为2月下旬至4月中旬,花期比原产地短10~20 d,Hass和Tonnage为A型花,Wilson为B型花;Hass、Tonnage和Wilson花粉萌发率分别为87%、75%和82%,开花后3 h为最佳授粉期。Hass果实生理成熟期11月初,Tonnage为8月中旬,Wilson为9月初;果实风味、口感、颜色等性状与引种地基本一致,Wilson平均单果质量达到引种地的2倍多,而Tonnage单果质量只达到引种地的69.5%,Hass单果质量与原产地相近。
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关键词
油梨
HASS
引种
花期
花粉萌发率
单果质量
原文传递
题名
基于SSR标记的澳洲坚果种质资源遗传多样性分析
被引量:
14
1
作者
井敏敏
黄炳钰
戴小红
李栋梁
陈晶晶
机构
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/国家热带果树种质资源圃/农业农村部热带果树生物学重点实验室
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2022年第2期262-270,共9页
基金
中国热带农业科学院基本科研业务费专项(No.1630062020001)
农业农村部物种品种资源保护费项目(No.125163006000160001)
国家热带果树种质资源圃平台运行服务项目(No.125163006000150007)。
文摘
澳洲坚果原产于澳大利亚亚热带雨林,是我国新兴的重要经济作物,其种质资源丰富,但遗传背景复杂,亲缘关系混乱。开展澳洲坚果种质资源遗传多样性分析,可拓展澳洲坚果种质资源创新利用途径,有效加快澳洲坚果育种进程。形态表型分析是最早用于种质鉴定和管理的标记之一,但易受环境因素影响。DNA分子标记技术在种质资源鉴定、遗传多样性分析中克服了传统表型分析易受环境影响的缺点。本研究采用9对高多态性SSR引物对91份国外引进以及自主选育品种(品系)澳洲坚果种质进行遗传多样性分析。结果表明,共扩增出73个等位基因位点,平均等位基因8个,平均基因多样性为0.689,平均杂合度为0.578,多态性信息含量PIC为0.453~0.792,平均值为0.659,表明91份澳洲坚果具有较高的多态性。UPGMA聚类分析表明,在遗传距离为0.33处,将91份澳洲坚果分为2大类,且其亲缘关系与地理来源无显著相关性,与主成分分析、Structure分析结果一致。本研究供试澳洲坚果材料群体内遗传变异显著高于群体间变异,且遗传成分来源单一,遗传结构较为简单。本研究为澳洲坚果种质的有效利用以及核心种质构建提供理论基础,为进一步加速澳洲坚果种质遗传改良以及分子辅助育种奠定基础。
关键词
澳洲坚果
种质资源
SSR标记
遗传多样性
Keywords
Macadamia
germplasm resources
SSR marker
genetic diversity
分类号
S664.9 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
芒果果实bHLH家族转录因子的生物信息学分析
被引量:
6
2
作者
郑斌
文定青
武红霞
邹明宏
刘恒
王松标
赵巧丽
机构
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/国家热带果树种质资源圃/农业农村部热带果树生物学重点实验室
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2019年第2期289-299,共11页
基金
广东省自然科学基金-粤东西北创新人才专项(No.2016A030307006)
国家重点研发计划项目(No.2017YFD0202107)
+3 种基金
热带果树种质资源收集
鉴定
编目
繁殖更新与保存分发利用专项
文摘
bHLH家族作为植物中较大的转录因子家族之一,在真核生物生长发育调控中具有重要作用。本研究基于芒果果实转录组数据,利用生物信息学方法鉴定出87个bHLH家族蛋白,其中酸性蛋白所占比例较大,大部分为不稳定蛋白,且均为不含信号肽的亲水性蛋白,除CL10714.Contig1为膜结合转录因子外,其余均不含跨膜结构。芒果bHLH蛋白结构域有多个氨基酸位点保守性较高,87个芒果bHLH蛋白中73个(83.91%)具有E-box结合功能。GO分析发现芒果bHLH蛋白共注释到生物学过程、细胞组分和分子功能3大类功能的17个亚类。进化树分析发现芒果bHLH蛋白与拟南芥有较高的保守性,并基于进化树对部分bHLH蛋白的功能进行了预测。本研究结果将为下一步芒果bHLH蛋白的功能研究奠定基础。
关键词
芒果
bHLH家族
转录因子
生物信息学
Keywords
mango(Mangifera indica Linn.)
bHLH family
transcription factor
bioinformatics
分类号
S667.7 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
油梨种苗繁育研究进展
被引量:
4
3
作者
郑斌
邹明宏
文定青
王松标
欧雄常
机构
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/国家热带果树种质资源圃/农业农村部热带果树生物学重点实验室
/海南省
热带
园艺采后处理与保鲜
重点
实验室
出处
《中国南方果树》
北大核心
2020年第6期168-173,共6页
基金
农业农村部物种品种资源保护费项目(19200401)资助。
文摘
油梨具有较高的营养价值,市场前景广阔,种苗需求量大。本综述从种子繁育、压条繁育、扦插繁育、嫁接繁育和组培繁育5个方面介绍了当前油梨种苗繁育技术的研究进展,以期为油梨大规模育苗提供参考。
关键词
油梨
种苗繁育
研究进展
分类号
S667.9 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
基于枝条、叶和花的油梨种质表型多样性分析
被引量:
4
4
作者
郑斌
施晓龙
邹明宏
机构
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/国家热带果树种质资源圃/农业农村部热带果树生物学重点实验室
云南
农业
大学
热带作物
学院
出处
《广东农业科学》
CAS
2020年第9期37-46,共10页
基金
农业农村部物种品种资源保护费项目(125163006000160004)。
文摘
【目的】明确当前粤西已收集油梨种质资源的表型多样性,加强油梨种质资源的利用。【方法】以保存于国家热带果树种质资源圃的53份油梨种质资源为试验材料,采用偏相关分析、主成分分析和聚类分析等方法,对油梨的7个质量性状(叶形、叶缘、叶尖形状、叶片颜色、叶面状态、花型、叶柄凹槽)和12个数量性状(枝条粗度、节间长度、叶长、叶宽、叶形指数、叶柄长度、花序侧轴长度、花序宽度、花序主轴长度、花梗长度、花瓣长度、萼片长度)进行调查分析。【结果】已收集油梨种质资源表型性状多样性丰富,质量性状与数量性状的多样性指数范围分别在0.094~1.228和1.373~1.921之间,表明油梨数量性状相对质量性状多样性更丰富。19个油梨表型性状间呈极显著相关的有29对,呈显著相关的21对。主成分分析表明,6个主成分因子的累计贡献率达72.396%,其中叶柄长度、枝条粗度、花瓣长度、花序侧轴长度、叶缘和叶面状态为主要性状。聚类分析显示,当欧氏距离为15时,可将53份油梨种质资源分为4大组群,组群Ⅰ花序较小,组群Ⅱ枝条粗度最粗,组群Ⅲ叶宽最窄,组群Ⅳ花序侧轴长度最长。【结论】粤西已收集保存的53份油梨资源的表型多样性丰富,调查的19个表型性状间有一定的相关性,其中叶柄长度、枝条粗度、花瓣长度、花序侧轴长度、叶缘和叶面状态可作为油梨资源评价及育种的主要指标。
关键词
油梨
种质资源
表型多样性
偏相关分析
聚类分析
Keywords
avocado
germplasm resources
phenotypic diversity
partial correlation analysis
cluster analysis
分类号
S667.9 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
3个美国油梨品种在广东湛江引种表现评价
5
作者
朱利飞
刘丽琴
郑雪文
胡小文
杨转英
机构
广东海洋大学滨海
农业
学院
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/国家热带果树种质资源圃/农业农村部热带果树生物学重点实验室
出处
《中国南方果树》
北大核心
2024年第1期83-90,共8页
基金
国家十三五重点研发计划项目(2019YFD1002205)
2020年省一流专业——园艺(010306052103)
农业农村部物种品种资源保护费项目(102125171630060009001)资助。
文摘
为了解引入国家热带果树种质资源圃(广东省湛江市)的Hass、Tonnage和Wilson 3个美国油梨品种的生育期、果实品质性状和适应性等情况,对3个品种花形态、开花特性、开花授粉受精生理特征和主要果实性状等进行观测和比较分析。结果表明,3个油梨品种在广东省湛江市均能正常开花结果,花期均为2月下旬至4月中旬,花期比原产地短10~20 d,Hass和Tonnage为A型花,Wilson为B型花;Hass、Tonnage和Wilson花粉萌发率分别为87%、75%和82%,开花后3 h为最佳授粉期。Hass果实生理成熟期11月初,Tonnage为8月中旬,Wilson为9月初;果实风味、口感、颜色等性状与引种地基本一致,Wilson平均单果质量达到引种地的2倍多,而Tonnage单果质量只达到引种地的69.5%,Hass单果质量与原产地相近。
关键词
油梨
HASS
引种
花期
花粉萌发率
单果质量
Keywords
avocado
Hass
introduction
flowering period
pollen germination rate
single fruit weight
分类号
S667.9 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SSR标记的澳洲坚果种质资源遗传多样性分析
井敏敏
黄炳钰
戴小红
李栋梁
陈晶晶
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2022
14
下载PDF
职称材料
2
芒果果实bHLH家族转录因子的生物信息学分析
郑斌
文定青
武红霞
邹明宏
刘恒
王松标
赵巧丽
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2019
6
下载PDF
职称材料
3
油梨种苗繁育研究进展
郑斌
邹明宏
文定青
王松标
欧雄常
《中国南方果树》
北大核心
2020
4
原文传递
4
基于枝条、叶和花的油梨种质表型多样性分析
郑斌
施晓龙
邹明宏
《广东农业科学》
CAS
2020
4
下载PDF
职称材料
5
3个美国油梨品种在广东湛江引种表现评价
朱利飞
刘丽琴
郑雪文
胡小文
杨转英
《中国南方果树》
北大核心
2024
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