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常规PCR与实时荧光定量PCR(qPCR)技术敏感性比较 被引量：3
1
作者 郭文涛 徐爱玲 +6 位作者 加洛 冯建萍 米宝玉 周奎章 李千 吴海生 栗冬梅 《青海畜牧兽医杂志》 2020年第1期7-9,共3页
对70匹采自青海省海南藏族自治州兴海县和贵南县喜马拉雅旱獭体表寄生蚤2科3属3种,包括斧形盖蚤(Callopsylla dolabris)、谢氏山蚤(Oropsyllasilantiewi)、人蚤(Pulex irritans)进行巴尔通体检测,并对11个阳性样品进行常规PCR和实时荧... 对70匹采自青海省海南藏族自治州兴海县和贵南县喜马拉雅旱獭体表寄生蚤2科3属3种,包括斧形盖蚤(Callopsylla dolabris)、谢氏山蚤(Oropsyllasilantiewi)、人蚤(Pulex irritans)进行巴尔通体检测,并对11个阳性样品进行常规PCR和实时荧光定量PCR(qPCR)的敏感性比较。通过常规PCR反应产物和qPCR反应产物琼脂糖凝胶电泳分析,发现qPCR检测敏感性高于常规PCR。此项技术的应用将对巴尔通体感染的早期快速诊断、监测和流行病学调查等研究提供有效方法。 展开更多
关键词 实时荧光定量PCR(qPCR) 巴尔通体 蚤类 青海
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新疆某养殖小区牛羊流产样品中布氏杆菌的分离鉴定 被引量：2
2
作者 于水发 赵晓丽 +6 位作者 张欢 杨琴 张倩 王勇 陈创夫 王震 崔步云 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2022年第8期86-91,共6页
旨在调查新疆某养殖小区内牛、羊的流产原因。本研究共在该养殖小区采集样本152份,其中牛流产胎儿样本120份、羊流产胎儿样本31份、牛奶样品1份。对胎儿的脾脏、肝脏、胃内容物和牛奶样品中的布氏杆菌进行PCR检测;从PCR阳性样本中进行... 旨在调查新疆某养殖小区内牛、羊的流产原因。本研究共在该养殖小区采集样本152份,其中牛流产胎儿样本120份、羊流产胎儿样本31份、牛奶样品1份。对胎儿的脾脏、肝脏、胃内容物和牛奶样品中的布氏杆菌进行PCR检测;从PCR阳性样本中进行病原分离,并通过生化鉴定和多重PCR方法对分离的病原进行种型分析。结果显示,共60(39.5%)份样本(34份牛流产胎儿、1份牛奶样本和25份羊流产胎儿)PCR检测为布氏杆菌阳性,其他病原如弓形虫、胎儿弯曲杆菌、瑟氏泰勒虫和胎儿三毛滴虫PCR检测结果均为阴性。从上述60份阳性样本中共分离出55株布氏杆菌,经多重PCR和生化鉴定显示,52株为羊种布氏杆菌生物3型;2只羊流产胎儿脏器分离的3株猪种布氏杆菌生物1型与疫苗株S2相似度非常高。本研究发现导致该养殖小区牛、羊流产的主要病原为羊种布氏杆菌生物3型,同时疑似猪种布氏杆菌疫苗株S2也可造成妊娠母羊的流产。 展开更多
关键词 新疆 流产 布氏杆菌病
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金黄色葡萄球菌类肠毒素W的超抗原活性位点预测与克隆表达
3
作者 杨玉花 库鑫 +9 位作者 宫雅楠 孟凡亮 卜东波 郭亚慧 魏销玥 龙丽瑾 范佳铭 张茂俊 张建中 闫笑梅 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期629-635,共7页
目的预测金黄色葡萄球菌类肠毒素W(SElW)与T细胞受体(TCR)的对接和超抗原活性位点,并对SElW进行克隆表达和纯化。方法利用AlphaFold对SElW蛋白单体进行三维结构预测,借助SAVES在线服务器使用ERRAT、拉氏图和Verify_3D等软件对蛋白模型... 目的预测金黄色葡萄球菌类肠毒素W(SElW)与T细胞受体(TCR)的对接和超抗原活性位点,并对SElW进行克隆表达和纯化。方法利用AlphaFold对SElW蛋白单体进行三维结构预测,借助SAVES在线服务器使用ERRAT、拉氏图和Verify_3D等软件对蛋白模型进行评估。用ZDOCK服务器模拟SElW与TCR的对接构象,并对SElW与其他肠毒素的氨基酸序列进行比对。设计引物扩增selw基因,将该片段重组于pMD18-T载体中并进行测序;经限制性内切酶BamHⅠ和HindⅢ双酶切后将目的片段重组于表达质粒pET-28a(+)中,重组质粒鉴定后用IPTG诱导表达;用亲和层析法对表达于上清中的SElW蛋白进行纯化,用BCA法对蛋白进行定量。结果三维结构预测结果显示,SElW蛋白由氨基末端和羧基末端两个结构域组成,其中氨基末端结构域由3个α-螺旋和6个β-片层组成,羧基末端结构域由2个α-螺旋和7个反向平行的β-片层组成。SElW蛋白模型的整体质量因素得分为98.08,其中93.24%的氨基酸Verify_3D得分≥0.2,且无氨基酸位于不允许区。模拟对接预测选择评分最高的对接构象(评分值为1521.328)作为分析对象,采用PyMOL软件分析SElW与TCR之间形成的19个氢键。结合序列比对和既往研究结果,本研究预测发现了SElW蛋白的5个重要超抗原活性位点,分别是Y18、N19、W55、C88和C98。通过克隆表达和蛋白纯化,获得了高纯度的可溶性重组蛋白SElW。结论研究预测了SElW蛋白中5个可能的超抗原活性位点,成功构建并表达了SElW蛋白,为进一步探索SElW免疫识别机制奠定了基础。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌肠毒素 分子对接 超抗原活性位点 克隆表达
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萧山地区不同年龄人群中幽门螺杆菌耐药性分析 被引量：6
4
作者 郭锋 张法红 +5 位作者 毕青 武伟 刘秋香 屠苗颖 杨宁敏 张建中 《中华消化内镜杂志》 北大核心 2015年第9期631-632,共2页
幽门螺杆菌（Hpylori）是胃炎和消化性溃疡的主要致病菌，Hpylori感染的根除治疗具有重要意义。目前，包含质子泵抑制剂（protonpumpinhibitor，PPI）和两种抗生素的三联疗法是最主要的治疗手段。但是随着且pylori耐药率的逐年递增，Hpy... 幽门螺杆菌（Hpylori）是胃炎和消化性溃疡的主要致病菌，Hpylori感染的根除治疗具有重要意义。目前，包含质子泵抑制剂（protonpumpinhibitor，PPI）和两种抗生素的三联疗法是最主要的治疗手段。但是随着且pylori耐药率的逐年递增，Hpylori的根除率逐渐下降；特别是在中国，在耐药率严重的许多大中城市，Hpylori根除率只有70％左右。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 耐药性分析 HPYLORI 含质子泵抑制剂 人群 年龄 山地 根除治疗
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2009-2014年浙江省瑞安地区幽门螺杆菌常用抗生素耐药监测分析 被引量：13
5
作者 施正超 余铭 +7 位作者 李克诚 林勇 李荣洲 郑炜烽 金培声 任宗海 杨宁敏 张建中 《中华消化内镜杂志》 北大核心 2015年第4期257-259,共3页
自从1983年幽门螺杆菌（helicobacter pylori，Hpylori）被发现以来，便以其很高的人群感染率及与慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌的高度相关性而引起国内外学者的高度重视。
关键词 幽门螺杆菌 抗生素耐药 监测分析 浙江省 人群感染率 消化性溃疡 慢性胃炎 国内外
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海南省布鲁氏菌病疫情特征研究 被引量：9
6
作者 王旭明 黄梅会 崔步云 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期350-353,共4页
目的分析海南省布鲁氏菌病(布病)流行病学特征。方法对2012-2017年海南省收集的16株布鲁氏菌采用Vitek 2 compact进行布鲁氏菌初步鉴定,再用传统生物学分型方法进行确证,结合饲养家畜血清学和病原学检测结果分析患者的流行病学特征。结... 目的分析海南省布鲁氏菌病(布病)流行病学特征。方法对2012-2017年海南省收集的16株布鲁氏菌采用Vitek 2 compact进行布鲁氏菌初步鉴定,再用传统生物学分型方法进行确证,结合饲养家畜血清学和病原学检测结果分析患者的流行病学特征。结果 Vitek 2 compact鉴定12株为羊种布鲁氏菌,4株为人苍白杆菌。传统生物学分型方法鉴定11株为羊种布鲁氏菌3型,5株为猪种布鲁氏菌3型。菌株对应的16例病例中2012年1例,2013年2例,2014年4例,2015年1例,2016年2例,2017年6例,分布在东方市、临高县、海口市、万宁市、乐东县、定安县等地。同时对疫区东方市745份羊血清进行布鲁氏菌血清抗体检测,阳性47例(6.3%),从东方市病羊采集的标本中分离到羊种布鲁氏菌3型。结论 Vitek 2 compact是一种简单、方便的布鲁氏菌鉴定方法,但不能替代传统生物学分型方法;海南地区布病主要流行的菌种为羊种3型及猪种3型,通过东方市2017年布病疫情,说明海南省有布病疫畜传染人的疫情,布病防控形势严峻。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 种型鉴定 流行病学
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