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山西省2007年Ⅰ型疫苗衍生脊髓灰质炎病毒的鉴定和基因特性分析 被引量:12
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作者 严冬梅 祝双利 +8 位作者 张勇 王东艳 安洪秋 李爱英 杨建芳 温宁 李黎 唐牛良明 许文波 《中国疫苗和免疫》 CAS 2009年第2期131-134,共4页
目的描述山西省2007年Ⅰ型疫苗衍生脊髓灰质炎(脊灰)病毒(Vaccine-derived Poliovirus,VDPV)的基因特征,分析该VDPV的来源及对当地维持无脊灰的影响。方法对山西省2007年1例急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例采集的双份... 目的描述山西省2007年Ⅰ型疫苗衍生脊髓灰质炎(脊灰)病毒(Vaccine-derived Poliovirus,VDPV)的基因特征,分析该VDPV的来源及对当地维持无脊灰的影响。方法对山西省2007年1例急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例采集的双份粪便标本进行病毒分离,并对分离到的脊灰病毒(CHN11061株)进行VP1编码区基因核苷酸序列测定和分析,然后与国内外报道的其它Ⅰ型VDPV构建亲缘进化树。结果从该AFP病例的双份粪便标本中分离到2株Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ混合型脊灰病毒,其中Ⅰ型毒株的VP1编码区基因核苷酸序列与PⅠ/赛宾(Sabin)疫苗株相比变异率≥1.0%,根据世界卫生组织(WHO)的标准鉴定为Ⅰ型VDPV。VP1编码区基因进化树图表明,山西省2007年Ⅰ型VDPV与国内外至今发现的其它VDPV进化距离较远,是新发现的VDPV,不属于循环着的(Circulating)VDPV(cVDPVs),同时无证据证明患儿为免疫缺陷患者,因此将这2株VDPV归类为Ⅰ型未分类的(Ambiguous)VDPV(aVDPV)。结论结合山西省2007年Ⅰ型VDPV的基因特征和当地口服脊灰减毒活疫苗(Oral Poliomylitis Attenuated Live Vaccine,OPV)免疫覆盖率情况,推测在当地存在1例免疫缺陷患者,由他/她长期携带并向外排泄变异的脊灰病毒,引起了山西省2007年VDPV感染事件。在脊灰消灭后期,应加强对可能存在的长期排毒者的发现和管理。 展开更多
关键词 疫苗衍生脊髓灰质炎病毒 VP1编码区 核苷酸序列测定和分析
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环境监测在疫苗衍生脊髓灰质炎病毒事件调查处理中的应用 被引量:4
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作者 吴照 温宁 +6 位作者 罗会明 王华庆 张勇 郝利新 梁晓峰 汤晶晶 丁峥嵘 《中国疫苗和免疫》 CAS 2012年第1期67-69,共3页
目的了解发现疫苗衍生脊髓灰质炎(脊灰)病毒(Vaccine-derived Poliovirus,VDPV)后,人、病毒及环境之间的循环状况,指导处置措施。方法急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例调查按个案调查表进行,省级AFP病例分类专家诊断小... 目的了解发现疫苗衍生脊髓灰质炎(脊灰)病毒(Vaccine-derived Poliovirus,VDPV)后,人、病毒及环境之间的循环状况,指导处置措施。方法急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例调查按个案调查表进行,省级AFP病例分类专家诊断小组做出最后分类。对健康儿童粪便标本、环境生活污水样品进行病毒分离,阳性分离物进行型内鉴定。结果 AFP病例的粪便标本阳性分离物脊灰病毒(Poliovirus,PV)型内鉴定为VDPV,患儿被确诊为VDPV病例。对病例、周围健康儿童及环境生活污水开展PV流行分布监测,未发现VDPV。结论环境污水监测能了解VDPV流行分布范围,有效指导VDPV事件的调查处理。 展开更多
关键词 环境污水监测 疫苗衍生脊髓灰质炎病毒
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2005年中国3个县1~6岁儿童人肠道病毒71型血清流行病学调查 被引量:66
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作者 郭学斌 祝双利 +7 位作者 王东艳 严冬梅 檀晓娟 朱晖 蒋小泓 唐浏英 杨朝辉 许文波 《中国疫苗和免疫》 CAS 2009年第2期141-144,共4页
目的了解2005年中国3个县儿童人肠道病毒71型(Human Enterovirus 71,HEV71)抗体水平及HEV71在儿童中的自然感染状况,为预防控制手足口病(Hand-foot-mouth Disease,HFMD)在儿童中的流行提供依据。方法利用2005年9月进行儿童麻疹抗体水平... 目的了解2005年中国3个县儿童人肠道病毒71型(Human Enterovirus 71,HEV71)抗体水平及HEV71在儿童中的自然感染状况,为预防控制手足口病(Hand-foot-mouth Disease,HFMD)在儿童中的流行提供依据。方法利用2005年9月进行儿童麻疹抗体水平调查时,在3个省各1个县共371名1~6岁儿童中所采集的血清标本,使用中和试验检测血清HEV71中和抗体,并对检测结果进行统计学分析。结果儿童HEV71中和抗体阳性164人,阳性率为44.2%。抗体阳性率分布与儿童年龄和所在地区有关,1岁儿童抗体阳性率最低,随着年龄的增长,抗体阳性率升高,各年龄抗体阳性率差异有显著的统计学意义(x2=25.73,P<0.05)。3个县儿童HEV71中和抗体阳性率不同,但差异无显著的统计学意义(x2=0.11,P>0.05)。抗体几何平均滴度1岁较低,2、3岁升高,4~6岁下降。3个县儿童HEV71中和抗体水平构成一致,以抗体阴性或低抗体水平为主。结论2005年以前3个县儿童曾发生HEV71感染;1~6岁儿童尤其是≤3岁儿童,HEV71中和抗体阳性率低,是HEV71导致HFMD的易感人群,应加强预防由HEV71引起的HFMD在≤3岁儿童中的流行或传播。 展开更多
关键词 人肠道病毒71型 中和抗体 血清流行病学调查
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单纯疱疹病毒1型引起的发热出疹性疾病需要与手足口病进行鉴别 被引量:5
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作者 祝双利 刘建锋 +12 位作者 孙强 李静 李晓嫘 张勇 陈瑛 温小云 严冬梅 黄国虹 张宝敏 张波 安洪秋 李慧 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期415-420,共6页
对2008年在甘肃省发生的一起疑似手足口病(HFMD)的发热出疹性疾病的流行进行病原体的实验室检测,明确引起这起传染病流行的病原体。从4名发热出疹患者采集的8份临床标本中(每个患者采集咽拭子和疱疹液标本),首先将临床标本接种到RD和HE... 对2008年在甘肃省发生的一起疑似手足口病(HFMD)的发热出疹性疾病的流行进行病原体的实验室检测,明确引起这起传染病流行的病原体。从4名发热出疹患者采集的8份临床标本中(每个患者采集咽拭子和疱疹液标本),首先将临床标本接种到RD和HEp-2细胞上进行病毒分离,对病毒分离阳性的标本提取病毒核酸,然后使用荧光定量-逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)进行人肠道病毒(HEV)核酸的检测。对HEV检测结果阴性的标本采用序列非依赖的单引物扩增技术(SISPA)进行"未知病原体"的鉴定。分离到的6株病毒均鉴定为单纯疱疹病毒I型(HSV-1),结合分析这起流行中患者的临床表现、流行病学调查结果以及实验室检测结果,表明HSV-1是引起这起发热出疹性疾病流行的病原体。6株HSV-1的gG区核苷酸和氨基酸水平上差异都较小,同源性分别高达98.8%和97.9%,说明这起疫情是由同一个病毒传播链引起的。HSV-1等病毒引起的发热出疹性疾病需要与HFMD进行鉴别诊断,由于仅从临床症状和流行病学资料上判断引起发热出疹性疾病的病原体是非常困难的,因此,必须依赖于实验室的诊断。 展开更多
关键词 发热出疹性疾病 手足口病 序列非依赖的单引物扩增技术 单纯疱疹病毒1型 A基因型
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柯萨奇病毒A16型的B1a和B1b两个分支在内蒙古自治区共同流行 被引量:5
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作者 田晓灵 张勇 +3 位作者 宋壮志 范耀春 马学恩 王文瑞 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期426-431,共6页
研究2010年引起内蒙古自治区手足口病流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackie virus A16,CVA16)的分子流行病学特征。采集内蒙古自治区12个盟市门诊就诊的888名手足口病患者粪便和咽拭子标本共921份,进行病毒分离,然后利用实时荧光PCR对阳... 研究2010年引起内蒙古自治区手足口病流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackie virus A16,CVA16)的分子流行病学特征。采集内蒙古自治区12个盟市门诊就诊的888名手足口病患者粪便和咽拭子标本共921份,进行病毒分离,然后利用实时荧光PCR对阳性分离物进行CVA16的鉴定。从临床症状分别为普通型、重型和死亡病例的临床标本中分离的CVA16中随机选取50株代表株进行VP1编码区扩增及核苷酸序列测定和分析,与其他各基因型和基因亚型的CVA16构建亲缘进化关系树。921份标本共分离出82株CVA16,分离率为8.90%,其中从重症病例分离出3株CVA16,从死亡病例中分离出1株CVA16。50株内蒙古CVA16代表株在核苷酸水平上与1998年以来中国大陆CVA16分离株的同源性都较高,尤其与2009年北京株和2010年河南株的同源性最高,分别为96.18%~98.88%和94.94%~98.76%;但与2007年内蒙古流行株存在一定的差异,同源性仅为91.68%~96.52%;亲缘进化关系树显示,所有内蒙古CVA16株都属于B1基因型的两大进化分支B1a和B1b,并处于不同的簇中,它们之间的核苷酸和氨基酸同源性分别为89.99%~100%和98.31%~100%,表现为CVA16分离株属于多个病毒传播链。2010年从内蒙古自治区不同临床症状手足口病病例分离的CVA16流行株属于B1基因型的两大进化分支B1a和B1b,两个进化分支的CVA16在内蒙古自治区共同进化和流行。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒A组16型 分子流行病学 B1基因型 内蒙古自治区
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北京市2008年肠道病毒71型VP_1编码区基因特征分析 被引量:10
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作者 黄芳 李伟红 +3 位作者 檀晓娟 曲梅 吕燕宁 丁立新 《中国疫苗和免疫》 CAS 2009年第6期527-530,共4页
目的了解北京市2008年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)流行期间,人肠道病毒71型(Human Enterovirus71,HEV71)分离株的VP1编码区基因特征。方法采集发病1~3d的咽拭子标本33份,采用人横纹肌肉瘤(Human Rhabdomyosarcoma,RD)... 目的了解北京市2008年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)流行期间,人肠道病毒71型(Human Enterovirus71,HEV71)分离株的VP1编码区基因特征。方法采集发病1~3d的咽拭子标本33份,采用人横纹肌肉瘤(Human Rhabdomyosarcoma,RD)细胞进行EV分离,用特异引物通过逆转录-聚合酶链反应扩增进行毒株鉴定。对分离到的HEV71进行VP1编码区全长扩增,并对扩增产物采用双脱氧链终止法进行序列测定,Bioedit7.0.5和Mega3.1软件进行序列比对和系统进化树分析。结果从33份咽拭子标本中共分离到16株病毒,经鉴定:HEV7114株,柯萨奇病毒(Coxsackie Virus,CV)A组16型(CVA16)2株,其中1例为HEV71和CVA16混合感染。对10株HEV71进行了VP1编码区全序列测定,10株病毒的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95.5%~100%和98.9%~100%;与安徽省阜阳市2008年流行株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95.4%~99.1%;与C4基因型代表株的核苷酸序列同源性>92%。基于HEV71的VP1编码区核苷酸序列构建亲缘性关系树,北京市2008年流行株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型中的C4a分支;且10株病毒处于四个相对独立的进化分支。结论北京市2008年从HFMD患儿分离的HEV71均为C4亚型,且属于2004年以来我国的优势分支——C4a。亲缘性分析提示,此次流行中至少存在4个HEV71传播链。由于近年来HEV71在中国持续大规模流行,迫切需要对HEV71进行连续的分子流行病学监测,及时阐明现阶段流行毒株的基因特征,为疾病预防控制提供病毒学依据。 展开更多
关键词 肠道病毒71型 基因型 分子流行病学
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2010年内蒙古自治区手足口病病原谱及人肠道病毒71型分子特征研究 被引量:2
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作者 田晓灵 张勇 +2 位作者 闫绍宏 马学恩 王文瑞 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期304-309,共6页
研究2010年中国内蒙古自治区引起手足口病(Hand foot and mouth disease,HFMD)的病原谱及人肠道病毒71型(Human enterovirus,HEV71)的分子特征。采集内蒙古自治区12个盟市门诊就诊的HFMD患者粪便和咽拭子标本共921份,进行病毒分离,然后... 研究2010年中国内蒙古自治区引起手足口病(Hand foot and mouth disease,HFMD)的病原谱及人肠道病毒71型(Human enterovirus,HEV71)的分子特征。采集内蒙古自治区12个盟市门诊就诊的HFMD患者粪便和咽拭子标本共921份,进行病毒分离,然后利用三通道实时荧光定量PCR法[同时检测HEV71,柯萨奇病毒A16型(CVA16)和人肠道病毒(HEV)]对阳性分离物进行鉴定,对鉴定为其它HEV的阳性分离物进行VP4和VP1编码区扩增及核苷酸序列测定和分析。921份标本共分离出153株病毒,阳性率为16.61%,其中61株为HEV71,占39.87%,82株为CVA16,占53.59%,7株为其它HEV(分别为6株CVB4和1株Ⅱ型脊髓灰质炎疫苗病毒株),占6.53%,3株为腺病毒。重症病例中分离到9株病毒,其中6株为HEV71,3株为CVA16。选取从临床诊断分别为普通型病例、重型病例的HFMD患者临床标本中分离到的32株HEV71代表株进行VP1编码区基因扩增及核苷酸序列测定和分析,与HEV71其它各基因型和基因亚型的代表株构建亲缘性进化树。32株内蒙古HEV71代表株与1998年以来中国大陆HEV71分离株的VP1区核苷酸和氨基酸水平上的同源性都较高,尤其与2008年的北京代表株同源性最高,与C4基因亚型代表株聚为一支,属于C4基因亚型C4a进化分支,但它们之间的核苷酸和氨基酸的同源性略有差异,分别为96.4%~100%和98.14%~100%,与2007年的内蒙古代表株存在一定的差异,核苷酸同源性为96.95%~97.87%。亲缘进化关系树显示,这些HEV71处于不同的簇中,属于多个病毒传播链。2010年内蒙古HFMD的病原谱以CVA16和HEV71为主,重症病例中以HEV71居多。内蒙古流行的HEV71属于C4基因亚型C4a进化分支,并且存在多个传播链,与2008年北京代表株亲缘关系比2007年内蒙古代表株亲缘关系近,说明内蒙古流行的HEV71不是独立进化的,而是与中国流行的HEV71在共同进化。 展开更多
关键词 内蒙古自治区 手足口病 肠道病毒71型 分子特征 C4基因亚型
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北京市2008年肠道病毒71型的RT-PCR鉴定及VP1区基因特征分析 被引量:1
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作者 贺电 白瑞婷 +7 位作者 张勇 单志兰 李丽 刘洁 马建新 张晓曦 严冬梅 许文波 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期421-423,共3页
目的 研究2008年北京市手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)患者中肠道病毒71型(Human enterovirus 71,HEV71)的VP1编码区基因特征.方法 采集北京市朝阳区医院和幼儿园的HFMD患者标本共285份,进行HEV71特异性RT-PCR鉴定和... 目的 研究2008年北京市手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)患者中肠道病毒71型(Human enterovirus 71,HEV71)的VP1编码区基因特征.方法 采集北京市朝阳区医院和幼儿园的HFMD患者标本共285份,进行HEV71特异性RT-PCR鉴定和病毒分离,随机选取10株HEV71阳性分离株进行VP1编码区基因扩增和核苷酸序列测定和分析.结果 129份标本RT-PCR鉴定结果 为阳性,阳性率为45.26%.10株HEV71在VP1区核苷酸水平和氨基酸水平上的差异分别在94.6%~99.6%和95.9%~100%之间.北京朝阳HEV71分离株属于C4基因亚型C4a进化分支.结论 RT-PCR法可以快速、准确地鉴定HEV71.引起本次HFMD流行的HEV71为C4基因亚型C4a进化分支,并且存在多个传播链,提示自1998年起,C4亚型的HEV71在中国大陆有较广泛的传播.加强对HEV71的分子流行病学监测,了解HEV71的基因特征,对预防和控制HEV71在中国的暴发具有重要意义. 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒属 基因型
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吉林省急性弛缓性麻痹病例中人肠道病毒71型VP_1编码区基因特征分析
9
作者 候祥 刘桂艳 +7 位作者 周剑惠 陈超 常新 王爽 魏雷雷 林琳 张勇 张晓磊 《中国疫苗和免疫》 CAS 2012年第6期527-530,共4页
目的了解吉林省急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例中,人肠道病毒71型(Human Enterovirus Type71,HEV71)VP1编码区的基因特征。方法 原始粪便标本来自吉林省2006~2007年<15岁儿童AFP病例,采用人横纹肌肉瘤(Human Rha... 目的了解吉林省急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例中,人肠道病毒71型(Human Enterovirus Type71,HEV71)VP1编码区的基因特征。方法 原始粪便标本来自吉林省2006~2007年<15岁儿童AFP病例,采用人横纹肌肉瘤(Human Rhabdom yosarcoma,RD)细胞进行病毒分离,阳性标本用肠道病毒(Enterovirus,EV)组合血清和HEV71特异性血清进行血清型鉴定,鉴定结果为HEV71的毒株,利用VP1编码区特异性引物,通过逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polym erase Chain Reaction,RT-PCR)扩增全长VP1编码区片段,并进行核苷酸序列测定,序列结果利用Bioedit软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析,用MEGA软件建立基因进化树并进行基因亲缘关系分析。结果 176例AFP病人中共分离到4株HEV71,血清型由HEV71特异性血清中和试验确定,并通过分子生物学方法 进一步证实。4株HEV71的VP1编码区核苷酸同源性为96.6%~100%,氨基酸同源性为98.3%~100%;与2009~2010年吉林省手足口病(Hand,Footand Mouth Disease,HFMD)患者中分离到的HEV71毒株核苷酸同源性为96.2%~98.8%,氨基酸同源性为98.3%~99.3%;与2008年分离于安徽省阜阳HFMD患者中的C4a进化分支代表株EU703813-Fuyang-08/2-C4的核苷酸同源性为96.5%~98.8%,氨基酸同源性为98.3%~99.3%;与1998年广东省深圳HFMD患者中分离到的C4b进化分支代表株AF302996-SHZH98(Shenzhen,深圳)-C4的核苷酸同源性为92.1%~93.1%,氨基酸同源性为96.2%~97.3%。构建的基因进化树显示,4株病毒均位于C4a进化分支。结论吉林省2006年和2007年AFP病例中分离到的HEV71属于C4基因亚型的C4a进化分支;通过与近年来吉林省HFMD患者中分离到的HEV71毒株以及基因数据库(GenBank)中的HEV71相比较,未见AFP病例中分离到的HEV71与HFMD病例中分离到的HEV71在VP1编码区核苷酸水平上有明显差别。 展开更多
关键词 急性弛缓性麻痹病例 人肠道病毒71型 基因特征
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2007~2012年山东省临沂市手足口病流行病学和肠道病毒71型基因特征分析 被引量:8
10
作者 张盛 张勇 +9 位作者 檀晓娟 林艺 王连森 祝双利 李晓嫘 王东艳 徐爱强 裴耀文 王显军 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期246-252,共7页
为了分析山东省临沂市2007~2012年手足口病(Hand, foot, and mouth disease, HFMD)的流行病学和肠道病毒71型(Enterovirus A71, EV-A71)的基因特征,采用描述流行病学方法,对国家传染病监测信息报告管理系统中的HFMD疫情资料进行... 为了分析山东省临沂市2007~2012年手足口病(Hand, foot, and mouth disease, HFMD)的流行病学和肠道病毒71型(Enterovirus A71, EV-A71)的基因特征,采用描述流行病学方法,对国家传染病监测信息报告管理系统中的HFMD疫情资料进行统计分析;对2007~2012年山东省临沂市HFMD病例的EV-A71分离株的VP1编码区进行逆转录-聚合酶链反应,并对扩增产物进行核苷酸序列测定,使用MEGA 5.0软件分析VP1区基因变异特征以及基因亲缘关系。结果显示,2007~2012年山东临沂市每年均有HFMD报告,其中2009年发病例数和死亡病例数最多,分别为14697例和9例,报告发病率为140.28/10万,死亡率为0.086/10万。发病高峰主要发生在4~7月,5月份最高;其中散居儿童发病数占77.37%~92.00%。2007~2009年发病高峰在2.5岁,2010~2012年发病高峰在1.5岁。连续6年实验室确诊HFMD共计1365例,占总病例数比例为2.98%;其中EV-A71构成比为44.18%,柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16, CVA16)为46.59%。2007~2012年在山东省临沂市分离到的EV-A71均属于C4基因亚型中C4a进化分支。2007~2012年山东省临沂市均有HFMD暴发流行,各区县发病率有明显差异,发病高峰在每年的4~7月。发病年龄集中在3岁以下儿童,散居儿童构成比例最高。各年份引起HFMD的病原体均以EV-A71和CVA16共循环为主。自2007年在山东省临沂市发现EV-A71 C4基因亚型的C4a引起的HFMD疫情以来,C4a在临沂市已经持续传播和流行了6年。 展开更多
关键词 手足口病 流行病学 EV-A71基因特征
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