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高通量测序技术在植物病毒分类中的应用
被引量:
6
1
作者
刘青
周书玉
+1 位作者
崔冬丽
HESLOP HARRISON John Seymour
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第7期87-95,共9页
植物病毒寄生可引起植物病毒病,甚至对植物造成毁灭性伤害.高通量测序技术(high-throughput sequencing, HTS)提供了一种快速、低成本、深度测序的解决方案,在病毒鉴定、新病毒检测和病毒基因组多样性等研究中具有优势,促进了植物病毒...
植物病毒寄生可引起植物病毒病,甚至对植物造成毁灭性伤害.高通量测序技术(high-throughput sequencing, HTS)提供了一种快速、低成本、深度测序的解决方案,在病毒鉴定、新病毒检测和病毒基因组多样性等研究中具有优势,促进了植物病毒分类的研究.本文概述了HTS技术检测病毒的进展、在植物病毒学领域应用案例和该方法检测病毒的优缺点,旨在说明HTS技术对病毒鉴定、新病毒发现和病毒分类的重要贡献,提出新病毒检测和鉴定是亟待解决的问题,为植物病毒病的预防提供参考.
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关键词
高通量测序
植物病毒分类
新病毒鉴定
原文传递
植物基因组重复序列研究进展
被引量:
6
2
作者
李晓宇
徐文魁
+1 位作者
Pat Heslop HARRISON
刘青
《扬州大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
北大核心
2019年第5期9-19,共11页
重复序列是指基因组中频繁出现的相同或对称的DNA片段,在植物基因组中占有很大比重。重复序列分为2种类型:一种是串联重复序列,主要分布在染色体着丝粒周缘区域、臂间区域和近端粒区域,某些短的串联重复序列均匀分布在基因组中;另一种...
重复序列是指基因组中频繁出现的相同或对称的DNA片段,在植物基因组中占有很大比重。重复序列分为2种类型:一种是串联重复序列,主要分布在染色体着丝粒周缘区域、臂间区域和近端粒区域,某些短的串联重复序列均匀分布在基因组中;另一种是散在重复序列,主要是反转录转座子和DNA转座子,通常散布在染色体或多倍体物种某些(个)亚基因组染色体上。目前重复序列的发现和识别技术已成为基因组学的研究热点,归纳这方面的研究进展,概括相关工具的分析特点,总结重复序列功能研究及其在遗传分析中的应用案例,可为发掘重复序列存在的生物学意义及其在物种亲缘关系分析和种质资源鉴定中的应用奠定基础。
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关键词
植物
核基因组
重复序列
研究进展
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职称材料
题名
高通量测序技术在植物病毒分类中的应用
被引量:
6
1
作者
刘青
周书玉
崔冬丽
HESLOP HARRISON John Seymour
机构
中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室/中国科学院华南植物园
中国科学院
核心
植物园
中国科学院
大学
莱斯特大学遗传学和基因组生物学系
出处
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第7期87-95,共9页
基金
国家自然科学基金项目(32070359)
中国科学院大学生创新实践训练计划项目(KCJH-80107-2020-004 No.97)
+1 种基金
国家留学基金项目(202004910143)
广东省自然科学基金面上项目(2021A1515012410)。
文摘
植物病毒寄生可引起植物病毒病,甚至对植物造成毁灭性伤害.高通量测序技术(high-throughput sequencing, HTS)提供了一种快速、低成本、深度测序的解决方案,在病毒鉴定、新病毒检测和病毒基因组多样性等研究中具有优势,促进了植物病毒分类的研究.本文概述了HTS技术检测病毒的进展、在植物病毒学领域应用案例和该方法检测病毒的优缺点,旨在说明HTS技术对病毒鉴定、新病毒发现和病毒分类的重要贡献,提出新病毒检测和鉴定是亟待解决的问题,为植物病毒病的预防提供参考.
关键词
高通量测序
植物病毒分类
新病毒鉴定
Keywords
high-throughput sequencing
plant virus classification
new virus identification
分类号
Q939.46 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
植物基因组重复序列研究进展
被引量:
6
2
作者
李晓宇
徐文魁
Pat Heslop HARRISON
刘青
机构
中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室/中国科学院华南植物园
中国科学院
大学
华南
农业大学生命
科学
学院
莱斯特大学遗传学和基因组生物学系
出处
《扬州大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
北大核心
2019年第5期9-19,共11页
基金
国家科技基础性工作专项(2013FY112100)
中国科学院华南植物园海外知名学者资助项目(Y861041001)
中国科学院大学生创新实践训练计划项目(No.59)
文摘
重复序列是指基因组中频繁出现的相同或对称的DNA片段,在植物基因组中占有很大比重。重复序列分为2种类型:一种是串联重复序列,主要分布在染色体着丝粒周缘区域、臂间区域和近端粒区域,某些短的串联重复序列均匀分布在基因组中;另一种是散在重复序列,主要是反转录转座子和DNA转座子,通常散布在染色体或多倍体物种某些(个)亚基因组染色体上。目前重复序列的发现和识别技术已成为基因组学的研究热点,归纳这方面的研究进展,概括相关工具的分析特点,总结重复序列功能研究及其在遗传分析中的应用案例,可为发掘重复序列存在的生物学意义及其在物种亲缘关系分析和种质资源鉴定中的应用奠定基础。
关键词
植物
核基因组
重复序列
研究进展
Keywords
plant
nuclear genome
repetitive DNA sequences
research progress
分类号
Q751 [生物学—分子生物学]
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职称材料
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作者
出处
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1
高通量测序技术在植物病毒分类中的应用
刘青
周书玉
崔冬丽
HESLOP HARRISON John Seymour
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022
6
原文传递
2
植物基因组重复序列研究进展
李晓宇
徐文魁
Pat Heslop HARRISON
刘青
《扬州大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
北大核心
2019
6
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职称材料
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