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云南软米水稻种质资源Waxy基因的检测与分析
被引量:
1
1
作者
彭波
阿新祥
+12 位作者
郑梦阳
郭莹
谷雨
张凯璇
彭娟
宋晓华
田夏雨
刘子月
孙艳芳
庞瑞华
李金涛
汪全秀
周伟
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第12期2693-2701,共9页
【目的】云南软米水稻种质资源材料中Waxy等位基因功能性遗传变异位点的检测,结合其稻米中的直链淀粉含量检测结果综合分析,为优质软米水稻新品种的分子育种提供理论依据。【方法】利用Waxy基因的4个功能性分子标记,针对75份云南软米水...
【目的】云南软米水稻种质资源材料中Waxy等位基因功能性遗传变异位点的检测,结合其稻米中的直链淀粉含量检测结果综合分析,为优质软米水稻新品种的分子育种提供理论依据。【方法】利用Waxy基因的4个功能性分子标记,针对75份云南软米水稻种质资源材料进行了PCR检测与分析,并利用近红外谷物分析器对其稻米中的直链淀粉含量进行了检测与综合分析。【结果】云南软米水稻种质资源材料中Waxy基因功能标记In1位置处为GG基因型的有39份,其余的36份为TT基因型或GT基因型;在Waxy基因功能标记E2位置处存在缺少的软米水稻种质资源材料有63份;在功能标记E4mq位置处为A基因型、G基因型、C或T基因型的软米水稻种质资源材料分别有8、37和30份;在功能标记E4op/hp位置处为A基因型、G基因型、C或T基因型的软米水稻种质资源材料分别有18、15和42份;Waxy基因功能标记E2、E4mq和E4op/hp位置处,携带不同的基因型,其对应稻米中的直链淀粉含量存在显著性差异。【结论】本试验对云南软米水稻种质资源材料中Waxy等位基因功能标记的检测,结合其稻米中直链淀粉含量检测的结果,发现携带不同Waxy等位基因型,其对应稻米中的直链淀粉含量明显不同,这为利用Waxy基因功能标记辅助选育优质软米水稻新品种奠定基础。
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关键词
软米
种质资源
WAXY基因
功能标记
直链淀粉含量
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职称材料
水稻qPC1基因启动子功能性变异位点的鉴定及其转运功能
被引量:
2
2
作者
彭波
邱静
+11 位作者
彭娟
何璐璐
孔冬艳
孙晓宇
刘岩
阿新祥
靳可心
孙艳芳
庞瑞华
周伟
赵金会
汪全秀
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第12期2573-2582,共10页
【目的】鉴定水稻种子中蛋白质含量的正调控基因qPC1启动子的功能性变异位点,开发qPC1基因分子标记,并解析其转运功能,为阐明qPC1基因的生物学功能及其利用qPC1基因进行分子育种提供理论依据。【方法】采用基因定点突变、水稻原生质体...
【目的】鉴定水稻种子中蛋白质含量的正调控基因qPC1启动子的功能性变异位点,开发qPC1基因分子标记,并解析其转运功能,为阐明qPC1基因的生物学功能及其利用qPC1基因进行分子育种提供理论依据。【方法】采用基因定点突变、水稻原生质体瞬时转化技术和双荧光素酶报告法鉴定qPC1基因启动子功能性变异位点,利用缺陷型酵母互补试验以及水稻根部氨基酸的吸收试验解析qPC1的转运功能。【结果】相对于南洋占qPC1序列,珍汕97 qPC1启动子-7~-12 bp位置处6个碱基(CACAGA)的缺失将导致其启动子活性显著增加。对此设计对应的功能性分子标记PB13,并利用PCR技术在珍汕97与南洋占的重组自交系群体中进行验证。在缺陷型酵母互补试验中发现qPC1蛋白能够转运γ-氨基丁酸、瓜氨酸、天冬氨酸、脯氨酸、精氨酸和谷氨酸等多种氨基酸,且发现qPC1能促进水稻根对多种氨基酸的吸收,并对苏氨酸、丝氨酸、甘氨酸、丙氨酸、脯氨酸、谷氨酸和酸性氨基酸具有较快的吸收与转运速率。【结论】水稻qPC1基因启动子区-7~-12 bp位置为其功能性变异位点,qPC1在酵母中能够参与多种氨基酸转运,且在水稻根中能促进氨基酸的吸收与转运,即qPC1蛋白可能是一种广谱性氨基酸转运蛋白。该试验结果为进一步全面阐明qPC1基因调控水稻种子中蛋白质含量的分子机制并利用qPC1基因进行优质水稻新品种的选育提供了重要信息。
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关键词
功能性位点
qPC1基因
转运功能
启动子
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职称材料
题名
云南软米水稻种质资源Waxy基因的检测与分析
被引量:
1
1
作者
彭波
阿新祥
郑梦阳
郭莹
谷雨
张凯璇
彭娟
宋晓华
田夏雨
刘子月
孙艳芳
庞瑞华
李金涛
汪全秀
周伟
机构
信阳师范
学院
生命
科学
学院
/大别山
农业
生物
资源
保护与利用
研究
院
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/农业部云南稻种资源观测实验站
信阳市植保植检站
信阳市
农业
科学院
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第12期2693-2701,共9页
基金
国家自然科学基金(U1604110,31600992,31801332)
国家重点研发计划项目(2016YFD0100101-10)
+6 种基金
河南省高等学校青年骨干教师培养计划(2019GGJS162)
河南省重点科技攻关项目(182102110442,192102110119)
河南省高等学校重点科研项目(21A180001,19A180030)
河南省重大科技专项(121100110200)
武汉大学杂交水稻国家重点实验室开放课题(KF202001)
河南省高等学校大学生创新训练计划项目(201910477004)
信阳师范学院“南湖学者奖励计划”青年项目(2016054)。
文摘
【目的】云南软米水稻种质资源材料中Waxy等位基因功能性遗传变异位点的检测,结合其稻米中的直链淀粉含量检测结果综合分析,为优质软米水稻新品种的分子育种提供理论依据。【方法】利用Waxy基因的4个功能性分子标记,针对75份云南软米水稻种质资源材料进行了PCR检测与分析,并利用近红外谷物分析器对其稻米中的直链淀粉含量进行了检测与综合分析。【结果】云南软米水稻种质资源材料中Waxy基因功能标记In1位置处为GG基因型的有39份,其余的36份为TT基因型或GT基因型;在Waxy基因功能标记E2位置处存在缺少的软米水稻种质资源材料有63份;在功能标记E4mq位置处为A基因型、G基因型、C或T基因型的软米水稻种质资源材料分别有8、37和30份;在功能标记E4op/hp位置处为A基因型、G基因型、C或T基因型的软米水稻种质资源材料分别有18、15和42份;Waxy基因功能标记E2、E4mq和E4op/hp位置处,携带不同的基因型,其对应稻米中的直链淀粉含量存在显著性差异。【结论】本试验对云南软米水稻种质资源材料中Waxy等位基因功能标记的检测,结合其稻米中直链淀粉含量检测的结果,发现携带不同Waxy等位基因型,其对应稻米中的直链淀粉含量明显不同,这为利用Waxy基因功能标记辅助选育优质软米水稻新品种奠定基础。
关键词
软米
种质资源
WAXY基因
功能标记
直链淀粉含量
Keywords
Soft rice
Germplasm resources
Waxy gene
Functional marker
Amylose content
分类号
S511.03 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
水稻qPC1基因启动子功能性变异位点的鉴定及其转运功能
被引量:
2
2
作者
彭波
邱静
彭娟
何璐璐
孔冬艳
孙晓宇
刘岩
阿新祥
靳可心
孙艳芳
庞瑞华
周伟
赵金会
汪全秀
机构
信阳师范大学生命
科学
学院
/大别山
农业
生物
资源
保护与利用
研究
院
信阳市植保植检站
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/农业部云南稻种资源观测实验站
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第12期2573-2582,共10页
基金
国家自然科学基金项目(U2004141,U1604110,31801332)
河南省高等学校青年骨干教师培养计划项目(2019GGJS162)
+2 种基金
河南省科技攻关项目(222102110141,222102110115,212102110249)
信阳市创新专项(20210007)
信阳师范学院2022年研究生科研创新基金项目(2022KYJJ066,2022KYJJ068)。
文摘
【目的】鉴定水稻种子中蛋白质含量的正调控基因qPC1启动子的功能性变异位点,开发qPC1基因分子标记,并解析其转运功能,为阐明qPC1基因的生物学功能及其利用qPC1基因进行分子育种提供理论依据。【方法】采用基因定点突变、水稻原生质体瞬时转化技术和双荧光素酶报告法鉴定qPC1基因启动子功能性变异位点,利用缺陷型酵母互补试验以及水稻根部氨基酸的吸收试验解析qPC1的转运功能。【结果】相对于南洋占qPC1序列,珍汕97 qPC1启动子-7~-12 bp位置处6个碱基(CACAGA)的缺失将导致其启动子活性显著增加。对此设计对应的功能性分子标记PB13,并利用PCR技术在珍汕97与南洋占的重组自交系群体中进行验证。在缺陷型酵母互补试验中发现qPC1蛋白能够转运γ-氨基丁酸、瓜氨酸、天冬氨酸、脯氨酸、精氨酸和谷氨酸等多种氨基酸,且发现qPC1能促进水稻根对多种氨基酸的吸收,并对苏氨酸、丝氨酸、甘氨酸、丙氨酸、脯氨酸、谷氨酸和酸性氨基酸具有较快的吸收与转运速率。【结论】水稻qPC1基因启动子区-7~-12 bp位置为其功能性变异位点,qPC1在酵母中能够参与多种氨基酸转运,且在水稻根中能促进氨基酸的吸收与转运,即qPC1蛋白可能是一种广谱性氨基酸转运蛋白。该试验结果为进一步全面阐明qPC1基因调控水稻种子中蛋白质含量的分子机制并利用qPC1基因进行优质水稻新品种的选育提供了重要信息。
关键词
功能性位点
qPC1基因
转运功能
启动子
Keywords
Functional sites
qPC1 gene
Transport function
Promoter
分类号
S511.01 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
云南软米水稻种质资源Waxy基因的检测与分析
彭波
阿新祥
郑梦阳
郭莹
谷雨
张凯璇
彭娟
宋晓华
田夏雨
刘子月
孙艳芳
庞瑞华
李金涛
汪全秀
周伟
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2020
1
下载PDF
职称材料
2
水稻qPC1基因启动子功能性变异位点的鉴定及其转运功能
彭波
邱静
彭娟
何璐璐
孔冬艳
孙晓宇
刘岩
阿新祥
靳可心
孙艳芳
庞瑞华
周伟
赵金会
汪全秀
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023
2
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