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中国在翻译后修饰的生物信息学研究领域的进展与前瞻 被引量：6
1
作者 刘泽先 蔡煜东 +11 位作者 郭雪江 李骜 李婷婷 邱建丁 任间 施绍萍 宋江宁 王明会 谢鹭 薛宇 张子丁 赵兴明 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期621-634,共14页
翻译后修饰在调控蛋白质构象变化、活性以及功能方面具有重要作用,并参与了几乎所有细胞通路和过程。蛋白质翻译后修饰的鉴定是阐明细胞内分子机理的基础。相对于劳动密集的、耗费时间的实验工作,利用各种生物信息学方法开展翻译后修饰... 翻译后修饰在调控蛋白质构象变化、活性以及功能方面具有重要作用,并参与了几乎所有细胞通路和过程。蛋白质翻译后修饰的鉴定是阐明细胞内分子机理的基础。相对于劳动密集的、耗费时间的实验工作,利用各种生物信息学方法开展翻译后修饰预测,能够提供准确、简便和快速的研究方案,并产生有价值的信息为进一步实验研究提供参考。文章主要综述了中国生物信息学者在翻译后修饰生物信息学领域所取得的研究进展,包括修饰底物与位点预测的计算方法学设计与完善、在线或本地化工具的设计与维护、修饰相关数据库及数据资源的构建及基于修饰蛋白质组学数据的生物信息学分析。通过比较国内外的同类研究,发现优势和不足,并对未来的研究作出前瞻。 展开更多
关键词 翻译后修饰 共价修饰 修饰组学 磷酸化
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基于网络药理学的miRNA和环境因子相互作用分析与建模
2
作者 崔庆华 邱承祥 陈耕 《中国药理通讯》 2012年第3期18-18,共1页
近年来，越多越多的研究表明，microRNA（miRNA）作为一类重要的小分子miRNA和包括药物在内的许多环境因子有功能相互作用。然而，这两者的相互作用目前仍缺乏系统的分析和建模，而相关研究对于理解miRNA和环境因子相互关系，对于疾病... 近年来，越多越多的研究表明，microRNA（miRNA）作为一类重要的小分子miRNA和包括药物在内的许多环境因子有功能相互作用。然而，这两者的相互作用目前仍缺乏系统的分析和建模，而相关研究对于理解miRNA和环境因子相互关系，对于疾病的预防、诊断、治疗和预后具有潜在价值。在本文中，我们系统整理和注释了具有实验证据支持的miRNA一环紧因子相互作用数据，并基于网络药理学方法对上述数据进行了系统分析和建模。 展开更多
关键词 MIRNA 药理学方法 相互作用 环境因子 建模 网络 系统整理 潜在价值
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网络药理学与药物靶点研究
3
作者 Wang J Li Z Qiu C Wang D Cui Q 《中国药理通讯》 2012年第3期23-23,共1页
网络药理学是近年来发展起来的新兴交叉学科，改变了以往“单一基因，单一靶点，单一疾病”的新药发现模式。网络药理学的出现对于新药的发现和药物的多靶点研究具有重要的意义，主要应用于新药的毒性预测以及药物的重新调整适用症两方面。
关键词 药物靶点 药理学 网络 新药发现 交叉学科 单一基因 毒性预测 多靶点
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孤独症谱系障碍生理功能异常的研究进展 被引量：2
4
作者 王祖群(综述) 王娟(审校) 《国际儿科学杂志》 2021年第6期381-385,共5页
孤独症谱系障碍是一组高度异质性的神经发育障碍性疾病,患者常存在不同的生理功能异常。文献报道最多的生理功能异常主要集中在四个方面,包括免疫失调/炎症、氧化应激、线粒体功能障碍和环境毒素暴露。该文综述了孤独症患者存在的四个... 孤独症谱系障碍是一组高度异质性的神经发育障碍性疾病,患者常存在不同的生理功能异常。文献报道最多的生理功能异常主要集中在四个方面,包括免疫失调/炎症、氧化应激、线粒体功能障碍和环境毒素暴露。该文综述了孤独症患者存在的四个方面生理异常的主要表现,旨在阐述各方面生理功能异常与孤独症的关系,为孤独症发病机制研究、治疗和预防策略提供线索。 展开更多
关键词 孤独症谱系障碍 免疫失调/炎症 氧化应激 线粒体功能障碍 环境毒素
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lncRNA在结核病患者外周血的差异性表达 被引量：4
5
作者 赵继利 刘微 +3 位作者 曹帅丽 屈艳琳 崔庆华 袁俐 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第4期328-334,340,共8页
目的比较活动性肺结核患者、潜伏感染者与健康对照者外周血结核分枝杆菌特异性抗原刺激前后lncRNA1和lncRNA2的差异性表达,探讨其作为诊断结核分枝杆菌感染生物标志物的可能性。方法收集活动性肺结核患者、潜伏感染者和健康对照者全血,... 目的比较活动性肺结核患者、潜伏感染者与健康对照者外周血结核分枝杆菌特异性抗原刺激前后lncRNA1和lncRNA2的差异性表达,探讨其作为诊断结核分枝杆菌感染生物标志物的可能性。方法收集活动性肺结核患者、潜伏感染者和健康对照者全血,分别在特异性抗原刺激前后提取RNA,利用实时荧光定量PCR方法检测lncRNA1和lncRNA2的mRNA表达水平。应用ELISA检测血浆中IFN-γ和IL-2含量。结果结核分枝杆菌特异性抗原刺激前,结核病组、潜伏感染组全血lncRNA1相对表达量较健康对照组分别下降32%和64%;lncRNA2结核病组相对表达量是健康对照组的6.10倍;抗原刺激后,结核病组、潜伏感染组lncRNA1相对表达量较健康对照组分别下降33%和77%,lncRNA2潜伏感染组相对表达量较健康对照组下降84%。与刺激前相比,抗原刺激后健康对照组、结核病组lncRNA1相对表达量分别提高1.80倍和2.80倍,lncRNA2健康对照组、潜伏感染组分别提高3.50倍和1.86倍(P<0.05)。健康组与潜伏感染组、结核病组与潜伏感染组、健康组与结核病组lncRNA1ROC曲线下面积(AUC)分别为0.700、0.752和0.400,lncRNA2的AUC分别为0.702、0.465和0.762。在结核特异性蛋白刺激前,结核病组IFN-γ、IL-2含量均高于健康组(P<0.05),刺激后,结核病组及潜伏感染组与健康组相比较、潜伏感染组与结核病组相比较IFN-γ均增高(P<0.05)。与刺激前相比,刺激后3组IFN-γ、IL-2诱导表达量均显著增高(P<0.05)。结论活动性结核病、潜伏感染和健康对照者全血结核特异性抗原刺激前后lncRNA1和lncRNA2均出现差异性表达,结核病及潜伏感染者血浆IFN-γ含量增高。lncRNA1和lncRNA2可能是诊断肺结核感染的潜在生物标志物。 展开更多
关键词 肺结核 结核分枝杆菌潜伏感染 长链非编码RNA 荧光定量PCR
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真菌环状RNA鉴定及研究展望
6
作者 胡雪嫣 张赟 +1 位作者 杨恩策 杜明昊 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期2215-2222,共8页
环状RNA是一类具有丰富调节潜力的闭合环状单链RNA,其可以通过竞争性结合内源RNA、充当蛋白质支架以及翻译模板等方式,从而参与基因表达调控。本文综述了真菌环状RNA的鉴定流程和难点,为后续解析环状RNA在真菌发育与代谢等过程中的调节... 环状RNA是一类具有丰富调节潜力的闭合环状单链RNA,其可以通过竞争性结合内源RNA、充当蛋白质支架以及翻译模板等方式,从而参与基因表达调控。本文综述了真菌环状RNA的鉴定流程和难点,为后续解析环状RNA在真菌发育与代谢等过程中的调节作用提供理论支持。 展开更多
关键词 真菌环状 RNA 环状 RNA 鉴定 RNA-SEQ 数据
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