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鸡MHC B-LBⅡ新等位基因检测及多态性研究 被引量：8
1
作者 徐日福 李奎 +5 位作者 陈国宏 强巴央宗 莫德林 李长春 樊斌 刘榜 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期1247-1255,共9页
在鸡的基因组中扩增了MHC B-LBⅡ基因第2外显子长度为374bp的片段,通过克隆、测序,发现了20个B-LBⅡ新等位基因.对第2外显子6个限制性酶切位点(AluⅠ、CaiⅠ、CfrⅠ、Hinl Ⅰ、HinfⅠ和RsaⅠ)的PCR-RFLP多态性进行分析,并运用在这6个位... 在鸡的基因组中扩增了MHC B-LBⅡ基因第2外显子长度为374bp的片段,通过克隆、测序,发现了20个B-LBⅡ新等位基因.对第2外显子6个限制性酶切位点(AluⅠ、CaiⅠ、CfrⅠ、Hinl Ⅰ、HinfⅠ和RsaⅠ)的PCR-RFLP多态性进行分析,并运用在这6个位点所观测的纯合基因型组合对B-LBⅡ等位基因进行初步检测,结果显示,该方法的等位基因检出率可达65%,等位基因主型检出率为68.75%.对B-LBⅡ基因7个单倍型和20个等位基因第2外显子多态性分析表明,核苷酸的多态变异位点为63个,其中简约性信息位点48个,单变异位点15个;仅在中国地方鸡种所检测到的简约性信息位点13个,单变异位点11个.序列同源性达90.6%～99.5%;核苷酸异义替换率为14.64%±2.67%,高于同义替换率2.92%±0.94%.为鸡B-LBⅡ基因多态性进化机制研究提供了参考资料. 展开更多
关键词 等位基因 中国地方鸡种B-LBⅡ基因 多态性
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藏鸡主要组织相容性复合体B-LBⅡ基因第二外显子序列遗传变异分析(英文) 被引量：4
2
作者 徐日福 李奎 +5 位作者 陈国宏 强巴央宗 张玉波 林丽 樊斌 刘榜 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第11期1136-1146,共11页
根据鸡主要组织相容性复合体B-LBⅡ基因序列设计特异性引物,在藏鸡基因组中扩增了一个包括其第二外显子和第二内含子在内长度为374 bp的片段,并通过克隆和PCR直接测序获得了该片段的核苷酸序列。发现了15个B-LBⅡ新等位基因。对18个B-L... 根据鸡主要组织相容性复合体B-LBⅡ基因序列设计特异性引物,在藏鸡基因组中扩增了一个包括其第二外显子和第二内含子在内长度为374 bp的片段,并通过克隆和PCR直接测序获得了该片段的核苷酸序列。发现了15个B-LBⅡ新等位基因。对18个B-LBⅡ等位基因核苷酸序列和其所编码的MHCB-LBⅡ分子β1结构域的氨基酸序列分析显示,第二外显子核苷酸序列遗传多态性异常丰富,存在着62个多态变异位点(共包括80个突变),其中41个为简约性多态位点;衡量该序列遗传多样性的π值为0.0718;反映其群体内遗传变异度的平均遗传距离为0.056±0.008,低于在5个外来品种所估算的平均遗传距离。该编码区核苷酸相对异义替换率(15.61±2.69%)显著高于其同义替换率(3.25±0.94%),进一步分析表明,基因重组和平衡选择机制可能是引起B-LBⅡ基因序列变异的主要因素。在β1结构域氨基酸序列中,存在11个同义替换和27个异义替换;在24个肽结合位点中有12个变异位点;与其他6个中国地方鸡品种和一个外来品种比较发现,有11个异义氨基酸替换仅出现在藏鸡群体中,并被认为与藏鸡的免疫特异性有关,可为鸡的抗病力研究提供分子依据。 展开更多
关键词 主要组织相容性复合体 遗传变异 等位基因 结构域 藏鸡
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