猪专门化分子生物学数据库的建立及其初步应用 被引量：1

1

作者 黄廷华 曹建华 +5 位作者 余梅 刘榜 朱猛进 赵书红 李奎 樊斌 《猪业科学》 2006年第2期19-20,共2页

以公共数据库为基础,利用自编过滤程序初步建立了以核酸序列为主的猪专门化分子生物学数据库。在此基础上初步实现了数据库应用,包括核酸电子自动延伸系统、BLAST同源序列检索程序、参照数据库、siRNA序列设计等。本数据库为猪生物信息... 以公共数据库为基础,利用自编过滤程序初步建立了以核酸序列为主的猪专门化分子生物学数据库。在此基础上初步实现了数据库应用,包括核酸电子自动延伸系统、BLAST同源序列检索程序、参照数据库、siRNA序列设计等。本数据库为猪生物信息学研究平台的建立打下了基础。 展开更多

关键词 分子生物学数据库 生物信息学 数据库应用 猪

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cAMP依赖性蛋白激酶调节亚单位类型1A(RIα)基因的分子生物学研究进展

2

作者 刘佳建 彭中镇 李奎 《生物工程进展》 CSCD 1998年第6期45-48,共4页

ｃＡＭＰ依赖性蛋白激酶调节亚单位类型１Ａ（ＲＩα）基因是ｃＡＭＰ依赖性蛋白激酶（ＰＫＡ）基因家族的一个成员，因其在人生殖细胞的生长、发育、成熟等过程中独有其功效而受到研究者的关注。本文就近年来该基因的定位、结构、功能... ｃＡＭＰ依赖性蛋白激酶调节亚单位类型１Ａ（ＲＩα）基因是ｃＡＭＰ依赖性蛋白激酶（ＰＫＡ）基因家族的一个成员，因其在人生殖细胞的生长、发育、成熟等过程中独有其功效而受到研究者的关注。本文就近年来该基因的定位、结构、功能及表达调控等方面研究进展作一综述。 展开更多

关键词 RIα 蛋白激酶 基因调节 CAMP

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DNA分子标记在动物个体识别与亲权鉴定方面的应用 被引量：14

3

作者 李孟华 王海生 +3 位作者 赵书红 刘榜 陈世林 李奎 《生物技术通报》 CAS CSCD 2001年第5期4-7,共4页

自从DNA分子标记技术建立以来 ,各种DNA分子标记相继被广泛地应用于遗传图谱的构建、评估遗传多样性以及个体识别、亲权鉴定等方面。综述了利用DNA分子标记技术 ,进行动物个体识别与亲权鉴定的原理、研究进展、现状及其应用前景与存在... 自从DNA分子标记技术建立以来 ,各种DNA分子标记相继被广泛地应用于遗传图谱的构建、评估遗传多样性以及个体识别、亲权鉴定等方面。综述了利用DNA分子标记技术 ,进行动物个体识别与亲权鉴定的原理、研究进展、现状及其应用前景与存在的问题。 展开更多

关键词 DAN分子标记 动物 个体识别 亲权鉴定 应用

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哺乳动物的miRNA研究 被引量：1

4

作者 程会军 张定校 樊斌 《生物学杂志》 CAS CSCD 2007年第3期1-5,共5页

微小RNA(microRNA,miRNA)是新近发现的一类重要非编码调控RNA,以转录或转录后水平调节方式参与哺乳动物发育(细胞生长、分化、凋亡)、免疫调节及疾病发生等过程。就miRNA的形成及作用机制,哺乳动物中miRNA发现策略、靶位点的识别,miRNA... 微小RNA(microRNA,miRNA)是新近发现的一类重要非编码调控RNA,以转录或转录后水平调节方式参与哺乳动物发育(细胞生长、分化、凋亡)、免疫调节及疾病发生等过程。就miRNA的形成及作用机制,哺乳动物中miRNA发现策略、靶位点的识别,miRNA功能研究进行综述,为类似研究提供参考。 展开更多

关键词 MIRNA 作用机制 功能 哺乳动物

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湖北省三品种猪27个微卫星座位的遗传变异 被引量：58

5

作者 樊斌 李奎 +2 位作者 彭中镇 龚炎长 赵书红 《生物多样性》 CAS CSCD 1999年第2期91-96,共6页

采用国际动物遗传学会（ＩＳＡＧ）和联合国粮农组织（ＦＡＯ）共同推荐的２７个微卫星标记，对湖北省３个主要地方猪种（通城猪、清平猪和阳新猪）的遗传变异进行了检测。计算出各个品种的基因杂合度、各个座位的多态信息含量及品种间... 采用国际动物遗传学会（ＩＳＡＧ）和联合国粮农组织（ＦＡＯ）共同推荐的２７个微卫星标记，对湖北省３个主要地方猪种（通城猪、清平猪和阳新猪）的遗传变异进行了检测。计算出各个品种的基因杂合度、各个座位的多态信息含量及品种间的遗传距离。结果表明，３个地方猪种的平均基因杂合度分别为０．７４８９、０．６９８７和０．６２７３，遗传多样性比较丰富；通城猪和清平猪亲缘关系较近。 展开更多

关键词 地方猪种 遗传多样性 微卫星 湖北

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藏鸡生长曲线拟合和分析的比较研究 被引量：95

6

作者 朱志明 强巴央宗 +4 位作者 朱猛进 纪素玲 唐晓惠 莫德林 刘榜 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期2159-2162,共4页

【目的】了解藏鸡的生长发育规律。【方法】运用Gompertz,Logistic,von Bertalanffy3种非线性模型分别对饲养在西藏高原的藏鸡0至16周龄体重生长数据进行了曲线拟合和分析。【结果】3种模型均能很好的模拟藏鸡生长曲线,但Gompertz模型... 【目的】了解藏鸡的生长发育规律。【方法】运用Gompertz,Logistic,von Bertalanffy3种非线性模型分别对饲养在西藏高原的藏鸡0至16周龄体重生长数据进行了曲线拟合和分析。【结果】3种模型均能很好的模拟藏鸡生长曲线,但Gompertz模型拟合效果更佳;进一步分析Gompertz模型拟合参数,发现藏公鸡成年体重(1 252.0 g)显著高于藏母鸡(808.9 g),但藏公鸡拐点时间为13.20周较藏母鸡的拐点时间11.27周迟。【结论】运用3种模型对藏鸡进行生长曲线的拟合和分析是可行的,对及时了解藏鸡的生长发育规律提供了参考。 展开更多

关键词 生长曲线 藏鸡 体重 模型

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微卫星及其功能研究 被引量：8

7

作者 杨述林 王志刚 +2 位作者 樊斌 刘榜 李奎 《湖北农业科学》 北大核心 2003年第6期91-93,共3页

概述了微卫星的发现及其在进化过程中产生和消亡的机理 ;

关键词 微卫星 进化 产生 消亡 序列 基因组 功能 DNA重复序列 染色质 折叠 性别 端粒 着丝粒 表达 蛋白 剂量效应 重组 复制 密码

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利用5个多态蛋白(酶)位点分析6个地方猪品种的遗传结构 被引量：4

8

作者 林丽 王志刚 +6 位作者 刘榜 李拥军 赵小丽 杨述林 樊斌 李奎 肖炜 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期511-515,共5页

利用 5个多态蛋白 (酶 )位点碱性磷酸酶 (Akp)、蛋白酶抑制物 1(PI 1)、后白蛋白 1(Po 1)、后白蛋白2 (Po 2 )和铜蓝蛋白 (Cp)分析了清平猪、阳新猪、南阳黑猪、南城黑猪、东乡花猪、杭猪 6个地方猪品种的遗传结构和遗传变异。 6个品种... 利用 5个多态蛋白 (酶 )位点碱性磷酸酶 (Akp)、蛋白酶抑制物 1(PI 1)、后白蛋白 1(Po 1)、后白蛋白2 (Po 2 )和铜蓝蛋白 (Cp)分析了清平猪、阳新猪、南阳黑猪、南城黑猪、东乡花猪、杭猪 6个地方猪品种的遗传结构和遗传变异。 6个品种的平均杂合度大小依次为 :南阳黑猪 (0 .4 14 2 )、南城黑猪 (0 .30 5 7)、阳新猪 (0 .30 32 )、东乡花猪 (0 .2 6 0 6 )、杭猪 (0 .2 4 78)、清平猪 (0 .2 4 16 ) ,通过计算Nei(1978)标准遗传距离 ,用UPGMA进行聚类分析 ,6个品种聚成 2大类 :清平猪、南城黑猪、阳新猪、南阳黑猪聚成一大类 ;东乡花猪与杭猪聚成另一类。 展开更多

关键词 猪 蛋白多态性 遗传结构 地方品种 遗传标记 蛋白酶

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一个新的猪肌肉组织EST的分离、定位与表达 被引量：3

9

作者 潘佩文 赵书红 +3 位作者 余梅 刘榜 熊统安 李奎 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第10期871-874,共4页

利用mRNA差异显示技术 ,从猪骨骼肌组织中分离到一个新的表达序列标签 (expressedsequencetag,EST)ESThp9 1(其GenBank登录号 :BI5 96 2 6 2 ) ,其序列长 196bp ,经BLAST程序与GenBank中存在的序列比对后 ,发现与猪的所有序列无同源性 ... 利用mRNA差异显示技术 ,从猪骨骼肌组织中分离到一个新的表达序列标签 (expressedsequencetag,EST)ESThp9 1(其GenBank登录号 :BI5 96 2 6 2 ) ,其序列长 196bp ,经BLAST程序与GenBank中存在的序列比对后 ,发现与猪的所有序列无同源性 ,但与大鼠的U3A核内小RNA基因及小鼠的U3B .4核内小RNA基因同源性分别为 87% (93个碱基 )和 85 % (96个碱基 )。半定量RT PCR表明 ,此EST在猪的多数组织中均有表达。通过体细胞杂种板(somaticcellhybridpanel,SCHP)及辐射杂种板 (radiationhybridpanel,RH)分析 ,ESThp9 1被定位于猪的 12号染色体长臂 ,与微卫星标记S0 0 90连锁。根据同源性比对和物理定位结果 ,推测ESThp9 1为猪的U3基因家族中一员。 展开更多

关键词 猪 肌肉组织 EST 分离 定位 表达 差异显示 表达序列标签 体细胞杂种板 辐射杂种板

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应用CATS法分离和鉴定猪GFAP基因的研究 被引量：3

10

作者 余梅 李奎 +2 位作者 赵书红 刘榜 熊统安 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第1期15-19,共5页

根据比较锚定序列示踪（ＣＡＴＳ）法，选择人和小鼠胶质细胞原纤维酸性蛋白（ＧＦＡＰ）基因的同源区域设计引物，用ＰＣＲ方法从二花脸猪基因组中分离到４１２ｂｐ的基因片段，经与基因资料库中已知功能基因的同源性比较，该片段可鉴... 根据比较锚定序列示踪（ＣＡＴＳ）法，选择人和小鼠胶质细胞原纤维酸性蛋白（ＧＦＡＰ）基因的同源区域设计引物，用ＰＣＲ方法从二花脸猪基因组中分离到４１２ｂｐ的基因片段，经与基因资料库中已知功能基因的同源性比较，该片段可鉴定为猪的ＧＦＡＰ基因，利用猪一啮齿类体细胞杂种克隆板将 ＧＦＡＰ基因定位于猪 １２号染色体 １２ｐ１１－（２／ ３）ｐ１３区域。 展开更多

关键词 猪 CATS 新基因 GFAP

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饱和苯酚-氯仿抽提法与Chelex-100树脂法提取DNA在研究犬STR基因座多态性中的应用比较 被引量：4

11

作者 王海生 张文平 +5 位作者 王祥 李孟华 康远方 刘榜 李奎 陈家琳 《湖北农业科学》 北大核心 2002年第6期107-110,共4页

在研究犬STR基因座多态性中,比较使用了饱和苯酚-氯仿抽提法和Chelex-100树脂法,两种方法提取的DNA在扩增后的检测结果均能准确地反映实验结果。尽管从平均峰面积和平均峰高值等指标上,利用Chelex-100树脂法提取的DNA质量和扩增后的检... 在研究犬STR基因座多态性中,比较使用了饱和苯酚-氯仿抽提法和Chelex-100树脂法,两种方法提取的DNA在扩增后的检测结果均能准确地反映实验结果。尽管从平均峰面积和平均峰高值等指标上,利用Chelex-100树脂法提取的DNA质量和扩增后的检测效果较饱和苯酚-氯仿抽提法差,但Chelex-100树脂提取法更为简单快捷,适合在建立警犬STR基因座等位基因数据库中和犬亲缘关系鉴定中广泛使用。 展开更多

关键词 饱和苯酚-氯仿抽提法 Chelex-100树脂法 提取 DNA 犬 STR基因座多态性 应用 比较

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用引物原位合成和体细胞杂种克隆板将猪微卫星SW943定位于12p11～(2/3p13) 被引量：2

12

作者 刘榜 王永强 +4 位作者 张庆德 余梅 赵书红 熊统安 李奎 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期460-464,共5页

以Dig 11 dUTP为报告分子 ,运用猪微卫星SW 94 3引物在猪减数分裂粗线期二价体 (下称二价体 )上进行引物原位DNA合成 (primedinsitulabeling ,PRINS) ,用鼠抗地高辛、兔抗鼠、羊抗兔抗体检测引物原位合成结果对SW 94 3进行定位研究 ,同... 以Dig 11 dUTP为报告分子 ,运用猪微卫星SW 94 3引物在猪减数分裂粗线期二价体 (下称二价体 )上进行引物原位DNA合成 (primedinsitulabeling ,PRINS) ,用鼠抗地高辛、兔抗鼠、羊抗兔抗体检测引物原位合成结果对SW 94 3进行定位研究 ,同时运用包含猪 啮齿类 2 7个细胞系的杂种细胞克隆板 ,通过PCR扩增进行SW 94 3的定位 ,结果将猪微卫星SW 94 3定位于 12 p11～ (2 /3p13)。 展开更多

关键词 引物原位合成 体细胞杂种克隆板 猪 微卫星SW943 微卫星DNA 染色体定位

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绒山羊随机扩增多态DNA研究 被引量：3

13

作者 陈世林 赵书红 +4 位作者 朱猛进 李永军 余梅 李孟华 李奎 《湖北农业科学》 北大核心 2002年第2期76-78,共3页

利用RAPD技术对西藏绒山羊、内蒙绒山羊、辽宁绒山羊的遗传变异进行了分析比较 ,用 37个随机引物和 5 5个两两组合的随机引物组合进行筛选 ,筛选出了 5个多态性较为丰富的随机引物 (组合 )。用其对 3个品种 ,每个品种 2 8个个体进行扩... 利用RAPD技术对西藏绒山羊、内蒙绒山羊、辽宁绒山羊的遗传变异进行了分析比较 ,用 37个随机引物和 5 5个两两组合的随机引物组合进行筛选 ,筛选出了 5个多态性较为丰富的随机引物 (组合 )。用其对 3个品种 ,每个品种 2 8个个体进行扩增。由RAPD指纹图计算出西藏绒山羊同内蒙绒山羊的遗传距离为 0 0 876 ,西藏绒山羊同辽宁绒山羊的遗传距离为 0 16 0 1,内蒙绒山羊同辽宁绒山羊的遗传距离为 0 0 80 3,西藏绒山羊、内蒙绒山羊、辽宁绒山羊的遗传变异分别为 0 32 6 6 ,0 2 6 2 2 ,0 2 4 75。 展开更多

关键词 绒山羊 随机扩增多态DNA 遗传变异 遗传距离

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畜禽微卫星的应用 被引量：7

14

作者 龚炎长 彭中镇 师守 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 1998年第6期51-52,共2页

微卫星（Ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｉｔｅ）是指由１－６ｂｐ的碱基序列为核心，呈串联重复状散在分布于整个基因组的ＤＮＡ序列。由于微卫星标记在基因组中具有数量大、分布广、分布均匀、多态含量丰富及检测方便适合自动化和半自动化分析... 微卫星（Ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｉｔｅ）是指由１－６ｂｐ的碱基序列为核心，呈串联重复状散在分布于整个基因组的ＤＮＡ序列。由于微卫星标记在基因组中具有数量大、分布广、分布均匀、多态含量丰富及检测方便适合自动化和半自动化分析的优点，已成为各物种遗传图谱构建、... 展开更多

关键词 畜禽 微卫星 DNA序列 遗传育种

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mRNA差异显示技术及其在猪基因组研究中的应用 被引量：3

15

作者 潘佩文 赵书红 +2 位作者 刘榜 李奎 彭中镇 《畜牧与兽医》 北大核心 2001年第3期38-40,共3页

差异显示是一种快速分离、鉴定不同细胞类型基因表达差异的有效方法。此技术自建立以来便广泛应用于比较研究中 ;

关键词 猪 基因组 MRNA差异显示技术 基本原理

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利用体细胞杂种克隆板进行染色体区域定位的数据分析 被引量：1

16

作者 余梅 刘榜 +2 位作者 赵书红 熊统安 李奎 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期48-52,共5页

利用猪×啮齿类体细胞杂种克隆板对本室新克隆和分离的猪胶质细胞原纤维酸性蛋白 (glialfibril laryacidicprotein ,GFAP)基因进行染色体区域定位 ,对应用体细胞杂种克隆板进行染色体区域定位的试验数据统计的基本过程和方法进行了... 利用猪×啮齿类体细胞杂种克隆板对本室新克隆和分离的猪胶质细胞原纤维酸性蛋白 (glialfibril laryacidicprotein ,GFAP)基因进行染色体区域定位 ,对应用体细胞杂种克隆板进行染色体区域定位的试验数据统计的基本过程和方法进行了分析 ,研究结果表明 :猪GFAP基因定位于染色体 12p11- (2 /3p13)区域 (P <0 .1% ) 。 展开更多

关键词 体细胞杂种克隆板 染色体区域定位 数据分析 猪 GFAP基因

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应用参考家系信息构建猪12号染色体部分微位星位点遗传图的研究 被引量：1

17

作者 赵书红 张建生 +4 位作者 孙仕铨 顾建平 余梅 李奎 彭中镇 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第5期469-473,共5页

为了提高猪１２号染色体遗传图的精度，选择德系大约克与二花脸猪通过回交方法建立了参考家系，采取了两胎共１５４头个体的血样，全血裂解法提取ＤＮＡ后，对每头猪的ＤＮＡ样品进行ＰＣＲ扩增后应用银染法检测了每头个体在猪１２号染... 为了提高猪１２号染色体遗传图的精度，选择德系大约克与二花脸猪通过回交方法建立了参考家系，采取了两胎共１５４头个体的血样，全血裂解法提取ＤＮＡ后，对每头猪的ＤＮＡ样品进行ＰＣＲ扩增后应用银染法检测了每头个体在猪１２号染色体上３个微卫星位点（ＳＷ１５５３，ＳＷ８７４，ＳＷ１３５０）的基因型，应用ＣＲＩＭＡＰ程序进行了统计分析，得到的３位点间的最佳排序为：ＳＷ１５５３－ＳＷ１３５０－ＳＷ８７４。其中在两个美国肉畜研究中心图中重组率为０的位点（ＳＷ１５５３，ＳＷ１３５０）上发现了重组，并与其他位点做了排序，提高了这一区域的定位精度。 展开更多

关键词 猪 12号染色体 遗传图 微位星位点

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用正交设计优化M13mp18RFDNA转染大肠杆菌TG_1的条件 被引量：1

18

作者 龚炎长 李奎 +2 位作者 彭中镇 师守坤 赵书红 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第5期386-388,共3页

采用正交设计（Ｌ９（３４））对影响Ｍ１３ｍｐ１８转染其宿主大肠杆菌ＴＧ１的３个因素：热激温度、时间和ＤＮＡ量各设３个水平进行优化。直观分析表明：热激温度是主要的，其次是ＤＮＡ量，最后是热激时间。直观分析确定的较优转染... 采用正交设计（Ｌ９（３４））对影响Ｍ１３ｍｐ１８转染其宿主大肠杆菌ＴＧ１的３个因素：热激温度、时间和ＤＮＡ量各设３个水平进行优化。直观分析表明：热激温度是主要的，其次是ＤＮＡ量，最后是热激时间。直观分析确定的较优转染条件为：热激温度４４℃、时间１２０ｓ、ＤＮＡ量６００ｐｇ。验证转染试验表明：在该条件下Ｍ１３ｍｐ１８对ＴＧ１的转染效率较高。 展开更多

关键词 畜牧 M13mp18噬菌体 转染 正交设计

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鸡卵细胞卵黄生成受体及其研究进展 被引量：3

19

作者 龚炎长 彭中镇 师守坤 《湖北农业科学》 1998年第1期56-58,共3页

对鸡卵细胞卵黄生成受体（ＯＶＲ）的结构、生理功能及其受控基因多态性的研究现状进行了综述，并讨论了对此基因作进一步研究的必要性。

关键词 卵细胞 卵黄生成受体 结构 功能 基因多态性 鸡

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藏山羊微卫星DNA复合扩增的条件探索 被引量：1

20

作者 李孟华 王海生 +5 位作者 张文平 康远方 赵书红 边次 刘榜 李奎 《湖北农业科学》 北大核心 2003年第1期89-91,共3页

对微卫星DNA的复合扩增与同步扩增进行比较研究 ,结果表明通过优化微卫星位点引物组合 ,以及复合扩增反应体系中模板DNA浓度、引物浓度、Mg2 +浓度、退火温度和检测时的电泳环境等一系列条件 ,其扩增产物量以及产物特异性虽然均有所下... 对微卫星DNA的复合扩增与同步扩增进行比较研究 ,结果表明通过优化微卫星位点引物组合 ,以及复合扩增反应体系中模板DNA浓度、引物浓度、Mg2 +浓度、退火温度和检测时的电泳环境等一系列条件 ,其扩增产物量以及产物特异性虽然均有所下降 ,然而其扩增产物能准确反映结果 ,且具有方便、快捷。 展开更多

关键词 藏山羊 微卫星DNA 复合扩增 条件

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