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利用RAPD和ISSR分子标记分析地黄种质遗传多样性 被引量：71
1
作者 周延清 景建洲 +2 位作者 李振勇 张宝华 贾敬芬 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期922-928,共7页
用RAPD与ISSR技术对地黄的 8个品种和 2个脱毒品系进行了种质遗传多样性分析。分别从 80条RAPD引物和 4 4条ISSR引物中筛选出适合地黄种质分析的 17条RAPD引物和 10条ISSR引物用于RAPD和ISSR分析。 17条RAPD引物共扩增出 177条带 ,多态... 用RAPD与ISSR技术对地黄的 8个品种和 2个脱毒品系进行了种质遗传多样性分析。分别从 80条RAPD引物和 4 4条ISSR引物中筛选出适合地黄种质分析的 17条RAPD引物和 10条ISSR引物用于RAPD和ISSR分析。 17条RAPD引物共扩增出 177条带 ,多态性位点数为 10 9;多态性位点比率为 6 1 5 8% ;平均多样性指数 (I)为0 3135 ;每个位点的有效等位基因数 (Ne)是 1 36 4 1;10条ISSR引物共扩增出 110条带 .多态性位点数为 79;多态性位点比率为 71 5 8% ;平均多样性指数 (I)为 0 35 77;每个位点的有效等位基因数 (Ne)是 1 4 0 37。基于扩增条带数据库建立了各自的Jaccard遗传相关系数矩阵 ,构建了相似的分子树状图 ,将 10个供试材料分为 2类 :一类群含组培 85 5、大田 85 5、组培 930 2、大田 930 2、金状元和金白 6个材料 ;另一类群含北京 1号、大红袍、地黄 910 4和野生地黄 4个材料。两种分子标记的分析结果呈极显著正相关 (r=0 6 4 9)。结果表明 ,RAPD与ISSR标记适合于地黄种质遗传多样性分析 。 展开更多
关键词 地黄 RAPD ISSR 种质遗传多样性 DNA分子标记
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怀区地黄遗传多样性的ISSR鉴定 被引量：48
2
作者 周延清 景建洲 +3 位作者 李振勇 张宝华 王天亮 贾敬芬 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期257-261,共5页
目的利用ISSR标记技术对怀区地黄的8个品种和2个茎尖培养脱毒系进行了遗传多样性分析。方法用44条ISSR引物进行初选,然后用其中适合的10个ISSR引物进行ISSR分析。结果10条ISSR引物共扩增出110条带。基于这些条带,用SPSS10.0软件分析,建... 目的利用ISSR标记技术对怀区地黄的8个品种和2个茎尖培养脱毒系进行了遗传多样性分析。方法用44条ISSR引物进行初选,然后用其中适合的10个ISSR引物进行ISSR分析。结果10条ISSR引物共扩增出110条带。基于这些条带,用SPSS10.0软件分析,建立了遗传Jaccard相关系数矩阵,构建了分子树状图,将怀区地黄的8个品种和2个组培系分为2类:其中一类群含有6个材料,包括组培85.5、大田85.5、组培9302、大田9302、金状元和金白地黄;另一类群含有4个材料,包括北京1号、大红袍、地黄9104和野生地黄。而且主成分分析结果支持上述的聚类分析结果;用POPGENE32软件分析知,多态性指数为0.3775,有效等位基因数为1.4037,多态性比率为71.82%;用一个ISSR6引物建立了10个供试地黄样品的DNA指纹图谱并且能将其彼此区分出来。结论ISSR标记适合于构建怀区地黄的DNA指纹图谱、品种鉴定和遗传多样性分析。 展开更多
关键词 怀区地黄 ISSR 遗传多样性 遗传相似性
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用ISSR标记技术分析山药品种遗传多样性 被引量：40
3
作者 周延清 景建洲 +4 位作者 李振勇 浩健 贾敬芬 张宝华 郝建国 《实验生物学报》 CSCD 北大核心 2005年第4期324-330,共7页
利用ISSR标记技术对28个山药品种的遗传多样性进行分析。结果表明,从44条ISSR引物中可筛选出7条能够扩增出清晰、稳定条带的引物;这7条ISSR引物对28个山药品种扩增条带间存在较大差异,多态性条带比率为83.01%,Shannon多样性指数为0.3191... 利用ISSR标记技术对28个山药品种的遗传多样性进行分析。结果表明,从44条ISSR引物中可筛选出7条能够扩增出清晰、稳定条带的引物;这7条ISSR引物对28个山药品种扩增条带间存在较大差异,多态性条带比率为83.01%,Shannon多样性指数为0.3191;构建的分子树状图将28个山药品种划分为4组:第一组含有日本白、花山药和日本园3个品种;第二组为小叶山药;第三组为嵩野1号;其余23个品种归入第四组。而且主成分分析结果支持上述的聚类分析结果。这为利用ISSR标记技术鉴定山药品种,为有效地利用山药种质资源提供了依据。 展开更多
关键词 ISSR标记技术 山药 品种 遗传多样性 主成分分析 聚类分析
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怀地黄ISSR扩增条件优化的研究(英文) 被引量：34
4
作者 周延清 景建洲 +2 位作者 李振勇 浩健 贾敬芬 《西北植物学报》 CAS CSCD 2004年第1期6-11,共6页
用CTAB法提取怀地黄嫩叶DNA,进行简单重复间序列标记 ISSR 分析.通过单因子实验分别研究了退火温度、Taq酶单位、Mg2+浓度、dNTP浓度、引物浓度和模板DNA浓度对ISSR-PCR反应的影响,找出各自的合适条件,而且每一个合适条件确定以后都被... 用CTAB法提取怀地黄嫩叶DNA,进行简单重复间序列标记 ISSR 分析.通过单因子实验分别研究了退火温度、Taq酶单位、Mg2+浓度、dNTP浓度、引物浓度和模板DNA浓度对ISSR-PCR反应的影响,找出各自的合适条件,而且每一个合适条件确定以后都被作为后续研究的一个条件.通过各个因子的组合研究建立了适宜于怀地黄ISSR分析的扩增体系:25μLPCR反应体积,1×TaqDNA酶缓冲液 10mmol/LTris-HCl,50mmol/LKCl,0.1%TrionX-100,pH9.0 ,2.5mmol/LMgCl2,1.5～1.0UTaq酶,60ng模板DNA,0.4μmmol/L引物,各0.4mmol/L的dATP、dGTP、dCTP和dTTP.合适的退火温度为53～55℃.为用ISSR技术分析鉴定怀地黄种质资源奠定了良好的基础. 展开更多
关键词 怀地黄 ISSR PCR 条件优化
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霸王基因组RAPD优化条件的建立 被引量：12
5
作者 郝瑞文 景建洲 +1 位作者 李振勇 贾敬芬 《中国沙漠》 CSCD 北大核心 2006年第2期286-290,共5页
实验以霸王20d龄无菌籽苗为材料，使用CTAB法提取其基因组DNA，进行RAPD条件优化分析。通过单因子实验分别研究了Mg^2＋浓度、dNTPs浓度、Taq酶的浓度、引物浓度和模板DNA浓度对RAPD反应的影响，即在25μL总反应体系中，Mg^2＋的适宜浓... 实验以霸王20d龄无菌籽苗为材料，使用CTAB法提取其基因组DNA，进行RAPD条件优化分析。通过单因子实验分别研究了Mg^2＋浓度、dNTPs浓度、Taq酶的浓度、引物浓度和模板DNA浓度对RAPD反应的影响，即在25μL总反应体系中，Mg^2＋的适宜浓度为1．5～2．5mmol·L^-1、dNTPs的适宜浓度为0．2～0．3mmol·L^-1、随机引物的浓度以1．2μmol·L^-1为宜、Taq酶的用量以2．0U为佳、模板DNA的最适用量为50ng。本研究的PCR扩增程序为94℃预变性8min，94℃变性1min，37℃退火1min，72℃延伸2min，设40个循环，最后72℃保温6min。 展开更多
关键词 霸王 RAPD PCR 条件优化
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草木樨状黄芪变异系中甲硫氨酸代谢相关cDNA的分子克隆及其在大肠杆菌中的表达
6
作者 刘永军 景建洲 +1 位作者 贾敬芬 李振勇 《西北植物学报》 CAS CSCD 2004年第1期1-5,共5页
利用mRNA差异显示技术 differentialdisplay 从草木樨状黄芪耐甲硫氨酸变异系中分离到一差异cDNA片段,命名为tm03 360bp .mRNA杂交结果显示,该片段只在变异苗中表达,初步确定其与甲硫氨酸代谢相关.测序后在Genebank搜寻,未发现有同源序... 利用mRNA差异显示技术 differentialdisplay 从草木樨状黄芪耐甲硫氨酸变异系中分离到一差异cDNA片段,命名为tm03 360bp .mRNA杂交结果显示,该片段只在变异苗中表达,初步确定其与甲硫氨酸代谢相关.测序后在Genebank搜寻,未发现有同源序列.进一步分析表明,该cDNA克隆可编码完整的蛋白.在该基因片段两端分别合成含Hind 和BamH 酶切位点的引物,用PCR扩增后亚克隆到pRSETA表达载体,转化宿主菌JM109 DE3 ,经IPTG诱导表达了N′端含6个组氨酸的蛋白质,分子量约为14kD,为进一步研究该蛋白的结构和生物学功能奠定基础. 展开更多
关键词 草木樨状黄芪变异系 甲硫氨酸代谢 克隆 表达
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