目的初步探讨老年冠心病患者肠道菌群结构的特点及差异。方法选取2018年10月~2020年1月北京某三甲医院住院的老年男性患者66例,将血管狭窄≥50%的36例作为冠心病组,血管狭窄<30%的30例作为对照组,收集患者大便进行处理,采用16S rDNA...目的初步探讨老年冠心病患者肠道菌群结构的特点及差异。方法选取2018年10月~2020年1月北京某三甲医院住院的老年男性患者66例,将血管狭窄≥50%的36例作为冠心病组,血管狭窄<30%的30例作为对照组,收集患者大便进行处理,采用16S rDNA高通量测序方法分析样本肠道菌群结构。结果Alpha多样性分析显示,冠心病组操作分类单元和Shannon指数高于对照组[(295.70±64.33)类vs(242.10±69.11)类,P=0.037;3.25±0.54 vs 2.33±0.56,P=0.020],Simpson指数低于对照组(0.08±0.03 vs 0.12±0.03,P=0.019);门层级水平,2组样本多样性无明显差异(P>0.05);冠心病组放线菌门细菌丰度较对照组增多、梭杆菌门细菌丰度较对照组减少(P<0.05,P<0.01),变形菌门较对照组减少,近统计学差异(P=0.0527)。属层级水平,2组多样性和物种丰度均有差异(P<0.05),冠心病组以双歧杆菌属和真杆菌属为主(P<0.05),对照组以志贺菌属和粪杆菌属丰度较高(P<0.05)。结论冠心病组肠道菌群的多样性更高,放线菌门、双歧杆菌属和真杆菌属相对丰度更高。展开更多
目的利用DNA-pool技术对原发性高血压患者进行测序,探索中国原发性高血压患者单核苷酸多态性变异(SNP)情况。方法连续收集2014年3月至2014年6月深圳市孙逸仙心血管医院的高血压门诊患者100例。将基因组DNA片段化处理至400~800bp进行建...目的利用DNA-pool技术对原发性高血压患者进行测序,探索中国原发性高血压患者单核苷酸多态性变异(SNP)情况。方法连续收集2014年3月至2014年6月深圳市孙逸仙心血管医院的高血压门诊患者100例。将基因组DNA片段化处理至400~800bp进行建库测序,将测序结果与NCBI(National Center of Biotechnology Information)人类基因库hg19进行比对。结果共生成120.8Gb原始序列数据,测序深度约为36.13倍,覆盖率达到了99.88%。通过生物信息学分析共检测到4 305 668个SNP点,其中C:G→T:A的变异类型最多,达到12 314个变异位点。结论研究验证了使用DNA-pool的全基因组重排序的方法。研究所得数据也对中国原发性高血压的基因型数据库进行了补充,对未来原发性高血压基因研究提供了一定的帮助。展开更多
文摘目的初步探讨老年冠心病患者肠道菌群结构的特点及差异。方法选取2018年10月~2020年1月北京某三甲医院住院的老年男性患者66例,将血管狭窄≥50%的36例作为冠心病组,血管狭窄<30%的30例作为对照组,收集患者大便进行处理,采用16S rDNA高通量测序方法分析样本肠道菌群结构。结果Alpha多样性分析显示,冠心病组操作分类单元和Shannon指数高于对照组[(295.70±64.33)类vs(242.10±69.11)类,P=0.037;3.25±0.54 vs 2.33±0.56,P=0.020],Simpson指数低于对照组(0.08±0.03 vs 0.12±0.03,P=0.019);门层级水平,2组样本多样性无明显差异(P>0.05);冠心病组放线菌门细菌丰度较对照组增多、梭杆菌门细菌丰度较对照组减少(P<0.05,P<0.01),变形菌门较对照组减少,近统计学差异(P=0.0527)。属层级水平,2组多样性和物种丰度均有差异(P<0.05),冠心病组以双歧杆菌属和真杆菌属为主(P<0.05),对照组以志贺菌属和粪杆菌属丰度较高(P<0.05)。结论冠心病组肠道菌群的多样性更高,放线菌门、双歧杆菌属和真杆菌属相对丰度更高。
文摘目的利用DNA-pool技术对原发性高血压患者进行测序,探索中国原发性高血压患者单核苷酸多态性变异(SNP)情况。方法连续收集2014年3月至2014年6月深圳市孙逸仙心血管医院的高血压门诊患者100例。将基因组DNA片段化处理至400~800bp进行建库测序,将测序结果与NCBI(National Center of Biotechnology Information)人类基因库hg19进行比对。结果共生成120.8Gb原始序列数据,测序深度约为36.13倍,覆盖率达到了99.88%。通过生物信息学分析共检测到4 305 668个SNP点,其中C:G→T:A的变异类型最多,达到12 314个变异位点。结论研究验证了使用DNA-pool的全基因组重排序的方法。研究所得数据也对中国原发性高血压的基因型数据库进行了补充,对未来原发性高血压基因研究提供了一定的帮助。