目的探讨orthogonal projection to latent structures(OPLS)方法的原理、特点及其在代谢组学高维数据分析中的应用。方法通过R语言编程实现OPLS方法,利用模拟试验探索OPLS的特性及适用条件,并通过实际数据进行验证。结果利用一个OPLS...目的探讨orthogonal projection to latent structures(OPLS)方法的原理、特点及其在代谢组学高维数据分析中的应用。方法通过R语言编程实现OPLS方法,利用模拟试验探索OPLS的特性及适用条件,并通过实际数据进行验证。结果利用一个OPLS预测主成分的模型拟合效果与利用偏最小二乘(PLS)多个主成分的模型拟合效果相同,同时具有较好的判别能力,其得分图的可视化效果优于PLS。结论 OPLS能够有效去除自变量矩阵X中与因变量Y无关的信息,使模型变得简单、易于解释,同时具有较好的可视化效果,可有效地用于代谢组学数据分析中。展开更多
代谢组学的概念自20世纪90年代被正式提出,已被广泛应用于医学研究领域,其一般研究流程包括样本采集、样本检测、数据预处理、数据分析和生物学解释等。常用的样本检测技术有核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)和高分辨率色谱...代谢组学的概念自20世纪90年代被正式提出,已被广泛应用于医学研究领域,其一般研究流程包括样本采集、样本检测、数据预处理、数据分析和生物学解释等。常用的样本检测技术有核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)和高分辨率色谱-质谱联用技术,本文所述方法针对后者。展开更多