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基于预后相关基因构建的分析模型可识别高风险胶质母细胞瘤（英文）
被引量：
1
1
作者
陈弟
陈迪康
+2 位作者
曹冬青
胡建
姚瑜
《中南大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期368-382,共15页
目的:通过对多个公共数据库中胶质母细胞瘤转录组数据进行挖掘,筛选胶质母细胞瘤预后相关的基因,并构建预后分析模型。方法:利用生物信息学技术对GEO(GSE53733)中生存时间大于36个月和小于12个月的样本数据对比分析得到差异表达基因,即...
目的:通过对多个公共数据库中胶质母细胞瘤转录组数据进行挖掘,筛选胶质母细胞瘤预后相关的基因,并构建预后分析模型。方法:利用生物信息学技术对GEO(GSE53733)中生存时间大于36个月和小于12个月的样本数据对比分析得到差异表达基因,即胶质母细胞瘤预后相关基因;采用Cox风险回归方法在CGGA和TCGA两个独立数据库中筛选与预后相关的标签基因并构建预后分析模型;采用基因探针富集分析(GSEA),GO(gene ontology)功能富集分析和蛋白网络互作分析(PPI)等方法分析高、低风险胶质母细胞瘤的分子特征。结果:分析得到211个胶质母细胞瘤预后相关基因,并且从中筛选出17个标签基因。利用分子标签基因构建的模型能将胶质母细胞瘤划分为高风险组和低分险组,高风险组的患者预后较差,在分子特征上更具免疫抑制性和侵袭性。结论:通过挖掘公共数据库建立的分析模型对胶质母细胞瘤预后有良好的预测作用,判定为高风险组的胶质母细胞瘤预后更差,可作为潜在的胶质母细胞瘤预后指示标签。
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关键词
胶质母细胞瘤
预后
CGGA
TCGA
下载PDF
职称材料
全外显子测序在肿瘤免疫治疗中的意义及其在脑胶质瘤中的应用
被引量：
1
2
作者
陈弟
唐超
姚瑜
《中华医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第15期1198-1200,共3页
近年来肿瘤免疫治疗为恶性肿瘤患者带来了新的希望，尤其是免疫检查点抑制剂治疗取得了很大的进展，但仍缺少预测疗效的标志物。基于测序技术分析肿瘤突变负荷、错配修复缺陷等是目前研究较多的免疫治疗标志物。随着新一代测序技术的发...
近年来肿瘤免疫治疗为恶性肿瘤患者带来了新的希望，尤其是免疫检查点抑制剂治疗取得了很大的进展，但仍缺少预测疗效的标志物。基于测序技术分析肿瘤突变负荷、错配修复缺陷等是目前研究较多的免疫治疗标志物。随着新一代测序技术的发展，全外显子测序为上述分析提供了契机。
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关键词
肿瘤免疫治疗
测序技术
外显子
脑胶质瘤
应用
恶性肿瘤患者
错配修复缺陷
预测疗效
原文传递
题名
基于预后相关基因构建的分析模型可识别高风险胶质母细胞瘤（英文）
被引量：
1
1
作者
陈弟
陈迪康
曹冬青
胡建
姚瑜
机构
复旦大学附属华山医院
神经
外科
复旦大学附属华山医院神经外科免疫室
德克萨斯
大学
安德森癌症中心癌症生物学系
出处
《中南大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期368-382,共15页
基金
supported by the National Natural Science Foundation of China(81572478,81472347)
文摘
目的:通过对多个公共数据库中胶质母细胞瘤转录组数据进行挖掘,筛选胶质母细胞瘤预后相关的基因,并构建预后分析模型。方法:利用生物信息学技术对GEO(GSE53733)中生存时间大于36个月和小于12个月的样本数据对比分析得到差异表达基因,即胶质母细胞瘤预后相关基因;采用Cox风险回归方法在CGGA和TCGA两个独立数据库中筛选与预后相关的标签基因并构建预后分析模型;采用基因探针富集分析(GSEA),GO(gene ontology)功能富集分析和蛋白网络互作分析(PPI)等方法分析高、低风险胶质母细胞瘤的分子特征。结果:分析得到211个胶质母细胞瘤预后相关基因,并且从中筛选出17个标签基因。利用分子标签基因构建的模型能将胶质母细胞瘤划分为高风险组和低分险组,高风险组的患者预后较差,在分子特征上更具免疫抑制性和侵袭性。结论:通过挖掘公共数据库建立的分析模型对胶质母细胞瘤预后有良好的预测作用,判定为高风险组的胶质母细胞瘤预后更差,可作为潜在的胶质母细胞瘤预后指示标签。
关键词
胶质母细胞瘤
预后
CGGA
TCGA
Keywords
glioblastoma
prognosis
CGGA
TCGA
分类号
R739.4 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
全外显子测序在肿瘤免疫治疗中的意义及其在脑胶质瘤中的应用
被引量：
1
2
作者
陈弟
唐超
姚瑜
机构
复旦大学附属华山医院
神经
外科
、
复旦大学附属华山医院神经外科免疫室
出处
《中华医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第15期1198-1200,共3页
基金
国家自然科学基金（81572478）
文摘
近年来肿瘤免疫治疗为恶性肿瘤患者带来了新的希望，尤其是免疫检查点抑制剂治疗取得了很大的进展，但仍缺少预测疗效的标志物。基于测序技术分析肿瘤突变负荷、错配修复缺陷等是目前研究较多的免疫治疗标志物。随着新一代测序技术的发展，全外显子测序为上述分析提供了契机。
关键词
肿瘤免疫治疗
测序技术
外显子
脑胶质瘤
应用
恶性肿瘤患者
错配修复缺陷
预测疗效
分类号
R739.41 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于预后相关基因构建的分析模型可识别高风险胶质母细胞瘤（英文）
陈弟
陈迪康
曹冬青
胡建
姚瑜
《中南大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
下载PDF
职称材料
2
全外显子测序在肿瘤免疫治疗中的意义及其在脑胶质瘤中的应用
陈弟
唐超
姚瑜
《中华医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
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