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利用CoMFA和CoMSIA对氟乐灵抗体识别特异性进行3D-QSAR分析
1
作者
李嘉宜
姚茜
+6 位作者
黄惠威
施迪燊
刘凤银
黄新安
袁学文
杨剑萍
穆洪涛
《化学世界》
CAS
2024年第4期226-232,共7页
为了探究氟乐灵多克隆抗体PcAb-2C识别特异性与药物分子三维结构的定量关系,利用PcAb-2C的交叉反应数据,选取比较分子力场分析法(CoMFA),比较分子相似指数法(CoMSIA)进行三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,并建立相应的模型。结果表明:CoMF...
为了探究氟乐灵多克隆抗体PcAb-2C识别特异性与药物分子三维结构的定量关系,利用PcAb-2C的交叉反应数据,选取比较分子力场分析法(CoMFA),比较分子相似指数法(CoMSIA)进行三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,并建立相应的模型。结果表明:CoMFA模型的交叉验证系数(r_(cv)^(2))为0.497,非交叉验证系数(r_(ncv)^(2))为0.999;CoMSIA模型的交叉验证系数(r_(cv)^(2))为0.498,非交叉验证系数(r_(ncv)^(2))为0.979。CoMFA模型中立体场和静电场的贡献值分别为63.10%和36.90%,CoMSIA模型中疏水场、静电场和立体场的贡献值分别为54.90%、38.40%和6.70%。各力场的贡献比例表明基团的疏水作用对化合物影响较大,推测出抗原疏水性的增强特别是N,N-二丙基部位的疏水性增强,有利于诱导出亲和力更强的抗体,为设计氟乐灵半抗原提供了信息。
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关键词
氟乐灵
多克隆抗体
比较分子力场分析法
比较分子相似性指数分析
原文传递
题名
利用CoMFA和CoMSIA对氟乐灵抗体识别特异性进行3D-QSAR分析
1
作者
李嘉宜
姚茜
黄惠威
施迪燊
刘凤银
黄新安
袁学文
杨剑萍
穆洪涛
机构
广东第二师范学院生物与食品工程系
广州中医药大学中药学
系
出处
《化学世界》
CAS
2024年第4期226-232,共7页
文摘
为了探究氟乐灵多克隆抗体PcAb-2C识别特异性与药物分子三维结构的定量关系,利用PcAb-2C的交叉反应数据,选取比较分子力场分析法(CoMFA),比较分子相似指数法(CoMSIA)进行三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,并建立相应的模型。结果表明:CoMFA模型的交叉验证系数(r_(cv)^(2))为0.497,非交叉验证系数(r_(ncv)^(2))为0.999;CoMSIA模型的交叉验证系数(r_(cv)^(2))为0.498,非交叉验证系数(r_(ncv)^(2))为0.979。CoMFA模型中立体场和静电场的贡献值分别为63.10%和36.90%,CoMSIA模型中疏水场、静电场和立体场的贡献值分别为54.90%、38.40%和6.70%。各力场的贡献比例表明基团的疏水作用对化合物影响较大,推测出抗原疏水性的增强特别是N,N-二丙基部位的疏水性增强,有利于诱导出亲和力更强的抗体,为设计氟乐灵半抗原提供了信息。
关键词
氟乐灵
多克隆抗体
比较分子力场分析法
比较分子相似性指数分析
Keywords
trifluralin
polyclonal antibodies
combining molecular force field analysis(CoMFA)
comparative molecular similarity index(CoMSIA)
分类号
TQ463 [化学工程—制药化工]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用CoMFA和CoMSIA对氟乐灵抗体识别特异性进行3D-QSAR分析
李嘉宜
姚茜
黄惠威
施迪燊
刘凤银
黄新安
袁学文
杨剑萍
穆洪涛
《化学世界》
CAS
2024
0
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已选择
0
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