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副溶血弧菌感染的九孔鲍血细胞均一化全长cDNA文库的构建 被引量:14
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作者 王淑红 邹志华 +2 位作者 张子平 施永春 王艺磊 《台湾海峡》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期278-285,共8页
采用Trizol试剂提取副溶血弧菌感染的九孔鲍血细胞的总RNA,经Oligotex纯化得到mRNA.根据SMART技术原理合成双链cDNA.双链cDNA采用双链特异核酸酶进行cDNA的均一化,构建成九孔鲍血细胞的均一化全长cDNA文库.原始文库的库容为3.4×106... 采用Trizol试剂提取副溶血弧菌感染的九孔鲍血细胞的总RNA,经Oligotex纯化得到mRNA.根据SMART技术原理合成双链cDNA.双链cDNA采用双链特异核酸酶进行cDNA的均一化,构建成九孔鲍血细胞的均一化全长cDNA文库.原始文库的库容为3.4×106cfu/cm3,重组率为92.3%,扩增后文库的滴度为2.6×1011cfu/cm3以上.从文库中随机挑取897个克隆,测序获得高质量ES-Ts814条,其中有23条Contigs;762条Singlets,Unigenes共785条,冗余率只有3.56%.以上结果说明所构建的文库质量好,完全可以满足后续基因克隆和表达序列标签测序工作的需要. 展开更多
关键词 CDNA文库 均一化 九孔鲍 副溶血弧菌 血细胞
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锯缘青蟹性腺发育与性别分化相关组织混合线性化cDNA文库构建及EST初步分析 被引量:3
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作者 邹志华 张子平 +4 位作者 王艺磊 陈锦民 贾锡伟 王淑红 林鹏 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期88-94,共7页
分别提取锯缘青蟹Scylla serrata卵巢、精巢、眼柄、促雄腺的总RNA,等量混合后经oligotex试剂分离mRNA,利用SMART(Switch mechanisms at the 5′end of RNA transcript)技术及DSN(duplex-specific nuclease)的特性构建线性化cDNA质粒文... 分别提取锯缘青蟹Scylla serrata卵巢、精巢、眼柄、促雄腺的总RNA,等量混合后经oligotex试剂分离mRNA,利用SMART(Switch mechanisms at the 5′end of RNA transcript)技术及DSN(duplex-specific nuclease)的特性构建线性化cDNA质粒文库。经检测文库约含有5.3×107重组子,扩增后的文库含有1011以上重组子。文库的插入cDNA长度为0.5—2.5kb,重组率大于98%。从构建的文库中随机挑取5 202个克隆进行大规模EST测序,获得3 346条ESTs,其中长度大于100bp的高质量ESTs 2 697条。经拼接与软件分析,2 697 ESTs代表了2 522个Unigenes,包括2 355个Singlets和167个Contigs,冗余率6.49%。EST序列经生物信息学分析(BLASTX,e<10-6),发现了Sry-like protein C、Sox14 protein、Sox4b、sex-determining protein fem-1、vitellogenin、vitellogenin receptor、cyclin A、cathepsin C和cyclin-dependent kinase 2等与性别分化和性腺发育相关的基因,以及热休克蛋白家族、泛素系统、抗氧化防御体系和抗病相关的功能基因。该文库具有较高的质量和利用价值,可为更大规模EST分析及采用基因芯片技术开展锯缘青蟹性腺发育及性别分化相关功能基因的研究奠定基础。 展开更多
关键词 锯缘青蟹SCYLLA SERRATA 线性化cDNA文库 性腺发育 性别分化 EST
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锯缘青蟹卵巢均一化cDNA文库的构建 被引量:4
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作者 邹志华 张子平 +4 位作者 王艺磊 陈锦民 贾锡伟 王淑红 林鹏 《福建水产》 2007年第4期1-4,共4页
为探讨锯缘青蟹(Scylla serrata)性腺发育的分子机制,本研究提取锯缘青蟹卵巢的总RNA,经oligotex试剂分离mRNA,利用SMART(Switch mechanisms at the 5 end of RNAtranscript)技术及双链特异核酸内切酶DSN(duplex-specific nuclease)的... 为探讨锯缘青蟹(Scylla serrata)性腺发育的分子机制,本研究提取锯缘青蟹卵巢的总RNA,经oligotex试剂分离mRNA,利用SMART(Switch mechanisms at the 5 end of RNAtranscript)技术及双链特异核酸内切酶DSN(duplex-specific nuclease)的特性构建均一化cDNA文库。经检测文库约含有4.7×107重组子,扩增后的文库含有1011以上重组子。从文库中随机挑取24个克隆进行PCR检测,文库的插入cDNA长度为500bp-2.5kb,重组率为95.8%。该文库的成功构建,为采用基因芯片技术开展锯缘青蟹性腺发育相关功能基因的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 性腺发育 均一化cDNA文库 锯缘青蟹
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