目的研究骨成形蛋白-激活素膜结合阻断因子(BMP and activin membrane-bound inhibitor,BAMBI)与卵巢癌耐药性之间的关系。方法运用GEPIA在线工具分析BAMBI在正常卵巢组织与卵巢癌组织中的表达差异;基于GEO数据库分析BAMBI在顺铂敏感性...目的研究骨成形蛋白-激活素膜结合阻断因子(BMP and activin membrane-bound inhibitor,BAMBI)与卵巢癌耐药性之间的关系。方法运用GEPIA在线工具分析BAMBI在正常卵巢组织与卵巢癌组织中的表达差异;基于GEO数据库分析BAMBI在顺铂敏感性与顺铂耐药性的卵巢癌细胞株中的表达差异;CTRP数据库进行卵巢癌细胞BAMBI表达量与化疗药物敏感性相关性分析;综合运用基因互做分析、基因通路富集、基因相关性分析、文本挖掘、miRNA-mRNA相互作用分析等生物信息学方法进一步证明BAMBI调节卵巢癌耐药性及探索其内在机制。结果BAMBI在卵巢癌组织的表达显著低于正常卵巢,同时对顺铂耐药的卵巢癌细胞系中BAMBI表达量也显著低于对顺铂敏感的卵巢癌细胞系,与BAMBI高度关联性的基因大部分与卵巢癌耐药性有关;基因通路富集对与BAMBI相关联的基因分析发现,TGF-β(转化生长因子-β)信号通路、Hippo信号通路、细胞因子及其受体等通路的富集程度最高;TSPAN5与BAMBI高度相关,并且在卵巢癌和顺铂耐药的细胞株A2780中低表达;文本挖掘显示,细胞增殖、生长、凋亡过程以及信号转导等生物过程同时与BAMBI蛋白、卵巢癌、肿瘤耐药性具有显著的关联性;miRNA-mRNA互作分析发现,靶向于BAMBI的15个miRNA皆与卵巢癌耐药性或其他肿瘤耐药性相关。结论低表达BAMBI介导了卵巢癌的耐药性的发生。展开更多
文摘目的研究骨成形蛋白-激活素膜结合阻断因子(BMP and activin membrane-bound inhibitor,BAMBI)与卵巢癌耐药性之间的关系。方法运用GEPIA在线工具分析BAMBI在正常卵巢组织与卵巢癌组织中的表达差异;基于GEO数据库分析BAMBI在顺铂敏感性与顺铂耐药性的卵巢癌细胞株中的表达差异;CTRP数据库进行卵巢癌细胞BAMBI表达量与化疗药物敏感性相关性分析;综合运用基因互做分析、基因通路富集、基因相关性分析、文本挖掘、miRNA-mRNA相互作用分析等生物信息学方法进一步证明BAMBI调节卵巢癌耐药性及探索其内在机制。结果BAMBI在卵巢癌组织的表达显著低于正常卵巢,同时对顺铂耐药的卵巢癌细胞系中BAMBI表达量也显著低于对顺铂敏感的卵巢癌细胞系,与BAMBI高度关联性的基因大部分与卵巢癌耐药性有关;基因通路富集对与BAMBI相关联的基因分析发现,TGF-β(转化生长因子-β)信号通路、Hippo信号通路、细胞因子及其受体等通路的富集程度最高;TSPAN5与BAMBI高度相关,并且在卵巢癌和顺铂耐药的细胞株A2780中低表达;文本挖掘显示,细胞增殖、生长、凋亡过程以及信号转导等生物过程同时与BAMBI蛋白、卵巢癌、肿瘤耐药性具有显著的关联性;miRNA-mRNA互作分析发现,靶向于BAMBI的15个miRNA皆与卵巢癌耐药性或其他肿瘤耐药性相关。结论低表达BAMBI介导了卵巢癌的耐药性的发生。
