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不同羊毛纤维直径细毛羊MYL6基因克隆及差异表达研究 被引量：1
1
作者 付雪峰 黄锡霞 +6 位作者 刘春洁 徐新明 张艳花 吴伟伟 于丽娟 石刚 田可川 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2016年第13期5-11,共7页
试验以苏博美利奴羊为研究对象,探讨肌球蛋白轻链6(MYL6)基因在不同羊毛纤维直径的苏博美利奴羊中的表达模式。通过克隆肌球蛋白轻链6(MYL6)基因,结合生物信息学方法对其进行遗传进化和理化性质分析,且预测其二级蛋白结构,又通过RT-PCR... 试验以苏博美利奴羊为研究对象,探讨肌球蛋白轻链6(MYL6)基因在不同羊毛纤维直径的苏博美利奴羊中的表达模式。通过克隆肌球蛋白轻链6(MYL6)基因,结合生物信息学方法对其进行遗传进化和理化性质分析,且预测其二级蛋白结构,又通过RT-PCR相对定量方法以2^(-△△ct)值检测MYL6基因在苏博美利奴羊上的表达规律。结果表明:苏博美利奴羊MYL6基因大小为152036915 bp,MYL6基因的CDS全长序列为696 bp,共编码了105个氨基酸,与绵羊、山羊、牛、猪、老鼠、兔子、鸡、狗和斑马鱼的CDS同源分别为96%、95%、40%、40%、40%、40%、0%、60%、0%。分别在1、220~336、415~864 bp位点上有3个开放式阅读框(ORF)。遗传理化性质研究显示MYL6蛋白含有1个信号肽,在苏氨酸上有5个磷酸化位点、6个N-糖基化位点和3个O-糖基化位点,可能是一种非分泌性蛋白;MYL6蛋白的二级结构以无规则卷曲为主,β-折叠区域占-2.00%;扭曲度占-0.16%;等电荷在-1.60~0.05。研究结果表明,苏博美利奴羊MYL6基因在超细型细毛羊皮肤组织表达量显著高于细型细毛羊的表达量(P<0.01,差异倍数为2.048)。本研究将为开展肌球蛋白轻链基因在细毛羊皮肤转录水平上的研究提供数据理论基础。 展开更多
关键词 苏博美利奴羊 MYL6基因 生物信息学 RT-PCR 转录水平
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苏博美利奴羊S100A11基因序列分析及表达研究
2
作者 付雪峰 刘春洁 +4 位作者 黄锡霞 石刚 徐新明 石晓雷 田可川 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第6期15-19,283,共6页
为了探讨S100A11基因在苏博美利奴羊中不同类型细度的细毛羊中的表达模式,试验以苏博美利奴羊为研究对象,克隆了钙囊素S100A11基因,采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对S100A11蛋白的理化性质进行分析,并对其二级蛋白结构进行预测,... 为了探讨S100A11基因在苏博美利奴羊中不同类型细度的细毛羊中的表达模式,试验以苏博美利奴羊为研究对象,克隆了钙囊素S100A11基因,采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对S100A11蛋白的理化性质进行分析,并对其二级蛋白结构进行预测,且通过RT-PCR相对定量方法检测S100A11基因在不同绵羊个体中的表达规律。结果表明：绵羊S100A11基因的CDS全长序列为866bp,编码了105个氨基酸,与绵羊、山羊、牛、猪、鼠、兔、鸡、狗和斑马鱼的CDS同源性分别为96%、96%、96%、87%、24%、44%、70%、70%、60%;分别在1bp、220~336bp、415~864bp有3个开放式阅读框（ORF）;S100A11基因全长为4798bp。S100A11蛋白含有1个信号肽、19个磷酸化位点;同时S100A11基因在超细型细毛羊皮肤组织表达量极显著高于细型细毛羊的表达量（P〈0.01）,差异倍数为2.048。 展开更多
关键词 绵羊 S100A11基因 生物信息学 RT-PCR 显著性表达
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英纯血马性格候选基因多态性与断奶行为相关性分析
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作者 肖海霞 托乎提·阿及德 +6 位作者 石国庆 张莉 毋状元 李海 谢立荣 帕热哈提江·吾甫尔 依巴代提·马木提 《农业开发与装备》 2018年第11期155-157,154,共4页
为减少断奶应激,同时为断奶前合理分群提供依据,本实验应用PCR-SSCP、PCR-RFLP技术分析脑源性神经营养因子(BDNF)、多巴胺-β-羧化酶基因(DBH)、5-HT转运体基因(SLC6A4-1、SLC6A4-2、SLC6A4-3)这5种与英纯血马性格有关的候选基因多态性... 为减少断奶应激,同时为断奶前合理分群提供依据,本实验应用PCR-SSCP、PCR-RFLP技术分析脑源性神经营养因子(BDNF)、多巴胺-β-羧化酶基因(DBH)、5-HT转运体基因(SLC6A4-1、SLC6A4-2、SLC6A4-3)这5种与英纯血马性格有关的候选基因多态性,并与断奶行为进行相关性分析。结果显示BDNF基因中AB为优势基因型,DBH-2基因中AA为优势基因型,SLC6A4-1基因中AA为优势基因型,SLC6A4-2基因中AA为优势基因型,SLC6A4-3基因中AB为优势基因型;SLC6A4-1、SLC6A4-2和SLC6A4-3基因多态位点处于Hardy-Weinberg平衡状态而BDNF和DBH-2基因多态位点不处于Hardy-Weinberg平衡状态。SLC6A4-1基因显著影响马驹踢、咬、啃木头(墙)的行为(P<0.05);SLC6A4-2基因对马驹断奶行为影响不显著(P>0.05);SLC6A4-3基因显著影响马驹的踢、啃木头(墙)、翻滚等行为(P<0.05)。因此SLC6A4-1基因和SLC6A4-3基因可以作为与断奶行为相关的候选基因,用于马产业生产实践中断奶应激防控的分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 英纯血马 性格基因 断奶行为 相关分析
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