T淋巴细胞激活蛋白家族2(the linker for activator of T-cells family member 2,LAT2)蛋白是一个跨膜转接蛋白(transmembrane adaptor proteins,TRAPs),具有多个酪氨酸磷酸化位点和支架功能,可捕获细胞内下游转接蛋白和效应蛋白,发挥...T淋巴细胞激活蛋白家族2(the linker for activator of T-cells family member 2,LAT2)蛋白是一个跨膜转接蛋白(transmembrane adaptor proteins,TRAPs),具有多个酪氨酸磷酸化位点和支架功能,可捕获细胞内下游转接蛋白和效应蛋白,发挥生物学作用。LAT2在白细胞中呈现“表达二分法”,参与白细胞的成熟分化和免疫应答。LAT2的差异性表达与白细胞的分化成熟,髓性白血病的类型和药物敏感度以及肿瘤的预后有关。本文就LAT2的基因克隆和表达、蛋白结构和功能及其在细胞中的作用以及可能机制进行综述。展开更多
目的探讨乳腺癌患者HOXA4基因启动子甲基化的情况及其与临床病理特征的相关性。方法运用 NEBNext Ultra TM RNA Library Prep Kit for Illumina 进行基因表达芯片测序,运用随机数字表法选择2014年深圳市宝安区妇幼保健院收治的9例乳腺...目的探讨乳腺癌患者HOXA4基因启动子甲基化的情况及其与临床病理特征的相关性。方法运用 NEBNext Ultra TM RNA Library Prep Kit for Illumina 进行基因表达芯片测序,运用随机数字表法选择2014年深圳市宝安区妇幼保健院收治的9例乳腺癌患者,分析癌组织与相应癌旁组织异常差异表达的基因。运用Illumina Infinium HD Methylation 450K Assay进行DNA甲基化测序,分析乳腺癌甲基化差异基因。基于肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库信息,分析乳腺癌的差异表达基因和差异甲基化基因。挑选显著高甲基化与低表达的基因,结合生物信息学,确定HOXA4为候选基因。运用随机数字表法收集2014—2017年深圳市宝安区妇幼保健院收治的另外86例乳腺癌患者,采用焦磷酸测序法和RT-PCR,检测乳腺癌组织及其癌旁乳腺组织中HOXA4基因甲基化率和mRNA表达,用Fisher确切概率法分析甲基化率与患者临床病理特征的关系。用 Cox 比例风险模型进行风险因素的单因素和多因素分析。分别用0、0.5、1、5、10、20 μmol/L的甲基化抑制剂RG108处理乳腺癌MCF-7细胞 5 d后,检测HOXA4 mRNA的表达。结果基因表达数据芯片分析发现在乳腺癌组织中有1 680个显著上调的基因和1 249个下调基因,整体水平上在不同区域乳腺癌患者甲基化水平较癌旁组织高( P 均< 0.001)。86例乳腺癌组织中HOXA4基因的甲基化率为94%(81/86),其中,30例高甲基化, 52例低甲基化;而在对应癌旁组织中,HOXA4基因甲基化率为57%(49/86),其中49例低甲基化,无高甲基化( P <0.001)。有HOXA4甲基化组的癌组织样本中HOXA4 mRNA表达低于无HOXA4甲基化组的癌组织样本( P =0.003)。HOXA4基因甲基化水平与乳腺癌淋巴结转移、ER表达有关( P = 0.039、0.017)。单因素分析结果显示患者的TNM分期、组织学分级、淋巴结转移及HOXA4甲基化是DFS的危险因素( RR =4.008,95% CI =1.296~12.393, P =0.016;RR =10.111,95% CI =2.607~39.217, P =0.001;RR =4.588,95% CI =1.201~17.523, P =0.026;RR =1.051,95% CI =1.007~1.098, P =0.024)。多因素分析显示组织学分级是乳腺癌患者DFS的独立预后因素( RR =14.461,95% CI =2.429~ 86.100, P =0.003)。采用不同浓度的RG108来处理MCF-7细胞后,各组HOXA4 mRNA表达比较,差异有统计学意义(χ^2=4.472, P =0.029)。结论HOXA4基因启动子甲基化在乳腺癌的发生、发展中起着重要作用,有潜力作为新的分子生物学指标,用于乳腺癌临床诊断。展开更多
文摘T淋巴细胞激活蛋白家族2(the linker for activator of T-cells family member 2,LAT2)蛋白是一个跨膜转接蛋白(transmembrane adaptor proteins,TRAPs),具有多个酪氨酸磷酸化位点和支架功能,可捕获细胞内下游转接蛋白和效应蛋白,发挥生物学作用。LAT2在白细胞中呈现“表达二分法”,参与白细胞的成熟分化和免疫应答。LAT2的差异性表达与白细胞的分化成熟,髓性白血病的类型和药物敏感度以及肿瘤的预后有关。本文就LAT2的基因克隆和表达、蛋白结构和功能及其在细胞中的作用以及可能机制进行综述。
文摘目的探讨乳腺癌患者HOXA4基因启动子甲基化的情况及其与临床病理特征的相关性。方法运用 NEBNext Ultra TM RNA Library Prep Kit for Illumina 进行基因表达芯片测序,运用随机数字表法选择2014年深圳市宝安区妇幼保健院收治的9例乳腺癌患者,分析癌组织与相应癌旁组织异常差异表达的基因。运用Illumina Infinium HD Methylation 450K Assay进行DNA甲基化测序,分析乳腺癌甲基化差异基因。基于肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库信息,分析乳腺癌的差异表达基因和差异甲基化基因。挑选显著高甲基化与低表达的基因,结合生物信息学,确定HOXA4为候选基因。运用随机数字表法收集2014—2017年深圳市宝安区妇幼保健院收治的另外86例乳腺癌患者,采用焦磷酸测序法和RT-PCR,检测乳腺癌组织及其癌旁乳腺组织中HOXA4基因甲基化率和mRNA表达,用Fisher确切概率法分析甲基化率与患者临床病理特征的关系。用 Cox 比例风险模型进行风险因素的单因素和多因素分析。分别用0、0.5、1、5、10、20 μmol/L的甲基化抑制剂RG108处理乳腺癌MCF-7细胞 5 d后,检测HOXA4 mRNA的表达。结果基因表达数据芯片分析发现在乳腺癌组织中有1 680个显著上调的基因和1 249个下调基因,整体水平上在不同区域乳腺癌患者甲基化水平较癌旁组织高( P 均< 0.001)。86例乳腺癌组织中HOXA4基因的甲基化率为94%(81/86),其中,30例高甲基化, 52例低甲基化;而在对应癌旁组织中,HOXA4基因甲基化率为57%(49/86),其中49例低甲基化,无高甲基化( P <0.001)。有HOXA4甲基化组的癌组织样本中HOXA4 mRNA表达低于无HOXA4甲基化组的癌组织样本( P =0.003)。HOXA4基因甲基化水平与乳腺癌淋巴结转移、ER表达有关( P = 0.039、0.017)。单因素分析结果显示患者的TNM分期、组织学分级、淋巴结转移及HOXA4甲基化是DFS的危险因素( RR =4.008,95% CI =1.296~12.393, P =0.016;RR =10.111,95% CI =2.607~39.217, P =0.001;RR =4.588,95% CI =1.201~17.523, P =0.026;RR =1.051,95% CI =1.007~1.098, P =0.024)。多因素分析显示组织学分级是乳腺癌患者DFS的独立预后因素( RR =14.461,95% CI =2.429~ 86.100, P =0.003)。采用不同浓度的RG108来处理MCF-7细胞后,各组HOXA4 mRNA表达比较,差异有统计学意义(χ^2=4.472, P =0.029)。结论HOXA4基因启动子甲基化在乳腺癌的发生、发展中起着重要作用,有潜力作为新的分子生物学指标,用于乳腺癌临床诊断。
