基于复杂网络理论的酵母菌PPI网络中关键蛋白质与核心蛋白质组的识别

1

作者 万杰 武子惠 +3 位作者 彭雨萱 李羚 李子正 丁彦蕊 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期565-572,共8页

识别关键蛋白质对疾病治疗、药物设计等领域有重要作用。本文首先采用5种节点重要性排序算法,对4种酵母菌PPI网络进行关键蛋白质识别,并通过分析不同网络之间共有的关键蛋白质,构建了关键蛋白质子网。再通过杰卡德相似度指标,筛选出子... 识别关键蛋白质对疾病治疗、药物设计等领域有重要作用。本文首先采用5种节点重要性排序算法,对4种酵母菌PPI网络进行关键蛋白质识别,并通过分析不同网络之间共有的关键蛋白质,构建了关键蛋白质子网。再通过杰卡德相似度指标,筛选出子网中拓扑特征相似的关键蛋白质对,发现4种网络中存在Gavin-EPG 1、Gavin-EPG 2、Babu-EPG 1、Babu-EPG 2、LCMS-EPG、MALDI-EPG共6个核心蛋白质组。尽管它们大都是核糖体蛋白质,然而不同的酵母菌PPI网络中核心蛋白质组中蛋白质的组成差异很大。本文所发现的关键蛋白质以及核心蛋白质组对进一步研究核糖体上蛋白质如何相互作用影响肽链的合成以及折叠提供了重要的理论参考。 展开更多

关键词 酵母菌相互作用网络 节点重要性排序算法 杰卡德相似度指标 关键蛋白质

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虚拟蜜网系统的设计与实现 被引量：1

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作者 黄芳 刘渊 《微计算机信息》 2010年第33期56-57,19,共3页

防御分布式拒绝服务(DDoS)攻击是当今网络安全领域最难解决的问题之一。在对应攻击防御方面,蜜网这种诱骗机制在一定程度上能减少攻击者对网络中其他系统的危害。本文主要通过虚拟蜜网体系的详细分析,利用虚拟软件如VMWare等,设计实现... 防御分布式拒绝服务(DDoS)攻击是当今网络安全领域最难解决的问题之一。在对应攻击防御方面,蜜网这种诱骗机制在一定程度上能减少攻击者对网络中其他系统的危害。本文主要通过虚拟蜜网体系的详细分析,利用虚拟软件如VMWare等,设计实现了一个基于该体系下的虚拟蜜网,证明了该蜜网体系有较强的防御以及捕获分析作用。 展开更多

关键词 网络安全 DDOS攻击 蜜罐 蜜网

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中美大学数学教学改革比较与借鉴

3

作者 过榴晓 曹栋 《科技创新导报》 2015年第24期255-256,共2页

该文回顾了美国大学数学基础主要是微积分课程近60年教学改革大致主要历程,从教学内容到习题形式及数量等比较了中美大学基础课程教材的区别,探讨了双方大学数学教学的理念和形式,美方教学偏注重"四原则",多角度及实用的去描... 该文回顾了美国大学数学基础主要是微积分课程近60年教学改革大致主要历程,从教学内容到习题形式及数量等比较了中美大学基础课程教材的区别,探讨了双方大学数学教学的理念和形式,美方教学偏注重"四原则",多角度及实用的去描述展现数学基本概念,而我们则侧重扎实的理论推导演绎。通过比较和分析,结合一贯的传统严谨严密特点,借鉴国外应用性和启发性强的特色,发挥平衡各自所长,摸索一个合适我们特色的大学基础数学教改方式与模式。 展开更多

关键词 大学数学 基础课程 教学改革 美国

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混沌系统反馈控制的Melnikov分析 被引量：4

4

作者 方燕燕 徐振源 蔡朝洪 《无锡轻工大学学报（食品与生物技术）》 CSCD 北大核心 2001年第6期624-629,共6页

提出一种新的对混沌系统进行控制的方法 .通过外加一个基于系统变量的简单反馈控制项 +Px ,调整反馈控制项中的参数值P ,引导系统转化为低周期运动 .同时 ,以Duffing系统为例 ,用Melnikov方法 ,较成功地解释了该方法进行混沌控制的数学... 提出一种新的对混沌系统进行控制的方法 .通过外加一个基于系统变量的简单反馈控制项 +Px ,调整反馈控制项中的参数值P ,引导系统转化为低周期运动 .同时 ,以Duffing系统为例 ,用Melnikov方法 ,较成功地解释了该方法进行混沌控制的数学物理机理 .计算机仿真的结果表明了理论分析的正确性及用于实践的可行性 . 展开更多

关键词 混沌控制 反馈 MELNIKOV方法 MELNIKOV函数

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基于有限时间观测器的离散系统混沌同步 被引量：6

5

作者 吴阳 张建成 《控制理论与应用》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1855-1864,共10页

本文基于驱动-响应模型针对一类离散时间混沌系统提出了一种基于有限时间观测器的同步方法.首先,将混沌系统写成具有未知输入的线性系统形式.随后,给出了观测器匹配条件和强可观条件.在观测器匹配条件的假设下,通过适当的状态变换,给出... 本文基于驱动-响应模型针对一类离散时间混沌系统提出了一种基于有限时间观测器的同步方法.首先,将混沌系统写成具有未知输入的线性系统形式.随后,给出了观测器匹配条件和强可观条件.在观测器匹配条件的假设下,通过适当的状态变换,给出了具有降维形式的有限时间观测器设计框架使得该观测器不再受到未知输入的影响.然后,证明了强可观条件结合观测器匹配条件可以保证一个有限时间观测器的存在,该观测器可以使得响应系统达到对驱动系统的精确同步,且达到同步所需要的时间可以任意设定,不受观测器系统矩阵极点配置和初值条件的影响.最后,给出了两个混沌系统的例子验证了所提方法的有效性. 展开更多

关键词 离散混沌系统 精确同步 有限时间观测器

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格的反软理想 被引量：6

6

作者 童娟 廖祖华 +4 位作者 赵衍才 廖翠萃 张龙祥 路腾 吴树忠 《浙江大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期33-39,共7页

首先给出了格的反软理想新概念,证明2个反软理想分别在软集的限制并和"或"运算下仍然是反软理想.其次,利用软集的反对偶给出反软理想的等价刻画.再次,利用软集的反扩张原理给出反软理想在同态映射下反像与原像的性质.最后,在... 首先给出了格的反软理想新概念,证明2个反软理想分别在软集的限制并和"或"运算下仍然是反软理想.其次,利用软集的反对偶给出反软理想的等价刻画.再次,利用软集的反扩张原理给出反软理想在同态映射下反像与原像的性质.最后,在全体反软理想组成的集合H上,引入链条件并讨论H是阿丁的或诺特的充要条件. 展开更多

关键词 反软理想 软集 反对偶 同态 反像

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多散射介质中光子密度波扩散方程的求解 被引量：5

7

作者 朱拓 朱湘东 +2 位作者 张逸新 陈健 倪晓武 《激光技术》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期318-320,共3页

将光源作为一个复数点光源 ,根据实验研究模型的要求 ,求解了多散射介质中光子密度波扩散方程 ,找出了与入射面相对应面的光子通量和介质中吸收系数改变量之间的关系。所得结论能直接用于多散射介质中成像问题的实验研究之中 ,即通过对... 将光源作为一个复数点光源 ,根据实验研究模型的要求 ,求解了多散射介质中光子密度波扩散方程 ,找出了与入射面相对应面的光子通量和介质中吸收系数改变量之间的关系。所得结论能直接用于多散射介质中成像问题的实验研究之中 ,即通过对光子通量的检测 ,反演出吸收系数改变量的分布 。 展开更多

关键词 多散射介质 光子密度波 扩散方程 复数光源

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关于循环子半群的结构与数量问题及拟环的特征与结构 被引量：1

8

作者 朱平 《纯粹数学与应用数学》 CSCD 2002年第3期239-243,249,共6页

彻底解决了所有循环子半群及其子群的结构和数量问题 ,并讨论了拟群分解问题 ,同时 ,对群论基本定理作了部分推广 ,并给出了定理的另一部分不可推广的反例 .最后 。

关键词 结构 数量 特征 循环半群 拟群 拟环 幂零扩张

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非牛顿润滑流的Maxwell模型的摄动解

9

作者 张荣 何雪明 《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2003年第6期75-80,共6页

对各种形式的Maxwell模型已有一些研究结果。Tichy讨论了粘弹性流体的Maxwell模型并对二维润滑流应用这一模型,使用以Deborah数为摄动量的正则摄动法,得到了模型的解。本文用双重正则摄动求解模型,得到了相应的解。顺便指出,所得速度的... 对各种形式的Maxwell模型已有一些研究结果。Tichy讨论了粘弹性流体的Maxwell模型并对二维润滑流应用这一模型,使用以Deborah数为摄动量的正则摄动法,得到了模型的解。本文用双重正则摄动求解模型,得到了相应的解。顺便指出,所得速度的粘弹性修正项与Tichy的相应结果不同。 展开更多

关键词 Maxwell模型 双重正则摄动法 Deborah数 粘度

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用摄动方法求一类广义振荡积分的值

10

作者 张荣 《大学数学》 2003年第6期114-116,共3页

摄动方法中求定积分所定义的函数的渐进展开式的各种方法被用来求一类广义振荡积分的近似值 。

关键词 广义振荡积分 摄动方法 渐进展开式 定积分 数值积分法

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对标准偏差估算公式选用的一种解释 被引量：1

11

作者 糜觉 《江南学院学报》 2001年第4期97-100,共4页

针对用标准偏差估算公式对偏差的平方取平均值时为什么除n - 1而不除n(n为测量次数 )的问题 ,用数理统计学的观点作了数学证明 。

关键词 随机误差 数学期望 随机变量 标准偏差 估算公式 数理统计 物理实验 高校

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动态残基网络社团视角下的木聚糖酶耐热性分析 被引量：1

12

作者 冯一诚 胡凯惠 +2 位作者 李心羽 王馨颖 丁彦蕊 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1220-1227,共8页

木聚糖酶在食品、饲料、造纸和纺织等行业有重要的应用,研究木聚糖酶的耐热性有助于挖掘其潜在的应用领域并提高经济价值。本文通过采用Louvain算法,对来自变铅青链霉菌的常温木聚糖酶(xyna_strli)和嗜热子囊菌的耐热木聚糖酶(xyna_the... 木聚糖酶在食品、饲料、造纸和纺织等行业有重要的应用,研究木聚糖酶的耐热性有助于挖掘其潜在的应用领域并提高经济价值。本文通过采用Louvain算法,对来自变铅青链霉菌的常温木聚糖酶(xyna_strli)和嗜热子囊菌的耐热木聚糖酶(xyna_theau)的动态残基相互作用网络进行社团检测,并分析社团演化与木聚糖酶耐热性的关系。结果表明:常温木聚糖酶的末端存在稳定相互作用;以GLU37和LEU5为中心的残基结构稳固了酶的结构。耐热木聚糖酶中,α8'、α8″上的相互作用提升了酶的热稳定性。通过分析稳定社团发现,稳定社团包含酶的末端通过稳定相互作用提高耐热性。相较于常温木聚糖酶,耐热木聚糖酶的稳定社团维持了更多短螺旋和柔性区域的稳定,其在活性位点GLU237附近的残基减少了活性位点与底物接触,提升了稳定性。 展开更多

关键词 木聚糖酶 动态残基网络 耐热性 演化社团 Louvain算法

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用自适应脉冲微扰引导混沌系统到周期解 被引量：8

13

作者 张荣 徐振源 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第10期5070-5076,共7页

用自适应脉冲微扰方法控制的系统的某个系统变量作为驱动,设计了一种自适应控制器方法对两个或多个响应混沌系统进行脉冲微扰,引导这些系统从混沌运动到低周期运动,实现同时控制多个混沌系统到不同的周期态.当选择相同的自适应控制器输... 用自适应脉冲微扰方法控制的系统的某个系统变量作为驱动,设计了一种自适应控制器方法对两个或多个响应混沌系统进行脉冲微扰,引导这些系统从混沌运动到低周期运动,实现同时控制多个混沌系统到不同的周期态.当选择相同的自适应控制器输入变量实施脉冲微扰时,还可控制两个或多个混沌系统达到不同的周期态同步.通过对Rssler混沌系统的仿真研究证实了方法的有效性. 展开更多

关键词 混沌控制 系统参量 自适应控制器 脉冲微扰 周期态同步

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关于非线性系统两类广义混沌同步存在性的研究 被引量：9

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作者 过榴晓 徐振源 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第10期6086-6092,共7页

研究了非线性系统两类广义混沌同步的存在性.即在响应系统的修正方程在具有渐近稳定平衡点或渐近稳定周期轨道的情况下,满足一定的条件,可将广义同步化流形存在性问题转化为Lipschitz函数族的压缩不动点问题,理论上严格证明了该广义同... 研究了非线性系统两类广义混沌同步的存在性.即在响应系统的修正方程在具有渐近稳定平衡点或渐近稳定周期轨道的情况下,满足一定的条件,可将广义同步化流形存在性问题转化为Lipschitz函数族的压缩不动点问题,理论上严格证明了该广义同步化流形的指数吸引性.数值仿真证实了理论的正确性及有效性. 展开更多

关键词 广义同步化流形 压缩不动点 指数吸引性

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非线性发展方程的Hlder连续惯性流形

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作者 过榴晓 徐振源 张荣 《系统科学与数学》 CSCD 北大核心 2009年第12期1631-1643,共13页

引入非线性发展方程的H(o|¨)lder连续惯性流形的概念,为原来惯性流形概念的推广和修正,惯性流形是有限维不变的Lipschiz流形,是研究发展方程解的长时间性态的合适工具,其缺点是需要谱间隙条件,提出H(o|¨)lder连续惯性流形也... 引入非线性发展方程的H(o|¨)lder连续惯性流形的概念,为原来惯性流形概念的推广和修正,惯性流形是有限维不变的Lipschiz流形,是研究发展方程解的长时间性态的合适工具,其缺点是需要谱间隙条件,提出H(o|¨)lder连续惯性流形也是有限维不变的,但光滑性减弱为H(o|¨)lder连续,不需要谱间隙条件,该流形与指数吸引子交集具有指数吸引性,无穷维动力系统可在H(o|¨)lder连续惯性流形上约化为有限维常微分方程组。 展开更多

关键词 Holder连续惯性流形 指数吸引子连续惯性流形 无穷维动力系统 指数吸引子.

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