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A、B、J亚群禽白血病病毒混合感染的鉴定及gp85基因序列分析 被引量：1
1
作者 窦俊峰 汪最 +5 位作者 李丽 卢琴 金鑫鑫 凌小淳 罗青平 翟新国 《中国畜牧兽医》 CSCD 北大核心 2024年第1期302-311,共10页
【目的】了解湖北地区禽白血病病毒(Avian leukosis virus, ALV)亚群之间混合感染及其gp85基因遗传变异情况,为进一步研究ALV混合感染的流行病学提供参考。【方法】对来自湖北宜昌疑似感染ALV的一只病死鸡进行病理剖检,无菌采集病变组... 【目的】了解湖北地区禽白血病病毒(Avian leukosis virus, ALV)亚群之间混合感染及其gp85基因遗传变异情况,为进一步研究ALV混合感染的流行病学提供参考。【方法】对来自湖北宜昌疑似感染ALV的一只病死鸡进行病理剖检,无菌采集病变组织接种DF-1细胞进行病毒分离,通过PCR、ELISA及间接免疫荧光试验(IFA)等方法进行亚群鉴定,进一步对分离株gp85基因的相似性和变异情况进行分析。【结果】剖检结果可见病死鸡肾脏、脾脏肿大,肺脏出血,表面可见灰白色肿瘤结节;组织匀浆接种DF-1细胞后,ELISA检测发现细胞上清P27抗原呈阳性;IFA检测发现,感染细胞里有特异性绿色荧光;PCR鉴定能同时扩增出A(692 bp)、B(847 bp)和J(545 bp)亚群的特异性条带。鉴定结果表明,从该病死鸡中分离到A、B和J亚群ALV毒株,分别命名为HBYC2022-A、HBYC2022-B和HBYC2022-J。分离株gp85基因核苷酸相似性分析显示,HBYC2022-A与江苏株JS-A1201相似性最高,为99.6%;HBYC2022-B与江苏株JS-B1204相似性最高,为99.7%;而HBYC2022-J与黑龙江株PK19FA01、广西株GX20YL12 J及安徽株AHaq02相似性均为100%。此外,分离株gp85基因高突变区域(hr1、hr2)氨基酸序列并未出现特殊点突变。【结论】鸡群存在A、B和J不同亚群ALV的混合感染情况,提示国内养禽场需提高警惕并加强针对ALV各亚群的流行病学调查。 展开更多
关键词 禽白血病病毒(ALV) 分离鉴定 混合感染 GP85基因 序列分析
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河北省及周边地区猪圆环病毒2型的遗传变异与重组分析 被引量：1
2
作者 翟新国 李朋辉 +3 位作者 苏金辉 李庆阳 张若冰 郑培培 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2023年第5期80-86,137,共8页
为了监测河北省及周边地区猪圆环病毒2型(Porcine circovirus 2,PCV-2)的流行性和遗传变异性,试验采集河北省及周边地区猪场疑似患断奶仔猪多系统衰竭综合征(PCVAD)仔猪的组织病料,提取DNA,采用PCR方法进行PCV-2全基因组扩增、克隆和测... 为了监测河北省及周边地区猪圆环病毒2型(Porcine circovirus 2,PCV-2)的流行性和遗传变异性,试验采集河北省及周边地区猪场疑似患断奶仔猪多系统衰竭综合征(PCVAD)仔猪的组织病料,提取DNA,采用PCR方法进行PCV-2全基因组扩增、克隆和测序,采用DNAStar软件对PCV-2测序结果进行剪辑、拼接和同源性分析,利用MEGA X 10.0.5软件对PCV-2基因组进行遗传进化分析,利用RDP4软件对PCV-2基因组进行重组分析。结果表明:成功扩增并克隆出6株PCV-2毒株的基因组序列,6株分离株分别为河北沧州株HB/NG/2020(OM524507)、HB/WT/2020(OM524511)和HB/CZ/2020(OM524512),河北邯郸株HB/WA/2020(OM524508),河北邢台株HB/ZZ/2020(OM524509)及内蒙古乌兰察布株NMG/QQ/2020(OM524510);经测序和全长拼接,PCV-2基因组长度均为1768 bp。经同源性分析,6株PCV-2毒株基因组核苷酸序列的同源性为97.8%~100%,与4株国产疫苗参考株LG、ZJ、SH和DBN-SX07-2同源性较低,为95.2%~96.8%;6株PCV-2 Cap基因长度均为705 bp,编码234个氨基酸;Cap蛋白氨基酸序列在6个位点存在相同氨基酸突变,其中68(A→N)、134(T→N)和169(S→G)存在于主要抗原表位区上;6株PCV-2分离株均归属于PCV-2d基因型,与国产疫苗参考株LG、ZJ、SH和DBN-SX07-2亲缘关系较远,其中HB/NG/2020、HB/CZ/2020、HB/WA/2020、HB/ZZ/2020和NMG/QQ/2020与我国参考株HN-MZ-2016亲缘关系最近,而HB/WT/2020与我国参考株201207JS亲缘关系最近;分离株HB/WT/2020基因组中存在1个重组事件,重组发生在PCV-2a基因型国产疫苗LG参考株和PCV-2d基因型流行毒株之间,重组区域为890~1628 nt,属于跨基因型重组。说明河北省及周边地区主要流行PCV-2d基因型毒株,HB/WT/2020株为跨基因型重组毒株,并且主要亲本为国产疫苗LG基因型。 展开更多
关键词 河北及周边地区 猪圆环病毒2型 基因组 遗传变异 重组分析
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