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2株猪繁殖与呼吸综合征病毒海南株的ORF5基因分析
1
作者
马佳镁
钟植文
+6 位作者
范悦轩
黄春媛
郑佳馨
曹芳芳
王金泉
刘光亮
曹宗喜
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期3049-3056,共8页
【目的】鉴定我国海南省新发现的2株猪繁殖与呼吸综合征病毒株HNHK1-2021和HNLG1-2021的进化关系。【方法】采用PCR方法对ORF5基因进行扩增和序列测定,利用MegAlign软件进行多重序列比对,利用MEGA X软件邻接法构建进化树。【结果】PRRSV...
【目的】鉴定我国海南省新发现的2株猪繁殖与呼吸综合征病毒株HNHK1-2021和HNLG1-2021的进化关系。【方法】采用PCR方法对ORF5基因进行扩增和序列测定,利用MegAlign软件进行多重序列比对,利用MEGA X软件邻接法构建进化树。【结果】PRRSV HNHK1-2021和HNLG1-2021毒株核苷酸相似性为82.9%,推导氨基酸相似性为82.6%。HNHK1-2021毒株和NADC30类PRRSV、QYYZ类PRRSV、VR-2332类PRRSV以及JXA1类PRRSV序列比对,80.8%~82.8%、90.2%~92.0%、82.1%~83.4%、81.9%~84.4%,推导氨基酸相似性分别为82.1%~84.6%、91.5%~94.5%、80.1%~83.1%、82.6%~84.6%;HNLG1-2021毒株和NADC30类PRRSV、QYYZ类PRRSV、VR2332类PRRSV以及JXA1类PRRSV序列比对,核苷酸相似性分别为83.7%~84.6%、81.8%~83.6%、97.7%~99.5%、85.6%~90.4%,推导氨基酸相似性为83.6%~85.1%、81.1%~82.6%、96.0%~98.5%,86.1%~90.5%。【结论】2株病毒株均属于北美型PRRSV,HNHK1-2021毒株属于QYYZ类PRRSV(谱系3)。HNLG1-2021毒株属于VR-2332类PRRSV(谱系5)。
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关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
ORF5基因
多重序列比对
同源性
下载PDF
职称材料
PRRSV HNHK3-2021毒株的ORF5和ORF7序列分析
2
作者
范悦轩
马佳镁
+5 位作者
黄春媛
郑佳馨
陈素贞
张艳
刘光亮
曹宗喜
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1292-1300,共9页
【目的】研究海南猪繁殖与呼吸综合征病毒PRRSV的流行病学特征和遗传变异规律。【方法】采集海南省海口市及周边地区样品,分离出PRRSV HNHK3-2021毒株,并测定NSP2基因以及ORF5和ORF7基因序列,采用Lasergene 7.1进行序列比对分析,用MEGA-...
【目的】研究海南猪繁殖与呼吸综合征病毒PRRSV的流行病学特征和遗传变异规律。【方法】采集海南省海口市及周边地区样品,分离出PRRSV HNHK3-2021毒株,并测定NSP2基因以及ORF5和ORF7基因序列,采用Lasergene 7.1进行序列比对分析,用MEGA-X进行遗传演化分析。【结果】分离出的PRRSV HNHK3-2021株为美洲型毒株,PRRSV HNHK3-2021株和EF112447 HEB1、EU109503 GD、EU624117 XH-GD的ORF5和ORF7的核苷酸相似性较高,分别为99.2%~99.3%和99.5%~100%,推导氨基酸相似性为99%~99.5%和100%;PRRSV HNHK3-2021株和EU864232 SHB、AY262352_HB-2(sh)2002、AY656990 Abst-1、AY032626 CH-1a、EU807840 CH-1R的ORF5和ORF7的核苷酸相似性为87.1%~96.4%和91.4%~97.3%,推导氨基酸的相似性为86.6%~93%和91.9%~97.6%;PRRSV HNHK3-2021株和JN654459 NADC30、KP860909 FJZ03、MH068878 SD17-38、AY881994 FJ-1的ORF5和ORF7的核苷酸相似性为85.4%~87.1%和89%~91.4%。氨基酸的相似性为86.1%~87.1%和89.5%~91.9%。【结论】RRSV HNHK3-2021毒株和EU624117 XH-GD具有最近的遗传距离。
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关键词
猪繁殖与呼吸综合征
遗传进化
ORF5
ORF7
下载PDF
职称材料
题名
2株猪繁殖与呼吸综合征病毒海南株的ORF5基因分析
1
作者
马佳镁
钟植文
范悦轩
黄春媛
郑佳馨
曹芳芳
王金泉
刘光亮
曹宗喜
机构
新疆
农业
大学动物医学
学院
海南省
农业
科学院
畜牧
兽医
研究所
/
海南省
热带动物繁育与疫病
研究
重点实验室/国家动物疫病数据
中心
海口观测实验点
广东永顺生物制药股份有限公司
海南省农业科学院畜牧兽医研究所海南省院士团队创新中心
出处
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期3049-3056,共8页
基金
海南省省属科研院所技术创新专项(jscx202001)
国家自然科学基金项目(32060796)
+2 种基金
家畜疫病病原生物学国家重点实验室开放基金(SKLVEB2020KFKT021)
海南省农业科学院院本级科研项目(HAAS2022PT0205)
国家重点研发计划(2023YFC3404302)。
文摘
【目的】鉴定我国海南省新发现的2株猪繁殖与呼吸综合征病毒株HNHK1-2021和HNLG1-2021的进化关系。【方法】采用PCR方法对ORF5基因进行扩增和序列测定,利用MegAlign软件进行多重序列比对,利用MEGA X软件邻接法构建进化树。【结果】PRRSV HNHK1-2021和HNLG1-2021毒株核苷酸相似性为82.9%,推导氨基酸相似性为82.6%。HNHK1-2021毒株和NADC30类PRRSV、QYYZ类PRRSV、VR-2332类PRRSV以及JXA1类PRRSV序列比对,80.8%~82.8%、90.2%~92.0%、82.1%~83.4%、81.9%~84.4%,推导氨基酸相似性分别为82.1%~84.6%、91.5%~94.5%、80.1%~83.1%、82.6%~84.6%;HNLG1-2021毒株和NADC30类PRRSV、QYYZ类PRRSV、VR2332类PRRSV以及JXA1类PRRSV序列比对,核苷酸相似性分别为83.7%~84.6%、81.8%~83.6%、97.7%~99.5%、85.6%~90.4%,推导氨基酸相似性为83.6%~85.1%、81.1%~82.6%、96.0%~98.5%,86.1%~90.5%。【结论】2株病毒株均属于北美型PRRSV,HNHK1-2021毒株属于QYYZ类PRRSV(谱系3)。HNLG1-2021毒株属于VR-2332类PRRSV(谱系5)。
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
ORF5基因
多重序列比对
同源性
Keywords
porcine reproductive and respiratory syndrome virus
ORF5 gene
multiple sequence alignment
homology
分类号
S855.2 [农业科学—临床兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
PRRSV HNHK3-2021毒株的ORF5和ORF7序列分析
2
作者
范悦轩
马佳镁
黄春媛
郑佳馨
陈素贞
张艳
刘光亮
曹宗喜
机构
新疆
农业
大学动物医学
学院
海南省
农业
科学院
畜牧
兽医
研究所
/
海南省
热带动物繁育与疫病
研究
重点实验室
海南省农业科学院畜牧兽医研究所海南省院士团队创新中心
出处
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1292-1300,共9页
基金
海南省省属科研院所技术创新专项(jscx202001)
国家自然科学基金项目(32060796)
+2 种基金
家畜疫病病原生物学国家重点实验室开放基金(SKLVEB2020KFKT021)
海南省农业科学院院本级科研项目(HAAS2022PT0205)
国家重点研发计划(2023YFC3404302)。
文摘
【目的】研究海南猪繁殖与呼吸综合征病毒PRRSV的流行病学特征和遗传变异规律。【方法】采集海南省海口市及周边地区样品,分离出PRRSV HNHK3-2021毒株,并测定NSP2基因以及ORF5和ORF7基因序列,采用Lasergene 7.1进行序列比对分析,用MEGA-X进行遗传演化分析。【结果】分离出的PRRSV HNHK3-2021株为美洲型毒株,PRRSV HNHK3-2021株和EF112447 HEB1、EU109503 GD、EU624117 XH-GD的ORF5和ORF7的核苷酸相似性较高,分别为99.2%~99.3%和99.5%~100%,推导氨基酸相似性为99%~99.5%和100%;PRRSV HNHK3-2021株和EU864232 SHB、AY262352_HB-2(sh)2002、AY656990 Abst-1、AY032626 CH-1a、EU807840 CH-1R的ORF5和ORF7的核苷酸相似性为87.1%~96.4%和91.4%~97.3%,推导氨基酸的相似性为86.6%~93%和91.9%~97.6%;PRRSV HNHK3-2021株和JN654459 NADC30、KP860909 FJZ03、MH068878 SD17-38、AY881994 FJ-1的ORF5和ORF7的核苷酸相似性为85.4%~87.1%和89%~91.4%。氨基酸的相似性为86.1%~87.1%和89.5%~91.9%。【结论】RRSV HNHK3-2021毒株和EU624117 XH-GD具有最近的遗传距离。
关键词
猪繁殖与呼吸综合征
遗传进化
ORF5
ORF7
Keywords
porcine reproductive and respiratory syndrome
genetic evolution analysis
ORF5
ORF7
分类号
S85 [农业科学—兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2株猪繁殖与呼吸综合征病毒海南株的ORF5基因分析
马佳镁
钟植文
范悦轩
黄春媛
郑佳馨
曹芳芳
王金泉
刘光亮
曹宗喜
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
PRRSV HNHK3-2021毒株的ORF5和ORF7序列分析
范悦轩
马佳镁
黄春媛
郑佳馨
陈素贞
张艳
刘光亮
曹宗喜
《新疆农业科学》
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