单抗药物分子大小变异体分析超速离心法的建立

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作者 俞小娟 褚文丹 +8 位作者 余启昆 王飞宇 崔永霏 常卿 叶苗 霍德华 李文奇 于传飞 王兰 《中国医药生物技术》 2025年第1期56-63,共8页

目的建立一种可用于测定单抗药物分子大小变异体的分析超速离心法。方法通过对转速、温度及数据分析参数等关键指标的优化,得到一种测定单抗药物分子大小变异体的方法,对该方法的专属性、重复性、精密度及线性进行方法学验证。结果优化... 目的建立一种可用于测定单抗药物分子大小变异体的分析超速离心法。方法通过对转速、温度及数据分析参数等关键指标的优化,得到一种测定单抗药物分子大小变异体的方法,对该方法的专属性、重复性、精密度及线性进行方法学验证。结果优化得到的最佳实验条件:转速为50000 r/min,温度为20℃,分析参数“Resolution”为150,“s max”为20。方法学验证结果表明,6次重复性实验的RSD为0.91%,总体精密度RSD为0.78%,在0.2~0.8 mg/mL的浓度条件下线性良好。结论该分析超速离心法的专属性、重复性、精密度和线性良好,可用于单抗药物分子大小变异体的测定。 展开更多

关键词 单克隆抗体 纯度 分析超速离心 方法学验证

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苍耳子不同溶剂提取物的抗炎作用及机制

2

作者 卢婧 师超 +1 位作者 孙淑萌 张彦丽 《山西医科大学学报》 CAS 2024年第11期1443-1448,共6页

目的 探究苍耳子不同溶剂提取物对LPS诱导的小鼠单核巨噬细胞白血病细胞(RAW264.7)的抗炎作用及机制。方法 将苍耳子分别用水、乙醇、乙醚提取后,采用HPLC法检测各提取物中绿原酸的含量,MTT法检测苍耳子不同溶剂提取物对RAW264.7细胞活... 目的 探究苍耳子不同溶剂提取物对LPS诱导的小鼠单核巨噬细胞白血病细胞(RAW264.7)的抗炎作用及机制。方法 将苍耳子分别用水、乙醇、乙醚提取后,采用HPLC法检测各提取物中绿原酸的含量,MTT法检测苍耳子不同溶剂提取物对RAW264.7细胞活性的影响。将RAW264.7分为对照组、模型组、水提取物组、乙醇提取物组、乙醚提取物组,除对照组外,其余各组均用浓度为1μg/mL LPS造模,造模成功后,水提取物组、乙醇提取物组、乙醚提取物组分别采用含1,5,10,50,100μg/mL苍耳子水提取物、乙醇提取物和乙醚提取物的完全培养基培养。采用ELISA法检测细胞上清液中一氧化氮(NO)、白细胞介素-6(IL-6)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)的含量,Western blot检测p-STAT3蛋白的表达量。结果 水提取物(STW)和乙醇提取物(CTW)绿原酸含量相对乙醚提取物(MTW)较高。100μg/mL水提取物对RAW264.7细胞活性有明显的抑制作用(P<0.01)。与对照组相比,模型组TNF-α、IL-6和NO含量显著上升(P<0.01);与模型组相比,10,50μg/mL水提取物组、10,50μg/mL乙醇提取物组、50μg/mL乙醚提取物组TNF-α、IL-6和NO含量均显著降低(P<0.01);10μg/mL乙醚提取物组NO含量显著高于10μg/mL水提取物组和10μg/mL乙醇提取物组(P<0.01)。与对照组相比,模型组p-STAT3表达量显著上升(P<0.01);与模型组相比,50μg/mL水提取物组、50μg/mL乙醇提取物组、50μg/mL乙醚提取物组p-STAT3蛋白表达量均显著降低(P<0.01)。结论 苍耳子水提取物、乙醇提取物、乙醚提取物均能够降低炎症因子的表达,可通过调控STAT3通路来抑制炎症的发生。 展开更多

关键词 苍耳子 RAW264.7 不同溶剂提取物 抗炎 STAT3通路

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部分高校生物废弃物处置现状分析与建议 被引量：23

3

作者 陈璐 冯倩倩 +3 位作者 靳娇 潘勋 江永亨 李文奇 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2017年第11期268-271,共4页

随着我国生物学领域快速发展,生物废弃物管理压力逐步增大,已成为高校及科研机构日益突出的环境和安全问题。该文在对国内外部分高校调研的基础上,首先分析国内部分实验室生物废弃物处置的现状、目前存在的主要问题,进而对生物废弃物管... 随着我国生物学领域快速发展,生物废弃物管理压力逐步增大,已成为高校及科研机构日益突出的环境和安全问题。该文在对国内外部分高校调研的基础上,首先分析国内部分实验室生物废弃物处置的现状、目前存在的主要问题,进而对生物废弃物管理工作提出几点建议。 展开更多

关键词 生物废弃物 处置现状 管理建议

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生物科学计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理 被引量：9

4

作者 杨涛 贾安宝 +2 位作者 阮华斌 王亚坤 刘燕 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2017年第2期227-230,234,共5页

以清华大学生命科学院生物计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理为案例,介绍了实验室现状、制度体系、平台运行和成果4个部分,阐述了实验室管理和运行过程中经常出现的问题,提出了有效的改进措施,以便进一步提高设备的完好率和利用率,切... 以清华大学生命科学院生物计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理为案例,介绍了实验室现状、制度体系、平台运行和成果4个部分,阐述了实验室管理和运行过程中经常出现的问题,提出了有效的改进措施,以便进一步提高设备的完好率和利用率,切实有效地为科研和教学服务,为建立高效有序的实验管理提供理论依据。 展开更多

关键词 生物科学计算平台 冷冻电镜结构解析实验室 实验室管理及运行

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公共科研平台全时开放服务实践与制度建设 被引量：11

5

作者 冯倩倩 连佳欢 +1 位作者 王文娟 潘勋 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2020年第6期250-253,共4页

公共科研平台提供全时开放式服务有助于提高大型仪器设备的使用效率,提升科研平台对科学研究和人才培养的技术支撑能力,是推进世界一流大学和一流学科建设的需要。该文结合生物医学测试中心全时开放服务实践,在用户培训与资质认定、网... 公共科研平台提供全时开放式服务有助于提高大型仪器设备的使用效率,提升科研平台对科学研究和人才培养的技术支撑能力,是推进世界一流大学和一流学科建设的需要。该文结合生物医学测试中心全时开放服务实践,在用户培训与资质认定、网络预约与分级管理、测试收费及政策引导、安全运行与保障措施等方面进行了一系列的制度建设。 展开更多

关键词 科研平台 全时开放服务 制度建设

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公共科研平台事业编制与非事业编制人员趋同管理的实践与思考 被引量：4

6

作者 潘勋 师亚敏 +1 位作者 常在 王宏伟 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2016年第2期208-211,共4页

公共科研平台的技术队伍建设与人员管理是影响大型仪器设备使用效率、支撑能力、服务水平的关键因素,然而遗留的计划经济体制下的事业编制"铁饭碗"与现行的非事业编制聘用制并存,成为了抑制公共科研平台发展活力的重要因素。... 公共科研平台的技术队伍建设与人员管理是影响大型仪器设备使用效率、支撑能力、服务水平的关键因素,然而遗留的计划经济体制下的事业编制"铁饭碗"与现行的非事业编制聘用制并存,成为了抑制公共科研平台发展活力的重要因素。通过对清华大学生命学科校级科研平台在事业编制与非事业编制人员趋同管理工作方面的实践,力求探寻适合公共科研平台发展的人员管理之路。 展开更多

关键词 公共科研平台 事业编制 非事业编制 趋同管理

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利用荧光寿命变化定量分子内和分子间相互作用的方法

7

作者 王文娟 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2021年第11期1358-1364,共7页

荧光寿命是指荧光分子在回到基态前在激发态停留的平均时间.本文发展了基于荧光寿命测量来定量分子内和分子间相互作用的方法:通过G碱基猝灭对于荧光寿命的影响定量DNA二级结构的形成;通过荧光共振能量传递(FRET)中荧光寿命的变化来定... 荧光寿命是指荧光分子在回到基态前在激发态停留的平均时间.本文发展了基于荧光寿命测量来定量分子内和分子间相互作用的方法:通过G碱基猝灭对于荧光寿命的影响定量DNA二级结构的形成;通过荧光共振能量传递(FRET)中荧光寿命的变化来定量分子间的相互作用.第一种方法巧妙利用了G碱基会猝灭临近的染料分子的性质,结合荧光寿命的变化,可以判断DNA二级结构的形成以及形成的比率.FRET是用于研究生物分子相互作用的一个重要手段.传统的FRET方法主要是基于强度的变化,但这种变化容易受到荧光表达水平变动、样品中分子扩散以及荧光串色的影响,因此经常存在着实验比较复杂和重复性差的问题.而基于荧光寿命的FRET研究则可以很好地克服上述缺点.通过检测供体荧光寿命的变化,我们能够方便快捷地判断是否发生FRET,并通过建立系统的数据分析方法,得到FRET的效率以及分子之间相互作用的信息. 展开更多

关键词 荧光寿命 荧光猝灭 G碱基猝灭 荧光共振能量传递 荧光衰减曲线 分子内相互作用 分子间相互作用 发卡结构 时间相关单光子计数

原文传递

基于OKR的生物计算平台管理

8

作者 唐贺 杨涛 阮华斌 《实验室研究与探索》 CAS 北大核心 2023年第6期253-256,287,共5页

生物计算平台面向3个学院提供IT支撑相关的各项科研辅助任务,其科研工作柔性大、任务多而杂、交互接口复杂、且时效性高。计算平台为了提高管理效率,迫切需要引入一套行之有效的扁平化管理方法,因此计算平台根据实际工作场景和目标与关... 生物计算平台面向3个学院提供IT支撑相关的各项科研辅助任务,其科研工作柔性大、任务多而杂、交互接口复杂、且时效性高。计算平台为了提高管理效率,迫切需要引入一套行之有效的扁平化管理方法,因此计算平台根据实际工作场景和目标与关键结果(OKR)的基本机理设计了一套针对性的新型管理体系,包括年度OKR,季度评分表等。这些举措得到了实际应用,能有效指导和提升日常工作,在基于OKR的有效管理下平台对生命学院重大科学研究项目提供了有力支撑。 展开更多

关键词 关键绩效指标 目标与关键结果 关键成果 目标管理

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基于三重四级杆液质联用的大型仪器管理方法探讨 被引量：6

9

作者 王雪颖 焦玉佩 +2 位作者 许丽娜 王昱淞 刘晓蕙 《实验室研究与探索》 CAS 北大核心 2020年第10期277-279,290,共4页

随着生命科学的飞速发展,高水平的科学研究对大型精密仪器的依赖性越来越强,公共设备平台对科研的支撑作用越来越大。针对目前大型仪器管理中普遍存在的问题,以蛋白质研究技术中心代谢组学平台的三重四级杆液相色谱质谱联用仪为例,结合... 随着生命科学的飞速发展,高水平的科学研究对大型精密仪器的依赖性越来越强,公共设备平台对科研的支撑作用越来越大。针对目前大型仪器管理中普遍存在的问题,以蛋白质研究技术中心代谢组学平台的三重四级杆液相色谱质谱联用仪为例,结合我校大型仪器平台建设的管理经验,从代谢组学研究领域出发,依据仪器本身的特点,分析探讨了在仪器基础操作、仪器利用效率、检测项目开发、服务质量、管理制度等方面的管理办法,使其在科学研究和社会服务中充分发挥优势,为科学发展和人才培养提供更好的支持,同时也为其他大型精密仪器的管理提供参考和借鉴。 展开更多

关键词 三重四级杆质谱 大型仪器管理 全时段运行

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甲基化结合高分辨质谱的磷脂酸高通量分析方法的建立和应用 被引量：2

10

作者 王雪颖 宗兆运 +4 位作者 焦玉佩 许丽娜 王昱淞 栗琳 刘晓蕙 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第2期249-255,共7页

基于甲基化反应,建立了同时测定磷脂酸和溶血磷脂酸的超高液相色谱-静电轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q Exactive Orbitrap MS)高通量定性与定量分析方法,并用于小鼠衰老模型脑组织样品的测定。样品经氯仿-甲醇溶剂进行全脂提取,使用三甲基硅... 基于甲基化反应,建立了同时测定磷脂酸和溶血磷脂酸的超高液相色谱-静电轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q Exactive Orbitrap MS)高通量定性与定量分析方法,并用于小鼠衰老模型脑组织样品的测定。样品经氯仿-甲醇溶剂进行全脂提取,使用三甲基硅烷化重氮甲烷衍生化试剂改善磷脂酸和溶血磷脂酸的色谱峰形,并采用高分辨质谱的数据依赖型扫描模式(Full MS/dd-MS^2),利用Tracefinder软件自建本地二级碎片数据库,结合正离子和负离子两种扫描模式下的碎片规律进行高通量的鉴定和定量分析。在本实验条件下,标准品PA(14∶0/14∶0)的线性相关指数大于0.99,定量限为0.125μg/mL,日内和日间精密度小于8.5%。将本方法用于C57BL/6小鼠衰老模型脑组织中,成功鉴定并定量检测了14个溶血磷脂酸和磷脂酸分子。脂肪酸链的数据分析结果表明,含有多不饱和脂肪酸链的磷脂酸在衰老过程中呈现下降趋势。本方法具有较高灵敏度及准确度,适用于生物体内磷脂酸和溶血磷脂酸的定性与定量分析。 展开更多

关键词 溶血磷脂酸 磷脂酸 甲基化 高分辨质谱 高通量

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生命科学公共平台质量管理探讨 被引量：2

11

作者 刘春春 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2022年第2期267-272,共6页

生物医学科研论文中实验可重复性差,以及由此引起的损失是学术界关注的重点,对于持续产出大量实验数据的生命科学公共平台,应采取质量控制程序等措施来确保实验的严谨性和可重复性。该文以实际工作经验为基础,探讨了质量管理的有关概念... 生物医学科研论文中实验可重复性差,以及由此引起的损失是学术界关注的重点,对于持续产出大量实验数据的生命科学公共平台,应采取质量控制程序等措施来确保实验的严谨性和可重复性。该文以实际工作经验为基础,探讨了质量管理的有关概念、思想、原则和方法,以及生命科学公共平台实际管理的关键细节,提出了可供参考的系统性质量管理措施。 展开更多

关键词 生命科学公共平台 质量管理体系 质量控制 质量保证 六西格玛

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基于高分辨质谱的甲基化心磷脂高通量分析方法的建立和应用

12

作者 焦玉佩 王雪颖 +3 位作者 许丽娜 王昱淞 刘紫琪 刘晓蕙 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期717-723,共7页

该文基于心磷脂标准品的甲基化反应,建立了高灵敏度高通量分析甲基化心磷脂的液相色谱-高分辨质谱方法。由于甲基化后的心磷脂具有特征性的碎片,因此建立了包含780个分子特征片段的模拟数据库用于脂质鉴定。衍生化后,CL(14∶0/14∶0/14... 该文基于心磷脂标准品的甲基化反应,建立了高灵敏度高通量分析甲基化心磷脂的液相色谱-高分辨质谱方法。由于甲基化后的心磷脂具有特征性的碎片,因此建立了包含780个分子特征片段的模拟数据库用于脂质鉴定。衍生化后,CL(14∶0/14∶0/14∶0/14∶0)信号提高了10倍,定量下限(LOQ)达到10 ng/mL。将该方法应用于小鼠衰老过程中心磷脂的调控研究,通过Tracefinder本地二级数据库共鉴定了43个心磷脂分子,其中21个心磷脂在衰老的大脑中有差异变化。结果发现:含有FA(20∶4)、FA(22∶6)长链多不饱和脂肪酸的心磷脂在衰老过程中呈下降趋势。高分辨质谱平台为甲基化的心磷脂分析提供了一种高通量筛选方法,对于低丰度心磷脂的检测具有很大潜力。 展开更多

关键词 心磷脂 甲基化 高分辨质谱 高通量

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利用激光扫描共聚焦显微镜研究叶绿体自发荧光 被引量：5

13

作者 冯倩倩 王文娟 +1 位作者 李海冬 潘勋 《清华大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第6期651-654,660,共5页

该文利用激光扫描共聚焦显微镜研究烟草叶片叶绿体自发荧光,为叶绿体研究提供理论和实验依据。首先,利用不同波长激发光的光谱扫描功能分别激发烟草叶片叶绿体,得到叶绿体自发荧光光谱;其次,利用不同激发光激发烟草叶片叶绿体,获取叶绿... 该文利用激光扫描共聚焦显微镜研究烟草叶片叶绿体自发荧光,为叶绿体研究提供理论和实验依据。首先,利用不同波长激发光的光谱扫描功能分别激发烟草叶片叶绿体,得到叶绿体自发荧光光谱;其次,利用不同激发光激发烟草叶片叶绿体,获取叶绿体自发荧光图像,并对荧光强度进行定量分析比较;最后,利用488nm激发光漂白烟草叶片叶绿体,观察自发荧光的稳定性。实验结果显示:488nm激光对叶绿体的激发效率最高,561nm激光的激发效率最低;发射光谱集中在大于637nm的波段,峰值在681nm处;且叶绿体自发荧光非常稳定。激光扫描共聚焦显微镜能够准确研究叶绿体自发荧光,对研究植物组织成像提供重要帮助,也对叶绿体基因工程研究有深远影响。 展开更多

关键词 激光扫描共聚焦显微镜 叶绿体 自发荧光 光谱扫描

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深度学习在荧光显微镜图像增强中的应用

14

作者 张彦丽 刘冰钰 +2 位作者 孙梦依 李静 王文娟 《现代生物医学进展》 2025年第2期394-400,共7页

传统荧光显微镜在分辨亚细胞结构方面面临衍射极限的挑战,难以有效分辨小于200纳米的结构,同时图像信噪比也有限。近年来,深度学习技术在显微镜图像处理领域展现出巨大的潜力,通过自动特征提取,不仅可以提高图像分辨率,还能显著改善图... 传统荧光显微镜在分辨亚细胞结构方面面临衍射极限的挑战,难以有效分辨小于200纳米的结构,同时图像信噪比也有限。近年来,深度学习技术在显微镜图像处理领域展现出巨大的潜力,通过自动特征提取,不仅可以提高图像分辨率,还能显著改善图像质量。本文系统综述了深度学习技术在荧光显微镜图像分析中的应用,尤其是在图像增强与超分辨率重建方面的最新进展。以卷积神经网络(CNN)、生成对抗网络(GAN)和U-Net等为代表的深度学习模型,已广泛用于分类、分割、目标跟踪及成像系统增强等多个领域。这些技术为低分辨率和低信噪比图像提供了高效的解决方案,使得活细胞和纳米尺度生物过程的动态观测成为可能。未来,深度学习技术有望进一步推动显微镜图像智能化处理,为生物医学研究提供更高效的工具和支持。 展开更多

关键词 深度学习 荧光显微镜 图像增强 超分辨重建 神经网络

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利用转盘共聚焦显微镜进行快速实验的新方法 被引量：4

15

作者 张彦丽 代亚丽 +3 位作者 陈亚兰 靳娇 潘勋 王文娟 《现代生物医学进展》 CAS 2019年第19期3784-3788,共5页

转盘共聚焦显微镜是快速激光共聚焦显微镜的一种,与传统的激光共聚焦显微镜相比具有一些相同点,也有其特有的优势。本文主要介绍转盘共聚焦显微镜的基本原理及如何利用转盘共聚焦显微镜进行快速实验及应用实例,并与传统激光共聚焦显微... 转盘共聚焦显微镜是快速激光共聚焦显微镜的一种,与传统的激光共聚焦显微镜相比具有一些相同点,也有其特有的优势。本文主要介绍转盘共聚焦显微镜的基本原理及如何利用转盘共聚焦显微镜进行快速实验及应用实例,并与传统激光共聚焦显微镜进行比较。转盘共聚焦显微镜具有速度快、灵敏度高、对样品光损伤和光淬灭程度低、操作灵活简单,是随着实验技术发展使用越来越广泛的实验仪器。 展开更多

关键词 激光共聚焦显微镜 转盘共聚焦显微镜 快速成像

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激光扫描共聚焦显微镜活细胞成像方法优化 被引量：7

16

作者 张彦丽 刘冰钰 +2 位作者 陈亚兰 王瑾瑜 曹慧珍 《现代生物医学进展》 CAS 2022年第1期196-200,共5页

激光扫描共聚焦显微镜可用于固定样品和活细胞样品的成像,近年来得到了广泛的应用。本文介绍了激光扫描共聚焦显微镜的基本原理及其在活细胞成像中的应用,并以FV10-ASW Viewer4.2软件为例,从扫描速度、分辨率、降噪、光电倍增调节、多... 激光扫描共聚焦显微镜可用于固定样品和活细胞样品的成像,近年来得到了广泛的应用。本文介绍了激光扫描共聚焦显微镜的基本原理及其在活细胞成像中的应用,并以FV10-ASW Viewer4.2软件为例,从扫描速度、分辨率、降噪、光电倍增调节、多参数协同优化、成像质量评估、图像后期处理等多个角度总结了激光扫描共聚焦活细胞成像系统的方法优化和推荐参数设置。本文的工作可以为活细胞实验提供一定参考。 展开更多

关键词 激光扫描共聚焦显微镜 活细胞成像 参数优化

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膀胱癌预后的mRNA分子标记和预测模型开发 被引量：1

17

作者 李文省 张彦丽 +2 位作者 周志敏 庞永冰 张雁 《临床泌尿外科杂志》 2020年第5期371-375,379,共6页

目的:通过TCGA数据库挖掘膀胱癌预后相关的mRNA分子标记,和构建膀胱癌患者预后的预测模型。方法:从TCGA数据库中下载膀胱癌患者的mRNA表达谱数据,进行预处理和分组后,先在训练数据中通过单因素Cox回归分析和基于似然的生存分析等方法鉴... 目的:通过TCGA数据库挖掘膀胱癌预后相关的mRNA分子标记,和构建膀胱癌患者预后的预测模型。方法:从TCGA数据库中下载膀胱癌患者的mRNA表达谱数据,进行预处理和分组后,先在训练数据中通过单因素Cox回归分析和基于似然的生存分析等方法鉴定与膀胱癌预后生存率显著相关的mRNA分子,然后通过多变量Cox回归分析建立基于mRNA分子表达谱的膀胱癌预后风险评分模型,最后通过ROC分析确定患者分类风险水平的最佳分界点,并通过Kaplan-Meier估计法和log-rank检验在验证数据集和全部数据集中分别验证预后风险评分模型。结果:开发了首个基于mRNA分子标记的膀胱癌预后风险评分模型,发现将基于7个mRNA分子标记的膀胱癌风险评分模型应用于训练集或验证数据时,高风险评分患者与低风险评分患者的生存曲线均存在显著差异,进一步的功能研究这发现这7个mRNA分子在肿瘤发生、进展和预后中可能发挥着重要作用。结论:7个mRNA分子标记包括ZNF432、TNFRSF14、POLR3G、ZNF574、LIPT1、AGER和ZRSR2,基于这7个mRNA表达谱构建的风险评分模型可作为新型生物标记用于膀胱癌患者预后生存期预测。 展开更多

关键词 膀胱癌 分子标记 预后模型 MRNA

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