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大叶黄精和黄精中与有机酸代谢相关的bHLH转录因子家族分析
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作者 朱天润 万小林 +1 位作者 粱思琪 肖强 《湖北农业科学》 2025年第2期202-206,共5页
采用测序平台对大叶黄精(Polygonatum kingianum var. grandifolium)和黄精(Polygonatum sibiricum Red)转录组进行测序,利用生物信息学方法对与有机酸代谢相关的bHLH转录因子家族进行鉴定,对预测的蛋白质开展理化性质、结构域以及系统... 采用测序平台对大叶黄精(Polygonatum kingianum var. grandifolium)和黄精(Polygonatum sibiricum Red)转录组进行测序,利用生物信息学方法对与有机酸代谢相关的bHLH转录因子家族进行鉴定,对预测的蛋白质开展理化性质、结构域以及系统进化关系的分析。结果表明,基于大叶黄精和黄精的转录组数据,共获得转录因子46 682个,其中bHLH转录因子110个;总转录数据中具有显著差异的转录因子共978个,其中bHLH转录因子共53个;结合代谢组预测数据,得到与有机酸相关的转录因子31个,其中与有机酸相关的bHLH转录因子22个。除Cluster-43865.11外,Motif 1在其他序列中均有分布,绝大多数序列均含Motif 4;22个bHLH转录因子家族成员均存在不同程度的保守基序变异现象,每个bHLH含有1~14个Motif,平均含有7.81个Motif。 展开更多
关键词 大叶黄精(Polygonatum kingianum var.grandifolium) 黄精(Polygonatum sibiricum Red) 有机酸 bHLH转录因子 生物信息学 家族 鉴定
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恩施市植被覆盖时空特征及动态变化分析 被引量:1
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作者 余可进 宋鄂平 谭志忠 《湖北农业科学》 2020年第7期109-112,116,共5页
以湖北省恩施市为研究区,运用RS和GIS技术,采用归一化植被指数及像元二分模型,对2007—2015年3个不同时期同一季像的遥感影像进行不同年份植被覆盖度信息的提取,基于转移矩阵及统计分析2007—2015年植被覆盖度时空变化特征和空间分布。... 以湖北省恩施市为研究区,运用RS和GIS技术,采用归一化植被指数及像元二分模型,对2007—2015年3个不同时期同一季像的遥感影像进行不同年份植被覆盖度信息的提取,基于转移矩阵及统计分析2007—2015年植被覆盖度时空变化特征和空间分布。通过对比分析可知,恩施市植被覆盖度以较高等级以上植被覆盖度为主,3期较高以上植被覆盖度占总面积比例均在68%以上。总体分布特征是中部地区及东北部地区植被覆盖度较低,向西南部及西北部的覆盖度逐渐升高,高覆盖的植被主要集中在西南部及东南部地区。恩施2007—2015年植被覆盖度一直处于正向增长趋势,未出现局部或整体退化的现象,中等及较高植被覆盖度转出面积基本转向至高植被覆盖区域,高植被覆盖区域面积共增加910.3 km2,增加了22.98%。恩施大部分乡镇植被覆盖度均处于较高的覆盖水平,2007—2015年总体呈现增长趋势。 展开更多
关键词 恩施市 遥感 植被覆盖度 动态变化 空间分布
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