目的采用生物学信息方法分析预测结核分枝杆菌Mce4A蛋白的结构和功能。方法登录NCBI数据库,获取Mce4A蛋白基因信息;运用ProParam工具和ProScale工具分析Mce4A蛋白预测基本理化性质和疏水性;利用SignaIP 4.1Server和TMHMM Server v.2.0...目的采用生物学信息方法分析预测结核分枝杆菌Mce4A蛋白的结构和功能。方法登录NCBI数据库,获取Mce4A蛋白基因信息;运用ProParam工具和ProScale工具分析Mce4A蛋白预测基本理化性质和疏水性;利用SignaIP 4.1Server和TMHMM Server v.2.0工具预测Mce4A蛋白的信号肽和跨膜区;应用SOMPA工具分析Mce4A蛋白的二级结构,并采用SWISS MODEL工具对该蛋白进行三级结构同源建模;运用ABCpred软件和SYFPEITHI预测Mce4A蛋白的B细胞抗原表位和T细胞抗原表位;运用STRING数据库预测Mce4A蛋白的相互作用蛋白。结果Mce4A蛋白基因全长1 203bp,编码400个氨基酸。该蛋白理论分子质量单位(Mr)为42.418 33×103,理论等电点为7.69,分子式为C1900H3022N510O576S6,半衰期为4.4h,脂肪系数为93.70,不稳定系数为27.89,总平均亲水性为0.023,为稳定性亲水蛋白。预测该蛋白在13-35位氨基酸之间形成一个典型的跨膜螺旋区,无信号肽。二级结构中α螺旋、β折叠、β转角、无规则卷曲分别占37%、21%、6.5%和35.5%。预测该蛋白共有18个B细胞抗原表位和23个CTL表位。相互作用蛋白预测显示该蛋白可与5个蛋白协同发挥作用。结论生物信息学分析Mce4A蛋白为稳定性亲水蛋白,具有跨膜区,是典型的跨膜蛋白,在MTB入侵宿主巨噬细胞及存活起重要的作用。该蛋白含有潜在的B、T细胞抗原表位,为药物作用靶位的选定和药物分子的设计提供了新的方向。展开更多
