病理生理学是一门沟通临床医学与基础医学的"桥梁"性学科。将TBL(Team based learning)教学模式引入病理生理学教学中不仅能够在基础理论课阶段让学生对临床病例有一定的感性认识,在学生进入临床之前更好的掌握、运用相关基...病理生理学是一门沟通临床医学与基础医学的"桥梁"性学科。将TBL(Team based learning)教学模式引入病理生理学教学中不仅能够在基础理论课阶段让学生对临床病例有一定的感性认识,在学生进入临床之前更好的掌握、运用相关基础知识,而且还极大地提高学生学习的积极性、主动性、创造性和团队协作能力,但同时也暴露了一些不足之处。这些经验和教训可为今后TBL模式在病理生理学教学中的应用提供有益的借鉴。展开更多
目的筛选三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)预后相关基因,并探讨影响TNBC预后的可能机制。方法GEO和TCGA数据库下载表达谱数据,分别使用GEO2R和R语言程序包筛选TNBC和非三阴性乳腺癌差异基因;GO和KEGG富集分析差异基因...目的筛选三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)预后相关基因,并探讨影响TNBC预后的可能机制。方法GEO和TCGA数据库下载表达谱数据,分别使用GEO2R和R语言程序包筛选TNBC和非三阴性乳腺癌差异基因;GO和KEGG富集分析差异基因的分子功能及信号通路;生存曲线和单变量Cox回归分析筛选预后相关基因,ROC曲线进一步验证;Cibersort算法探讨预后相关基因与免疫细胞浸润的关系;HPA数据库在线分析预后相关基因在正常乳腺组织中的分布。结果获得TNBC差异基因217个,富集在雌激素相关信号通路,生物过程主要富集在乳腺上皮发育、腺体发育、腺体形态发生等,细胞成分主要富集在微绒毛膜、细胞基底外侧膜等,分子功能主要富集于跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性等;筛选出7个预后相关基因,ROC曲线显示AUC值>0.8的有COL9A3;免疫浸润分析显示COL9A3表达与记忆B细胞和单核细胞的浸润程度呈负相关,与初始B细胞和中性粒细胞的浸润程度呈正相关。单细胞测序结果显示COL9A3主要分布在成纤维细胞中。结论筛选出COL9A3可能作为TNBC预后相关基因;TNBC的发生发展可能与雌激素受体相关信号通路、细胞基底外侧膜和基膜的改变以及单核细胞、中性粒细胞的浸润及EMT的进程有关,为TNBC临床治疗提供参考。展开更多
文摘病理生理学是一门沟通临床医学与基础医学的"桥梁"性学科。将TBL(Team based learning)教学模式引入病理生理学教学中不仅能够在基础理论课阶段让学生对临床病例有一定的感性认识,在学生进入临床之前更好的掌握、运用相关基础知识,而且还极大地提高学生学习的积极性、主动性、创造性和团队协作能力,但同时也暴露了一些不足之处。这些经验和教训可为今后TBL模式在病理生理学教学中的应用提供有益的借鉴。
文摘目的筛选三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)预后相关基因,并探讨影响TNBC预后的可能机制。方法GEO和TCGA数据库下载表达谱数据,分别使用GEO2R和R语言程序包筛选TNBC和非三阴性乳腺癌差异基因;GO和KEGG富集分析差异基因的分子功能及信号通路;生存曲线和单变量Cox回归分析筛选预后相关基因,ROC曲线进一步验证;Cibersort算法探讨预后相关基因与免疫细胞浸润的关系;HPA数据库在线分析预后相关基因在正常乳腺组织中的分布。结果获得TNBC差异基因217个,富集在雌激素相关信号通路,生物过程主要富集在乳腺上皮发育、腺体发育、腺体形态发生等,细胞成分主要富集在微绒毛膜、细胞基底外侧膜等,分子功能主要富集于跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性等;筛选出7个预后相关基因,ROC曲线显示AUC值>0.8的有COL9A3;免疫浸润分析显示COL9A3表达与记忆B细胞和单核细胞的浸润程度呈负相关,与初始B细胞和中性粒细胞的浸润程度呈正相关。单细胞测序结果显示COL9A3主要分布在成纤维细胞中。结论筛选出COL9A3可能作为TNBC预后相关基因;TNBC的发生发展可能与雌激素受体相关信号通路、细胞基底外侧膜和基膜的改变以及单核细胞、中性粒细胞的浸润及EMT的进程有关,为TNBC临床治疗提供参考。
