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西安交通大学医学部生物化学与分子生物学系
1
作者 武丽涛 《基础医学教育》 2024年第3期F0003-F0003,共1页
西安交通大学医学部生物化学与分子生物学系随原西安医学院创建于1937年,前身为生物化学教研组,后组建生物化学教研室,主要承担医学生的生物化学课程教学。随着学科发展,于1982年起开设分子生物学课程,1996年更名为生物化学与分子生物... 西安交通大学医学部生物化学与分子生物学系随原西安医学院创建于1937年,前身为生物化学教研组,后组建生物化学教研室,主要承担医学生的生物化学课程教学。随着学科发展,于1982年起开设分子生物学课程,1996年更名为生物化学与分子生物学教研室,隶属原西安医科大学基础医学院。 展开更多
关键词 生物化学与分子生物学 西安医科大学 西安医学院 基础医学院 生物化学教研室 西安交通大学 化学课程教学 医学部
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大鼠软骨生成过程表达的小分子RNA生物信息学分析
2
作者 邵世滨 闵自信 +4 位作者 郭源旭 王权成 孙梦瑶 韩燕 孙健 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期462-466,共5页
目的：分析大鼠软骨形成过程中小分子 RNA（sRNA）表达谱变化及其基因功能,探讨软骨细胞增殖与分化的机制。方法取新生、断乳、性成熟3个时间节点的雌性 SD 大鼠股骨头软骨构建 sRNA 文库,Solexa 测序平台鉴定软骨组织全部 sRNA 序列表... 目的：分析大鼠软骨形成过程中小分子 RNA（sRNA）表达谱变化及其基因功能,探讨软骨细胞增殖与分化的机制。方法取新生、断乳、性成熟3个时间节点的雌性 SD 大鼠股骨头软骨构建 sRNA 文库,Solexa 测序平台鉴定软骨组织全部 sRNA 序列表达,所得的全部清洁序列与 SD 大鼠基因组信息比对,并做生物信息学分析。结果3个文库筛选出与基因组序列完全匹配序列,分别对应着217921条（41.23%）、196650条（38.74%）、245436条（41.54%）unique sRNA 序列。长度为20~24 nt 的 sRNA 占比：d 0为71.94%、d 21为72.85%、d 42为86.39%；其中,长度为22 nt的 sRNA 约占清洁序列的一半。文库序列分布特征,符合高质量 sRNA 文库的特征。超过总数62%的清洁序列来自于成熟 miRNA 序列,但在3个文库中的占比却仅仅只有0.69%、0.78%和0.63%。约60%的unique sRNA 序列无法与 miRBase 20.0和 Rfam9.1匹配。结论3个 sRNA 文库的 miRNA 这种分布模式,可能暗示着有功能不同或者来源各异的 miRNA,参与了对骨骼发育和骨形成关键阶段软骨细胞增殖与分化的调控。 展开更多
关键词 SRNA 生物信息学 软骨生成 大鼠 Solexa测序
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获得构建miRNA高表达载体的pre-miRNA及其侧翼DNA序列的生物信息学方法
3
作者 李嘉熙 宋刘梅 +6 位作者 王美晨 蓝茜 李玥 刘莉 王璇 韩燕 李冬民 《中国医学教育技术》 2013年第5期546-549,共4页
近年研究发现pre-miRNA发夹结构两侧的序列对miRNA的成熟至关重要。文章主要介绍了利用"miRBase"和"Ensembl"数据库获得构建microRNA高表达载体的pre-miRNA及其侧翼DNA序列的生物信息学方法:即先通过"miRBase&... 近年研究发现pre-miRNA发夹结构两侧的序列对miRNA的成熟至关重要。文章主要介绍了利用"miRBase"和"Ensembl"数据库获得构建microRNA高表达载体的pre-miRNA及其侧翼DNA序列的生物信息学方法:即先通过"miRBase"数据库获得pre-miRNA在"Ensembl"数据库的位置链接;然后在"Ensembl"数据库内获得pre-miRNA在基因组上的位置及碱基序列;最后在pre-miRNA序列导出窗口5'和3'侧翼序列输入框内填写所需侧翼序列的长度,进而获得pre-miRNA及其侧翼的DNA序列。 展开更多
关键词 “miRBase”数据库 “Ensembl”数据库 成熟miRNA miRNA前体(precursormicroRNA pre-miRNA) pre-miRNA侧翼
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microRNA-181b调控精神分裂症易感基因EGR3的分子机制 被引量：1
4
作者 张蕊 张天布 +3 位作者 范怡伦 张钰洋 杨雪文 马捷 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期669-673,共5页
目的用分子生物学的方法来检测microRNA-181b对EGR3基因的靶向调控作用,为后续microRNA-181b在精神分裂症(schizophrenia)中的分子功能研究指明方向。方法运用生物信息学软件预测到精神分裂症易感基因EGR3是microRNA-181b的潜在靶基因,... 目的用分子生物学的方法来检测microRNA-181b对EGR3基因的靶向调控作用,为后续microRNA-181b在精神分裂症(schizophrenia)中的分子功能研究指明方向。方法运用生物信息学软件预测到精神分裂症易感基因EGR3是microRNA-181b的潜在靶基因,随后采用PCR方法扩增EGR3基因3'UTR包含与microRNA-181b种子序列相结合的片段,再将该片段连接入pmirGLO质粒载体,用双酶切和测序的方法进行鉴定,与UCSC网站上EGR3序列相同的阳性重组质粒载体记为pmirGLO-EGR3。最后将该重组体与microRNA-181b阴性对照(NC)和模拟物(mimics)分为五组转染HEK293T细胞系,进行双荧光素酶报告基因活性测定。结果双酶切和测序结果表明EGR3 3'UTR成功构建入pmirGLO载体中。荧光显微镜下观察发现细胞转染实验成功,在大约90%的细胞中可检测到荧光信号。双荧光素酶报告基因活性检测结果表明,microRNA-181bmimics与NC相比,显著性降低了报告基因的活性。结论在细胞水平证明了精神分裂症易感基因EGR3是microRNA-181b的靶基因,对后续microRNA-181b的功能研究,以及其在精神分裂症中的分子作用机制研究提供了新的线索。 展开更多
关键词 精神分裂症 microRNA-181b EGR3 3'UTR 调控
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TNF-α和IL-1β通过MAPK通路上调人支气管平滑肌细胞的缓激肽受体和内皮素受体 被引量：12
5
作者 蔡艳 杨旭东 雷莹 《西北药学杂志》 CAS 2018年第3期353-359,共7页
目的支气管平滑肌对气道收缩剂的高反应性是哮喘的主要病理表现,但这种现象背后的分子机制尚未明确。肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白细胞介素-1β(IL-1β)的释放对气道高反应性的发生起重要作用。研究旨在考察促炎性细胞因子TNF-α和IL-1... 目的支气管平滑肌对气道收缩剂的高反应性是哮喘的主要病理表现,但这种现象背后的分子机制尚未明确。肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白细胞介素-1β(IL-1β)的释放对气道高反应性的发生起重要作用。研究旨在考察促炎性细胞因子TNF-α和IL-1β对缓激肽、内皮素-1和血栓素A2的G蛋白偶联受体(GPCR)在人支气管平滑肌细胞(HBSMCs)中mRNA水平的影响。方法将HBSMCs与炎性细胞因子TNF-α,IL-1β,IL-6,IL-13以及MAPK信号通路抑制剂共同培养后,检测缓激肽受体B1和B2、内皮素B受体、血栓素A2受体和β2肾上腺素受体mRNA水平的变化。结果 TNF-α增加了HBSMCs中缓激肽B1和B2受体的mRNA水平,IL-1β增加了HBSMCs中的内皮素B受体的mRNA水平。P38 MAPK抑制剂SB203580和JNK抑制剂SP600125降低了TNF-α上调的缓激肽受体mRNA水平,MEK1/2抑制剂U0126和IκB激酶抑制剂TPCA-1消除了由IL-1β引起的内皮素B受体的mRNA水平增加。结论 TNF-α通过p38 MAPK和JNK信号通路在转录水平上调缓激肽B1和B2受体,IL-1β通过MEK1/2和下游NF-κB通路在转录水平上调HBSMCs中内皮素B受体。 展开更多
关键词 TNF-Α IL-1Β 人支气管平滑肌细胞 缓激肽受体 内皮素B受体 MAPK
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哮喘的遗传学研究进展 被引量：2
6
作者 杨旭东 《国外医学（医学地理分册）》 CAS 2016年第1期73-76,共4页
哮喘是一种常见的多基因复杂性疾病,具有较高的遗传度。近年来,寻找哮喘的易感基因已成为哮喘遗传学研究的主要内容。本文对定位克隆、候选基因研究和全基因组关联研究等寻找哮喘易感基因的策略,及近年来研究较多的一些哮喘易感基因的... 哮喘是一种常见的多基因复杂性疾病,具有较高的遗传度。近年来,寻找哮喘的易感基因已成为哮喘遗传学研究的主要内容。本文对定位克隆、候选基因研究和全基因组关联研究等寻找哮喘易感基因的策略,及近年来研究较多的一些哮喘易感基因的研究进行简要概述。 展开更多
关键词 哮喘 研究方法 易感基因 多态性
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PBL教学在全科医师培训教学中应用的必要性 被引量：7
7
作者 蒋晓刚 倪锋 惠鹏宇 《解放军预防医学杂志》 CAS 2019年第12期29-30,32,共3页
目的观察分析PBL教学在全科医师培训教学中应用的必要性。方法选取本院(在2018年2月-2019年2月)搜集的88名全科医师一般资料,按照不同教学方法分为实验组(44,应用PBL教学方法)和对照组(44例,应用传统教学方法)。采用统计学分析两组全科... 目的观察分析PBL教学在全科医师培训教学中应用的必要性。方法选取本院(在2018年2月-2019年2月)搜集的88名全科医师一般资料,按照不同教学方法分为实验组(44,应用PBL教学方法)和对照组(44例,应用传统教学方法)。采用统计学分析两组全科医师的培训效果(问诊及病例分析能力、体检及临床技能、辅助检查分析、执业医师综合、执业医师实践)、每周学习时间(课余学习总时间、讨论学习时间、查询资料学习时间)。结果实验组培训效果(问诊及病例分析能力、体检及临床技能、辅助检查分析、执业医师综合、执业医师实践)显著高于对照组(P<0.05),实验组每周学习时间(课余学习总时间、讨论学习时间、查询资料学习时间)多于对照组(P<0.05)。结论PBL教学在全科医师培训教学中可显著提高培训效果。 展开更多
关键词 PBL教学 全科医师 培训教学 应用效果
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miR-369-3p对缺氧诱导海马神经元细胞增殖、凋亡的影响及其机制 被引量：3
8
作者 吕喆 蒋晓刚 廉民学 《海南医学》 CAS 2020年第16期2041-2047,共7页
目的探讨miR-369-3p对缺氧诱导的海马神经元细胞(Hhn)增殖、凋亡的影响及其作用机制。方法将Hhn细胞置于持续充入95%N2+5%CO2的密闭培养箱中进行缺氧处理48 h(缺氧组),正常培养的细胞作为对照组。将miR-NC、miR-369-3p、anti-miR-NC、an... 目的探讨miR-369-3p对缺氧诱导的海马神经元细胞(Hhn)增殖、凋亡的影响及其作用机制。方法将Hhn细胞置于持续充入95%N2+5%CO2的密闭培养箱中进行缺氧处理48 h(缺氧组),正常培养的细胞作为对照组。将miR-NC、miR-369-3p、anti-miR-NC、anti-miR-369-3p转染至Hhn细胞中,分别记为miR-NC组、miR-369-3p组、anti-miR-NC组、anti-miR-369-3p组;将anti-miR-NC、anti-miR-369-3p、pcDNA3.1、pcDNA3.1-NAMPT分别转染至Hhn细胞中再进行缺氧处理,分别记为缺氧+anti-miR-NC组、缺氧+anti-miR-369-3p组、缺氧+pcDNA3.1组、缺氧+pcDNA3.1-NAMPT组;将anti-miR-369-3p质粒分别与si-NC、si-NAMPT共转染至Hhn细胞中再进行缺氧处理,分别记为缺氧+anti-miR-369-3p+si-NC组、缺氧+anti-miR-369-3p+si-NAMPT组;转染均采用脂质体法。实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测miR-369-3p表达水平;流式细胞术检测细胞凋亡;蛋白质印迹(Western blot)法检测细胞周期素D1(Cyclin D1)、p21、B细胞淋巴瘤/白血病-2(Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)和酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)表达;四甲基偶氮唑盐比色法(MTT)检测细胞增殖活性;超氧化物歧化酶(SOD)和丙二醛(MDA)试剂盒分别检测SOD活性和MDA含量;双荧光素酶报告基因检测miR-369-3p和NAMPT的靶向关系。结果与对照组比较,缺氧组Hhn细胞中miR-369-3p表达水平升高,NAMPT表达水平降低,P21、Bax表达水平升高,Cyclin D1、Bcl-2表达水平降低,细胞活性降低,细胞凋亡率升高,SOD活性降低,MDA含量升高,差异均有统计学意义(P<0.05);与缺氧+anti-miR-NC组比较,缺氧+anti-miR-369-3p组miR-369-3p表达水平降低,P21、Bax表达水平降低,Cyclin D1、Bcl-2表达水平升高,细胞活性升高,细胞凋亡率降低,SOD活性升高,MDA含量降低,差异均有统计学意义(P<0.05);与缺氧+pcDNA3.1组比较,缺氧+pcDNA3.1-NAMPT组NAMPT表达水平升高,P21、Bax表达水平降低,Cyclin D1、Bcl-2表达水平升高,细胞活性升高,细胞凋亡率降低,SOD活性升高,MDA含量降低,差异均有统计学意义(P<0.05);与缺氧+anti-miR-369-3p+si-NC组比较,缺氧+anti-miR-369-3p+si-NAMPT组P21、Bax表达水平升高,Cyclin D1、Bcl-2表达水平降低,细胞活性降低,细胞凋亡率升高,SOD活性降低,MDA含量升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论抑制miR-369-3p表达可促进缺氧诱导的海马神经元细胞增殖,抑制细胞凋亡,减轻氧化应激反应,保护缺氧诱导的海马神经元细胞损伤,其机制可能与NAMPT相关,可为阿尔兹海默症的防治提供新思路和新靶点。 展开更多
关键词 Hhn细胞 miR-369-3p 酰胺磷酸核糖转移酶 缺氧诱导 海马神经元细胞 凋亡
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结直肠癌组织中NMNAT2蛋白的表达及其临床意义
9
作者 吕喆 廉民学 蒋晓刚 《临床医学研究与实践》 2020年第26期121-123,共3页
目的探讨结直肠癌组织中烟酰胺单核苷酸腺苷酰转移酶2(NMNAT2)蛋白的表达及其临床意义。方法选择2015年1月至2017年12月收集的120例结直肠癌及癌旁组织标本为研究对象,给予常规固定-包埋-切片处理后,行免疫组化检测结直肠癌组织中NMNAT... 目的探讨结直肠癌组织中烟酰胺单核苷酸腺苷酰转移酶2(NMNAT2)蛋白的表达及其临床意义。方法选择2015年1月至2017年12月收集的120例结直肠癌及癌旁组织标本为研究对象,给予常规固定-包埋-切片处理后,行免疫组化检测结直肠癌组织中NMNAT2蛋白,分析其表达情况及临床意义。结果 NMNAT2蛋白表达定位主要是结直肠癌细胞胞质,且结直肠癌组织NMNAT2蛋白表达阳性率高于癌旁正常结直肠组织(P<0.05)。不同性别、年龄、形态类型、组织类型、分化程度、肿瘤大小的结直肠癌组织NMNAT2蛋白表达情况比较,差异无统计学意义(P>0.05);不同浸润深度、淋巴结转移、TNM分期的结直肠癌组织NMNAT2蛋白表达情况比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论结直肠癌组织中NMNAT2蛋白特异性高,且直接参与结直肠肿瘤的发生、发展,可以作为结直肠癌的新促癌基因,成为临床新型结直肠癌诊断、治疗靶点。 展开更多
关键词 结直肠癌组织 烟酰胺单核苷酸腺苷酰转移酶2蛋白 标本
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CALM1基因遗传多态性与骨关节炎的荟萃分析 被引量：4
10
作者 张富军 王晓莉 +3 位作者 赵盼盼 聂发毅 张蕊 马捷 《中华临床医师杂志（电子版）》 CAS 2015年第24期109-112,共4页
目的检验CALM1基因遗传多态性与骨关节炎(OA)的相关性。方法对2015年6月之前发表的关于CALM1基因与OA的文献进行检索、收集和整理,采用荟萃分析的手段对CALM1的单核苷酸多态性位点(SNP)与OA进行分析。结果本研究在4个团队的4份独立样本... 目的检验CALM1基因遗传多态性与骨关节炎(OA)的相关性。方法对2015年6月之前发表的关于CALM1基因与OA的文献进行检索、收集和整理,采用荟萃分析的手段对CALM1的单核苷酸多态性位点(SNP)与OA进行分析。结果本研究在4个团队的4份独立样本(包括患者1 591例和健康对照1 523例)中对CALM1核心启动子区SNP rs12885713进行分析。结果发现,在亚洲人群中rs12885713与OA存在显著的相关性(P=0.02)。结论本次分析显示至少在亚洲人群中,CALM1很可能参与了OA的发生发展过程。 展开更多
关键词 骨关节炎 多态性 单核苷酸 CALM1 荟萃分析 关联
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