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基于叶绿体rps16基因和核基因ITS片段研究肉苁蓉属系统位置 被引量:9
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作者 李汐 祝铭 +2 位作者 孙延霞 钟扬 李建强 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期431-436,共6页
在前人对列当科系统发育研究的基础上,追加了肉苁蓉属(Cistanche)的基因序列数据,运用最大简约法、最大似然法和贝叶斯推断方法探讨了其在列当科中的系统位置及列当科中属间关系。基于rps16基因序列及rps16+ITS联合序列建立了列当科系... 在前人对列当科系统发育研究的基础上,追加了肉苁蓉属(Cistanche)的基因序列数据,运用最大简约法、最大似然法和贝叶斯推断方法探讨了其在列当科中的系统位置及列当科中属间关系。基于rps16基因序列及rps16+ITS联合序列建立了列当科系统发育树,结果显示,肉苁蓉属、列当属(Orobanche)以及草苁蓉属(Bos-chniakia)聚在同一进化枝内,肉苁蓉属和列当属表现出最近亲缘关系;列当科中的全寄生类群、半寄生类群和非寄生类群分属在3个不同分支中。 展开更多
关键词 列当科 肉苁蓉属 rps16 ITS 系统发育树
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青藏高原生物资源开发的现状与前景 被引量:10
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作者 张体操 乔琴 钟扬 《生命科学》 CSCD 2013年第5期446-450,共5页
青藏高原是全世界最高的高原,也是国际生物多样性热点地区之一,生物资源十分丰富,是研究和开发生物资源持续利用的天然实验室。概述了青藏高原生物资源的特点,列举了珍稀濒危的动植物资源及保护现状,探讨了青藏高原生物资源开发的前景,... 青藏高原是全世界最高的高原,也是国际生物多样性热点地区之一,生物资源十分丰富,是研究和开发生物资源持续利用的天然实验室。概述了青藏高原生物资源的特点,列举了珍稀濒危的动植物资源及保护现状,探讨了青藏高原生物资源开发的前景,尤其是高新生物技术在该领域的应用潜力。 展开更多
关键词 青藏高原 生物资源 生物多样性 生物技术
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麻黄属rbcL基因的适应性进化检测与结构模建 被引量:6
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作者 刘念 王庆彪 +5 位作者 陈婕 朱勇 扎西次仁 胡祎瑶 陈凡 钟扬 《科学通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第14期1341-1346,共6页
采用PAML程序检测麻黄属14种及其他9种裸子植物rbcL基因的适应性进化.以"分支"模型检测到该属植物RbcL蛋白催化活性区先后经历了3次大范围的选择;以"分支-位点"模型检测出在该基因第365位密码子位点存在正选择的物... 采用PAML程序检测麻黄属14种及其他9种裸子植物rbcL基因的适应性进化.以"分支"模型检测到该属植物RbcL蛋白催化活性区先后经历了3次大范围的选择;以"分支-位点"模型检测出在该基因第365位密码子位点存在正选择的物种;计算机三维结构模建进一步显示该位点引起RbcL蛋白βG折叠、βH折叠和βE折叠的空间结构变化,这些变化可能与麻黄属该蛋白对环境的适应有关. 展开更多
关键词 麻黄属 裸子植物 rbcL适应性进化 三维结构模建
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节尾狐猴二氧化碳感知相关基因CAⅡ的序列分析及进化意义
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作者 赵佳媛 薛晨轶 +6 位作者 金科 王合瑞 王爱善 范敏玉 孙璘 王莉 钟扬 《科学通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期210-214,共5页
碳酸酐酶Ⅱ(CAⅡ)基因和D型鸟苷酸环化酶(GC-D)基因是二氧化碳感知通路上的2个相关基因.本研究测定了节尾狐猴的CAⅡ基因序列,并利用GenBank数据及文献等提供的8个物种的CAⅡ基因和GC-D基因的序列,比较2个基因树的拓扑结构和遗传距离,... 碳酸酐酶Ⅱ(CAⅡ)基因和D型鸟苷酸环化酶(GC-D)基因是二氧化碳感知通路上的2个相关基因.本研究测定了节尾狐猴的CAⅡ基因序列,并利用GenBank数据及文献等提供的8个物种的CAⅡ基因和GC-D基因的序列,比较2个基因树的拓扑结构和遗传距离,发现这2个基因具有一致的进化趋势,表明二氧化碳感知通路上的相关基因间可能存在着较强的进化关联与一致进化趋势. 展开更多
关键词 D型鸟苷酸环化酶 碳酸酐酶Ⅱ 节尾狐猴 基因树 遗传距离
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应用比较基因组分析检测乙型肝炎病毒中可能的重组事件 被引量:2
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作者 叶琳 张原 +2 位作者 梅旖 南蓬 钟扬 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第14期1322-1328,共7页
应用生物信息学软件RDP3和Simplot及5种重组检测算法(RDP,GENECONV,MaxChi,Chimaera和SiScan),对791个人类乙型肝炎病毒(HBV)全基因组和38个非人灵长类乙型肝炎病毒全基因组序列进行了比较分析,以检测可能的重组事件及重组子.用RDP3检测... 应用生物信息学软件RDP3和Simplot及5种重组检测算法(RDP,GENECONV,MaxChi,Chimaera和SiScan),对791个人类乙型肝炎病毒(HBV)全基因组和38个非人灵长类乙型肝炎病毒全基因组序列进行了比较分析,以检测可能的重组事件及重组子.用RDP3检测出9个重组事件及61个重组子,并用Simplot分析确定了具有两条亲代序列的6个事件中重组发生的位置.61个重组子中53个为首次发现.研究还表明PreC/C基因区域和基因边缘附近发生重组频率较高. 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 重组 RDP3 Simplot
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