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仁怀市主要河流春季大型底栖动物群落结构及其水质评价
1
作者 何浩宇 龙茂源 +8 位作者 张书海 周岳兵 甘雷 王桢璐 项涛 居涛 石磊 安苗 董响红 《山地农业生物学报》 2024年第1期28-38,共11页
底栖动物是水域生态系统不可或缺的组成部分,亦是水环境状况的重要指示类群。为探究仁怀市主要河流大型底栖动物的群落结构和水质状况,我们于2023年春季对赤水河仁怀段干流、8条主要支流及其附属水库的大型底栖动物群落进行了调查。结... 底栖动物是水域生态系统不可或缺的组成部分,亦是水环境状况的重要指示类群。为探究仁怀市主要河流大型底栖动物的群落结构和水质状况,我们于2023年春季对赤水河仁怀段干流、8条主要支流及其附属水库的大型底栖动物群落进行了调查。结果发现:此次考察共采集到大型底栖动物93种,隶属于4门7纲18目58科,其中,软体动物17种(18.28%);环节动物9种(9.68%);水生昆虫65种(69.89%);甲壳动物和扁形动物各1种(均占1.08%)。优势种为多足摇蚊属一种(Polypedilum sp.)、河蚬(Corbicula fluminea)、摇蚊属一种(Chironomus sp.)与长跗摇蚊属一种(Tanytarsus sp.)。利用生物多样性和底栖动物分类评价指数对该市主要河流进行水质生物学评价,结果显示:Shannon-Wiener指数与Margalef指数评级偏差,Pielou指数评级偏优,而生物学污染性指数和生物指数评级一致,指示仁怀市主要河流水质整体上存在一定程度的退化。 展开更多
关键词 河流 仁怀市 大型底栖动物 群落结构 水质评价
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柯乐猪PAEP基因多态性及其与繁殖性状的关联分析
2
作者 赵永 郭小江 +6 位作者 李维 熊力 杨红文 王春源 吴燕 向进 张依裕 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1593-1602,共10页
【目的】研究孕激素相关子宫内膜蛋白(progestogen associated endometrial protein,PAEP)基因多态性对柯乐猪繁殖性状的影响,以挖掘柯乐猪的高繁殖力基因,用于提升柯乐猪的繁殖力。【方法】以189头经产柯乐猪为试验动物,采用PCR产物测... 【目的】研究孕激素相关子宫内膜蛋白(progestogen associated endometrial protein,PAEP)基因多态性对柯乐猪繁殖性状的影响,以挖掘柯乐猪的高繁殖力基因,用于提升柯乐猪的繁殖力。【方法】以189头经产柯乐猪为试验动物,采用PCR产物测序和序列比对鉴定单核苷酸多态性(SNP)位点,利用SHEsis在线软件分析SNP位点的群体遗传特性,通过RNAfold、SOPMA、SWISS-MODEL和SWISS-PdbViewer程序对SNP位点进行生物信息学分析,利用SPSS 22.0软件分析PAEP基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状的相关性。【结果】在柯乐猪PAEP基因中共鉴定到3个SNPs位点:外显子4的g.1884992 T>C位点,为错义突变,导致第135位缬氨酸(V)变成丙氨酸(A);内含子4的g.1885152 G>C和g.1887834 G>A位点。3个突变位点均检测到3种基因型;g.1884992 T>C位点属于低度多态(PIC<0.25),g.1885152 G>C、g.1887834 G>A位点属于中度多态(0.25<PIC<0.5)。g.1884992 T>C位点产生的基因型分布未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);g.1885152 G>C和g.1887834 G>A位点产生的基因型分布均极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。连锁分析发现,g.1885152 G>C和g.1887834 G>A位点完全连锁,共产生3种单倍型和6种双倍型。g.1884992 T>C位点引起PAEP基因mRNA及蛋白的二级结构发生改变。关联分析结果表明,g.1884992 T>C位点对柯乐猪总产仔数和产活仔数的影响均达到显著水平(P<0.05),g.1885152 G>C、g.1887834 G>A位点对柯乐猪总产仔数、产活仔数、断奶仔数和断奶窝重的影响均达到显著水平(P<0.05);双倍型H3H3个体总产仔数、产活仔数、断奶仔数和断奶窝重均显著高于其他5种双倍型(P<0.05),初生窝重显著高于双倍型H1H1、H2H2和H2H3(P<0.05);双倍型H1H3个体的总产仔数和断奶仔数显著高于双倍型H1H1、H1H2、H2H2和H2H3(P<0.05),产活仔数显著高于双倍型H2H3(P<0.05)。【结论】PAEP基因中存在的3个SNPs对柯乐猪繁殖性状有显著影响,其中H3H3为有利双倍型,可作为柯乐猪繁殖性状选择的遗传标记。 展开更多
关键词 柯乐猪 PAEP基因 单核苷酸多态性 繁殖性状
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柯乐猪MMP2基因多态性及其与繁殖性状的关联分析
3
作者 向进 杨齐心 +7 位作者 罗华伦 洪亚婷 郭小江 杨红文 李维 王春源 吴燕 张依裕 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期1142-1150,共9页
【目的】探究基质金属蛋白酶2(matrix metallopeptidase 2,MMP2)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)及其与繁殖性状的相关性,筛选与柯乐猪繁殖性状相关的遗传标记。【方法】试验选择212头健康的经产柯乐母猪,采... 【目的】探究基质金属蛋白酶2(matrix metallopeptidase 2,MMP2)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)及其与繁殖性状的相关性,筛选与柯乐猪繁殖性状相关的遗传标记。【方法】试验选择212头健康的经产柯乐母猪,采用直接测序法筛选柯乐猪MMP2基因SNP位点,利用RNAfold在线软件预测MMP2基因不同单倍型mRNA二级结构,并通过SPSS 22.0软件分析MMP2基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状的相关性。【结果】在柯乐猪MMP2基因第2外显子中检测到1个SNP位点(g.30062403 C>T),在第4外显子中检测到2个SNPs位点(g.30065309 C>T和g.30065312 C>T),均存在3种基因型(CC、CT和CT)。遗传特性分析结果显示,g.30062403 C>T位点为低度多态,g.30065309 C>T和g.30065312 C>T位点属于中度多态。卡方适合性检验结果显示,g.30062403 C>T位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),另2个位点均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。连锁不平衡分析结果显示,g.30065309 C>T和g.30065312 C>T位点之间存在强连锁不平衡。单倍型mRNA二级结构分析显示,单倍型H1的mRNA二级结构与原序列相同,其他3种单倍型均导致mRNA二级结构和最小自由能发生变化。关联分析结果显示,g.30062403 C>T位点TT基因型个体的窝产活仔数显著高于CC基因型,断奶窝重显著高于CT基因型(P<0.05);g.30065309 C>T位点CC基因型个体的断奶仔数显著高于TT基因型(P<0.05);g.30065312 C>T位点TT基因型个体的窝产活仔数、断奶仔数均显著高于CT基因型(P<0.05)。双倍型H2H2为窝产仔数、窝产活仔数、断奶仔数、断奶窝重的优势双倍型,H1H4为初生窝重的优势双倍型。【结论】柯乐猪MMP2基因3个SNPs位点与其窝产仔数、窝产活仔数、初生窝重、断奶仔数及断奶窝重均存在显著关联性,可作为分子育种遗传标记。 展开更多
关键词 柯乐猪 MMP2基因 多态性 繁殖性状 关联分析
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两个贵州山羊品种GHSR和GHRL基因遗传变异及其与生长性状的关联性 被引量：15
4
作者 宋桃伟 蔡惠芬 +4 位作者 罗卫星 刘若余 张依裕 孙岩岩 刘彬 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期140-153,共14页
【目的】探讨GHSR和GHRL基因作为山羊体重体尺性状候选基因的可能性,寻找与山羊生长性状相关的分子遗传标记。【方法】以贵州白山羊和贵州黑山羊为研究素材,采用DNA混合池结合PCR产物直接测序及PCR-SSCP技术检测GHSR和GHRL基因的单核苷... 【目的】探讨GHSR和GHRL基因作为山羊体重体尺性状候选基因的可能性,寻找与山羊生长性状相关的分子遗传标记。【方法】以贵州白山羊和贵州黑山羊为研究素材,采用DNA混合池结合PCR产物直接测序及PCR-SSCP技术检测GHSR和GHRL基因的单核苷酸多态性,利用SPSS(18.0)软件GLM统计模型分析基因SNPs不同基因型及合并基因型与贵州山羊生长性状的关联性,同时采用在线软件对GHSR基因进行生物信息学分析。【结果】在GHSR基因外显子2和3′UTR分别检测到G200A同义突变和T628C位点,而在5′UTR区和外显子1则未发现多态性。设计一对特异性引物对G200A位点进行PCR-SSCP分析,表现为3种基因型,依次命名为GG、GA和AA。GG基因型为优势基因型,在贵州白山羊和贵州黑山羊母羊群体中等位基因G为优势等位基因,其等位基因频率分别为0.6731和0.5243。而在贵州黑山羊公羊群体中A则为优势等位基因,其频率为0.5122。多态信息含量均表现为中度多态(0.25<PIC<0.50)。在GHRL基因内含子2处发现1个G141A突变,外显子2和外显子4处分别检测到2个同义突变(T78C和C14T),设计一对特异性引物对C14T位点进行SSCP分析,显示为2种基因型CT和CC。在所有试验群体中,CC基因型为优势基因型,其频率分别为0.7692、0.9417和0.9390,等位基因C为优势等位基因,其频率依次为0.8846、0.9709和0.9695,多态信息含量均显示为低度多态(PIC<0.25)。χ2检验显示所有试验群体G200A和C14T位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。关联分析表明,GHSR基因G200A位点与山羊体重、体高、体斜长和管围显著相关(P<0.05),纯合子GG基因型优势较为明显,贵州白山羊GG基因型个体的体高显著高于GA基因型个体和管围显著高于AA基因型个体(P<0.05)。C14T位点贵州黑山羊(公羊)CC基因型个体的体重、体高和胸围显著高于CT基因型(P<0.05)。组合基因型对体高和胸围指标的影响显著(P<0.05),表现为CCGG合并基因型个体的体高显著高于CCAA合并基因型个体(P<0.05)。生物信息学分析揭露,GHSR基因5’UTR处未检测到核心启动子区和Cp G岛,仅发现1个CAAT-box和部分潜在的转录因子结合位点,G200A导致m RNA二级结构发生明显变化。GHSR蛋白二级结构以α-螺旋为主(48.90%),三级结构及跨膜螺旋结构预测表明该蛋白是膜蛋白。【结论】研究初步推测GHSR基因和GHRL基因多态性及合并基因型对山羊生长性状具有较显著的影响,G200A和C14T位点可作为山羊生长性状的有效遗传标记用于指导山羊的分子育种。 展开更多
关键词 GHSR基因 GHRL基因 遗传变异 生长性状 关联分析
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复方中草药对贵州黄鸡繁殖性能的影响 被引量：11
5
作者 饶永超 李维 +4 位作者 张芸 杨德凤 李洪林 林家栋 张福平 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第5期221-225,共5页
试验旨在探究日粮中添加复方中草药添加剂(菟丝子、淫羊藿、巴戟天按照质量比1:1:1混合)对产蛋后期贵州黄鸡种鸡繁殖性能的影响。试验选取385日龄贵州黄鸡种母鸡120只和种公鸡72只,随机分为4组,每组3个重复,种母鸡每个重复10只,种公鸡... 试验旨在探究日粮中添加复方中草药添加剂(菟丝子、淫羊藿、巴戟天按照质量比1:1:1混合)对产蛋后期贵州黄鸡种鸡繁殖性能的影响。试验选取385日龄贵州黄鸡种母鸡120只和种公鸡72只,随机分为4组,每组3个重复,种母鸡每个重复10只,种公鸡每个重复6只。对照组饲喂基础日粮,复方中草药添加组分别在基础日粮中添加0.5%、1.0%、1.5%复方中草药添加剂,预试期7 d,正试期28 d,检测复方中草药对精液品质、激素水平、卵泡数量和种蛋孵化效果的影响。结果表明:与对照组相比,日粮添加0.5%、1.0%、1.5%复方中草药添加剂提高了种公鸡精子密度、精子活率和睾丸睾酮浓度,改善精子畸形率(P<0.05);添加复方中草药添加剂提高了种母鸡血清雌二醇、促黄体素、孕激素浓度(P<0.05),也增加了种母鸡卵泡数量(P<0.05),降低了种母鸡血清催乳素浓度(P<0.05),1.5%中草药组种母鸡的产蛋量高于对照组(P<0.05),并提高了种蛋受精率、孵化率和健雏率(P<0.05)。在本试验条件下,在产蛋后期添加复方中草药添加剂可改善贵州黄鸡公鸡的精液品质,提高母鸡的产蛋性能以及孵化性能,有效提高贵州黄鸡的繁殖性能。 展开更多
关键词 贵州黄鸡 复方中草药添加剂 繁殖性能
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贵州省东方蜜蜂Apis cerana线粒体DNA遗传多样性研究 被引量：3
6
作者 赵金玉 龙见坤 +2 位作者 DAVID Tembong Cham 陈祥盛 常志敏 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2022年第3期595-605,共11页
为探明贵州省东方蜜蜂Apis cerana遗传多样性及遗传分化现状,对贵州省9个地级市79个样点采集的东方蜜蜂样本线粒体DNA(mt DNA)COI-COII序列进行扩增与测序,分析其遗传多样性、遗传结构及亲缘关系。序列结果显示扩增后COI-COII序列长度约... 为探明贵州省东方蜜蜂Apis cerana遗传多样性及遗传分化现状,对贵州省9个地级市79个样点采集的东方蜜蜂样本线粒体DNA(mt DNA)COI-COII序列进行扩增与测序,分析其遗传多样性、遗传结构及亲缘关系。序列结果显示扩增后COI-COII序列长度约为760 bp,A+T平均含量(82.3%)明显高于C+G(17.7%),碱基偏移性明显。单倍型分析共发现33个单倍型,其中主体单倍型H1为9个地理群体共有。单倍型多样度分析表明平均单倍型多样度为0.802,其中黔南地区最高,遵义地区最低;平均核苷酸多样度为0.014,其中六盘水地区最高,黔西南及安顺地区最低。中性检验结果表明贵州省部分地区东方蜜蜂可能经历过群体扩张。9个地区样点的平均遗传距离介于0.0012~0.0044之间,其中毕节与黔东南地区间最大,为0.0044,安顺与黔南、遵义地区间最小,均为0.0012。在单倍型系统进化树中,79个样点东方蜜蜂可分为两个类群。研究结果为贵州省东方蜜蜂遗传分化研究、种质资源保护与开发利用提供参考依据。 展开更多
关键词 贵州省 东方蜜蜂 线粒体DNA 遗传多样性 遗传距离
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KISS1基因SNP对柯乐猪繁殖性状的影响
7
作者 熊力 谭元成 +5 位作者 郭小江 杨红文 杨齐心 杨酸 向进 张依裕 《现代畜牧科技》 2023年第8期93-96,共4页
研究旨在了解KISS1基因对猪繁殖力的影响,以78头初产柯乐猪为材料,采用聚合酶链式反应(PCR)产物直接测序与人工较对相结合鉴定KISS1基因单核苷酸多态性(SNP)位点,分析SNP位点对柯乐猪繁殖指标的影响。结果显示在KISS1基因第1外显子处发... 研究旨在了解KISS1基因对猪繁殖力的影响,以78头初产柯乐猪为材料,采用聚合酶链式反应(PCR)产物直接测序与人工较对相结合鉴定KISS1基因单核苷酸多态性(SNP)位点,分析SNP位点对柯乐猪繁殖指标的影响。结果显示在KISS1基因第1外显子处发现g.64835073 A>G同义突变,在第1内含子处发现g.64835529 G>A突变,2个SNP位点均产生3种基因型,均为中度多态位点,且均符合Hardy-Weinberg平衡;g.64835073 A>G位点对5个繁殖指标的影响未能达到显著水平(P>0.05);其中g.64835529 G>A位点对总产仔数、初生个体重、断奶个体重的影响达显著水平,揭示g.64835529 G>A位点可能作为猪产仔数的一个分子标记。 展开更多
关键词 柯乐猪 KISS1基因 SNP 繁殖性状
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全基因组选择信号解析剑白香猪和从江香猪的遗传差异
8
作者 袁巍 毕欢 +4 位作者 张雨丹 张依裕 顾晓龙 杨红文 陈伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期3631-3641,共11页
旨在通过全基因组选择信号分析揭示剑白香猪和从江香猪的遗传差异,提高对从江香猪和剑白香猪种群的保护状况、遗传多样性、群体结构和和适应性进化的认识。本研究随机选取2岁龄从江香猪和剑白香猪各5头,并分为两组。通过全基因组重测序... 旨在通过全基因组选择信号分析揭示剑白香猪和从江香猪的遗传差异,提高对从江香猪和剑白香猪种群的保护状况、遗传多样性、群体结构和和适应性进化的认识。本研究随机选取2岁龄从江香猪和剑白香猪各5头,并分为两组。通过全基因组重测序对从江香猪和剑白香猪测序,将测序数据利用bwa软件比对到猪参考基因组Sscrofa 11.1上,随后使用GATK软件进行变异检测和SNP、INDEL过滤提取。同时,利用Plink和SNeP软件进行群体遗传多样性分析,包括群体有效大小、多态位点比例、观测杂合度、期望杂合度。使用vcftools软件分析群体选择信号,并通过KEGG和GO分析受选择区域基因。经过SNP和INDEL分析,发现从江香猪和剑白香猪群体共有的SNPs位点数为16158002个,从江香猪特有的为6863992个,剑白香猪特有的为4275660个;共有的INDEls位点数为3275375个,从江香猪特有的为1674081个,剑白香猪特有的为1114248个。从采样起算,从江香猪和剑白香猪的群体在13代前的有效大小均为18头。其中,从江香猪的多态性位点比例更高,达到了0.8757,而二者群体的观测杂合度均高于期望杂合度。剑白香猪和从江香猪的核苷酸多样性均小于0.5%,群体内选择检验Tajima’s D值均大于0,ROD值为0.5531,Fst值为0.7362。KEGG和GO富集分析表明,剑白香猪和从江香猪的遗传差异涉及多种通路和基因功能。包括涉及轴突引导、ECM与受体的相互作用、局部粘附、PI3K-Akt信号通路、硫辛酸代谢、cGMP-PKG信号通路、MAPK信号传导途径、核苷酸切除修复、阿佩林信号通路、心律失常性右室心肌病等通路。剑白香猪和从江香猪群体之间存在一定的群体多态性损失,群体分歧度较高,两亚群间存在明显的种群分化,并且二者基因组内存在大量的中等频率等位基因,需要提高从江香猪和剑白香猪群体内的遗传多样性,减少外来血缘引入导致纯种度降低的风险。 展开更多
关键词 全基因组 选择信号 香猪 遗传差异
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PBL教学模式在家畜繁殖学实验教学改革中的应用探索
9
作者 陈祥 敖政 +1 位作者 赵佳福 龚婷 《黑龙江动物繁殖》 2022年第4期57-61,共5页
家畜繁殖学是一门实践性很强的课程,探索实验教学新模式对提高该课程教学效果具有重要作用。教师将学生分为两组,即采用传统教学模式的传统组和应用PBL教学模式的PBL组,对比问题式学习教学方法(problem-based learning,PBL)和传统方法... 家畜繁殖学是一门实践性很强的课程,探索实验教学新模式对提高该课程教学效果具有重要作用。教师将学生分为两组,即采用传统教学模式的传统组和应用PBL教学模式的PBL组,对比问题式学习教学方法(problem-based learning,PBL)和传统方法在家畜繁殖学实验教学中的效果。结果表明:PBL组学生在实验报告、实验操作和结果展示等方面的能力提升优于传统组;问卷调查显示,PBL组学生对实验趣味性、实验创新性、能力提升等方面的满意度高于传统组。说明PBL教学法有助于提高家畜繁殖学的教学效果。 展开更多
关键词 家畜繁殖学 PBL 实验教学 教学效果 创新能力
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柯乐猪PRLR基因多态性与繁殖性状的关联性 被引量：3
10
作者 杨酸 郭小江 +5 位作者 杨红文 熊力 李晨 谭元成 王春源 张依裕 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期556-564,共9页
本研究旨在探究催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)基因的单核苷酸突变位点(single nucleotide polymorphism,SNP)及其对柯乐猪繁殖性状的遗传效应,以期为提高柯乐猪的繁殖性能研究提供基因标记。采用PCR产物直接测序法对204头柯乐猪P... 本研究旨在探究催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)基因的单核苷酸突变位点(single nucleotide polymorphism,SNP)及其对柯乐猪繁殖性状的遗传效应,以期为提高柯乐猪的繁殖性能研究提供基因标记。采用PCR产物直接测序法对204头柯乐猪PRLR基因外显子区的SNP位点进行筛查鉴定,同时利用SPSS软件中单因子方差法分析各SNPs不同基因型和双倍型与7个繁殖性状的相关性,并通过在线软件分析碱基变异对mRNA二级结构的影响。结果显示,在柯乐猪PRLR基因第8外显子检测到g.20655220 C>T突变,其导致丝氨酸变成脯氨酸,为错义突变;在第4内含子检测到2个同义突变位点g.20648859 C>T和g.20648931 C>T,3个SNPs均存在3种基因型,g.20648931 C>T属于低度多态,其余2个位点属于中度多态;经卡方χ^(2)检验,g.20655220 C>T位点的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),g.20648859 C>T和g.20648931 C>T位点的基因型分布极显著(P<0.01)偏离Hardy-Weinberg平衡;g.20655220 C>T位点导致PRLR基因mRNA序列二级结构发生改变,致使mRNA二级结构稳定性降低;3个SNPs共组成5种单倍型和9种双倍型,优势单倍型H1(CCC)频率为0.610,优势双倍型H1H1(CCCCCC)频率为0.382。关联性分析结果显示,g.20655220 C>T位点CC基因型母猪的初生个体重、断奶窝重和断奶个体重均显著(P<0.05)高于CT基因型,g.20648931 C>T位点CT基因型母猪的初生个体重、初生窝重和断奶窝重均显著(P<0.05)高于CC基因型和TT基因型,且该位点在初生个体重上,CC基因型显著(P<0.05)高于TT基因型;双倍型H1H5(CTCTCT)在产仔数和活仔数上为优势双倍型,H2H3(CCTTCT)在断奶窝重和断奶个体重上为较优双倍型。综上,PRLR基因可作为候选基因参与柯乐猪繁殖性状的分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 PRLR基因 柯乐猪 多态性 繁殖性状
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柯乐猪DSP基因SNP鉴定及其与繁殖性状的关联分析 被引量：1
11
作者 向进 王春源 +3 位作者 吴燕 谭元成 杨酸 张依裕 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期95-102,共8页
本研究旨在分析柯乐猪桥粒斑蛋白(Desmoplakin,DSP)基因单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)与繁殖性状的相关性。选择86头柯乐猪母猪,利用DNA混合池结合Sanger测序筛选DSP基因SNP位点,并采用SPSS 22.0软件中的一般线... 本研究旨在分析柯乐猪桥粒斑蛋白(Desmoplakin,DSP)基因单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)与繁殖性状的相关性。选择86头柯乐猪母猪,利用DNA混合池结合Sanger测序筛选DSP基因SNP位点,并采用SPSS 22.0软件中的一般线性模型(GLM)对DSP基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状进行关联分析。结果表明,在柯乐猪DSP基因中共发现了9个SNP位点,在第14外显子发现3个SNP位点:g.4897767G>A、g.4897776C>T和g.4897824G>A,在第14内含子发现6个SNP位点:g.4897943G>T、g.4897954C>T、g.4897991T>C、g.4897997T>G、g.4897999C>G和g.4898004C>T。连锁不平衡分析发现g.4897767G>A、g.4897999C>G和g.4898004C>T位点之间、g.4897824G>A与g.4897999C>G、g.4898004C>T位点之间以及g.4897776C>T与g.4897943G>T、g.4897991T>C位点之间均存在强连锁不平衡。统计分析显示,g.4897943G>T位点对断奶均重的影响达到显著水平。对外显子的SNP位点进行单倍型分析,发现单倍型5种、双倍型10种,其中双倍型个体H1H2(AGCCAG)总产仔数、断奶仔猪数和断奶窝重均显著大于H2H4(AGCCAA)个体;H1H5(AGCCGG)的初生窝重显著大于H2H4(AGCCAA)个体;H4H4(GGCCAA)的初生均重显著大于H1H2(AGCCAG)个体。通过分析单倍型mRNA二级结构发现,单倍型H2(ACA)、H4(GCA)、H5(ACG)均引起了DSP基因mRNA二级结构改变,可能会影响转录和翻译效率,进而影响猪繁殖性能。综上,DSP基因可以作为柯乐猪繁殖性状选择的分子标记。 展开更多
关键词 柯乐猪 DSP基因 单核苷酸多态性 繁殖性状 关联分析
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柯乐猪TAC3第1内含子多态对繁殖性状的影响
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作者 郭小江 熊力 +5 位作者 谭元成 杨红文 杨齐心 杨酸 向进 张依裕 《中国猪业》 2023年第3期90-93,共4页
TAC3基因参与哺乳动物繁殖相关的生命活动。试验以78头初产柯乐猪为材料,通过PCR产物直接测序和序列比对鉴定TAC3基因的遗传变异,分析遗传变异对繁殖性状的影响。结果显示,在柯乐猪TAC3基因第1内含子中检测到1个中度多态位点:g.22329038... TAC3基因参与哺乳动物繁殖相关的生命活动。试验以78头初产柯乐猪为材料,通过PCR产物直接测序和序列比对鉴定TAC3基因的遗传变异,分析遗传变异对繁殖性状的影响。结果显示,在柯乐猪TAC3基因第1内含子中检测到1个中度多态位点:g.22329038 T>C,产生3种基因型TT、TC和CC,TC和T分别为优势基因型和优势等位基因,基因型分布未偏离Hardy-Weinberg平衡,TT基因型个体的产活仔数显著高于CC基因型(P<0.05),其他指标在不同基因型间差异未能达到显著水平(P>0.05),揭示g.22329038 T>C位点可能是柯乐猪产活仔数的一个重要分子标记。 展开更多
关键词 柯乐猪 TAC3基因 多态性 繁殖性状
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贵州黑山羊COL1A1基因真核表达载体构建及其对颗粒细胞中胶原蛋白家族基因和产羔基因的影响
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作者 周明帅 温晓艳 +3 位作者 陆情梅 刘彬 杨永鲜 赵佳福 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期261-272,共12页
【目的】构建I型胶原蛋白α1链基因(COL1A1)过表达载体,并分析其对颗粒细胞中胶原蛋白家族基因和产羔相关基因的影响,为后续深入研究COL1A1基因影响山羊产羔性状的分子机制打下基础。【方法】通过重叠延伸PCR克隆COL1A1基因A和B片段,然... 【目的】构建I型胶原蛋白α1链基因(COL1A1)过表达载体,并分析其对颗粒细胞中胶原蛋白家族基因和产羔相关基因的影响,为后续深入研究COL1A1基因影响山羊产羔性状的分子机制打下基础。【方法】通过重叠延伸PCR克隆COL1A1基因A和B片段,然后分别重组连接至pUC57和pcDNA3.1(+)线性化载体上,再通过酶切连接获得COL1A1基因全长,构建pcDNA3.1(+)-COL1A1过表达载体;转染山羊卵巢颗粒细胞后,通过Western blotting检测COL1A1蛋白表达效率,采用免疫荧光检测其在颗粒细胞中的定位情况,并以实时荧光定量PCR检测COL1A1基因过表达对胶原蛋白家族基因COL1A1、COL2A1和COL3A1及产羔相关基因[骨形态发生蛋白15(BMP15)、骨形态发生蛋白受体1B(BMPR1B)、生长分化因子9(GDF9)和促卵泡激素β亚基(FSHB)]表达的影响。【结果】COL1A1基因全长环化质粒检测大小为1847 bp,连接至pcDNA3.1(+)线性化载体上成功构建获得COL1A1基因过表达载体。Western blotting检测结果表明,pcDNA3.1(+)-COL1A1转染颗粒细胞48 h后,COL1A1蛋白表达量极显著高于pcDNA3.1(+)空载体转染组(P<0.01,下同);免疫荧光检测结果表明,COL1A1蛋白在颗粒细胞细胞核及细胞质中均有表达,但在细胞核中的表达水平更高;实时荧光定量PCR检测结果表明,pcDNA3.1(+)-COL1A1转染组颗粒细胞中COL1A1、COL2A1和COL3A1胶原蛋白家族基因及GDF9、FSHB和BMP15产羔相关基因的相对表达量极显著高于pcDNA3.1(+)空载体转染组,但对BMPR1B基因的表达无显著影响(P>0.05)。【结论】COL1A1基因在卵巢颗粒细胞中广泛表达,其过表达能极显著促进胶原蛋白家族基因COL2A1和COL3A1及产羔相关基因GDF9、FSHB和BMPR1B在颗粒细胞中的表达,即COL1A1基因可协同胶原蛋白家族基因的表达促进ECM合成来影响卵巢组织结构、胚胎发育及促进性腺激素表达,进而影响山羊产羔性状,可作为影响贵州黑山羊多羔候选基因进行深入研究。 展开更多
关键词 贵州黑山羊 COL1A1基因 细胞外基质 卵巢颗粒细胞 产羔性状
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贵州半细毛羊线粒体D-loop区母系遗传结构分析
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作者 张继 吴雪 刘若余 《农技服务》 2022年第8期40-45,共6页
贵州半细毛羊是贵州省培育出的绵羊品种,为贵州绵羊的育种保种和开发利用提供科学依据,对20只贵州半细毛羊的线粒体DNA D-loop序列进行PCR扩增测序与分析,探究贵州半细毛羊母系的遗传结构。结果表明:20只贵州半细毛羊个体的A、G、C、T... 贵州半细毛羊是贵州省培育出的绵羊品种,为贵州绵羊的育种保种和开发利用提供科学依据,对20只贵州半细毛羊的线粒体DNA D-loop序列进行PCR扩增测序与分析,探究贵州半细毛羊母系的遗传结构。结果表明:20只贵州半细毛羊个体的A、G、C、T平均含量分别为33.1%、14.4%、22.9%、29.7%,其中A+T为62.8%,G+C为37.3%,A+T含量明显高于G+C含量。20条序列中共发现多态位点84个,其中转换83个,颠换1个。通过构建遗传发育树发现贵州半细毛羊有两个母系起源。 展开更多
关键词 线粒体DNA D-loop 贵州半细毛羊 母系 遗传结构
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稻田综合种养研究进展及其在贵州省的发展现状
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作者 岳勇 张书海 +1 位作者 董响红 王桢璐 《山地农业生物学报》 2023年第5期46-51,共6页
随着乡村振兴战略的实施,我国农业产业结构进一步调整,发展效益农业,充分利用现有稻田开展养殖生产,有助于提高稻田产出率和经济效益。该文以稻田综合种养模式为研究对象,基于已有的文献和稻田综合种养近百年来的现实发展状态,综述了稻... 随着乡村振兴战略的实施,我国农业产业结构进一步调整,发展效益农业,充分利用现有稻田开展养殖生产,有助于提高稻田产出率和经济效益。该文以稻田综合种养模式为研究对象,基于已有的文献和稻田综合种养近百年来的现实发展状态,综述了稻田综合种养的发展历史及在贵州省内推广稻田综合种养模式的持续可行性,以及在种养殖过程中面临的问题,同时探讨了稻田综合种养模式在逐步研究发展过程中存在的分歧,以期为贵州省水产养殖、稻田综合种养寻求出新的绿色可持续发展方式。 展开更多
关键词 稻田综合种养 贵州省 稻田养鱼 稻虾共作
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日粮中添加菜粕对安格斯母牛繁殖性能的影响
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作者 吴燕 邹茂华 +2 位作者 罗清云 王春梅 张依裕 《中国畜禽种业》 2023年第5期76-81,共6页
选择体况良好、无生殖系统疾病的成年且体重相近的经产空怀母牛20头,随机分成2组,每组10头,对照组不添加菜粕,试验组在日粮中添加10%菜粕。整个试验分3个阶段饲养,第一阶段包括空怀和妊娠前期,第二阶段妊娠中期和后期,第三阶段泌乳期,... 选择体况良好、无生殖系统疾病的成年且体重相近的经产空怀母牛20头,随机分成2组,每组10头,对照组不添加菜粕,试验组在日粮中添加10%菜粕。整个试验分3个阶段饲养,第一阶段包括空怀和妊娠前期,第二阶段妊娠中期和后期,第三阶段泌乳期,每个阶段过渡期15d,整个饲养期13个月。结果显示:试验组安格斯母牛妊娠率和产犊率均比对照组低10%,试验组犊牛发病率比对照组高12.5%;试验组犊母牛初生体重和1月龄犊母牛、犊公牛体重以及2月龄犊公牛体重均显著低于对照组(P<0.05),其他体尺各指标各组间差异未达到显著水平(P>0.05),表明日粮中添加菜粕饲喂安格斯母牛对犊牛体重有不利影响而对其体尺的影响不明显;此外,试验组的产后第一次发情时间、第一次配种天数和产后配种妊娠天数均显著低于对照组(P<0.05),表明日粮中添加菜粕推延了安格斯母牛发情配种时间。结果表明:安格斯母牛妊娠中后期和哺乳期日粮中添加菜粕可影响其健康状况,推延产后发情配种和妊娠时间,且不利于公、母犊牛1、2月龄体重。 展开更多
关键词 菜粕 安格斯母牛 繁殖性能
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贵州白山羊的体尺与体重及其相关性 被引量：17
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作者 康建兵 蔡惠芬 +7 位作者 罗卫星 王锋 曾浩 苏娜芬 黄兰 钱成 刘彬 孙岩岩 《贵州农业科学》 CAS 2015年第8期171-173,共3页
为贵州白山羊的品种选择和育种提供理论依据,对选自贵州省沿河县新景乡贵州白山羊保种区(贵州白山羊中心产区)的415只贵州白山羊,其中,育成羊194只(公羊59只、母羊100只和羯羊35只),成年羊221只(公羊13只、母羊122只和羯羊86只),测定其... 为贵州白山羊的品种选择和育种提供理论依据,对选自贵州省沿河县新景乡贵州白山羊保种区(贵州白山羊中心产区)的415只贵州白山羊,其中,育成羊194只(公羊59只、母羊100只和羯羊35只),成年羊221只(公羊13只、母羊122只和羯羊86只),测定其体重(y)、体高(x1)、体斜长(x2)、胸围(x3)和管围(x4),进行相关性分析和通径分析,并建立最优回归方程。结果表明:胸围是影响贵州白山羊体重最主要的体尺指标,胸围对体重的直接作用较大,通径系数为0.593;体高、体斜长和管围对贵州白山羊体重的直接作用较小;体高对体重的间接作用最大,通径系数为0.656。贵州白山羊体尺-体重的最优回归方程为y=-55.358+0.127x1+0.429x2+0.651x3+0.644x4,R2=0.831。 展开更多
关键词 贵州白山羊 体尺 体重 相关性
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贵州白山羊GFI1B基因多态性与生长性状的相关性 被引量：9
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作者 陈志 罗卫星 +3 位作者 刘若余 蔡惠芬 张依裕 宋桃伟 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期159-164,共6页
本试验旨在研究贵州白山羊GFI1B基因第八外显子的多态性,及其与生长性状的相关性。通过PCR-RFLP技术对贵州白山羊外显子SNPs位点进行检测,利用一般线形模型分析其与生长性状的关联性。结果显示,供试群体中在外显子上检测到2个SNPs位点,... 本试验旨在研究贵州白山羊GFI1B基因第八外显子的多态性,及其与生长性状的相关性。通过PCR-RFLP技术对贵州白山羊外显子SNPs位点进行检测,利用一般线形模型分析其与生长性状的关联性。结果显示,供试群体中在外显子上检测到2个SNPs位点,即第八外显子263(G/T)和340(G/A)。最小二乘法分析表明,G340A位点,CC型和DD型的体重、体长、胸深和胸宽对CD型达到差异及显著水平(p<0.01)。本研究检测到的GFI1B基因第八外显子340(G/A)多态性位点可作为贵州白山羊生长性状的候选分子标记。 展开更多
关键词 GFI1B基因 贵州白山羊 PCR-RFLP 生长性状
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贵州山羊品种RERG基因多态性与生长性状的相关性 被引量：5
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作者 陈志 罗卫星 +4 位作者 刘若余 蔡惠芬 承杰 宋桃伟 张依裕 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期1915-1922,共8页
【目的】研究贵州地方山羊品种黔北麻羊、贵州白山羊和贵州黑山羊ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor(RERG)基因第2、3和4外显子的多态性及其与生长性状的相关性。【方法】本试验通过PCR-SSCP技术和直接测序法,对3个... 【目的】研究贵州地方山羊品种黔北麻羊、贵州白山羊和贵州黑山羊ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor(RERG)基因第2、3和4外显子的多态性及其与生长性状的相关性。【方法】本试验通过PCR-SSCP技术和直接测序法,对3个品种外显子SNPs位点进行检测,利用一般线性模型分析其与生长性状的关联性。【结果】3个供试群体中在第4外显子上都检测到4个SNPs位点,即56 bp(C/G)、826 bp(A/G)、1 434 bp(T/C)和1 798 bp(A/T)。最小二乘法分析结果表明,AA型和BB型的体重对AB型达到差异极显著水平(P<0.01),CC型和DD型的体重对CD型达到差异显著水平(P<0.05),EE型和FF型的体重对EF型达到差异极显著水平(P<0.01)、1 798 bp(A/T)位点各基因型间差异不显著。【结论】RERG基因的56 bp(C/G)、826 bp(A/G)和1 434 bp(T/C)多态性位点可作为生长性状的候选分子标记。 展开更多
关键词 RERG基因 贵州山羊品种 PCR-SSCP 生长性状
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贵州白山羊和黔北麻羊TFAM基因部分外显子多态性研究 被引量：4
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作者 谢海强 杨永强 +5 位作者 宋桃伟 孙岩岩 刘彬 罗卫星 张依裕 刘若余 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第16期138-140,163,F0003,共5页
利用黔北麻羊和贵州白山羊构建品种DNA池,设计1对引物分别扩增其TFAM基因第2外显子及第1内含子部分序列。PCR产物纯化后进行双向测序,DNAStar和BLAST分析确定多态性位点。利用生物信息学软件分析SNPs位点对TFAM基因RNA二级结构和TFAM蛋... 利用黔北麻羊和贵州白山羊构建品种DNA池,设计1对引物分别扩增其TFAM基因第2外显子及第1内含子部分序列。PCR产物纯化后进行双向测序,DNAStar和BLAST分析确定多态性位点。利用生物信息学软件分析SNPs位点对TFAM基因RNA二级结构和TFAM蛋白二级、三级结构的影响。结果表明:在羊TFAM基因中筛选到5个SNPs:T1005C、G1099C、A1130C、G1164C、T1287C,其中T1005C为同义突变,G1099C为错义突变,导致编码的甘氨酸(Gly)变为半胱氨酸(Cys);A1130C、G1164C、T1287C 3个突变位点均位于内含子区。SNPs位点对TFAM基因RNA二级结构和TFAM蛋白结构有一定影响。 展开更多
关键词 TFAM SNPS 肌内脂肪沉积 黔北麻羊 贵州白山羊
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