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《动物遗传多样性、发育与进化专刊》导读
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作者 毛炳宇 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期547-547,I0001,共2页
遗传资源与进化国家重点实验室(中国科学院昆明动物研究所)立足于我国西南和东南亚丰富的生物多样性遗传资源,在我国生物多样性和战略生物资源研究等方面发挥了主导作用,在国际进化生物学领域具有重要影响力。本期《动物学研究》组... 遗传资源与进化国家重点实验室(中国科学院昆明动物研究所)立足于我国西南和东南亚丰富的生物多样性遗传资源,在我国生物多样性和战略生物资源研究等方面发挥了主导作用,在国际进化生物学领域具有重要影响力。本期《动物学研究》组织了遗传资源与进化国家重点实验室的12篇综述与研究论文,和实验室外的4篇相关稿件,组成了本期《动物遗传多样性、发育与进化专刊》,内容上涉及生物多样性的保护与利用、物种间系统发育与基因家族的进化分析、线粒体DNA在进化分析中的应用及其与肿瘤发生的关系等。 展开更多
关键词 《动物遗传多样性、发育与进化专刊》 书刊 内容介绍 遗传资源
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中国灵长类动物保护的成就与挑战
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作者 李保国 张河 +21 位作者 李明 蒋学龙 范朋飞 周江 郭松涛 齐晓光 李进华 路纪琪 夏东坡 崔亮伟 向左甫 周岐海 黄志旁 黄乘明 肖文 胡慧建 周智鑫 陈明勇 黎大勇 范朋来 杨寅 潘汝亮 《西北大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期755-766,共12页
气候变化和人类活动的双重影响导致全球灵长类生物多样性急剧下降。中国是北半球灵长类动物种类最多的国家,但在农业社会向现代社会转型的过程中,现代农业的扩张、自然资源的消耗以及土地的过度开发,使中国面临着严重的生态威胁。为此,... 气候变化和人类活动的双重影响导致全球灵长类生物多样性急剧下降。中国是北半球灵长类动物种类最多的国家,但在农业社会向现代社会转型的过程中,现代农业的扩张、自然资源的消耗以及土地的过度开发,使中国面临着严重的生态威胁。为此,中国实施了包括栖息地恢复和保护在内的多种生态保护措施,在生物多样性保护方面取得了实质性进展,某些地区的灵长类动物种群数量有所增加。该研究对中国灵长类动物的历史文献和实地调查资料进行了系统分析,对中国灵长类动物的濒危状况进行了评估。尽管大多数灵长类物种的栖息地有所改善,种群数量也有所增长,但许多物种仍然面临着严重的威胁,包括种群数量的减少。例如,缅甸金丝猴、东黑冠长臂猿和海南长臂猿等物种由于分布范围有限和种群数量极少,仍然特别脆弱。科学数据的缺乏以及保护生物学研究的不足,进一步加剧了这些挑战。此外,蜂猴、倭蜂猴、印支灰叶猴、肖氏乌叶猴和戴帽叶猴等物种的详细种群监测数据仍然缺乏,这严重阻碍了针对这些物种保护管理政策的制定。因此,在生物多样性保护方面,迫切需要开展专门的灵长类动物调查,实行跨境保护和区域合作,建立全面系统的数据库平台,对灵长类生物学进行持续深入的研究。此外,加强公众对野生动物保护的认识也至关重要。这些综合、系统的工作将为中国灵长类物种的保护和管理提供科学依据。 展开更多
关键词 灵长类动物 生物多样性 栖息地破碎化 生境修复 保护策略
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云南发现海南原指树蛙
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作者 张栋儒 唐尚婧 +2 位作者 沈文菁 李琪 韦新葵 《四川动物》 北大核心 2024年第2期195-201,共7页
2019年6月8日,在云南省罗平县多依河村采集到3号树蛙科Rhacophoridae原指树蛙属Kurixalus物种标本。标本为雄性,体型较小,吻端较尖;鼓膜明显且圆;眼大,瞳孔横置;背部皮肤粗糙;泄殖孔下方具圆疣;第4指、掌部、前臂、第5趾、跖和跗的外侧... 2019年6月8日,在云南省罗平县多依河村采集到3号树蛙科Rhacophoridae原指树蛙属Kurixalus物种标本。标本为雄性,体型较小,吻端较尖;鼓膜明显且圆;眼大,瞳孔横置;背部皮肤粗糙;泄殖孔下方具圆疣;第4指、掌部、前臂、第5趾、跖和跗的外侧均具有顶端白色的锯齿状缘膜;背面深褐色为主,四肢有深褐色横斑,两眼间有三角形黑斑;后背有一瓶形斑纹,腹面满布深色大斑点;单咽下内声囊。经过形态特征比较,并基于线粒体COⅠ基因片段构建的原指树蛙属部分物种的系统发育分析结果,鉴定这些标本为海南原指树蛙K. hainanus,是云南省两栖动物新记录。本研究扩展了对海南原指树蛙的分布范围的认知,为该物种的生物多样性研究、保护、管理,以及利用积累了重要基础数据。 展开更多
关键词 海南原指树蛙 云南省 新记录
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史氏鲟和达氏鳇养殖亲鱼群体遗传多样性分析 被引量:14
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作者 牛翠娟 胡红霞 +1 位作者 罗静 李陈 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1795-1799,共5页
利用线粒体控制区序列片段(史氏鲟,425bp,达氏鳇,434bp)分析检测了两个养殖场留做后备亲鱼的史氏鲟和达氏鳇的遗传多样性。在所检测的养殖史氏鲟后备亲鱼4个年龄群体共34个体中,发现5个单倍型,共有11个多态位点,占碱基总数的2.6%,无简... 利用线粒体控制区序列片段(史氏鲟,425bp,达氏鳇,434bp)分析检测了两个养殖场留做后备亲鱼的史氏鲟和达氏鳇的遗传多样性。在所检测的养殖史氏鲟后备亲鱼4个年龄群体共34个体中,发现5个单倍型,共有11个多态位点,占碱基总数的2.6%,无简约信息位点。不同单倍型之间有1~10个变异位点,占碱基总数的0.2%~2.4%。各单倍型之间的遗传距离为0.002~0.024。单倍型多样性Hd=0.768,平均核苷酸差异数k=4.367,核苷酸多样性Pi=0.011。而分别来自2个养殖场的2个达氏鳇养殖群体都是1个群体仅1个单倍型,2个单倍型之间仅有2个碱基差异,遗传距离为0.005,遗传变异极度缺乏。结果提示在利用史氏鲟和达氏鳇后备亲鱼进行繁殖育苗时要充分注意近交的影响。 展开更多
关键词 史氏鲟 达氏鳇 后备亲鱼 线粒体控制区 遗传多样性
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文昌鸡线粒体DNA控制区序列遗传多样性分析 被引量:9
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作者 廖承红 王华伟 +3 位作者 梁浩 张建行 韦双双 周海龙 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期145-147,共3页
运用PCR产物直接测序的方法对海南省文昌市90只文昌鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第Ⅰ高变区序列进行了分析。用CLUSTAL X 1.81软件进行序列比较,其中38只个体共检测到27个核苷酸多态位点,全部为转换无颠换,序列突变率为5.29%... 运用PCR产物直接测序的方法对海南省文昌市90只文昌鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第Ⅰ高变区序列进行了分析。用CLUSTAL X 1.81软件进行序列比较,其中38只个体共检测到27个核苷酸多态位点,全部为转换无颠换,序列突变率为5.29%。用DnaSP软件估计出序列存在16个单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.935,核苷酸多样度(π)为0.01479,平均核苷酸差异数(k)为7.541。运用Mega4.0软件计算出不同个体间的遗传距离,并据此构建了NJ系统树。文昌鸡样品在NJ无根树上聚为4大分支。研究结果表明,文昌鸡群体内个体序列变异程度较大,遗传多样性丰富,揭示文昌鸡在遗传组成上具有4个母系来源。 展开更多
关键词 文昌鸡 线粒体DNA D-LOOP 遗传多样性
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树鼩进化分类地位的分子证据 被引量:55
6
作者 许凌 范宇 +1 位作者 蒋学龙 姚永刚 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期70-76,共7页
树鼩隶属攀鼩目,广泛分布于东南亚、南亚和中国南部等地区。由于其独特的特点,如体型小、脑-体重比例高、生殖周期短、寿命短和饲养成本低等,在生物医学研究中被认为是可望替代灵长类动物的新型实验动物。然而,关于树鼩与灵长类动物的... 树鼩隶属攀鼩目,广泛分布于东南亚、南亚和中国南部等地区。由于其独特的特点,如体型小、脑-体重比例高、生殖周期短、寿命短和饲养成本低等,在生物医学研究中被认为是可望替代灵长类动物的新型实验动物。然而,关于树鼩与灵长类动物的亲缘关系一直存在争议。明确树鼩的分类地位是创建实验动物的重要研究基础。该文介绍了近年来关于树鼩分类地位探讨的分子证据。在现有的研究中,大部分核DNA序列研究,包括近期树鼩全基因组序列分析,都支持树鼩是灵长动物的近缘旁系群,然而绝大部分基于线粒体DNA序列的研究却显示树鼩与啮齿动物的亲缘关系更为接近。这样的分歧主要是由于线粒体序列和核基因数据的差异以及不同的算法导致。综合现有不同DNA数据的研究结果,作者认为树鼩作为灵长类的近亲这一结论应该成为共识。 展开更多
关键词 树鼩 系统分类 核基因DNA 线粒体DNA
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广西掌突蟾属新纪录——侗掌突蟾
7
作者 曹宇阳 蒋瑛 +3 位作者 王绍能 车静 伍春莲 吴云鹤 《野生动物学报》 北大核心 2024年第2期456-460,共5页
2016年4月4日,在广西桂林市猫儿山安堂平(25°54'42.21″N,110°27'54.93″E)采集并测量掌突蟾属(Leptobrachella)4只标本(1♀:KIZ 027219;3:KIZ 045761,KIZ 045711,KIZ 027220),标本浸泡于75%乙醇溶液中保存于中国科... 2016年4月4日,在广西桂林市猫儿山安堂平(25°54'42.21″N,110°27'54.93″E)采集并测量掌突蟾属(Leptobrachella)4只标本(1♀:KIZ 027219;3:KIZ 045761,KIZ 045711,KIZ 027220),标本浸泡于75%乙醇溶液中保存于中国科学院昆明动物研究所博物馆。该蛙体型中等(雄性体长26.92~30.60 mm,雌性体长39.16 mm,表1),趾间微蹼,有侧缘膜,腹部白色,两侧有棕色雾状斑点,背部有细小的白色颗粒,前伸贴体时胫跗关节前达眼中部,具肩腺、股腺和腹侧腺,无犁骨齿,吻端和眼间有相互垂直的白色条纹,符合侗掌突蟾(Leptobrachella dong)的鉴定特征[1],且系统发育分析显示所采集标本与模式产地标本聚成单支系,支持率为0.96/89(图1)。 展开更多
关键词 模式产地 掌突 犁骨齿 吻端 中国科学院 缘膜 鉴定特征 猫儿山
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云南境内南盘江水系鱼类种质资源现状及保护对策 被引量:17
8
作者 王伟营 杨君兴 陈小勇 《水生态学杂志》 北大核心 2011年第5期19-29,共11页
为了解南盘江鱼类资源现状,保护和恢复南盘江鱼类多样性,2008年6月至2010年3月,对云南省境内南盘江鱼类现状进行实地考察,结合中国科学院昆明动物研究所馆藏标本和历年相关记录,分析南盘江鱼类种质资源现状。结果表明,云南境内南盘江及... 为了解南盘江鱼类资源现状,保护和恢复南盘江鱼类多样性,2008年6月至2010年3月,对云南省境内南盘江鱼类现状进行实地考察,结合中国科学院昆明动物研究所馆藏标本和历年相关记录,分析南盘江鱼类种质资源现状。结果表明,云南境内南盘江及其附属湖泊共有鱼类8目、20科、71属、160种;其中,土著种137种,特有种93种,外来种23种。鲤科鱼类最多,有94种,占鱼类总数的58.8%,其次为条鳅科32种,占总数的20.0%,爬鳅科7种,占总数的4.4%。南盘江鱼类种类众多,但由于人为影响,河流污染比较严重,目前已有24种鱼类被列为濒危种类。分析南盘江近两年的鱼类种质资源现状,发现土著种类的数量大幅下降,这与南盘江河流环境恶化和水电开发力度增大密切相关。 展开更多
关键词 种质资源 鱼类 南盘江
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高血压易感基因的分子进化 被引量:4
9
作者 季林丹 钱海霞 徐进 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1195-1203,共9页
利用家系连锁分析、候选基因法及全基因组关联研究均未能有效发现普通人群的高血压易感基因或位点。遗传学研究表明,人类许多疾病易感性的形成与走出非洲时的环境适应性进化密切相关,这为高血压遗传学研究提供了新思路。文章系统综述了... 利用家系连锁分析、候选基因法及全基因组关联研究均未能有效发现普通人群的高血压易感基因或位点。遗传学研究表明,人类许多疾病易感性的形成与走出非洲时的环境适应性进化密切相关,这为高血压遗传学研究提供了新思路。文章系统综述了高血压易感基因分子进化研究的理论基础和最新进展,介绍了本研究小组运用分子进化思路在中国汉族人群高血压遗传学研究中的发现,对未来的研究方向进行了展望,以期为高血压和其他疾病的遗传学研究提供参考。 展开更多
关键词 高血压 遗传易感性 进化 适应
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单细胞真核生物的miRNA系统及其进化意义 被引量:8
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作者 张燕琼 文建凡 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期39-42,共4页
miRNA系统在高等多细胞真核生物中得到了广泛深入的研究。近年来,人们在单细胞真核生物上的miRNA研究也取得了重要进展。这不仅丰富了人们对miRNA在整个生物界中的认识,更重要的是对于揭示miRNA这一表达调节系统是如何在生物界中起源进... miRNA系统在高等多细胞真核生物中得到了广泛深入的研究。近年来,人们在单细胞真核生物上的miRNA研究也取得了重要进展。这不仅丰富了人们对miRNA在整个生物界中的认识,更重要的是对于揭示miRNA这一表达调节系统是如何在生物界中起源进化的问题具有重要意义。该文结合作者在最低等单细胞真核生物——贾第虫上的研究结果,对该领域的研究进展作一概述,并对有关miRNA这一系统的起源进化问题进行了探讨。 展开更多
关键词 单细胞真核生物 MIRNA 贾第虫 进化
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阳宗海鱼类群落结构及变化
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作者 张丽媛 熊清海 +5 位作者 田敏 刘淑伟 王慧 曲品 蒋荣明 杨剑虹 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期60-69,共10页
【目的】摸清阳宗海鱼类资源现状,分析鱼类变迁,为鱼类管理和湖泊水生态修复提供基础资料。【方法】于2022年3、5、8和10月在阳宗海的10个采样点,使用8种网目刺网和2种地笼开展4次实地调查。采用相对重要性指数划定优势种,采用Shannon-W... 【目的】摸清阳宗海鱼类资源现状,分析鱼类变迁,为鱼类管理和湖泊水生态修复提供基础资料。【方法】于2022年3、5、8和10月在阳宗海的10个采样点,使用8种网目刺网和2种地笼开展4次实地调查。采用相对重要性指数划定优势种,采用Shannon-Wiener多样性指数、Pielou’s均匀度指数和Margalef丰富度指数分析鱼类多样性。【结果】采集到鱼类32976尾,共计791694 g,隶属7目11科23属24种;其中鲤科(Cyprinidae)11种,占45.83%;外来种19种,占79.17%;优势种为太湖新银鱼(Neosalanx taihuensis)、鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、鳙(H.nobilis)和子陵吻鰕虎鱼(Rhinogobius giurinus)。渔获物中,3月个体数量最多,占41.62%;8月种类数量最多,占95.83%,渔获量也最大,占40.84%;明珠湾个体数量最多,占22.06%,渔获量也最大,占15.82%;阳宗大河口种类数量最多,占91.67%;小型鱼类数量占95.04%;外来种数量占99.27%、质量占97.40%。鱼类多样性为较低至一般水平。与历史记录相比,阳宗海鱼类群落结构已发生较大变化,历史记录的20种土著种仅采集到5种,且为广布、广适种;首次记录到青鱼(Mylopharyngodon piceus)、䱗(Hemiculter leucisculus)、大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)、鲇(Silurus asotus)、瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus vachelli)和粘皮鲻鰕虎鱼(Mugilogobius myxodermus)。【结论】阳宗海鱼类主要由外来种组成,小型化明显,外来种引入和生境破坏是其主要影响因素。 展开更多
关键词 阳宗海 鱼类群落结构 时空分布 多样性
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金丝猴属物种高海拔适应遗传机制 被引量:1
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作者 于黎 吴仲义 张亚平 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期676-676,共1页
金丝猴属(Rhinopithecus)属于灵长目、猴科、疣猴亚科,是亚洲疣猴亚科中特化程度最高的一个类群。金丝猴属包括5个近缘物种:滇金丝猴(R.bieti)、怒江金丝猴(R.strykeri)、川金丝猴(R.roxellana)、黔金丝猴(R.brelichia)和越南金丝猴(R.a... 金丝猴属(Rhinopithecus)属于灵长目、猴科、疣猴亚科,是亚洲疣猴亚科中特化程度最高的一个类群。金丝猴属包括5个近缘物种:滇金丝猴(R.bieti)、怒江金丝猴(R.strykeri)、川金丝猴(R.roxellana)、黔金丝猴(R.brelichia)和越南金丝猴(R.avunculus)。所有物种均被列为红色物种名录濒危物种。除了重要保护生物学价值,金丝猴属物种还发展出以树叶为食的特化食性,而且占据了从低海拔到高海拔的生境类型(800~4500 m)。 展开更多
关键词 疣猴 生境类型 生物学价值 猴科 近缘 遗传机制 比较基因组学 进化基因组学 缺氧反应 功能实验
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甘肃盐池湾国家级自然保护区黑颈鹤的种群数量与分布 被引量:2
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作者 张立勋 舒美林 +4 位作者 安蓓 索义拉 色拥军 达布西力特 杨晓君 《Zoological Research》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第S01期117-123,共7页
甘肃是黑颈鹤(Grus nigricollis)的主要繁殖地之一。2014年4—10月,以甘肃盐池湾国家级自然保护区为研究区域,采用样线法和样点法调查黑颈鹤的数量与分布范围,并了解黑颈鹤的栖息地环境与保护现状。记录到黑颈鹤数量最高为148只,其中亚... 甘肃是黑颈鹤(Grus nigricollis)的主要繁殖地之一。2014年4—10月,以甘肃盐池湾国家级自然保护区为研究区域,采用样线法和样点法调查黑颈鹤的数量与分布范围,并了解黑颈鹤的栖息地环境与保护现状。记录到黑颈鹤数量最高为148只,其中亚成体30只,幼体38只。与2012年(140只)、2013年(149只)相比,黑颈鹤数量保持稳定。调查还发现黑颈鹤巢址42个,均分布于海拔3160~3260 m的河流湖泊湿地、沼泽湿地等水资源、食物资源较丰富的地方。由于2014年湿地水资源相对减少,导致许多湿地水位下降,水域面积减小,使黑颈鹤的繁殖受到自然条件制约和天敌干扰。建议保护区通过提高管理水平,强化宣传教育,严格执法力度,减少人为干扰来加强黑颈鹤保护和湿地恢复工作。 展开更多
关键词 黑颈鹤 盐池湾 种群数量 栖息地 保护
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遗传学视角下东亚人群的起源和演化 被引量:8
14
作者 田娇阳 李玉春 +1 位作者 孔庆鹏 张亚平 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期814-824,共11页
东亚是研究解剖学意义上现代人迁徙和演化的重要地带之一,该地区现代人群的起源及形成问题一直都是人类学领域广泛关注的焦点。遗传学研究为重建东亚人群历史提供了新的视角和见解。越来越多的遗传学证据表明,现代人约20万年前起源于非... 东亚是研究解剖学意义上现代人迁徙和演化的重要地带之一,该地区现代人群的起源及形成问题一直都是人类学领域广泛关注的焦点。遗传学研究为重建东亚人群历史提供了新的视角和见解。越来越多的遗传学证据表明,现代人约20万年前起源于非洲的晚期智人,并于10万年前走出非洲,大约在5~6万年前沿海岸线快速到达东亚南部,进而扩散到整个东亚地区。早期智人可能对走出非洲的现代人有一定程度的遗传贡献。早期定居、文化同化、人群迁徙以及基因交流等,对东亚人群的起源和演化起着至关重要的作用。前期的研究对东亚人群的源流历史进行了细致的分析,很大程度上解决了考古学、历史学等领域长期以来存在的分歧,然而这还需通过全基因组学和古DNA研究的进一步验证。本文从遗传学视角梳理和总结了东亚人群起源、迁徙和演化的历史,完善了对东亚人群演变的系统认识,并对未来东亚人群源流历史研究的发展方向做了展望。 展开更多
关键词 MTDNA Y染色体 全基因组 古DNA 东亚人群
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黒腹果蝇中嵌合新基因的进化命运和表达模式 被引量:3
15
作者 占祖兵 张越 +1 位作者 赵若苹 王文 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期585-595,共11页
新基因的起源和进化对基因组多样性的产生具有重要的贡献。新基因起源常常通过外显子重排而形成嵌合的基因结构,以产生具有新功能的蛋白质。该文调查了在黒腹果蝇中的14个新起源的嵌合基因在群体中的多态性,发现其中8个在群体中的核苷... 新基因的起源和进化对基因组多样性的产生具有重要的贡献。新基因起源常常通过外显子重排而形成嵌合的基因结构,以产生具有新功能的蛋白质。该文调查了在黒腹果蝇中的14个新起源的嵌合基因在群体中的多态性,发现其中8个在群体中的核苷酸多态性会引起提前终止子,而其他6个在群体中编码框都完整且其中4个受到负选择。研究结果表明,嵌合新基因起源后可能存在两种命运:积累提前终止子突变而假基因化,或者表现出一定功能而受自然选择固定下来。基因表达的数据显示,与RNA介导外显子重排(逆转座)形成的新基因不一样,这些由DNA水平外显子重排产生的新基因没有精巢或者雄性特异性表达模式,而是表现出更为多样性的时空表达模式,这提示尽管通过DNA水平外显子重排产生的新基因可能正在变成假基因或者非蛋白质编码的RNA基因,但它们依然可能具有进化出广泛的生物学功能的潜力。 展开更多
关键词 黒腹果蝇 嵌合新基因 外显子重排 表达模式
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云南李仙江流域水电开发中的鱼类资源保护 被引量:9
16
作者 杨永宏 杨君兴 +2 位作者 潘晓赋 周伟 杨美临 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期188-195,共8页
水电工程的开发对江河道鱼类资源产生了诸多不利影响,在保护和恢复日益增多的濒危鱼类种群的实践中,孕育和逐渐形成了保护水产学。该文对李仙江流域水电开发与流域内珍稀鱼类异鱲、越鳠、软鳍新光唇鱼和暗色唇鱼人工增殖保护实践中的实... 水电工程的开发对江河道鱼类资源产生了诸多不利影响,在保护和恢复日益增多的濒危鱼类种群的实践中,孕育和逐渐形成了保护水产学。该文对李仙江流域水电开发与流域内珍稀鱼类异鱲、越鳠、软鳍新光唇鱼和暗色唇鱼人工增殖保护实践中的实施效果和存在问题进行了分析。李仙江水电开发与鱼类增殖保护为河流鱼类的增殖保护提供了一个参考模式。但是增殖放流不是简单地一项任务,要保证整个过程得以顺利进行,需要提前进行繁育规划,提前委托,监测和增殖技术研究先行,资源保护与当地经济发展相结合。 展开更多
关键词 水电开发 鱼类 增殖放流 李仙江 云南
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从金凤蝶分离的一株微孢子虫的全基因组MITEs转座子鉴定与系统进化分析 被引量:3
17
作者 刘铁 许金山 +4 位作者 李田 潘国庆 何强 李学燕 周泽扬 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期52-58,共7页
微型反向重复转座元件(MITEs)是一种非自主性DNA类转座子。从四川省雅安市野外的金凤蝶(Papiliomachaon Linnaeus)中分离到-株微孢子虫,简称PM-1。采用生物信息学分析方法,利用MITE—Hunter软件在PM.1基因组中鉴定出21个MITEs家... 微型反向重复转座元件(MITEs)是一种非自主性DNA类转座子。从四川省雅安市野外的金凤蝶(Papiliomachaon Linnaeus)中分离到-株微孢子虫,简称PM-1。采用生物信息学分析方法,利用MITE—Hunter软件在PM.1基因组中鉴定出21个MITEs家族,命名为NpmMEl-NpmME21。其中有5个家族属于Stowaway—like类,1个家族属于Tourist-like类,2个家族属于Pegasus—like类,其余13个家族为新家族。比较家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)已鉴定的MITEs转座子,发现PM-1分离株的NpmME20与家蚕微孢子虫的NbMEI属于同一家族,且在家蚕微孢子虫基因组中的拷贝数是PM-1分离株基因组中的30倍,表明该MITEs家族从2种微孢子虫共同祖先分化后,在家蚕微孢子虫基因组中经历了爆发式的扩增。对PM.1分离株NpmMEs各家族内拷贝序列两两间遗传距离的分析显示,NpmME1、NpmME8家族的遗传距离明显大于NpmME10、NpmME13、NpmME16家族,在家蚕微孢子虫中也有类似现象,暗示着前两者更为古老。进一步调查NpmMEs在PM.1基因组上的位置发现,NpmMEs转座子偏向于分布在基因侧翼非编码区,无基因内插入偏向;部分NpmMEs序列与基因起始密码子或终止密码子重叠,改变了基因的原有结构。研究结果有助于进一步阐释微孢子虫MITEs转座子的进化起源以及对基因组结构的影响。 展开更多
关键词 微孢子虫 金凤蝶分离株 家蚕微孢子虫 微型反向重复转座元件 基因组
原文传递
转录因子ZnF-706在鳞翅目昆虫中的进化格局及在家蚕中的功能 被引量:3
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作者 崔勇 朱亚楠 +4 位作者 黄悦莹 谭丽庄 冯启理 王文 相辉 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期9-20,共12页
【目的】探讨家蚕Bombyx mori的潜在驯化基因——转录因子ZnF-706在鳞翅目(Lepidoptera)昆虫进化过程及家蚕驯化过程中的分子进化格局;并基于CRISPR/Cas9家蚕基因组编辑平台,探讨ZnF-706基因在家蚕中的功能。【方法】首先分析了家蚕ZnF-... 【目的】探讨家蚕Bombyx mori的潜在驯化基因——转录因子ZnF-706在鳞翅目(Lepidoptera)昆虫进化过程及家蚕驯化过程中的分子进化格局;并基于CRISPR/Cas9家蚕基因组编辑平台,探讨ZnF-706基因在家蚕中的功能。【方法】首先分析了家蚕ZnF-706序列特征,并利用已发表芯片数据调研该基因在家蚕幼虫组织中的表达格局;利用Phylogenetic Analysis byMaximum Likelihood (PAML)分支检验方法,分析该基因在鳞翅目不同类群中的分子进化格局。基于已发表的家蚕-野桑蚕Bombyx mandarina群体基因组多态性数据,对ZnF-706进行基因区域人工选择信号分析;对ZnF-706基因上游2 kb的调控区域进行单核苷酸多态性位点频率检测,发掘在家蚕群体中固定下来的突变位点;针对突变位点所在区域进行转录因子结合活性预测。利用CRISPR/Cas9基因编辑技术敲除ZnF-706基因,获得纯和突变体;以野生型家蚕为对照,检测突变体的茧重及蛹重变化。【结果】家蚕ZnF-706的编码蛋白具有典型的锌指蛋白结构域。ZnF-706在家蚕5龄第3天幼虫各组织中广泛表达,尤其表皮、脂肪体和生殖腺中有很高的表达量;该基因在鳞翅目、蚕蛾总科(Bombycoidea)及天蚕Antherea yamamai 3个分支中均呈现快速进化信号,在家蚕中有强烈的人工选择信号。该基因所在基因组区域的家蚕-野桑蚕种群分歧度参数Fst明显升高,家蚕群体中的群体多样性π明显降低,表明它位于一个选择扫荡区域内;该基因在家蚕-野桑蚕中的9个SNP位点存在于上游调控区,并位于转录因子结合活性区域内。该基因的纯合家蚕突变体ΔZn F-706生存力减弱,并且茧重以及蛹重与野生型家蚕相比都显著降低。但与黑腹果蝇Drosophila melanogaster中不同的是,家蚕中该基因的突变并不致死。【结论】ZnF-706可能在鳞翅目尤其是泌丝昆虫中进化,并在家蚕驯化过程中受到选择压力,提示其对于特征性状茧丝的变异可能发挥作用。该基因可能通过对丝蛋白基因的直接调控,或通过影响家蚕的生长发育而间接地影响茧丝性状。本研究不仅为探究家养动物人工选择机制提供了来自昆虫类材料的独有证据,也为后续深入开展家蚕重要经济性状的转录调控研究提供线索。 展开更多
关键词 鳞翅目 家蚕 泌丝昆虫 驯化基因 转录因子 CRISPR/Cas9
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核糖核酸酶基因超家族分子进化 被引量:6
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作者 郎大田 张亚平 于黎 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期316-326,共11页
核糖核酸酶基因(Ribonuclease A,RNASE A)超家族是进化生物学中研究新基因起源及新功能演变的重要模式系统之一。RNASE A超家族中的很多成员表现出基因复制的进化模式,而且在适应性(正)选择的驱动下,发生了功能分化。文章综述了RNASE A... 核糖核酸酶基因(Ribonuclease A,RNASE A)超家族是进化生物学中研究新基因起源及新功能演变的重要模式系统之一。RNASE A超家族中的很多成员表现出基因复制的进化模式,而且在适应性(正)选择的驱动下,发生了功能分化。文章综述了RNASE A超家族成员在不同动物类群中进化模式的研究进展,包括近年来越来越多在基因组水平上开展的相关研究,显示该基因超家族可能具有比人们以往认识的更为复杂的基因进化模式。随着越来越多动物基因组数据的产生,对更多动物代表类群进行RNASE A超家族研究,将有望揭示新的进化机制和功能分化,为系统认识动物适应进化的遗传机制奠定基础。 展开更多
关键词 核糖核酸酶基因超家族 适应性进化 基因复制 功能分化 基因组
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能量代谢途径相关基因变异与肿瘤细胞适应性进化 被引量:4
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作者 刘佳 孔庆鹏 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期557-565,共9页
肿瘤细胞的快速增殖是一个极其耗能的过程,尽管如此,肿瘤细胞即便在有氧条件下也主要以糖酵解获取能量(有氧糖酵解),这是肿瘤细胞的显著特征之一。这种产能方式转变导致肿瘤细胞内部发生一系列生理变化,为其快速增殖提供能量物质和用于... 肿瘤细胞的快速增殖是一个极其耗能的过程,尽管如此,肿瘤细胞即便在有氧条件下也主要以糖酵解获取能量(有氧糖酵解),这是肿瘤细胞的显著特征之一。这种产能方式转变导致肿瘤细胞内部发生一系列生理变化,为其快速增殖提供能量物质和用于新细胞合成所需的生物大分子,同时为有效适应肿瘤微环境改变奠定基础。该文通过介绍能量代谢相关基因变异研究进展,基于分子进化视角探讨肿瘤细胞中相关基因可能存在的适应性进化遗传印记,为诠释肿瘤细胞能量代谢方式发生转变的可能机制提供新的视角和证据。 展开更多
关键词 能量代谢 基因变异 肿瘤 适应性进化
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