目的:鉴定与子痫前期(PE)相关的关键基因及其主要的富集通路。验证差异表达基因(DEG)CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPA)在PE胎盘组织的表达情况及对滋养细胞上皮间质转化(EMT)的影响。方法:①筛选PE关键基因:在GEO数据库中下载GSE10588、GSE...目的:鉴定与子痫前期(PE)相关的关键基因及其主要的富集通路。验证差异表达基因(DEG)CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPA)在PE胎盘组织的表达情况及对滋养细胞上皮间质转化(EMT)的影响。方法:①筛选PE关键基因:在GEO数据库中下载GSE10588、GSE25906、GSE35574 PE胎盘转录组微阵列数据集矩阵数据,分别进行DEG筛选;同时在数据库中下载GSE75010矩阵数据对每个基因的表达量进行单因素Logistics回归分析,以鉴定PE胎盘中的关键基因;利用STRING数据库构建关键基因的蛋白质-蛋白质互相作用网络(PPI),并进行京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)富集分析。②验证:收集14例正常妊娠孕妇(对照组)和14例PE孕妇(PE组)的胎盘组织。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测比较CEBPA在两组中的mRNA表达水平,免疫荧光检测CEBPA在胎盘组织的表达以及定位。在HTR8/SVneo细胞系中敲降CEBPA后(细胞转染分为:siNC组、siCEBPA组)检测EMT相关蛋白表达水平。结果:①对数据库的微阵列数据进行分析及Logistics回归分析,最终鉴定出78个PE相关的关键基因。②关键基因PPI发现:CEBPA与瘦素(LEP)有紧密联系,KEGG分析发现,这些关键基因与碳代谢、氨基酸的生物合成、氨基酸和核苷酸糖代谢等通路相关。③CEBPA在PE组的mRNA相对表达量明显高于对照组(0.6977±0.4210 vs 0.3811±0.2596,P<0.05)。胎盘组织中CEBPA主要表达于滋养细胞。④与siNC组比较,在对CEBPA敲降以后siCEBPA组的神经元钙黏蛋白(N-cad)表达升高(0.6410±0.0600 vs 0.9606±0.1016,P<0.05),而上皮钙黏蛋白(E-cad)表达差异无统计学意义(P>0.05)。且敲降CEBPA后细胞骨架变得松散。结论:CEBPA与PE的发病相关,在多个数据集中和胎盘组织中均呈现高表达,并且可能通过抑制EMT从而参与PE的发生过程。展开更多
文摘目的:鉴定与子痫前期(PE)相关的关键基因及其主要的富集通路。验证差异表达基因(DEG)CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPA)在PE胎盘组织的表达情况及对滋养细胞上皮间质转化(EMT)的影响。方法:①筛选PE关键基因:在GEO数据库中下载GSE10588、GSE25906、GSE35574 PE胎盘转录组微阵列数据集矩阵数据,分别进行DEG筛选;同时在数据库中下载GSE75010矩阵数据对每个基因的表达量进行单因素Logistics回归分析,以鉴定PE胎盘中的关键基因;利用STRING数据库构建关键基因的蛋白质-蛋白质互相作用网络(PPI),并进行京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)富集分析。②验证:收集14例正常妊娠孕妇(对照组)和14例PE孕妇(PE组)的胎盘组织。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测比较CEBPA在两组中的mRNA表达水平,免疫荧光检测CEBPA在胎盘组织的表达以及定位。在HTR8/SVneo细胞系中敲降CEBPA后(细胞转染分为:siNC组、siCEBPA组)检测EMT相关蛋白表达水平。结果:①对数据库的微阵列数据进行分析及Logistics回归分析,最终鉴定出78个PE相关的关键基因。②关键基因PPI发现:CEBPA与瘦素(LEP)有紧密联系,KEGG分析发现,这些关键基因与碳代谢、氨基酸的生物合成、氨基酸和核苷酸糖代谢等通路相关。③CEBPA在PE组的mRNA相对表达量明显高于对照组(0.6977±0.4210 vs 0.3811±0.2596,P<0.05)。胎盘组织中CEBPA主要表达于滋养细胞。④与siNC组比较,在对CEBPA敲降以后siCEBPA组的神经元钙黏蛋白(N-cad)表达升高(0.6410±0.0600 vs 0.9606±0.1016,P<0.05),而上皮钙黏蛋白(E-cad)表达差异无统计学意义(P>0.05)。且敲降CEBPA后细胞骨架变得松散。结论:CEBPA与PE的发病相关,在多个数据集中和胎盘组织中均呈现高表达,并且可能通过抑制EMT从而参与PE的发生过程。
