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基于幽门螺杆菌hp0169基因三维结构的生物信息学分析
1
作者
林玲辉
李娜
+5 位作者
尹晓燕
王晓凌
胡亚平
刘威
费瑞
田新利
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期739-748,共10页
目的:克隆幽门螺杆菌(Hp) hp0169基因并进行晶体学研究,分析其二级结构和三维结构。方法:由UniProt数据库中检索Hp NCTC26695菌株hp0169基因及其编码蛋白序列,采用生物信息学方法分析Hp重组胶原蛋白酶(HpPrtC)蛋白理化性质,SOPMA和DNASt...
目的:克隆幽门螺杆菌(Hp) hp0169基因并进行晶体学研究,分析其二级结构和三维结构。方法:由UniProt数据库中检索Hp NCTC26695菌株hp0169基因及其编码蛋白序列,采用生物信息学方法分析Hp重组胶原蛋白酶(HpPrtC)蛋白理化性质,SOPMA和DNAStrar软件预测HpPrtC蛋白二级结构特征,SWISS-MOPEL软件构建HpPrtC蛋白三维结构,IEDB和ABCpred软件预测HpPrtC蛋白B淋巴细胞抗原表位,SYFPEITHI网站预测T淋巴细胞抗原表位,专家库(EP)算法和随机森林(RF)算法预测HpPrtC蛋白可结晶性。原核表达HpPrtC重组蛋白,经Ni^(2+)亲和层析和分子筛技术纯化蛋白,结晶试剂盒筛选HpPrtC的结晶条件。结果:hp0169基因共包含1 269个碱基配对,编码蛋白全长422个氨基酸,理论等电点为7.64,相对分子质量为47 300。HpPrtC蛋白为亲水性、可溶性蛋白。HpPrtC蛋白α螺旋的氨基酸数量占全部氨基酸数量百分率为35.78%,β片层为18.72%,β转角为6.87%,无规则卷曲为38.63%。抗原表位分析,HpPrtC蛋白含有B淋巴细胞的5个优势线性表位和3个构象表位及多个T淋巴细胞潜在优势抗原表位。同源建模,HpPrtC蛋白呈二聚体,单体由β折叠围成桶状结构,周围被α螺旋和无规则卷曲围绕。HpPrtC蛋白为中等难度结晶,且无信号肽和跨膜螺旋,在0.2 mol·L^(-1)氯化镁、 0.1 mol·L^(-1)三羟甲基氨基甲烷(Tris)、3.4 mol·L^(-1)己二醇和pH 8.5条件下出现细小成簇的针状晶体。结论:HpPrtC是一种亲水型蛋白,呈二聚体构造,在适宜条件下呈细小成簇针状晶体,其具有T淋巴细胞和B淋巴细胞优势抗原表位,可作为Hp疫苗设计的抗原,用于构建多价融合疫苗或多表位疫苗,本研究结果为Hp的防治提供了实验基础。
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关键词
幽门螺杆菌
hp0169基因
抗原表位
蛋白结晶
生物信息学
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职称材料
本科护理免疫学第二课堂构建对学员的影响研究
被引量:
2
2
作者
王钰姝
陈俊国
+2 位作者
孙溦
曾冬梅
陈戬
《重庆医学》
CAS
2018年第29期3831-3832,共2页
免疫学是护理专业必修的一门前沿和交叉学科[1-2],与其他课程(护理学基础、护理心理学、护理英语等)相比,免疫学内容更为枯燥和深奥,理论性和逻辑性更强,且与临床实践的联系更为紧密[3-5]。于护理本科生而言,理想地掌握免疫学知识对今...
免疫学是护理专业必修的一门前沿和交叉学科[1-2],与其他课程(护理学基础、护理心理学、护理英语等)相比,免疫学内容更为枯燥和深奥,理论性和逻辑性更强,且与临床实践的联系更为紧密[3-5]。于护理本科生而言,理想地掌握免疫学知识对今后临床工作至关重要[2]。目前护理教学工作者为提高免疫学教学效果进行了许多尝试,如案例教学法结合以问题为基础的教学法(PBL)、讲授和案例融合、情境教学法、基础理论与临床实际相结合等,并取得了理想的效果[1,6-8]。但是以教师为主导、传统授课为核心的第一课堂以外的第二课堂在护理免疫教学过程中的应用研究相对较少。有研究表明为多方位培养综合素质较高的医护人员,需将第一课堂与第二课堂结合[9]。为了提高学员对免疫学的掌握度,提高学员综合素养,本研究探讨了本科护理免疫学教学过程中构建第二课堂对学员的影响,现报道如下。
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关键词
第二课堂
本科护理
免疫学
以问题为基础的教学法
学员
临床实践
教学过程
护理学基础
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职称材料
急性病毒感染条件下组蛋白甲基化转移酶EZH2对CD4^+T细胞mTOR信号通路的影响
被引量:
3
3
作者
吴家林
陈香宇
+1 位作者
田钦
叶丽林
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期334-340,共7页
目的探究在急性病毒感染条件下组蛋白甲基化转移酶EZH2对CD4^+T细胞mTOR信号通路的影响。方法运用淋巴细胞脑膜炎脉络丛病毒Armstrong病毒株对EZH2条件性诱导敲除小鼠进行感染,建立急性病毒感染模型。在不同时间点给与他莫昔芬处理,诱导...
目的探究在急性病毒感染条件下组蛋白甲基化转移酶EZH2对CD4^+T细胞mTOR信号通路的影响。方法运用淋巴细胞脑膜炎脉络丛病毒Armstrong病毒株对EZH2条件性诱导敲除小鼠进行感染,建立急性病毒感染模型。在不同时间点给与他莫昔芬处理,诱导EZH2敲除,然后采用流式细胞术检测小鼠脾脏CD4^+T细胞的频率和数量,以及mTOR通路和相关代谢指标的表达情况。结果 1)感染第8天,EZH2敲除组的CD44^+CD4^+T细胞的频率和数量与对照组相比都显著下降,mTORC1信号通路下游靶标S6,4E-BP1的磷酸化水平以及CD71,CD98的表达量显著下降,而mTORC2信号通路下游靶标Akt,FoxO1/3a的磷酸化水平显著升高。2)感染后第4~7天给予他莫昔芬处理诱导EZH2敲除,第8天检测他莫昔芬处理组CD44^+CD4^+T细胞的数量下降,但下降程度降低。S6及Akt磷酸化水平无统计学差异,p4E-BP1和CD71、CD98表达量降低,而pFoxO1/3a表达量上升。3)在感染后期第9~12天进行他莫昔芬处理的小鼠与对照组相比,其CD44^+CD4^+T细胞的数量和频率,以及mTORC1、mTORC2相关指标的表达量均没有统计学差异。结论在急性病毒感染条件下甲基化转移酶EZH2对CD4^+T细胞的免疫应答至关重要,同时对CD4^+T细胞的mTOR信号通路具有调控作用,并且这样的调控作用主要发生在感染早期。
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关键词
组蛋白甲基化转移酶
急性病毒感染
EZH2
CD4^+T细胞
MTOR信号通路
原文传递
阿苯达唑对小鼠皮下黑色素瘤内浸润T细胞频率和功能的影响
被引量:
2
4
作者
何志强
张伟楠
+3 位作者
方静怡
张妍
郑鸿
鲁元刚
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期340-346,360,共8页
目的探讨抗寄生虫药物阿苯达唑(albendazole,ABZ)对小鼠皮下黑色素瘤内T细胞浸润和功能的影响。方法C57BL/6小鼠腹部皮下接种B16F10-luciferase黑色素瘤细胞。荷瘤4 d后,将肿瘤体积大小基本一致的小鼠随机分成2组,每组5只。ABZ组每天给...
目的探讨抗寄生虫药物阿苯达唑(albendazole,ABZ)对小鼠皮下黑色素瘤内T细胞浸润和功能的影响。方法C57BL/6小鼠腹部皮下接种B16F10-luciferase黑色素瘤细胞。荷瘤4 d后,将肿瘤体积大小基本一致的小鼠随机分成2组,每组5只。ABZ组每天给予100 mg/kg的ABZ溶液进行灌胃治疗;Control组给予等量体积PBS灌胃。期间测量并记录荷瘤小鼠肿瘤生长大小,于第12天处死小鼠。对肿瘤进行称重,并利用流式细胞仪分析小鼠脾脏、引流淋巴结、外周血和肿瘤中浸润T细胞的差异。结果相较于对照组小鼠,ABZ处理组小鼠肿瘤体积较小,重量较轻;ABZ处理组小鼠脾脏、引流淋巴结、外周血中CD4^(+)T细胞和CD8^(+)T细胞频率无明显差异,但肿瘤内CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞浸润增多;同时我们发现肿瘤内浸润的耗竭前体CD8^(+)T细胞增多,且CD8^(+)T细胞分泌IFN-γ和Granzyme B能力增强,而Treg细胞减少。结论抗寄生虫药物ABZ能够通过增加皮下瘤体内CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞浸润,减少Treg细胞数量进而抑制小鼠皮下黑色素瘤的生长。
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关键词
阿苯达唑
黑色素瘤
免疫细胞浸润
T细胞
原文传递
题名
基于幽门螺杆菌hp0169基因三维结构的生物信息学分析
1
作者
林玲辉
李娜
尹晓燕
王晓凌
胡亚平
刘威
费瑞
田新利
机构
邢台
医学
高等专科
学
校病原生物
学
与
免疫
学
教研室
陆军军医大学基础医学院全军免疫学研究所
吉林
大学
基础
医学院
细胞生物
学
系
出处
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期739-748,共10页
基金
河北省卫健委医学科学研究项目(20201591)。
文摘
目的:克隆幽门螺杆菌(Hp) hp0169基因并进行晶体学研究,分析其二级结构和三维结构。方法:由UniProt数据库中检索Hp NCTC26695菌株hp0169基因及其编码蛋白序列,采用生物信息学方法分析Hp重组胶原蛋白酶(HpPrtC)蛋白理化性质,SOPMA和DNAStrar软件预测HpPrtC蛋白二级结构特征,SWISS-MOPEL软件构建HpPrtC蛋白三维结构,IEDB和ABCpred软件预测HpPrtC蛋白B淋巴细胞抗原表位,SYFPEITHI网站预测T淋巴细胞抗原表位,专家库(EP)算法和随机森林(RF)算法预测HpPrtC蛋白可结晶性。原核表达HpPrtC重组蛋白,经Ni^(2+)亲和层析和分子筛技术纯化蛋白,结晶试剂盒筛选HpPrtC的结晶条件。结果:hp0169基因共包含1 269个碱基配对,编码蛋白全长422个氨基酸,理论等电点为7.64,相对分子质量为47 300。HpPrtC蛋白为亲水性、可溶性蛋白。HpPrtC蛋白α螺旋的氨基酸数量占全部氨基酸数量百分率为35.78%,β片层为18.72%,β转角为6.87%,无规则卷曲为38.63%。抗原表位分析,HpPrtC蛋白含有B淋巴细胞的5个优势线性表位和3个构象表位及多个T淋巴细胞潜在优势抗原表位。同源建模,HpPrtC蛋白呈二聚体,单体由β折叠围成桶状结构,周围被α螺旋和无规则卷曲围绕。HpPrtC蛋白为中等难度结晶,且无信号肽和跨膜螺旋,在0.2 mol·L^(-1)氯化镁、 0.1 mol·L^(-1)三羟甲基氨基甲烷(Tris)、3.4 mol·L^(-1)己二醇和pH 8.5条件下出现细小成簇的针状晶体。结论:HpPrtC是一种亲水型蛋白,呈二聚体构造,在适宜条件下呈细小成簇针状晶体,其具有T淋巴细胞和B淋巴细胞优势抗原表位,可作为Hp疫苗设计的抗原,用于构建多价融合疫苗或多表位疫苗,本研究结果为Hp的防治提供了实验基础。
关键词
幽门螺杆菌
hp0169基因
抗原表位
蛋白结晶
生物信息学
Keywords
Helicobacter pylori
hp0169 gene
Crystallization
Antigenic epitope
Bioinformatics
分类号
R378.99 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
本科护理免疫学第二课堂构建对学员的影响研究
被引量:
2
2
作者
王钰姝
陈俊国
孙溦
曾冬梅
陈戬
机构
陆军
军医大学
西南医院急救部
陆军
军医大学
医学
教育
研究
室
陆军军医大学基础医学院全军免疫学研究所
出处
《重庆医学》
CAS
2018年第29期3831-3832,共2页
基金
陆军军医大学人文社科基金项目(2017XRW16)
文摘
免疫学是护理专业必修的一门前沿和交叉学科[1-2],与其他课程(护理学基础、护理心理学、护理英语等)相比,免疫学内容更为枯燥和深奥,理论性和逻辑性更强,且与临床实践的联系更为紧密[3-5]。于护理本科生而言,理想地掌握免疫学知识对今后临床工作至关重要[2]。目前护理教学工作者为提高免疫学教学效果进行了许多尝试,如案例教学法结合以问题为基础的教学法(PBL)、讲授和案例融合、情境教学法、基础理论与临床实际相结合等,并取得了理想的效果[1,6-8]。但是以教师为主导、传统授课为核心的第一课堂以外的第二课堂在护理免疫教学过程中的应用研究相对较少。有研究表明为多方位培养综合素质较高的医护人员,需将第一课堂与第二课堂结合[9]。为了提高学员对免疫学的掌握度,提高学员综合素养,本研究探讨了本科护理免疫学教学过程中构建第二课堂对学员的影响,现报道如下。
关键词
第二课堂
本科护理
免疫学
以问题为基础的教学法
学员
临床实践
教学过程
护理学基础
分类号
G642 [文化科学—高等教育学]
R47 [医药卫生—护理学]
下载PDF
职称材料
题名
急性病毒感染条件下组蛋白甲基化转移酶EZH2对CD4^+T细胞mTOR信号通路的影响
被引量:
3
3
作者
吴家林
陈香宇
田钦
叶丽林
机构
陆军军医大学基础医学院全军免疫学研究所
出处
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期334-340,共7页
基金
国家自然科学基金(31800742)
文摘
目的探究在急性病毒感染条件下组蛋白甲基化转移酶EZH2对CD4^+T细胞mTOR信号通路的影响。方法运用淋巴细胞脑膜炎脉络丛病毒Armstrong病毒株对EZH2条件性诱导敲除小鼠进行感染,建立急性病毒感染模型。在不同时间点给与他莫昔芬处理,诱导EZH2敲除,然后采用流式细胞术检测小鼠脾脏CD4^+T细胞的频率和数量,以及mTOR通路和相关代谢指标的表达情况。结果 1)感染第8天,EZH2敲除组的CD44^+CD4^+T细胞的频率和数量与对照组相比都显著下降,mTORC1信号通路下游靶标S6,4E-BP1的磷酸化水平以及CD71,CD98的表达量显著下降,而mTORC2信号通路下游靶标Akt,FoxO1/3a的磷酸化水平显著升高。2)感染后第4~7天给予他莫昔芬处理诱导EZH2敲除,第8天检测他莫昔芬处理组CD44^+CD4^+T细胞的数量下降,但下降程度降低。S6及Akt磷酸化水平无统计学差异,p4E-BP1和CD71、CD98表达量降低,而pFoxO1/3a表达量上升。3)在感染后期第9~12天进行他莫昔芬处理的小鼠与对照组相比,其CD44^+CD4^+T细胞的数量和频率,以及mTORC1、mTORC2相关指标的表达量均没有统计学差异。结论在急性病毒感染条件下甲基化转移酶EZH2对CD4^+T细胞的免疫应答至关重要,同时对CD4^+T细胞的mTOR信号通路具有调控作用,并且这样的调控作用主要发生在感染早期。
关键词
组蛋白甲基化转移酶
急性病毒感染
EZH2
CD4^+T细胞
MTOR信号通路
Keywords
Histone methyltransferase
Acute viral infection
EZH2
CD4^+ T cell
mTOR signaling pathway
分类号
R392.12 [医药卫生—免疫学]
原文传递
题名
阿苯达唑对小鼠皮下黑色素瘤内浸润T细胞频率和功能的影响
被引量:
2
4
作者
何志强
张伟楠
方静怡
张妍
郑鸿
鲁元刚
机构
陆军
军医大学
陆军
特色
医学
中心整形美容科
陆军军医大学基础医学院全军免疫学研究所
青岛农业
大学
动物
医学院
陆军
军医大学
新桥医院胸外科
出处
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期340-346,360,共8页
基金
陆军军医大学优秀人才计划(B-3253)
国家自然科学基金No.81702443。
文摘
目的探讨抗寄生虫药物阿苯达唑(albendazole,ABZ)对小鼠皮下黑色素瘤内T细胞浸润和功能的影响。方法C57BL/6小鼠腹部皮下接种B16F10-luciferase黑色素瘤细胞。荷瘤4 d后,将肿瘤体积大小基本一致的小鼠随机分成2组,每组5只。ABZ组每天给予100 mg/kg的ABZ溶液进行灌胃治疗;Control组给予等量体积PBS灌胃。期间测量并记录荷瘤小鼠肿瘤生长大小,于第12天处死小鼠。对肿瘤进行称重,并利用流式细胞仪分析小鼠脾脏、引流淋巴结、外周血和肿瘤中浸润T细胞的差异。结果相较于对照组小鼠,ABZ处理组小鼠肿瘤体积较小,重量较轻;ABZ处理组小鼠脾脏、引流淋巴结、外周血中CD4^(+)T细胞和CD8^(+)T细胞频率无明显差异,但肿瘤内CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞浸润增多;同时我们发现肿瘤内浸润的耗竭前体CD8^(+)T细胞增多,且CD8^(+)T细胞分泌IFN-γ和Granzyme B能力增强,而Treg细胞减少。结论抗寄生虫药物ABZ能够通过增加皮下瘤体内CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞浸润,减少Treg细胞数量进而抑制小鼠皮下黑色素瘤的生长。
关键词
阿苯达唑
黑色素瘤
免疫细胞浸润
T细胞
Keywords
Albendazole
Melanoma
Immune cells infiltration
T cells
分类号
R392 [医药卫生—免疫学]
R739.5 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于幽门螺杆菌hp0169基因三维结构的生物信息学分析
林玲辉
李娜
尹晓燕
王晓凌
胡亚平
刘威
费瑞
田新利
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
本科护理免疫学第二课堂构建对学员的影响研究
王钰姝
陈俊国
孙溦
曾冬梅
陈戬
《重庆医学》
CAS
2018
2
下载PDF
职称材料
3
急性病毒感染条件下组蛋白甲基化转移酶EZH2对CD4^+T细胞mTOR信号通路的影响
吴家林
陈香宇
田钦
叶丽林
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
原文传递
4
阿苯达唑对小鼠皮下黑色素瘤内浸润T细胞频率和功能的影响
何志强
张伟楠
方静怡
张妍
郑鸿
鲁元刚
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
原文传递
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