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题名白刺VQ基因家族的鉴定及分析
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作者
王丽蓉
黄丽霞
杜萌
易丹
王劼
杨鑫光
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机构
青海民族大学生态环境与资源学院
青海省特色经济植物高值化利用重点实验室
青海省生物技术与分析测试省级重点实验室
甘肃农业大学林学院
中国科学院西北高原生物研究所
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出处
《西北农业学报》
北大核心
2025年第3期498-507,共10页
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基金
青海省自然科学基金(2021-ZJ-944Q)。
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文摘
VQ蛋白(VQ motif-containing proteins)在高等植物的质体中起着转录调控作用且与植物耐干旱、盐碱有很大关系。为了获得白刺VQ基因家族蛋白的基本特征以及白刺VQ基因在干旱和盐胁迫下的表达特征,本研究基于白刺(Nitraria tangutorum Bobr.)全长转录组数据,通过生物信息学手段鉴定并分析了白刺VQ家族蛋白的基本特征,基于白刺以及拟南芥VQ蛋白序列,利用MEGA软件建立了VQ蛋白的系统发育树,最后利用qRT-PCR方法对NtVQ7基因的组织特异性表达特征以及干旱和盐胁迫下的表达特征进行了分析。结果表明,从白刺转录组中共鉴定出7个具有完整FxxxVQxLTG保守结构域的NtVQ家族成员,分别命名为NtVQ1~NtVQ7;氨基酸数目为155~320,分子质量为17.13~34.86 ku,等电点分布为5.23~10.81,不稳定指数为37.4~93.77,且均为亲水性蛋白;除NtVQ2定位在细胞外或细胞核中,其余的成员均被定位在细胞核中;系统发育树显示NtVQ1与NtVQ2、NtVQ3与NtVQ7的亲缘关系最近;叶片中的NtVQ7对PEG和NaCl胁迫做出不同响应,相对于PEG胁迫NtVQ7对盐胁迫更加敏感,且在盐胁迫后恢复过程中其表达量恢复上调;另外,该基因在不同组织器官中呈现不同的表达特征。
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关键词
VQ基因家族
白刺
生物信息学
表达特征
胁迫
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Keywords
VQ gene family
Nitraria tangutorum
Bioinformatics
Expression characteristics
Stress
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分类号
R73
[医药卫生—肿瘤]
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