热休克蛋白90(Heat shock protein 90,Hsp90)是生物体受到刺激时发生应激反应而产生的一类应激蛋白。Hsp90包含Hsp90A,Hsp90B,Hsp90C,TRAP和Htp G5个亚家族。本文采用生物信息学方法对所选11个物种的Hsp90基因进行了分析。统计Hsp90亚...热休克蛋白90(Heat shock protein 90,Hsp90)是生物体受到刺激时发生应激反应而产生的一类应激蛋白。Hsp90包含Hsp90A,Hsp90B,Hsp90C,TRAP和Htp G5个亚家族。本文采用生物信息学方法对所选11个物种的Hsp90基因进行了分析。统计Hsp90亚家族在物种间的分布情况,验证了Hsp90亚家族在物种间的分布规律,即Hsp90A亚家族分布于除细菌外的其他所有物种中,Hsp90B和TRAP1亚家族在物种间的分布无明显规律,Hsp90C亚家族只存在于植物中,Htp G亚家族大部分存在于细菌中。通过构建系统发育树,发现Hsp90家族在进化过程中具有保守性。使用Cell-PLoc,Sub Loc v1.0,PSORT II和Multi Loc四种亚细胞定位软件对所选的11个物种的Hsp90进行亚细胞定位分析,发现Hsp90A,Htp G亚家族偏好出现在细胞质中,Hsp90B亚家族除存在于细胞质外还存在于内质网中,Hsp90C亚家族则集中于细胞质和线粒体中,TRAP1亚家族基本位于线粒体中。展开更多
探讨原发性肝癌患者精确放疗后乙型肝炎病毒(hepatitis b virus,HBV)再激活的危险特征和分类预测模型。提出基于遗传算法的特征选择方法,从原发性肝癌数据的初始特征集中选择HBV再激活的最优特征子集。建立贝叶斯和支持向量机的HBV再激...探讨原发性肝癌患者精确放疗后乙型肝炎病毒(hepatitis b virus,HBV)再激活的危险特征和分类预测模型。提出基于遗传算法的特征选择方法,从原发性肝癌数据的初始特征集中选择HBV再激活的最优特征子集。建立贝叶斯和支持向量机的HBV再激活分类预测模型,并预测最优特征子集和初始特征集的分类性能。实验结果表明,基于遗传算法的特征选择提高了HBV再激活分类性能,最优特征子集的分类性能明显优于初始特征子集的分类性能。影响HBV再激活的最优特征子集包括:HBV DNA水平,肿瘤分期TNM,Child-Pugh,外放边界和全肝最大剂量。贝叶斯的分类准确性最高可达82.89%,支持向量机的分类准确性最高可达83.34%。展开更多
基因芯片技术是基因组学中的重要研究工具。而基因芯片数据( 微阵列数据) 往往是高维的,使得降维成为微阵列数据分析中的一个必要步骤。本文对美国哈佛医学院 G. J. Gordon 等人提供的肺癌微阵列数据进行分析。通过 t- test,Wilcoxon ...基因芯片技术是基因组学中的重要研究工具。而基因芯片数据( 微阵列数据) 往往是高维的,使得降维成为微阵列数据分析中的一个必要步骤。本文对美国哈佛医学院 G. J. Gordon 等人提供的肺癌微阵列数据进行分析。通过 t- test,Wilcoxon 秩和检测分别提取微阵列数据特征属性,后根据 CART( Classification and Regression Tree) 算法,以 Gini 差异性指标作为误差函数,用提取的特征属性广延的构造分类树; 再进行剪枝找到最优规模的树,目的是提高树的泛化性能使得能很好适应新的预测数据。实验证明: 该方法对肺癌微阵列数据分类识别率达到 96% 以上,且很稳定; 并可以得到人们容易理解的分类规则和分类关键基因。展开更多
微粒体甘油三酯转运蛋白MTP(microsomal triglyceride transfer protein,MTP)首先是从牛的肝细胞微粒体碎片中分离获得的,其作用是加速甘油三脂(triglyceride,TG)、胆固醇(cholesteryl ester,CE)和磷脂酰胆碱(phosphatidylcholine,PC)...微粒体甘油三酯转运蛋白MTP(microsomal triglyceride transfer protein,MTP)首先是从牛的肝细胞微粒体碎片中分离获得的,其作用是加速甘油三脂(triglyceride,TG)、胆固醇(cholesteryl ester,CE)和磷脂酰胆碱(phosphatidylcholine,PC)的转运和细胞或亚细胞膜的生物合成。它后来在肝细胞和小肠的微粒体膜中发现[1],由于它的位置及其转运TG可以推测与血浆脂蛋白中极低密度脂蛋白(very low density lipoprotein,VLDL)和乳糜微粒(chylomicrons,CM)的组装过程有关。展开更多
脂质代谢是机体的重要代谢过程,其紊乱会导致众多疾病的发生。人类白细胞分化抗原36(cluster of differentiation 36,CD36)是一种在单核细胞、巨噬细胞、平滑肌细胞以及脂肪细胞高度表达的清道夫受体,是识别氧化低密度脂蛋白及长链脂肪...脂质代谢是机体的重要代谢过程,其紊乱会导致众多疾病的发生。人类白细胞分化抗原36(cluster of differentiation 36,CD36)是一种在单核细胞、巨噬细胞、平滑肌细胞以及脂肪细胞高度表达的清道夫受体,是识别氧化低密度脂蛋白及长链脂肪酸的主要受体和转运蛋白,在脂质代谢过程中发挥着重要作用。本文综述了CD36基因及蛋白的结构和生理功能,阐述了清道夫受体CD36在脂质代谢过程中发挥的作用,并系统地总结了其级联AMPK、mTOR和MAPK信号通路参与脂质代谢过程的分子机制,为相关生物学研究提供了理论基础。展开更多
文摘探讨原发性肝癌患者精确放疗后乙型肝炎病毒(hepatitis b virus,HBV)再激活的危险特征和分类预测模型。提出基于遗传算法的特征选择方法,从原发性肝癌数据的初始特征集中选择HBV再激活的最优特征子集。建立贝叶斯和支持向量机的HBV再激活分类预测模型,并预测最优特征子集和初始特征集的分类性能。实验结果表明,基于遗传算法的特征选择提高了HBV再激活分类性能,最优特征子集的分类性能明显优于初始特征子集的分类性能。影响HBV再激活的最优特征子集包括:HBV DNA水平,肿瘤分期TNM,Child-Pugh,外放边界和全肝最大剂量。贝叶斯的分类准确性最高可达82.89%,支持向量机的分类准确性最高可达83.34%。
文摘微粒体甘油三酯转运蛋白MTP(microsomal triglyceride transfer protein,MTP)首先是从牛的肝细胞微粒体碎片中分离获得的,其作用是加速甘油三脂(triglyceride,TG)、胆固醇(cholesteryl ester,CE)和磷脂酰胆碱(phosphatidylcholine,PC)的转运和细胞或亚细胞膜的生物合成。它后来在肝细胞和小肠的微粒体膜中发现[1],由于它的位置及其转运TG可以推测与血浆脂蛋白中极低密度脂蛋白(very low density lipoprotein,VLDL)和乳糜微粒(chylomicrons,CM)的组装过程有关。
文摘脂质代谢是机体的重要代谢过程,其紊乱会导致众多疾病的发生。人类白细胞分化抗原36(cluster of differentiation 36,CD36)是一种在单核细胞、巨噬细胞、平滑肌细胞以及脂肪细胞高度表达的清道夫受体,是识别氧化低密度脂蛋白及长链脂肪酸的主要受体和转运蛋白,在脂质代谢过程中发挥着重要作用。本文综述了CD36基因及蛋白的结构和生理功能,阐述了清道夫受体CD36在脂质代谢过程中发挥的作用,并系统地总结了其级联AMPK、mTOR和MAPK信号通路参与脂质代谢过程的分子机制,为相关生物学研究提供了理论基础。
