背景与目的:胰腺癌是恶性程度较高的消化系统肿瘤之一,因其起病隐匿,早期常无典型症状,且肿瘤的侵袭性较强,故预后较差。随着对胰腺癌分子发病机制的深入研究,免疫治疗已成为胰腺癌治疗的新焦点。文献计量学是一种分析某一领域文献、直...背景与目的:胰腺癌是恶性程度较高的消化系统肿瘤之一,因其起病隐匿,早期常无典型症状,且肿瘤的侵袭性较强,故预后较差。随着对胰腺癌分子发病机制的深入研究,免疫治疗已成为胰腺癌治疗的新焦点。文献计量学是一种分析某一领域文献、直观地总结文献的趋势并预测研究热点的常用方法。本文旨在通过文献计量和知识图谱可视化分析胰腺癌免疫治疗的研究现状、热点和趋势,为后续的研究提供方向。方法:从Web of Science核心合集中提取相关出版物从开始到2022年5月发表的有关胰腺癌免疫治疗的文献,使用CtieSpace和VOSviewer等软件对该领域文献的国家、机构、作者、参考文献和关键词进行文献计量可视化分析。结果:共纳入2009—2022年发表与胰腺癌免疫治疗相关的英文文献2230篇,自2016年文献数量每年都在稳定增长。这些文献的7365位作者来自75个国家/地区的884个机构,共有7943篇共被引参考文献。发文量最多的国家为美国(n=964),其次是中国(n=552);发文量最多的机构为美国约翰霍普金斯大学(n=67)和德克萨斯大学MD安德森癌症中心(n=65);发文量最多的作者为美国约翰霍普金斯大学的ElizabethMJaffee(n=41)和LeiZheng(n=31)。共被引次数最多的文献为“Genomicanalyses identify molecular subtypes of pancreatic cancer”(n=161),共被引参考文献时间线图显示,聚类“肿瘤微环境”是从2016年开始一直持续到现在的热点。关键词的突发检测揭示了胰腺癌免疫治疗领域的发展,最初的热点主要是“疫苗”,而近年来重点转移到“伊匹单抗”“检查点阻断”“上皮间质转化”“星状细胞”“巨噬细胞”“错配修复缺陷”和“肿瘤微环境”等。结论:与胰腺癌免疫治疗的相关研究呈持续上升趋势,是胰腺癌治疗的重要研究方向,目前美国在这一研究领域尚处于绝对领先地位。相关研究表明独特的肿瘤微环境可能是胰腺癌恶性程度较高且对放化疗不敏感的主要原因,深入研究胰腺癌肿瘤微环境(TME)的致病机理是目前研究的重点。除此之外,聚焦于“上皮间质转化”和“免疫检查点抑制”等的研究较为普遍,现有的研究表明单一的治疗手段对胰腺癌的治疗效果有限,免疫联合疗法或化疗联合免疫疗法可以进一步提高胰腺癌的临床疗效,是未来临床研究的趋势。展开更多
背景与目的:富亮氨酸α2糖蛋白1(LRG1)是富亮氨酸重复序列(LRR)家族蛋白成员,近些年研究显示LRG1在恶性肿瘤的发生、上皮间质转化、侵袭转移、异常血管生成、预后预测中发挥重要作用。然而LRG1在乳腺癌中的表达、预后、功能和潜在机制...背景与目的:富亮氨酸α2糖蛋白1(LRG1)是富亮氨酸重复序列(LRR)家族蛋白成员,近些年研究显示LRG1在恶性肿瘤的发生、上皮间质转化、侵袭转移、异常血管生成、预后预测中发挥重要作用。然而LRG1在乳腺癌中的表达、预后、功能和潜在机制方面尚待阐明。本研究旨在通过生物信息学方法系统分析LRG1在乳腺癌中的表达及意义。方法:使用TCGA、Breast Cancer Gene-Expression Miner、UALCAN、Kaplan-Meier Plotter、Gene MANIA、DAVID等多个数据库对LRG1在乳腺癌中的表达与临床病理特征关系、预后价值、相互蛋白作用网络及功能富集进行综合分析。结果:TCGA数据库分析显示,LRG1 m RNA在乳腺浸润癌中的表达量明显高于正常组织(23.461 vs.8.357,P<0.001)。在不同分子亚型中,luminal型乳腺癌中LRG1 m RNA表达量为37.462(9.930~74.197),高于HER-2阳性型乳腺癌和三阴性乳腺癌(TNBC)(均P<0.01);Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期乳腺癌中LRG1 m RNA的表达水平均高于正常乳腺组织(均P<0.05)。Breast Cancer Gene-Expression Miner数据库分析显示,雌激素受体(ER)和(或)孕激素受体(PR)阳性乳腺癌中LRG1 m RNA的表达水平高于ER和(或)PR阴性乳腺癌,HER-2阴性乳腺癌中LRG1 mRNA表达高于HER-2阳性型乳腺癌(均P<0.05);淋巴结阳性乳腺癌LRG1 m RNA表达量高于淋巴结阴性乳腺癌(P<0.0001)。用GEPIA在线平台对TCGA数据库中乳腺癌数据进行生存分析发现,LRG1高表达患者总生存率(OS)及无复发生存率(RFS)均低于低表达患者,但差异无统计学意义(HR=0.81,P=0.200;HR=0.70,P=0.064);用Kaplan-Meier plotter对TCGA中乳腺癌数据进行生存分析发现,LRG1的表达与luminal A型、luminal B型、HER-2阳性型乳腺癌的OS无明显关系(均P>0.05),但在basal-like亚型中,LRG1低表达患者OS明显优于LRG1高表达患者(HR=3.12,95%CI=1.54~6.29,P<0.001)。使用Gene MANIA数据库进行分析,共筛选出20个与LRG1相互作用蛋白质,GO富集分析显示,LRG1及与其共表达相关的20个蛋白富集于细胞胞外区,外泌体,血液微粒,受体复合物等结构中,参与细胞的血管生成调控、上皮间充质的转化、缺氧反应等相关生物学过程。结论:LRG1在乳腺癌组织中表达上调,并可预测部分不良乳腺癌亚型的预后,LRG1可能为乳腺癌治疗提供新的靶点。展开更多
文摘背景与目的:胰腺癌是恶性程度较高的消化系统肿瘤之一,因其起病隐匿,早期常无典型症状,且肿瘤的侵袭性较强,故预后较差。随着对胰腺癌分子发病机制的深入研究,免疫治疗已成为胰腺癌治疗的新焦点。文献计量学是一种分析某一领域文献、直观地总结文献的趋势并预测研究热点的常用方法。本文旨在通过文献计量和知识图谱可视化分析胰腺癌免疫治疗的研究现状、热点和趋势,为后续的研究提供方向。方法:从Web of Science核心合集中提取相关出版物从开始到2022年5月发表的有关胰腺癌免疫治疗的文献,使用CtieSpace和VOSviewer等软件对该领域文献的国家、机构、作者、参考文献和关键词进行文献计量可视化分析。结果:共纳入2009—2022年发表与胰腺癌免疫治疗相关的英文文献2230篇,自2016年文献数量每年都在稳定增长。这些文献的7365位作者来自75个国家/地区的884个机构,共有7943篇共被引参考文献。发文量最多的国家为美国(n=964),其次是中国(n=552);发文量最多的机构为美国约翰霍普金斯大学(n=67)和德克萨斯大学MD安德森癌症中心(n=65);发文量最多的作者为美国约翰霍普金斯大学的ElizabethMJaffee(n=41)和LeiZheng(n=31)。共被引次数最多的文献为“Genomicanalyses identify molecular subtypes of pancreatic cancer”(n=161),共被引参考文献时间线图显示,聚类“肿瘤微环境”是从2016年开始一直持续到现在的热点。关键词的突发检测揭示了胰腺癌免疫治疗领域的发展,最初的热点主要是“疫苗”,而近年来重点转移到“伊匹单抗”“检查点阻断”“上皮间质转化”“星状细胞”“巨噬细胞”“错配修复缺陷”和“肿瘤微环境”等。结论:与胰腺癌免疫治疗的相关研究呈持续上升趋势,是胰腺癌治疗的重要研究方向,目前美国在这一研究领域尚处于绝对领先地位。相关研究表明独特的肿瘤微环境可能是胰腺癌恶性程度较高且对放化疗不敏感的主要原因,深入研究胰腺癌肿瘤微环境(TME)的致病机理是目前研究的重点。除此之外,聚焦于“上皮间质转化”和“免疫检查点抑制”等的研究较为普遍,现有的研究表明单一的治疗手段对胰腺癌的治疗效果有限,免疫联合疗法或化疗联合免疫疗法可以进一步提高胰腺癌的临床疗效,是未来临床研究的趋势。
文摘背景与目的:富亮氨酸α2糖蛋白1(LRG1)是富亮氨酸重复序列(LRR)家族蛋白成员,近些年研究显示LRG1在恶性肿瘤的发生、上皮间质转化、侵袭转移、异常血管生成、预后预测中发挥重要作用。然而LRG1在乳腺癌中的表达、预后、功能和潜在机制方面尚待阐明。本研究旨在通过生物信息学方法系统分析LRG1在乳腺癌中的表达及意义。方法:使用TCGA、Breast Cancer Gene-Expression Miner、UALCAN、Kaplan-Meier Plotter、Gene MANIA、DAVID等多个数据库对LRG1在乳腺癌中的表达与临床病理特征关系、预后价值、相互蛋白作用网络及功能富集进行综合分析。结果:TCGA数据库分析显示,LRG1 m RNA在乳腺浸润癌中的表达量明显高于正常组织(23.461 vs.8.357,P<0.001)。在不同分子亚型中,luminal型乳腺癌中LRG1 m RNA表达量为37.462(9.930~74.197),高于HER-2阳性型乳腺癌和三阴性乳腺癌(TNBC)(均P<0.01);Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期乳腺癌中LRG1 m RNA的表达水平均高于正常乳腺组织(均P<0.05)。Breast Cancer Gene-Expression Miner数据库分析显示,雌激素受体(ER)和(或)孕激素受体(PR)阳性乳腺癌中LRG1 m RNA的表达水平高于ER和(或)PR阴性乳腺癌,HER-2阴性乳腺癌中LRG1 mRNA表达高于HER-2阳性型乳腺癌(均P<0.05);淋巴结阳性乳腺癌LRG1 m RNA表达量高于淋巴结阴性乳腺癌(P<0.0001)。用GEPIA在线平台对TCGA数据库中乳腺癌数据进行生存分析发现,LRG1高表达患者总生存率(OS)及无复发生存率(RFS)均低于低表达患者,但差异无统计学意义(HR=0.81,P=0.200;HR=0.70,P=0.064);用Kaplan-Meier plotter对TCGA中乳腺癌数据进行生存分析发现,LRG1的表达与luminal A型、luminal B型、HER-2阳性型乳腺癌的OS无明显关系(均P>0.05),但在basal-like亚型中,LRG1低表达患者OS明显优于LRG1高表达患者(HR=3.12,95%CI=1.54~6.29,P<0.001)。使用Gene MANIA数据库进行分析,共筛选出20个与LRG1相互作用蛋白质,GO富集分析显示,LRG1及与其共表达相关的20个蛋白富集于细胞胞外区,外泌体,血液微粒,受体复合物等结构中,参与细胞的血管生成调控、上皮间充质的转化、缺氧反应等相关生物学过程。结论:LRG1在乳腺癌组织中表达上调,并可预测部分不良乳腺癌亚型的预后,LRG1可能为乳腺癌治疗提供新的靶点。
