柿叶含有丰富的钙、铁、锰、锌等人体必需的矿质元素,不同柿树品种,其柿叶中矿质元素的组成和含量有着明显差异。本研究以‘君迁子’(Diospyros Lotus Linn,DL)为对照,采用代谢组学-转录组学联合分析,研究了‘黑柿’(Diospyros kaki.Hei...柿叶含有丰富的钙、铁、锰、锌等人体必需的矿质元素,不同柿树品种,其柿叶中矿质元素的组成和含量有着明显差异。本研究以‘君迁子’(Diospyros Lotus Linn,DL)为对照,采用代谢组学-转录组学联合分析,研究了‘黑柿’(Diospyros kaki.HeiShi,HS)、‘西村早生’(Diospyros kaki Thunb.Nishimurawase,NM)、‘泰富’(Diospyros kaki Thunb.TaiFu,TF)鲜嫩柿叶中矿质元素的含量差异。代谢组学分析显示,从DL vs.HS、DL vs.NM和DL vs.TF中分别获得了382、391和368个差异代谢产物(differentially accumulated metabolites,DAMs),其中229个为共同DAMs。经RNA测序,获得了182008个单基因(unigenes),平均长度为652 bp,从DL vs.HS、DL vs.NM和DL vs.TF中分别获得了2598、3503和3333个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。经基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,分别从DL vs.HS、DL vs.NM和DL vs.TF中获得了9、12和12个与矿物质吸收相关的DEGs,其中6个为共同DEGs,每百万碱基测序的转录本序列每千碱基序列片段数(fragments per kilobase of transcript sequence per millions base pairs sequenced,FPKM)值差异倍数为1.34–6.15,经实时荧光定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)验证,其表达趋势均与RNA测序结果一致,相对表达水平差异倍数为0.26–10.21。转录组学数据分析和qRT-PCR验证结果表明,‘黑柿’鲜嫩柿叶中含有较高含量的矿物质,‘西村早生’和‘泰富’次之。联合分析显示,6个DEGs与其代谢产物呈正相关。本研究结果说明,3个柿树品种中,‘黑柿’的鲜嫩柿叶可推荐用于富含矿质元素柿叶茶的制作。展开更多
1刊物简介《生物工程学报》(1985年创刊,月刊,英文刊名Chinese Journal of Biotechnology)是由中国科学院微生物研究所和中国微生物学会主办的,国内外公开发行的综合性学术期刊。本刊已被美国医学索引、俄罗斯文摘、日本科学技术社数据...1刊物简介《生物工程学报》(1985年创刊,月刊,英文刊名Chinese Journal of Biotechnology)是由中国科学院微生物研究所和中国微生物学会主办的,国内外公开发行的综合性学术期刊。本刊已被美国医学索引、俄罗斯文摘、日本科学技术社数据库、英国国际农业与生物科学研究文摘、美国剑桥科学文摘(自然科学卷)<CSA(NS)>、波兰哥白尼索引、荷兰Elsevier公司的.展开更多
文摘柿叶含有丰富的钙、铁、锰、锌等人体必需的矿质元素,不同柿树品种,其柿叶中矿质元素的组成和含量有着明显差异。本研究以‘君迁子’(Diospyros Lotus Linn,DL)为对照,采用代谢组学-转录组学联合分析,研究了‘黑柿’(Diospyros kaki.HeiShi,HS)、‘西村早生’(Diospyros kaki Thunb.Nishimurawase,NM)、‘泰富’(Diospyros kaki Thunb.TaiFu,TF)鲜嫩柿叶中矿质元素的含量差异。代谢组学分析显示,从DL vs.HS、DL vs.NM和DL vs.TF中分别获得了382、391和368个差异代谢产物(differentially accumulated metabolites,DAMs),其中229个为共同DAMs。经RNA测序,获得了182008个单基因(unigenes),平均长度为652 bp,从DL vs.HS、DL vs.NM和DL vs.TF中分别获得了2598、3503和3333个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。经基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,分别从DL vs.HS、DL vs.NM和DL vs.TF中获得了9、12和12个与矿物质吸收相关的DEGs,其中6个为共同DEGs,每百万碱基测序的转录本序列每千碱基序列片段数(fragments per kilobase of transcript sequence per millions base pairs sequenced,FPKM)值差异倍数为1.34–6.15,经实时荧光定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)验证,其表达趋势均与RNA测序结果一致,相对表达水平差异倍数为0.26–10.21。转录组学数据分析和qRT-PCR验证结果表明,‘黑柿’鲜嫩柿叶中含有较高含量的矿物质,‘西村早生’和‘泰富’次之。联合分析显示,6个DEGs与其代谢产物呈正相关。本研究结果说明,3个柿树品种中,‘黑柿’的鲜嫩柿叶可推荐用于富含矿质元素柿叶茶的制作。
文摘1刊物简介《生物工程学报》(1985年创刊,月刊,英文刊名Chinese Journal of Biotechnology)是由中国科学院微生物研究所和中国微生物学会主办的,国内外公开发行的综合性学术期刊。本刊已被美国医学索引、俄罗斯文摘、日本科学技术社数据库、英国国际农业与生物科学研究文摘、美国剑桥科学文摘(自然科学卷)<CSA(NS)>、波兰哥白尼索引、荷兰Elsevier公司的.
